MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 212652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_015953	CGG	2	6	658690	658695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18503	NC_015953	GC	3	6	658809	658814	0 %	0 %	50 %	50 %	344998213
18504	NC_015953	CGG	2	6	658840	658845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18505	NC_015953	TCG	2	6	658876	658881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18506	NC_015953	CGG	2	6	658951	658956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18507	NC_015953	CTC	2	6	659033	659038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344998213
18508	NC_015953	CGG	2	6	659041	659046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18509	NC_015953	CGC	2	6	659051	659056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998213
18510	NC_015953	GCC	2	6	659058	659063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998213
18511	NC_015953	GTC	2	6	659066	659071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18512	NC_015953	TCT	2	6	659116	659121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344998213
18513	NC_015953	CCCG	2	8	659122	659129	0 %	0 %	25 %	75 %	344998213
18514	NC_015953	GAC	2	6	659192	659197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18515	NC_015953	CGA	2	6	659227	659232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18516	NC_015953	TCGGCC	2	12	659238	659249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344998213
18517	NC_015953	ATCCG	2	10	659274	659283	20 %	20 %	20 %	40 %	344998213
18518	NC_015953	CGG	2	6	659288	659293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18519	NC_015953	C	6	6	659389	659394	0 %	0 %	0 %	100 %	344998213
18520	NC_015953	GAG	2	6	659400	659405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344998213
18521	NC_015953	GGC	2	6	659426	659431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998213
18522	NC_015953	TCG	2	6	659439	659444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18523	NC_015953	CGT	2	6	659518	659523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998213
18524	NC_015953	GC	3	6	659534	659539	0 %	0 %	50 %	50 %	344998213
18525	NC_015953	TGG	2	6	659566	659571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998213
18526	NC_015953	TGG	2	6	659581	659586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998213
18527	NC_015953	AGG	2	6	659609	659614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_015953	GGC	3	9	659628	659636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18529	NC_015953	GGGCGT	2	12	659734	659745	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344998214
18530	NC_015953	CGGC	2	8	659759	659766	0 %	0 %	50 %	50 %	344998214
18531	NC_015953	GCC	2	6	659839	659844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998214
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18536	NC_015953	GCC	2	6	660004	660009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998214
18537	NC_015953	GCAC	2	8	660059	660066	25 %	0 %	25 %	50 %	344998214
18538	NC_015953	GCC	2	6	660068	660073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998214
18539	NC_015953	CGC	2	6	660088	660093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998214
18540	NC_015953	GCC	2	6	660141	660146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998214
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18542	NC_015953	GTC	2	6	660266	660271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998214
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18544	NC_015953	GGA	2	6	660319	660324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344998214
18545	NC_015953	TTCG	2	8	660336	660343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18546	NC_015953	GAG	2	6	660369	660374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_015953	GCG	2	6	660397	660402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18548	NC_015953	GCC	2	6	660430	660435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18549	NC_015953	CCGGA	2	10	660449	660458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18550	NC_015953	TACG	3	12	660500	660511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18551	NC_015953	GC	3	6	660515	660520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18552	NC_015953	GC	3	6	660536	660541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18553	NC_015953	TCCG	2	8	660628	660635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18554	NC_015953	ACG	2	6	660659	660664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998215
18555	NC_015953	CGG	2	6	660716	660721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998215
18556	NC_015953	CTA	2	6	660734	660739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344998215
18557	NC_015953	CGC	3	9	660740	660748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998215
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18559	NC_015953	TACC	2	8	660917	660924	25 %	25 %	0 %	50 %	344998215
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18561	NC_015953	CGGCG	2	10	660945	660954	0 %	0 %	60 %	40 %	344998215
18562	NC_015953	CGG	2	6	661040	661045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998215
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18564	NC_015953	CGAT	2	8	661093	661100	25 %	25 %	25 %	25 %	344998215
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18580	NC_015953	CG	3	6	661745	661750	0 %	0 %	50 %	50 %	344998215
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18591	NC_015953	CCA	2	6	662220	662225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18592	NC_015953	CGA	2	6	662226	662231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18593	NC_015953	GA	3	6	662230	662235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_015953	GCC	2	6	662286	662291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998216
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18602	NC_015953	CGACAT	2	12	662477	662488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344998216
18603	NC_015953	CCG	2	6	662497	662502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998216
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18605	NC_015953	TCC	2	6	662595	662600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344998216
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18608	NC_015953	AC	3	6	662801	662806	50 %	0 %	0 %	50 %	344998216
18609	NC_015953	CGC	2	6	662954	662959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18610	NC_015953	CGG	2	6	662966	662971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18611	NC_015953	CGA	2	6	662975	662980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18612	NC_015953	CGA	2	6	663015	663020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18613	NC_015953	GC	3	6	663063	663068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18614	NC_015953	CTC	3	9	663097	663105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344998217
18615	NC_015953	GGCA	2	8	663120	663127	25 %	0 %	50 %	25 %	344998217
18616	NC_015953	ACGG	2	8	663167	663174	25 %	0 %	50 %	25 %	344998217
18617	NC_015953	GCG	2	6	663181	663186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998217
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18621	NC_015953	CGC	2	6	663311	663316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998217
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18730	NC_015953	GCT	2	6	666752	666757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18732	NC_015953	CGG	2	6	666868	666873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18733	NC_015953	CCCGA	2	10	666900	666909	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18734	NC_015953	CGT	2	6	666935	666940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18735	NC_015953	CG	4	8	666942	666949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18736	NC_015953	CAT	2	6	666971	666976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18737	NC_015953	TCC	2	6	666989	666994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18738	NC_015953	CGA	2	6	666997	667002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18739	NC_015953	CCGT	2	8	667003	667010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18740	NC_015953	CGA	2	6	667038	667043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998219
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18986	NC_015953	GGT	2	6	675990	675995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998226
18987	NC_015953	TCC	2	6	676027	676032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344998226
18988	NC_015953	GCT	2	6	676035	676040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998226
18989	NC_015953	TTC	2	6	676042	676047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344998226
18990	NC_015953	CGG	4	12	676061	676072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998226
18991	NC_015953	GC	3	6	676134	676139	0 %	0 %	50 %	50 %	344998226
18992	NC_015953	CCG	2	6	676163	676168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998226
18993	NC_015953	GCCG	2	8	676182	676189	0 %	0 %	50 %	50 %	344998226
18994	NC_015953	GAC	2	6	676191	676196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998226
18995	NC_015953	GCT	2	6	676200	676205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998226
18996	NC_015953	GGC	2	6	676239	676244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998226
18997	NC_015953	GCGG	2	8	676251	676258	0 %	0 %	75 %	25 %	344998226
18998	NC_015953	CGG	3	9	676256	676264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998226
18999	NC_015953	TGG	2	6	676283	676288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998226
19000	NC_015953	CCG	2	6	676373	676378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998226

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