MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 212652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015953	GCGG	2	8	521843	521850	0 %	0 %	75 %	25 %	344998093
14502	NC_015953	CGG	2	6	521856	521861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998093
14503	NC_015953	TGG	2	6	521868	521873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998093
14504	NC_015953	CCG	2	6	521881	521886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14505	NC_015953	CGG	2	6	521932	521937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998094
14506	NC_015953	CGG	2	6	521944	521949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998094
14507	NC_015953	GCC	2	6	522000	522005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998094
14508	NC_015953	CGT	2	6	522010	522015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998094
14509	NC_015953	GACGGT	2	12	522017	522028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344998094
14510	NC_015953	CGG	2	6	522085	522090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998094
14511	NC_015953	GCC	2	6	522122	522127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998094
14512	NC_015953	G	6	6	522148	522153	0 %	0 %	100 %	0 %	344998094
14513	NC_015953	GC	3	6	522160	522165	0 %	0 %	50 %	50 %	344998094
14514	NC_015953	CAG	2	6	522287	522292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998094
14515	NC_015953	CGG	2	6	522295	522300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998094
14516	NC_015953	CGA	2	6	522310	522315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998094
14517	NC_015953	CAG	2	6	522323	522328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998094
14518	NC_015953	AGC	2	6	522408	522413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998094
14519	NC_015953	TGG	2	6	522427	522432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998094
14520	NC_015953	GGT	2	6	522490	522495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998094
14521	NC_015953	AGC	2	6	522507	522512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_015953	ACCGGC	2	12	522537	522548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14523	NC_015953	GCG	2	6	522560	522565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_015953	CG	3	6	522564	522569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14525	NC_015953	CGG	2	6	522640	522645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998095
14526	NC_015953	GAG	2	6	522656	522661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344998095
14527	NC_015953	GCG	2	6	522729	522734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998095
14528	NC_015953	CGG	2	6	522787	522792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998095
14529	NC_015953	ACG	2	6	522837	522842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998095
14530	NC_015953	CCG	2	6	522844	522849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998095
14531	NC_015953	CGGG	2	8	522853	522860	0 %	0 %	75 %	25 %	344998095
14532	NC_015953	CGC	2	6	522896	522901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998095
14533	NC_015953	GGGCA	2	10	522936	522945	20 %	0 %	60 %	20 %	344998095
14534	NC_015953	GGT	2	6	523007	523012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998095
14535	NC_015953	GCC	3	9	523040	523048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998095
14536	NC_015953	ACG	2	6	523083	523088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998095
14537	NC_015953	GGAC	2	8	523132	523139	25 %	0 %	50 %	25 %	344998095
14538	NC_015953	CGA	2	6	523153	523158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998095
14539	NC_015953	CCGG	2	8	523168	523175	0 %	0 %	50 %	50 %	344998095
14540	NC_015953	GC	4	8	523204	523211	0 %	0 %	50 %	50 %	344998095
14541	NC_015953	GAC	2	6	523263	523268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998095
14542	NC_015953	CCGCGG	2	12	523303	523314	0 %	0 %	50 %	50 %	344998095
14543	NC_015953	GTG	2	6	523397	523402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_015953	CGG	2	6	523410	523415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_015953	CGT	2	6	523439	523444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14546	NC_015953	GCT	3	9	523466	523474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14547	NC_015953	TTC	2	6	523485	523490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344998096
14548	NC_015953	GACC	2	8	523496	523503	25 %	0 %	25 %	50 %	344998096
14549	NC_015953	CGGTGG	2	12	523543	523554	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344998096
14550	NC_015953	GCC	2	6	523575	523580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998096
14551	NC_015953	TGC	2	6	523582	523587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14552	NC_015953	GCT	2	6	523604	523609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14553	NC_015953	CGA	2	6	523649	523654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14554	NC_015953	CGA	2	6	523661	523666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14555	NC_015953	GCG	2	6	523705	523710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998096
