MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 7345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015951	CCGGC	2	10	198910	198919	0 %	0 %	40 %	60 %	345007630
5002	NC_015951	GGGTG	2	10	198940	198949	0 %	20 %	80 %	0 %	345007630
5003	NC_015951	CGC	2	6	199000	199005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5004	NC_015951	TCG	2	6	199056	199061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5005	NC_015951	TCGGTC	2	12	199119	199130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5006	NC_015951	CAG	2	6	199139	199144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5007	NC_015951	CGGT	2	8	199176	199183	0 %	25 %	50 %	25 %	345007630
5008	NC_015951	GGCA	2	8	199184	199191	25 %	0 %	50 %	25 %	345007630
5009	NC_015951	GCC	2	6	199192	199197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5010	NC_015951	CG	3	6	199203	199208	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5011	NC_015951	GCCAC	2	10	199312	199321	20 %	0 %	20 %	60 %	345007630
5012	NC_015951	GGC	2	6	199359	199364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5013	NC_015951	CCG	2	6	199434	199439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5014	NC_015951	CGA	2	6	199487	199492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5015	NC_015951	CAG	2	6	199505	199510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5016	NC_015951	GCC	2	6	199521	199526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5017	NC_015951	GCC	2	6	199557	199562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5018	NC_015951	TCGG	2	8	199622	199629	0 %	25 %	50 %	25 %	345007630
5019	NC_015951	CGG	3	9	199627	199635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5020	NC_015951	CAG	2	6	199673	199678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5021	NC_015951	GGCC	2	8	199807	199814	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5022	NC_015951	CGG	2	6	199921	199926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5023	NC_015951	GGC	2	6	199943	199948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5024	NC_015951	GCC	2	6	199992	199997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5025	NC_015951	GCA	2	6	200035	200040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5026	NC_015951	GGC	2	6	200083	200088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5027	NC_015951	GCC	2	6	200145	200150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5028	NC_015951	CGG	2	6	200188	200193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5029	NC_015951	TGG	2	6	200211	200216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
5030	NC_015951	TCC	2	6	200333	200338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
5031	NC_015951	GGTCC	2	10	200375	200384	0 %	20 %	40 %	40 %	345007630
5032	NC_015951	CTG	2	6	200405	200410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5033	NC_015951	TCA	2	6	200419	200424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007630
5034	NC_015951	GCA	2	6	200425	200430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5035	NC_015951	TCC	2	6	200481	200486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
5036	NC_015951	GCG	2	6	200492	200497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5037	NC_015951	GCGTCG	2	12	200505	200516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345007630
5038	NC_015951	CGGCC	2	10	200536	200545	0 %	0 %	40 %	60 %	345007630
5039	NC_015951	GGT	2	6	200553	200558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
5040	NC_015951	AGC	2	6	200574	200579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5041	NC_015951	GCG	2	6	200631	200636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5042	NC_015951	CCGG	2	8	200646	200653	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5043	NC_015951	CCGG	2	8	200656	200663	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5044	NC_015951	CGG	2	6	200729	200734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5045	NC_015951	CTC	2	6	200759	200764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
5046	NC_015951	AGC	2	6	200766	200771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5047	NC_015951	CGC	2	6	200791	200796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5048	NC_015951	GC	3	6	200799	200804	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5049	NC_015951	TCGC	2	8	200844	200851	0 %	25 %	25 %	50 %	345007630
5050	NC_015951	GCG	2	6	200907	200912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5051	NC_015951	TGG	2	6	200955	200960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
5052	NC_015951	GCGG	2	8	201005	201012	0 %	0 %	75 %	25 %	345007630
5053	NC_015951	TGG	2	6	201013	201018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
5054	NC_015951	GCA	2	6	201058	201063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5055	NC_015951	GCG	2	6	201066	201071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5056	NC_015951	CGC	2	6	201094	201099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5057	NC_015951	CAG	2	6	201110	201115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5058	NC_015951	GGC	2	6	201128	201133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5059	NC_015951	GTC	2	6	201182	201187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5060	NC_015951	TCG	2	6	201279	201284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5061	NC_015951	CAG	3	9	201320	201328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5062	NC_015951	CGG	2	6	201371	201376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5063	NC_015951	CGG	2	6	201406	201411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5064	NC_015951	GCG	2	6	201435	201440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5065	NC_015951	CG	3	6	201464	201469	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5066	NC_015951	CAG	2	6	201482	201487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5067	NC_015951	ACCG	2	8	201494	201501	25 %	0 %	25 %	50 %	345007630
