MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015957	GAGT	2	8	504307	504314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_015957	GCC	2	6	504320	504325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_015957	GCG	2	6	504334	504339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008400
14004	NC_015957	CGG	2	6	504341	504346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008400
14005	NC_015957	CGG	2	6	504357	504362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008400
14006	NC_015957	CCG	2	6	504363	504368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14007	NC_015957	GCC	2	6	504370	504375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14008	NC_015957	GCC	3	9	504395	504403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14009	NC_015957	GCC	2	6	504419	504424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14010	NC_015957	GCC	2	6	504450	504455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14011	NC_015957	CGGCCT	2	12	504609	504620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008400
14012	NC_015957	GCCG	2	8	504651	504658	0 %	0 %	50 %	50 %	345008400
14013	NC_015957	CGC	2	6	504666	504671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14014	NC_015957	GCC	2	6	504714	504719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008400
14015	NC_015957	GAT	2	6	504724	504729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008400
14016	NC_015957	CGGCG	2	10	504745	504754	0 %	0 %	60 %	40 %	345008400
14017	NC_015957	CCAG	2	8	504759	504766	25 %	0 %	25 %	50 %	345008400
14018	NC_015957	TCG	2	6	504839	504844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008400
14019	NC_015957	GCT	2	6	504907	504912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008400
14020	NC_015957	TCC	2	6	504920	504925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008400
14021	NC_015957	ACC	2	6	504950	504955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008400
14022	NC_015957	CTG	2	6	504967	504972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008400
14023	NC_015957	GAA	2	6	505003	505008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008400
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14025	NC_015957	GGC	3	9	505084	505092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008400
14026	NC_015957	TCG	2	6	505097	505102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008400
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14030	NC_015957	TGCGG	2	10	505136	505145	0 %	20 %	60 %	20 %	345008400
14031	NC_015957	CGA	2	6	505156	505161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008400
14032	NC_015957	GC	3	6	505165	505170	0 %	0 %	50 %	50 %	345008400
14033	NC_015957	GTC	2	6	505218	505223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008400
14034	NC_015957	GAGC	2	8	505256	505263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14035	NC_015957	GCC	2	6	505353	505358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_015957	CGCGGG	2	12	505360	505371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_015957	GCC	2	6	505377	505382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_015957	GCC	2	6	505400	505405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008401
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14047	NC_015957	CGG	2	6	505795	505800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_015957	ATCG	2	8	505809	505816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14049	NC_015957	GC	4	8	505832	505839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_015957	CCGG	2	8	505901	505908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_015957	TTG	2	6	505992	505997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_015957	GAG	2	6	506017	506022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_015957	CGG	2	6	506042	506047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_015957	TGCC	2	8	506064	506071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_015957	GGT	3	9	506089	506097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_015957	CTG	2	6	506190	506195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_015957	GCC	2	6	506222	506227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_015957	ACCG	2	8	506276	506283	25 %	0 %	25 %	50 %	345008402
14059	NC_015957	TGCG	2	8	506339	506346	0 %	25 %	50 %	25 %	345008402
14060	NC_015957	CT	3	6	506354	506359	0 %	50 %	0 %	50 %	345008402
14061	NC_015957	GGA	2	6	506388	506393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008402
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14105	NC_015957	GCCC	2	8	507946	507953	0 %	0 %	25 %	75 %	345008403
14106	NC_015957	GACG	2	8	507971	507978	25 %	0 %	50 %	25 %	345008403
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14121	NC_015957	AGC	2	6	508297	508302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008403
14122	NC_015957	GTC	2	6	508332	508337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008403
14123	NC_015957	GCT	2	6	508343	508348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008403
14124	NC_015957	AGC	2	6	508372	508377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008403
14125	NC_015957	TGCGC	2	10	508412	508421	0 %	20 %	40 %	40 %	345008403
14126	NC_015957	CGC	2	6	508451	508456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008403
14127	NC_015957	CG	3	6	508482	508487	0 %	0 %	50 %	50 %	345008403
14128	NC_015957	GGCC	2	8	508512	508519	0 %	0 %	50 %	50 %	345008403
14129	NC_015957	CGC	2	6	508540	508545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14130	NC_015957	CGG	2	6	508549	508554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008404
14131	NC_015957	CCG	2	6	508559	508564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14132	NC_015957	CGC	2	6	508580	508585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14133	NC_015957	GC	3	6	508587	508592	0 %	0 %	50 %	50 %	345008404
14134	NC_015957	CAC	2	6	508669	508674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008404
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14138	NC_015957	CGCGC	2	10	508932	508941	0 %	0 %	40 %	60 %	345008404
14139	NC_015957	GTG	2	6	509054	509059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008404
