MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015957	AGCG	2	8	522149	522156	25 %	0 %	50 %	25 %	345008414
14502	NC_015957	CTT	2	6	522232	522237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008414
14503	NC_015957	GTG	2	6	522284	522289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008414
14504	NC_015957	CA	3	6	522290	522295	50 %	0 %	0 %	50 %	345008414
14505	NC_015957	GGTG	2	8	522328	522335	0 %	25 %	75 %	0 %	345008414
14506	NC_015957	GGA	2	6	522400	522405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008414
14507	NC_015957	CGA	2	6	522414	522419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008414
14508	NC_015957	CCGC	2	8	522518	522525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14509	NC_015957	CG	3	6	522554	522559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_015957	CTT	2	6	522693	522698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008415
14511	NC_015957	GTCG	2	8	522699	522706	0 %	25 %	50 %	25 %	345008415
14512	NC_015957	TGG	2	6	522725	522730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008415
14513	NC_015957	CGT	2	6	522815	522820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14514	NC_015957	GTC	2	6	522828	522833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14515	NC_015957	CCG	2	6	522883	522888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14516	NC_015957	C	6	6	522898	522903	0 %	0 %	0 %	100 %	345008415
14517	NC_015957	GCC	2	6	522963	522968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14518	NC_015957	TCG	2	6	522988	522993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14519	NC_015957	GGA	2	6	523014	523019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008415
14520	NC_015957	GCT	2	6	523020	523025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14521	NC_015957	CGC	2	6	523028	523033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14522	NC_015957	CGC	2	6	523037	523042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14523	NC_015957	GGA	2	6	523059	523064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008415
14524	NC_015957	CGG	2	6	523100	523105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008415
14525	NC_015957	CTT	2	6	523113	523118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008415
14526	NC_015957	GAC	2	6	523170	523175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14527	NC_015957	TGG	2	6	523211	523216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008415
14528	NC_015957	CCG	2	6	523242	523247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14529	NC_015957	ACG	2	6	523264	523269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14530	NC_015957	CGT	2	6	523277	523282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14531	NC_015957	GTC	2	6	523290	523295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14532	NC_015957	GCA	2	6	523310	523315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14533	NC_015957	CGC	2	6	523343	523348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14534	NC_015957	CGG	2	6	523382	523387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008415
14535	NC_015957	CGT	2	6	523418	523423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
14536	NC_015957	GGA	2	6	523431	523436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008415
14537	NC_015957	CCG	2	6	523456	523461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
14538	NC_015957	CGG	2	6	523469	523474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008415
14539	NC_015957	TGA	2	6	523484	523489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008415
14540	NC_015957	CCGT	2	8	523515	523522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14541	NC_015957	CGCTG	2	10	523531	523540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14542	NC_015957	ACG	2	6	523565	523570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_015957	GCC	2	6	523582	523587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_015957	CGCA	2	8	523617	523624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14545	NC_015957	TGCC	2	8	523631	523638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14546	NC_015957	CAT	2	6	523707	523712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008416
14547	NC_015957	GCA	2	6	523791	523796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14548	NC_015957	GGCG	2	8	523896	523903	0 %	0 %	75 %	25 %	345008416
14549	NC_015957	CGG	2	6	523913	523918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
14550	NC_015957	CGG	2	6	523949	523954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
14551	NC_015957	CCG	2	6	523970	523975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008416
14552	NC_015957	TC	3	6	523992	523997	0 %	50 %	0 %	50 %	345008416
14553	NC_015957	GAT	2	6	524022	524027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008416
14554	NC_015957	ACG	2	6	524048	524053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14555	NC_015957	GGC	2	6	524069	524074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
14556	NC_015957	CGG	2	6	524090	524095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
14557	NC_015957	GAC	2	6	524101	524106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14558	NC_015957	TGC	2	6	524243	524248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14559	NC_015957	GGC	2	6	524376	524381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
14560	NC_015957	TCT	2	6	524396	524401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008416
14561	NC_015957	CG	3	6	524428	524433	0 %	0 %	50 %	50 %	345008416
14562	NC_015957	ATG	2	6	524437	524442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008416
14563	NC_015957	GTG	2	6	524458	524463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008416
14564	NC_015957	GCCC	2	8	524482	524489	0 %	0 %	25 %	75 %	345008416
14565	NC_015957	CCA	2	6	524514	524519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008416
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14567	NC_015957	ATC	2	6	524608	524613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008416
14568	NC_015957	CGT	2	6	524666	524671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
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14570	NC_015957	GGA	2	6	524748	524753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008416
