MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 7345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	ACT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015951	CCTC	2	8	200	207	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015951	CTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015951	CAG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015951	CA	4	8	422	429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015951	ACA	2	6	445	450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015951	AT	3	6	482	487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015951	ACC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015951	CGGA	2	8	541	548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015951	CGG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007458
11	NC_015951	ACC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007458
12	NC_015951	CTG	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
13	NC_015951	CTG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
14	NC_015951	TGG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007458
15	NC_015951	CGT	3	9	835	843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015951	CGG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015951	GCG	2	6	853	858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015951	GC	3	6	894	899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015951	AGAT	2	8	911	918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015951	GCGG	2	8	981	988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015951	ATGC	2	8	993	1000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015951	GCG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015951	GCG	2	6	1131	1136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
24	NC_015951	CCG	3	9	1183	1191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007459
25	NC_015951	GCT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
26	NC_015951	GAA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007459
27	NC_015951	GGA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007459
28	NC_015951	CAGC	2	8	1308	1315	25 %	0 %	25 %	50 %	345007459
29	NC_015951	GC	3	6	1375	1380	0 %	0 %	50 %	50 %	345007459
30	NC_015951	CCA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007459
31	NC_015951	AGC	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
32	NC_015951	GCT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
33	NC_015951	AGCA	2	8	1504	1511	50 %	0 %	25 %	25 %	345007459
34	NC_015951	GCG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
35	NC_015951	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
36	NC_015951	GCT	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
37	NC_015951	TCG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
38	NC_015951	ACGC	2	8	1726	1733	25 %	0 %	25 %	50 %	345007460
39	NC_015951	CCGC	2	8	1771	1778	0 %	0 %	25 %	75 %	345007460
40	NC_015951	AGG	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007460
41	NC_015951	CGG	2	6	1787	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007460
42	NC_015951	GCC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
43	NC_015951	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
44	NC_015951	GCC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
45	NC_015951	ACC	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007460
46	NC_015951	CCG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
47	NC_015951	CG	3	6	2048	2053	0 %	0 %	50 %	50 %	345007460
48	NC_015951	CGACCC	2	12	2069	2080	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345007460
49	NC_015951	GGCT	3	12	2128	2139	0 %	25 %	50 %	25 %	345007460
50	NC_015951	AGG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015951	TGGCC	2	10	2232	2241	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015951	CGGAAC	2	12	2244	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015951	GGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015951	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015951	GTC	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
56	NC_015951	GTC	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
57	NC_015951	AG	3	6	2505	2510	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
58	NC_015951	TCCGC	2	10	2587	2596	0 %	20 %	20 %	60 %	345007461
59	NC_015951	AG	3	6	2619	2624	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
60	NC_015951	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007461
61	NC_015951	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
62	NC_015951	CTG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015951	TGC	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015951	AGC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015951	CTC	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015951	TGC	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015951	AGC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015951	AGCC	2	8	2856	2863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015951	TCA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015951	CG	3	6	2961	2966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015951	C	6	6	2989	2994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_015951	CTG	2	6	2999	3004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015951	ATCC	2	8	3090	3097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015951	CACCCC	2	12	3184	3195	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_015951	CCG	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015951	GAG	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007462
77	NC_015951	C	6	6	3319	3324	0 %	0 %	0 %	100 %	345007462
78	NC_015951	GCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
79	NC_015951	CCTAGC	2	12	3372	3383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007462
80	NC_015951	TCG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
81	NC_015951	TCT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007462
82	NC_015951	CCA	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
83	NC_015951	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007462
84	NC_015951	GTC	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
85	NC_015951	CCG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007462
86	NC_015951	TCG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
87	NC_015951	ACCG	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	345007462
88	NC_015951	TACC	2	8	3822	3829	25 %	25 %	0 %	50 %	345007462
89	NC_015951	CAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
90	NC_015951	ACC	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
91	NC_015951	CTGC	2	8	3886	3893	0 %	25 %	25 %	50 %	345007462
92	NC_015951	CGACCT	2	12	3921	3932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007462
93	NC_015951	CGG	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
94	NC_015951	GGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
95	NC_015951	GTT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007462
96	NC_015951	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
97	NC_015951	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
98	NC_015951	GCG	2	6	4183	4188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
99	NC_015951	CGG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
100	NC_015951	TCA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
101	NC_015951	CGG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
102	NC_015951	CGG	2	6	4269	4274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
103	NC_015951	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
104	NC_015951	GCG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
105	NC_015951	CGG	2	6	4449	4454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
106	NC_015951	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007462
107	NC_015951	GCG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015951	GA	3	6	4612	4617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015951	TGC	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015951	TG	3	6	4734	4739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015951	GGTCA	2	10	4740	4749	20 %	20 %	40 %	20 %	345007463
112	NC_015951	GAG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007463
113	NC_015951	GAT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007463
114	NC_015951	GTC	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007463
115	NC_015951	CGG	2	6	4944	4949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
116	NC_015951	CCGCGG	2	12	4982	4993	0 %	0 %	50 %	50 %	345007463
117	NC_015951	TTG	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007463
118	NC_015951	GCG	3	9	5029	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
119	NC_015951	GCG	2	6	5051	5056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
120	NC_015951	GGCG	2	8	5061	5068	0 %	0 %	75 %	25 %	345007463
121	NC_015951	GCCA	2	8	5099	5106	25 %	0 %	25 %	50 %	345007463
122	NC_015951	CG	3	6	5140	5145	0 %	0 %	50 %	50 %	345007463
123	NC_015951	GGCG	2	8	5190	5197	0 %	0 %	75 %	25 %	345007463
124	NC_015951	CCA	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007463
125	NC_015951	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007464
126	NC_015951	TCG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
127	NC_015951	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007464
128	NC_015951	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
129	NC_015951	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
130	NC_015951	GTC	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
131	NC_015951	CG	4	8	5678	5685	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
132	NC_015951	CGG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
133	NC_015951	AGG	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007464
134	NC_015951	GGTCGC	2	12	5843	5854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345007464
135	NC_015951	GGGT	2	8	5875	5882	0 %	25 %	75 %	0 %	345007464
136	NC_015951	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
137	NC_015951	AGT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
138	NC_015951	GTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
139	NC_015951	GGGC	2	8	6073	6080	0 %	0 %	75 %	25 %	345007464
140	NC_015951	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
141	NC_015951	CTT	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
142	NC_015951	GGTGTA	2	12	6147	6158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	345007464
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144	NC_015951	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
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169	NC_015951	GCG	2	6	6980	6985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_015951	GC	4	8	10506	10513	0 %	0 %	50 %	50 %	345007467
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267	NC_015951	GGCG	2	8	10663	10670	0 %	0 %	75 %	25 %	345007467
268	NC_015951	CAG	2	6	10672	10677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007467
269	NC_015951	AGC	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015951	TCAC	2	8	10832	10839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
271	NC_015951	AAG	2	6	10840	10845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015951	GCC	2	6	10848	10853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_015951	GT	3	6	10896	10901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015951	ACT	2	6	10907	10912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_015951	GT	3	6	10943	10948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015951	GAGC	3	12	10961	10972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_015951	GGCC	2	8	11637	11644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
296	NC_015951	CG	3	6	11647	11652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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301	NC_015951	GGC	2	6	11701	11706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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304	NC_015951	G	6	6	11801	11806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015951	CAG	2	6	11816	11821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_015951	GAG	2	6	11879	11884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
307	NC_015951	CAC	2	6	11904	11909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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