14140	NC_015957	CGC	3	9	509062	509070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14141	NC_015957	GGCGA	2	10	509096	509105	20 %	0 %	60 %	20 %	345008404
14142	NC_015957	GCT	2	6	509110	509115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008404
14143	NC_015957	GCCC	2	8	509134	509141	0 %	0 %	25 %	75 %	345008404
14144	NC_015957	CGA	2	6	509212	509217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008404
14145	NC_015957	CCG	2	6	509241	509246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14146	NC_015957	CGC	2	6	509260	509265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008404
14147	NC_015957	GCG	2	6	509349	509354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008404
14148	NC_015957	TCG	2	6	509355	509360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008404
14149	NC_015957	CAC	2	6	509362	509367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008404
14150	NC_015957	ACG	2	6	509375	509380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008404
14151	NC_015957	CCA	2	6	509394	509399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008404
14152	NC_015957	GAGC	2	8	509495	509502	25 %	0 %	50 %	25 %	345008404
14153	NC_015957	CTG	2	6	509581	509586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14154	NC_015957	GC	3	6	509592	509597	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14155	NC_015957	GTG	2	6	509653	509658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008405
14156	NC_015957	GC	3	6	509699	509704	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14157	NC_015957	GTC	2	6	509727	509732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14158	NC_015957	CG	4	8	509781	509788	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14159	NC_015957	GTC	2	6	509800	509805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14160	NC_015957	CG	3	6	509806	509811	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14161	NC_015957	CGC	2	6	509841	509846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14162	NC_015957	CGA	2	6	509847	509852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14163	NC_015957	GCC	2	6	509866	509871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14164	NC_015957	GGT	2	6	509889	509894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008405
14165	NC_015957	GCC	2	6	509905	509910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14166	NC_015957	GGTG	2	8	509913	509920	0 %	25 %	75 %	0 %	345008405
14167	NC_015957	GCC	2	6	509989	509994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
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14170	NC_015957	GCC	3	9	510067	510075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14171	NC_015957	TGG	2	6	510086	510091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008405
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14173	NC_015957	CAC	3	9	510138	510146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008405
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14175	NC_015957	TGC	2	6	510209	510214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14176	NC_015957	CGC	2	6	510218	510223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14177	NC_015957	CGGC	3	12	510266	510277	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14178	NC_015957	GCC	2	6	510352	510357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
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14181	NC_015957	GCA	2	6	510438	510443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14182	NC_015957	GC	3	6	510450	510455	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14183	NC_015957	GAG	2	6	510538	510543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008405
14184	NC_015957	CG	3	6	510559	510564	0 %	0 %	50 %	50 %	345008405
14185	NC_015957	CGG	2	6	510584	510589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008405
14186	NC_015957	GCT	2	6	510672	510677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
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14189	NC_015957	GCTGG	2	10	510780	510789	0 %	20 %	60 %	20 %	345008405
14190	NC_015957	CGA	2	6	510795	510800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008405
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14192	NC_015957	CGC	3	9	510830	510838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008405
14193	NC_015957	GCG	2	6	510866	510871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008405
14194	NC_015957	TCG	2	6	510895	510900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14195	NC_015957	TCG	2	6	510917	510922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008405
14196	NC_015957	CGGCC	2	10	510966	510975	0 %	0 %	40 %	60 %	345008405
14197	NC_015957	GGA	2	6	510990	510995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008405
14198	NC_015957	GCG	2	6	511072	511077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008405
14199	NC_015957	CGG	2	6	511078	511083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008405
14200	NC_015957	CCCG	2	8	511115	511122	0 %	0 %	25 %	75 %	345008405
14201	NC_015957	AGCG	2	8	511123	511130	25 %	0 %	50 %	25 %	345008405
14202	NC_015957	GGA	2	6	511145	511150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008405
14203	NC_015957	CAC	2	6	511166	511171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008406
14204	NC_015957	GCA	2	6	511337	511342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008406
14205	NC_015957	GGC	3	9	511364	511372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008406
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14207	NC_015957	CGG	2	6	511394	511399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008406
14208	NC_015957	GGA	2	6	511421	511426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008406
14209	NC_015957	AAG	2	6	511431	511436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008406
14210	NC_015957	TCC	2	6	511474	511479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008406
14211	NC_015957	GC	3	6	511499	511504	0 %	0 %	50 %	50 %	345008406
14212	NC_015957	CGA	2	6	511514	511519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008406