14571	NC_015957	CGT	2	6	524790	524795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14572	NC_015957	CAG	2	6	524842	524847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14573	NC_015957	TCG	2	6	524855	524860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
14574	NC_015957	GGT	2	6	524862	524867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008416
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14576	NC_015957	GGC	2	6	525141	525146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
14577	NC_015957	GCCGAA	2	12	525198	525209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14578	NC_015957	TGG	2	6	525317	525322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
14579	NC_015957	GTC	2	6	525339	525344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14580	NC_015957	GTG	2	6	525349	525354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
14581	NC_015957	GCA	2	6	525362	525367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
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14583	NC_015957	CCA	2	6	525401	525406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008417
14584	NC_015957	GGTCGG	2	12	525419	525430	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345008417
14585	NC_015957	GCT	2	6	525437	525442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14586	NC_015957	GCA	2	6	525461	525466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14587	NC_015957	TGA	2	6	525485	525490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008417
14588	NC_015957	GGT	2	6	525498	525503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
14589	NC_015957	CAG	3	9	525519	525527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14590	NC_015957	TCG	2	6	525568	525573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14591	NC_015957	CGGT	2	8	525580	525587	0 %	25 %	50 %	25 %	345008417
14592	NC_015957	TCC	2	6	525607	525612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008417
14593	NC_015957	GCG	3	9	525621	525629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
14594	NC_015957	TGG	3	9	525664	525672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
14595	NC_015957	CTG	2	6	525699	525704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
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14598	NC_015957	GCT	2	6	525770	525775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14599	NC_015957	TCC	2	6	525778	525783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008417
14600	NC_015957	GGC	2	6	525800	525805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
14601	NC_015957	GTC	2	6	525837	525842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
14602	NC_015957	CGC	2	6	525908	525913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008417
14603	NC_015957	G	6	6	525932	525937	0 %	0 %	100 %	0 %	345008417
14604	NC_015957	G	6	6	525943	525948	0 %	0 %	100 %	0 %	345008417
14605	NC_015957	TGA	2	6	526004	526009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008417
14606	NC_015957	CGG	2	6	526014	526019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
14607	NC_015957	TCG	2	6	526150	526155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
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14609	NC_015957	CGAC	2	8	526241	526248	25 %	0 %	25 %	50 %	345008417
14610	NC_015957	TGG	2	6	526253	526258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
14611	NC_015957	TTCC	2	8	526260	526267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14612	NC_015957	CGGG	2	8	526289	526296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14613	NC_015957	GCGG	2	8	526304	526311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14614	NC_015957	GGTC	2	8	526425	526432	0 %	25 %	50 %	25 %	345008418
14615	NC_015957	GTGG	2	8	526465	526472	0 %	25 %	75 %	0 %	345008418
14616	NC_015957	CCGG	2	8	526493	526500	0 %	0 %	50 %	50 %	345008418
14617	NC_015957	CCG	2	6	526522	526527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008418
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14620	NC_015957	GAT	2	6	526690	526695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008418
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14739	NC_015957	CAC	2	6	530414	530419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008421
14740	NC_015957	GAC	2	6	530438	530443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008421
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14742	NC_015957	GTC	2	6	530571	530576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008422
14743	NC_015957	GCGA	2	8	530593	530600	25 %	0 %	50 %	25 %	345008422
14744	NC_015957	CGA	2	6	530606	530611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008422
14745	NC_015957	CGC	2	6	530615	530620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008422
14746	NC_015957	CGC	2	6	530625	530630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008422
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14749	NC_015957	GCCC	2	8	530866	530873	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14750	NC_015957	CG	3	6	530903	530908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14751	NC_015957	GTCG	2	8	530928	530935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14752	NC_015957	GAC	2	6	530938	530943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14753	NC_015957	CGA	2	6	530946	530951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14755	NC_015957	ACC	2	6	531008	531013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008423
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14772	NC_015957	CGC	2	6	531838	531843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008424
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14777	NC_015957	CCGGG	2	10	532031	532040	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14778	NC_015957	GCC	2	6	532051	532056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14985	NC_015957	CGT	2	6	540916	540921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008434
14986	NC_015957	GGTGAG	2	12	540933	540944	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	345008434
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14989	NC_015957	CGA	2	6	541021	541026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008434
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14991	NC_015957	CTG	2	6	541113	541118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008434
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