MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 212652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
195501	NC_015953	GCCC	2	8	6814327	6814334	0 %	0 %	25 %	75 %	345003464
195502	NC_015953	CTC	2	6	6814367	6814372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003464
195503	NC_015953	GCA	2	6	6814426	6814431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003464
195504	NC_015953	GGT	2	6	6814478	6814483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345003464
195505	NC_015953	GCA	2	6	6814501	6814506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003464
195506	NC_015953	GCGCG	2	10	6814507	6814516	0 %	0 %	60 %	40 %	345003464
195507	NC_015953	TGG	2	6	6814594	6814599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345003464
195508	NC_015953	CTG	2	6	6814673	6814678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003464
195509	NC_015953	CCT	2	6	6814726	6814731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003464
195510	NC_015953	TGC	3	9	6814834	6814842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003464
195511	NC_015953	GT	3	6	6814849	6814854	0 %	50 %	50 %	0 %	345003464
195512	NC_015953	GC	3	6	6814882	6814887	0 %	0 %	50 %	50 %	345003464
195513	NC_015953	GCG	2	6	6814902	6814907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003464
195514	NC_015953	GATC	2	8	6815017	6815024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195515	NC_015953	AAG	2	6	6815027	6815032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195516	NC_015953	CGGGC	2	10	6815060	6815069	0 %	0 %	60 %	40 %	345003465
195517	NC_015953	GCA	2	6	6815104	6815109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195518	NC_015953	GCACC	2	10	6815122	6815131	20 %	0 %	20 %	60 %	345003465
195519	NC_015953	CACC	2	8	6815137	6815144	25 %	0 %	0 %	75 %	345003465
195520	NC_015953	GCA	3	9	6815161	6815169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195521	NC_015953	CGGCC	2	10	6815179	6815188	0 %	0 %	40 %	60 %	345003465
195522	NC_015953	C	6	6	6815194	6815199	0 %	0 %	0 %	100 %	345003465
195523	NC_015953	CGG	2	6	6815201	6815206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195524	NC_015953	CCG	2	6	6815212	6815217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003465
195525	NC_015953	TGC	2	6	6815227	6815232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195526	NC_015953	CCA	2	6	6815242	6815247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345003465
195527	NC_015953	CGT	3	9	6815248	6815256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195528	NC_015953	CCA	2	6	6815260	6815265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345003465
195529	NC_015953	GCACCC	2	12	6815281	6815292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345003465
195530	NC_015953	GCA	2	6	6815341	6815346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195531	NC_015953	AGC	2	6	6815373	6815378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195532	NC_015953	ACG	2	6	6815448	6815453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195533	NC_015953	TCC	2	6	6815460	6815465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003465
195534	NC_015953	CCGG	3	12	6815470	6815481	0 %	0 %	50 %	50 %	345003465
195535	NC_015953	CGC	2	6	6815498	6815503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003465
195536	NC_015953	GTC	2	6	6815528	6815533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195537	NC_015953	GCC	2	6	6815538	6815543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003465
195538	NC_015953	CGG	2	6	6815553	6815558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195539	NC_015953	GGT	2	6	6815575	6815580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345003465
195540	NC_015953	GCC	2	6	6815656	6815661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003465
195541	NC_015953	AGCC	2	8	6815697	6815704	25 %	0 %	25 %	50 %	345003465
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195543	NC_015953	CGG	2	6	6815722	6815727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195544	NC_015953	CAG	2	6	6815750	6815755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195545	NC_015953	CGCCC	2	10	6815762	6815771	0 %	0 %	20 %	80 %	345003465
195546	NC_015953	CCT	2	6	6815848	6815853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003465
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195549	NC_015953	CGG	2	6	6815950	6815955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195550	NC_015953	GC	4	8	6815981	6815988	0 %	0 %	50 %	50 %	345003465
195551	NC_015953	CGG	2	6	6815992	6815997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195552	NC_015953	CGG	2	6	6816060	6816065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003465
195553	NC_015953	CCT	2	6	6816073	6816078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003465
195554	NC_015953	CTC	2	6	6816086	6816091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003465
195555	NC_015953	CCG	2	6	6816098	6816103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003465
195556	NC_015953	GAC	2	6	6816110	6816115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003465
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195558	NC_015953	GC	3	6	6816139	6816144	0 %	0 %	50 %	50 %	345003465
195559	NC_015953	CGTG	2	8	6816162	6816169	0 %	25 %	50 %	25 %	345003465
195560	NC_015953	CAC	2	6	6816170	6816175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345003465
195561	NC_015953	TGC	2	6	6816217	6816222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003465
195562	NC_015953	GCA	2	6	6816279	6816284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195563	NC_015953	GCGCG	2	10	6816293	6816302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
195564	NC_015953	ATC	2	6	6816348	6816353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195565	NC_015953	GTCT	2	8	6816367	6816374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
195566	NC_015953	ATCTG	2	10	6816378	6816387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
195567	NC_015953	ACCCTC	2	12	6816396	6816407	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345003466
195568	NC_015953	CGG	2	6	6816427	6816432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003466
195569	NC_015953	TCG	2	6	6816442	6816447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003466
195570	NC_015953	GCC	2	6	6816633	6816638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003466