5068	NC_015951	GTCCC	2	10	201536	201545	0 %	20 %	20 %	60 %	345007630
5069	NC_015951	CAG	2	6	201581	201586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5070	NC_015951	CG	3	6	201597	201602	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5071	NC_015951	GAGG	2	8	201608	201615	25 %	0 %	75 %	0 %	345007630
5072	NC_015951	CGG	2	6	201658	201663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5073	NC_015951	AGCG	2	8	201675	201682	25 %	0 %	50 %	25 %	345007630
5074	NC_015951	CCGCA	2	10	201695	201704	20 %	0 %	20 %	60 %	345007630
5075	NC_015951	CGA	2	6	201754	201759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
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5077	NC_015951	GCCACG	2	12	201801	201812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007630
5078	NC_015951	CAG	3	9	201821	201829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5079	NC_015951	CCG	2	6	201856	201861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
5080	NC_015951	GGT	2	6	201865	201870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
5081	NC_015951	AGCGC	2	10	201904	201913	20 %	0 %	40 %	40 %	345007630
5082	NC_015951	CGT	2	6	201943	201948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5083	NC_015951	ACG	2	6	201987	201992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5084	NC_015951	CGG	2	6	202013	202018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5085	NC_015951	GCG	2	6	202065	202070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5086	NC_015951	CAG	2	6	202100	202105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
5087	NC_015951	CGG	2	6	202123	202128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
5088	NC_015951	CCA	2	6	202141	202146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007630
5089	NC_015951	GCCG	2	8	202166	202173	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
5090	NC_015951	TCC	2	6	202178	202183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
5091	NC_015951	CG	3	6	202214	202219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_015951	GCG	2	6	202226	202231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015951	GCC	3	9	202291	202299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_015951	GTG	2	6	202300	202305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015951	CG	3	6	202377	202382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_015951	CGTT	2	8	202512	202519	0 %	50 %	25 %	25 %	345007631
5097	NC_015951	CCG	2	6	202551	202556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5098	NC_015951	GTC	2	6	202571	202576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5099	NC_015951	CGC	2	6	202877	202882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5100	NC_015951	ATC	2	6	202883	202888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007631
5101	NC_015951	GCG	2	6	202905	202910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007631
5102	NC_015951	CGC	2	6	202927	202932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5103	NC_015951	GGCGA	2	10	202940	202949	20 %	0 %	60 %	20 %	345007631
5104	NC_015951	GCT	2	6	203008	203013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5105	NC_015951	CCGGC	2	10	203071	203080	0 %	0 %	40 %	60 %	345007631
5106	NC_015951	CCT	2	6	203263	203268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
5107	NC_015951	ACG	2	6	203280	203285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5108	NC_015951	TCC	2	6	203289	203294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
5109	NC_015951	GCC	2	6	203330	203335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5110	NC_015951	TCA	2	6	203376	203381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007631
5111	NC_015951	TCG	2	6	203382	203387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5112	NC_015951	GCCC	2	8	203391	203398	0 %	0 %	25 %	75 %	345007631
5113	NC_015951	GCC	2	6	203420	203425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5114	NC_015951	TAC	2	6	203429	203434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007631
5115	NC_015951	GCC	3	9	203436	203444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5116	NC_015951	CTC	2	6	203464	203469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
5117	NC_015951	GTC	2	6	203483	203488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5118	NC_015951	AGA	2	6	203494	203499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007631
5119	NC_015951	ACC	2	6	203528	203533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007631
5120	NC_015951	TCG	2	6	203586	203591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5121	NC_015951	ACG	2	6	203601	203606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007631
5122	NC_015951	CGC	2	6	203609	203614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
5123	NC_015951	CCT	2	6	203628	203633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
5124	NC_015951	TGGA	2	8	203645	203652	25 %	25 %	50 %	0 %	345007631
5125	NC_015951	AGAA	2	8	203700	203707	75 %	0 %	25 %	0 %	345007631
5126	NC_015951	CTC	2	6	203729	203734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
5127	NC_015951	GC	3	6	203770	203775	0 %	0 %	50 %	50 %	345007631
5128	NC_015951	AGC	2	6	203797	203802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007631
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5130	NC_015951	CCT	2	6	203828	203833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007632
5131	NC_015951	GGCCC	2	10	203841	203850	0 %	0 %	40 %	60 %	345007632
5132	NC_015951	GCC	2	6	203878	203883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007632
5133	NC_015951	GCAC	2	8	203890	203897	25 %	0 %	25 %	50 %	345007632
5134	NC_015951	TCA	2	6	204017	204022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007632