14556	NC_015953	GTG	2	6	523725	523730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344998096
14557	NC_015953	CGAACC	2	12	523739	523750	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344998096
14558	NC_015953	CGG	2	6	523800	523805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998096
14559	NC_015953	CTG	3	9	523821	523829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14560	NC_015953	CG	3	6	523878	523883	0 %	0 %	50 %	50 %	344998096
14561	NC_015953	GCGG	2	8	523920	523927	0 %	0 %	75 %	25 %	344998096
14562	NC_015953	GC	3	6	523950	523955	0 %	0 %	50 %	50 %	344998096
14563	NC_015953	CTT	2	6	524006	524011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344998096
14564	NC_015953	GGTG	2	8	524032	524039	0 %	25 %	75 %	0 %	344998096
14565	NC_015953	CGG	3	9	524059	524067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998096
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14568	NC_015953	GC	3	6	524090	524095	0 %	0 %	50 %	50 %	344998096
14569	NC_015953	CGC	2	6	524099	524104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998096
14570	NC_015953	CG	4	8	524109	524116	0 %	0 %	50 %	50 %	344998096
14571	NC_015953	CGA	2	6	524147	524152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14572	NC_015953	GCG	2	6	524179	524184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998096
14573	NC_015953	CTGG	2	8	524195	524202	0 %	25 %	50 %	25 %	344998096
14574	NC_015953	GCT	3	9	524303	524311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
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14578	NC_015953	CGC	2	6	524350	524355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998096
14579	NC_015953	TCG	2	6	524365	524370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14580	NC_015953	GGCG	2	8	524381	524388	0 %	0 %	75 %	25 %	344998096
14581	NC_015953	CCG	3	9	524392	524400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998096
14582	NC_015953	GGGC	2	8	524404	524411	0 %	0 %	75 %	25 %	344998096
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14585	NC_015953	CTGG	2	8	524477	524484	0 %	25 %	50 %	25 %	344998096
14586	NC_015953	CGC	2	6	524485	524490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998096
14587	NC_015953	TGC	2	6	524491	524496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998096
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14590	NC_015953	GCA	2	6	524543	524548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998096
14591	NC_015953	CCGGGG	2	12	524552	524563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998096
14592	NC_015953	CGTA	2	8	524580	524587	25 %	25 %	25 %	25 %	344998096
14593	NC_015953	GGC	2	6	524629	524634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_015953	GGC	2	6	524679	524684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14595	NC_015953	CGC	2	6	524740	524745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998097
14596	NC_015953	CGT	2	6	524765	524770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14597	NC_015953	GC	3	6	524786	524791	0 %	0 %	50 %	50 %	344998097
14598	NC_015953	CGC	2	6	524835	524840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998097
14599	NC_015953	GC	3	6	524981	524986	0 %	0 %	50 %	50 %	344998097
14600	NC_015953	GTC	2	6	524994	524999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14601	NC_015953	CGG	2	6	525018	525023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14602	NC_015953	ACG	2	6	525061	525066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14603	NC_015953	CGTC	2	8	525073	525080	0 %	25 %	25 %	50 %	344998097
14604	NC_015953	GC	3	6	525095	525100	0 %	0 %	50 %	50 %	344998097
14605	NC_015953	AGGTCG	3	18	525103	525120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344998097
14606	NC_015953	GCGT	2	8	525121	525128	0 %	25 %	50 %	25 %	344998097
14607	NC_015953	CCT	2	6	525248	525253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344998097
14608	NC_015953	GCG	2	6	525299	525304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14609	NC_015953	GCC	2	6	525316	525321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998097
14610	NC_015953	GCG	2	6	525347	525352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14611	NC_015953	CTG	2	6	525363	525368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14612	NC_015953	GCG	2	6	525373	525378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14613	NC_015953	GGC	2	6	525379	525384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998097
14614	NC_015953	GCT	2	6	525392	525397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14615	NC_015953	TCG	2	6	525406	525411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344998097
14616	NC_015953	GCC	2	6	525438	525443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344998097
14617	NC_015953	CGTA	2	8	525592	525599	25 %	25 %	25 %	25 %	344998097
14618	NC_015953	GGCC	2	8	525602	525609	0 %	0 %	50 %	50 %	344998097
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14984	NC_015953	CGG	2	6	538831	538836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344998106
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