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195572	NC_015953	ATG	2	6	6816663	6816668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345003466
195573	NC_015953	CGA	2	6	6816677	6816682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003466
195574	NC_015953	CTG	2	6	6816711	6816716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003466
195575	NC_015953	CGG	2	6	6816724	6816729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003466
195576	NC_015953	CGGCG	2	10	6816744	6816753	0 %	0 %	60 %	40 %	345003466
195577	NC_015953	CG	3	6	6816759	6816764	0 %	0 %	50 %	50 %	345003466
195578	NC_015953	GCG	2	6	6816781	6816786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003466
195579	NC_015953	GCCG	2	8	6816791	6816798	0 %	0 %	50 %	50 %	345003466
195580	NC_015953	GC	3	6	6816812	6816817	0 %	0 %	50 %	50 %	345003466
195581	NC_015953	CGGA	2	8	6816820	6816827	25 %	0 %	50 %	25 %	345003466
195582	NC_015953	CGT	2	6	6816847	6816852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003466
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195584	NC_015953	CGGAC	2	10	6816876	6816885	20 %	0 %	40 %	40 %	345003466
195585	NC_015953	GC	3	6	6816907	6816912	0 %	0 %	50 %	50 %	345003466
195586	NC_015953	CGG	2	6	6816914	6816919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003466
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195588	NC_015953	CCG	2	6	6816976	6816981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003466
195589	NC_015953	TTC	2	6	6817020	6817025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345003466
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195591	NC_015953	TCC	2	6	6817120	6817125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003466
195592	NC_015953	GGGCC	2	10	6817139	6817148	0 %	0 %	60 %	40 %	345003466
195593	NC_015953	GGC	2	6	6817209	6817214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003466
195594	NC_015953	GCT	3	9	6817220	6817228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003466
195595	NC_015953	CCGG	2	8	6817245	6817252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
195596	NC_015953	CGC	2	6	6817253	6817258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
195597	NC_015953	AGC	2	6	6817274	6817279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195598	NC_015953	CCG	2	6	6817293	6817298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003467
195599	NC_015953	CCA	2	6	6817299	6817304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345003467
195600	NC_015953	CAG	2	6	6817315	6817320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195601	NC_015953	CAC	2	6	6817363	6817368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345003467
195602	NC_015953	CGA	2	6	6817401	6817406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195603	NC_015953	GAG	2	6	6817415	6817420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345003467
195604	NC_015953	GAC	2	6	6817444	6817449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195605	NC_015953	CGC	2	6	6817456	6817461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003467
195606	NC_015953	AGGAC	2	10	6817473	6817482	40 %	0 %	40 %	20 %	345003467
195607	NC_015953	GCC	2	6	6817491	6817496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003467
195608	NC_015953	CTG	2	6	6817517	6817522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195609	NC_015953	GCG	2	6	6817586	6817591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003467
195610	NC_015953	CGT	2	6	6817596	6817601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003467
195611	NC_015953	CCCGT	2	10	6817618	6817627	0 %	20 %	20 %	60 %	345003467
195612	NC_015953	CGGG	2	8	6817638	6817645	0 %	0 %	75 %	25 %	345003467
195613	NC_015953	GGGC	2	8	6817662	6817669	0 %	0 %	75 %	25 %	345003467
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195615	NC_015953	ACCG	2	8	6817746	6817753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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195945	NC_015953	GCA	2	6	6829432	6829437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345003474
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195950	NC_015953	TGTGCT	2	12	6829615	6829626	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345003474
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195954	NC_015953	GCC	2	6	6829736	6829741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
195955	NC_015953	CGA	2	6	6829791	6829796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195956	NC_015953	ACC	2	6	6829814	6829819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195957	NC_015953	TCC	2	6	6829863	6829868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003475
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195959	NC_015953	GTC	3	9	6830033	6830041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
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195962	NC_015953	TCG	2	6	6830088	6830093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
195963	NC_015953	GCC	3	9	6830106	6830114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345003475
195964	NC_015953	CTC	2	6	6830129	6830134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345003475
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195968	NC_015953	CGT	2	6	6830212	6830217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
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195988	NC_015953	TCG	2	6	6830790	6830795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
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195990	NC_015953	CGG	2	6	6830817	6830822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345003475
195991	NC_015953	GCT	2	6	6830839	6830844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
195992	NC_015953	ATG	2	6	6830933	6830938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345003475
195993	NC_015953	CTG	2	6	6830957	6830962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345003475
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195996	NC_015953	GCAC	2	8	6831136	6831143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
195997	NC_015953	CGG	2	6	6831180	6831185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
195998	NC_015953	TCC	2	6	6831199	6831204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195999	NC_015953	CGC	2	6	6831264	6831269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
196000	NC_015953	CGA	2	6	6831317	6831322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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