5135	NC_015951	CCTA	2	8	204050	204057	25 %	25 %	0 %	50 %	345007632
5136	NC_015951	CGA	2	6	204078	204083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007632
5137	NC_015951	CGT	3	9	204105	204113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007632
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5139	NC_015951	CGA	2	6	204177	204182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007632
5140	NC_015951	CTC	2	6	204208	204213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007632
5141	NC_015951	TCG	2	6	204224	204229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007632
5142	NC_015951	CGA	2	6	204243	204248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007632
5143	NC_015951	GACC	2	8	204252	204259	25 %	0 %	25 %	50 %	345007632
5144	NC_015951	CCA	2	6	204344	204349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007632
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5150	NC_015951	CAGC	2	8	204525	204532	25 %	0 %	25 %	50 %	345007632
5151	NC_015951	GGC	2	6	204534	204539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007632
5152	NC_015951	C	6	6	204551	204556	0 %	0 %	0 %	100 %	345007632
5153	NC_015951	CTG	2	6	204563	204568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007632
5154	NC_015951	AGA	2	6	204575	204580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007632
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5157	NC_015951	GAC	2	6	204621	204626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007632
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5168	NC_015951	GTG	2	6	205181	205186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_015951	GGT	2	6	205208	205213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_015951	GTT	2	6	205232	205237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5171	NC_015951	CGG	2	6	205240	205245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5172	NC_015951	GT	3	6	205270	205275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_015951	GGCT	2	8	205287	205294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5174	NC_015951	GCA	2	6	205300	205305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5176	NC_015951	GCCC	2	8	205381	205388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5177	NC_015951	G	6	6	205497	205502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_015951	GCC	2	6	205536	205541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5179	NC_015951	G	6	6	205610	205615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5180	NC_015951	GCA	2	6	205651	205656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5181	NC_015951	ACG	2	6	205701	205706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5182	NC_015951	TGCCG	2	10	205761	205770	0 %	20 %	40 %	40 %	345007634
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5203	NC_015951	GCC	2	6	206612	206617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007635
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5225	NC_015951	GTCG	2	8	207570	207577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5226	NC_015951	TG	3	6	207603	207608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5227	NC_015951	GTG	2	6	207620	207625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_015951	CTG	2	6	207652	207657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5229	NC_015951	GGT	2	6	207701	207706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_015951	CAGCGT	2	12	207803	207814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5231	NC_015951	AGC	2	6	207848	207853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_015951	CGG	2	6	207855	207860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5233	NC_015951	CCG	2	6	207884	207889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5234	NC_015951	GCG	2	6	207917	207922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5235	NC_015951	CGG	2	6	207948	207953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_015951	GCA	2	6	207977	207982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5237	NC_015951	CGC	2	6	208003	208008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5238	NC_015951	CGC	2	6	208053	208058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5239	NC_015951	GTC	2	6	208129	208134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_015951	GAC	2	6	208147	208152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_015951	CGC	3	9	208155	208163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5242	NC_015951	GCCCT	2	10	208183	208192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5243	NC_015951	GTC	2	6	208198	208203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_015951	TGG	2	6	208213	208218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_015951	GCC	2	6	208222	208227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5246	NC_015951	GAT	2	6	208234	208239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_015951	CGG	2	6	208319	208324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007637
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5493	NC_015951	CCG	2	6	217046	217051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007641
5494	NC_015951	TCGG	2	8	217058	217065	0 %	25 %	50 %	25 %	345007641
5495	NC_015951	CGA	2	6	217074	217079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007641
5496	NC_015951	CAG	3	9	217081	217089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007641
5497	NC_015951	GC	3	6	217139	217144	0 %	0 %	50 %	50 %	345007641
5498	NC_015951	CCA	2	6	217260	217265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_015951	AGG	2	6	217275	217280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_015951	CGT	2	6	217320	217325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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