14213	NC_015957	ACG	2	6	511606	511611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008406
14214	NC_015957	CA	3	6	511665	511670	50 %	0 %	0 %	50 %	345008406
14215	NC_015957	ATG	2	6	511686	511691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008406
14216	NC_015957	CTC	2	6	511814	511819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008406
14217	NC_015957	CAG	2	6	511845	511850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008406
14218	NC_015957	GAGCTG	2	12	511881	511892	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345008406
14219	NC_015957	CATGGT	2	12	511913	511924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345008406
14220	NC_015957	GCCCT	2	10	511932	511941	0 %	20 %	20 %	60 %	345008406
14221	NC_015957	GCC	2	6	511989	511994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008406
14222	NC_015957	GGC	4	12	512027	512038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008406
14223	NC_015957	CGACCG	2	12	512051	512062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345008406
14224	NC_015957	CG	3	6	512061	512066	0 %	0 %	50 %	50 %	345008406
14225	NC_015957	GC	3	6	512093	512098	0 %	0 %	50 %	50 %	345008406
14226	NC_015957	GAT	2	6	512108	512113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008406
14227	NC_015957	GCC	2	6	512207	512212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14228	NC_015957	CGG	2	6	512254	512259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14229	NC_015957	CGG	2	6	512283	512288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008407
14230	NC_015957	CCGC	2	8	512289	512296	0 %	0 %	25 %	75 %	345008407
14231	NC_015957	TCG	2	6	512324	512329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008407
14232	NC_015957	CG	3	6	512358	512363	0 %	0 %	50 %	50 %	345008407
14233	NC_015957	CTC	2	6	512407	512412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008407
14234	NC_015957	CCA	2	6	512428	512433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008407
14235	NC_015957	CAG	2	6	512443	512448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008407
14236	NC_015957	CAG	3	9	512479	512487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008407
14237	NC_015957	CAC	2	6	512524	512529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008407
14238	NC_015957	GAC	2	6	512584	512589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008407
14239	NC_015957	CTC	2	6	512590	512595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008407
14240	NC_015957	GC	3	6	512597	512602	0 %	0 %	50 %	50 %	345008407
14241	NC_015957	GCC	2	6	512613	512618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008407
14242	NC_015957	GCA	2	6	512619	512624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008407
14243	NC_015957	GC	3	6	512658	512663	0 %	0 %	50 %	50 %	345008407
14244	NC_015957	TCGGCG	2	12	512696	512707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008407
14245	NC_015957	GGT	2	6	512779	512784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008407
14246	NC_015957	GGC	2	6	512820	512825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008407
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14250	NC_015957	GCCC	2	8	512936	512943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14251	NC_015957	CGG	2	6	512951	512956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14252	NC_015957	GA	3	6	513044	513049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_015957	CGG	2	6	513165	513170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008408
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14297	NC_015957	CGA	2	6	514874	514879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008410
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14341	NC_015957	CGGGG	2	10	516428	516437	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14342	NC_015957	CAG	2	6	516484	516489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008411
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14345	NC_015957	CTC	2	6	516763	516768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008411
14346	NC_015957	GGCGC	2	10	516769	516778	0 %	0 %	60 %	40 %	345008411
14347	NC_015957	GCGTAC	2	12	516797	516808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345008411
14348	NC_015957	GGTCGA	2	12	516849	516860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345008411
14349	NC_015957	ACGCG	2	10	516871	516880	20 %	0 %	40 %	40 %	345008411
14350	NC_015957	CACCG	2	10	516904	516913	20 %	0 %	20 %	60 %	345008411
14351	NC_015957	TCC	3	9	516944	516952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008411
14352	NC_015957	CGG	3	9	516987	516995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008411
14353	NC_015957	CAG	2	6	517015	517020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008411
14354	NC_015957	TCC	2	6	517022	517027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008411
14355	NC_015957	CG	3	6	517045	517050	0 %	0 %	50 %	50 %	345008411
14356	NC_015957	AGCC	2	8	517124	517131	25 %	0 %	25 %	50 %	345008411
14357	NC_015957	CGG	2	6	517136	517141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008411
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14479	NC_015957	GCA	2	6	521450	521455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
14480	NC_015957	AGC	2	6	521482	521487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
14481	NC_015957	CCG	2	6	521585	521590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008413
14482	NC_015957	CAC	2	6	521622	521627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008413
14483	NC_015957	GAC	2	6	521637	521642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
14484	NC_015957	CAA	2	6	521711	521716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14485	NC_015957	CCT	2	6	521820	521825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008414
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14487	NC_015957	AGC	2	6	521849	521854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008414
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14499	NC_015957	GC	3	6	522089	522094	0 %	0 %	50 %	50 %	345008414
14500	NC_015957	GAGCC	2	10	522104	522113	20 %	0 %	40 %	40 %	345008414

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