MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015947	TGG	2	6	689021	689026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
18002	NC_015947	GAA	2	6	689031	689036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344206022
18003	NC_015947	GATCGA	2	12	689079	689090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344206022
18004	NC_015947	TGG	2	6	689117	689122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
18005	NC_015947	CG	3	6	689125	689130	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
18006	NC_015947	G	6	6	689133	689138	0 %	0 %	100 %	0 %	344206022
18007	NC_015947	GAT	2	6	689230	689235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344206022
18008	NC_015947	CGG	2	6	689237	689242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206022
18009	NC_015947	GGT	2	6	689290	689295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
18010	NC_015947	GGT	2	6	689299	689304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
18011	NC_015947	CGC	3	9	689330	689338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206022
18012	NC_015947	GC	3	6	689461	689466	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
18013	NC_015947	GCA	2	6	689474	689479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206022
18014	NC_015947	TGT	2	6	689493	689498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344206022
18015	NC_015947	TGG	2	6	689499	689504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
18016	NC_015947	TCGA	2	8	689512	689519	25 %	25 %	25 %	25 %	344206022
18017	NC_015947	CCG	2	6	689559	689564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206022
18018	NC_015947	TGC	2	6	689571	689576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206022
18019	NC_015947	AGC	2	6	689611	689616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206022
18020	NC_015947	CGTG	2	8	689655	689662	0 %	25 %	50 %	25 %	344206022
18021	NC_015947	CGT	2	6	689816	689821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206022
18022	NC_015947	GC	3	6	689864	689869	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
18023	NC_015947	GCAGCT	2	12	689883	689894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344206022
18024	NC_015947	GTGGCA	2	12	690059	690070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344206022
18025	NC_015947	GTGG	2	8	690223	690230	0 %	25 %	75 %	0 %	344206022
18026	NC_015947	GGACC	2	10	690418	690427	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18027	NC_015947	CTG	2	6	690501	690506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18028	NC_015947	TCC	2	6	690524	690529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344206023
18029	NC_015947	CGC	2	6	690545	690550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206023
18030	NC_015947	TTC	2	6	690645	690650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344206023
18031	NC_015947	GTG	2	6	690651	690656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206023
18032	NC_015947	GC	3	6	690709	690714	0 %	0 %	50 %	50 %	344206023
18033	NC_015947	TGC	2	6	690715	690720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18034	NC_015947	CGC	3	9	690732	690740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206023
18035	NC_015947	TGC	2	6	690742	690747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18036	NC_015947	GCT	2	6	690761	690766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18037	NC_015947	CG	3	6	690813	690818	0 %	0 %	50 %	50 %	344206023
18038	NC_015947	GCTG	2	8	690881	690888	0 %	25 %	50 %	25 %	344206023
18039	NC_015947	CAG	2	6	690891	690896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18040	NC_015947	GGA	2	6	690959	690964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344206023
18041	NC_015947	GCT	2	6	690986	690991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18042	NC_015947	TTC	2	6	690993	690998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344206023
18043	NC_015947	GGC	2	6	691076	691081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206023
18044	NC_015947	GCAGGC	2	12	691085	691096	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344206023
18045	NC_015947	CTG	2	6	691119	691124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18046	NC_015947	TGC	2	6	691145	691150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18047	NC_015947	GCT	2	6	691157	691162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
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18049	NC_015947	CCGG	2	8	691189	691196	0 %	0 %	50 %	50 %	344206023
18050	NC_015947	GTG	2	6	691245	691250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206023
18051	NC_015947	TGCCGG	2	12	691270	691281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344206023
18052	NC_015947	CGC	2	6	691372	691377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206023
18053	NC_015947	TGC	3	9	691435	691443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18054	NC_015947	TGC	3	9	691489	691497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
18055	NC_015947	CGT	2	6	691513	691518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
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18057	NC_015947	GCCA	2	8	691571	691578	25 %	0 %	25 %	50 %	344206023
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18059	NC_015947	TGCGG	2	10	691614	691623	0 %	20 %	60 %	20 %	344206023
18060	NC_015947	GCG	2	6	691754	691759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206023
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18062	NC_015947	CGG	2	6	691786	691791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206023
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18067	NC_015947	TGC	2	6	691966	691971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
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18070	NC_015947	CAG	2	6	692028	692033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206023
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18073	NC_015947	TGA	2	6	692087	692092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344206023
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18079	NC_015947	GC	4	8	692261	692268	0 %	0 %	50 %	50 %	344206023
18080	NC_015947	GCTG	2	8	692291	692298	0 %	25 %	50 %	25 %	344206023
18081	NC_015947	TG	3	6	692318	692323	0 %	50 %	50 %	0 %	344206023
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18083	NC_015947	GCAG	2	8	692519	692526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18084	NC_015947	GC	3	6	692539	692544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18085	NC_015947	GGCTC	2	10	692559	692568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18086	NC_015947	GC	3	6	692578	692583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18087	NC_015947	CGG	2	6	692593	692598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206024
18088	NC_015947	CG	3	6	692650	692655	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18089	NC_015947	TCG	2	6	692658	692663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206024
18090	NC_015947	GGCCA	2	10	692707	692716	20 %	0 %	40 %	40 %	344206024
18091	NC_015947	CCAGCG	2	12	692745	692756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344206024
18092	NC_015947	GC	3	6	692787	692792	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18093	NC_015947	TCG	2	6	692801	692806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206024
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18098	NC_015947	CG	5	10	693024	693033	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18099	NC_015947	CGG	2	6	693075	693080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206024
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18102	NC_015947	GCA	2	6	693183	693188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206024
18103	NC_015947	GC	3	6	693199	693204	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18104	NC_015947	CAC	2	6	693229	693234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206024
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18106	NC_015947	GCG	2	6	693266	693271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206024
18107	NC_015947	GCATCG	2	12	693272	693283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344206024
18108	NC_015947	GGCC	2	8	693300	693307	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18109	NC_015947	CAG	2	6	693379	693384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206024
18110	NC_015947	GGTCA	2	10	693388	693397	20 %	20 %	40 %	20 %	344206024
18111	NC_015947	GCCGGT	2	12	693445	693456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344206024
18112	NC_015947	CCA	2	6	693462	693467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206024
18113	NC_015947	CG	4	8	693505	693512	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
18114	NC_015947	GCC	2	6	693514	693519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206024
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18119	NC_015947	TGC	2	6	693708	693713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206024
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18122	NC_015947	CGGC	2	8	693822	693829	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
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18243	NC_015947	CACC	2	8	697685	697692	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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18360	NC_015947	GGC	2	6	702624	702629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206034
18361	NC_015947	CGG	2	6	702630	702635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206034
18362	NC_015947	ACC	2	6	702658	702663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206034
18363	NC_015947	CGC	2	6	702736	702741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206034
18364	NC_015947	CG	3	6	702745	702750	0 %	0 %	50 %	50 %	344206034
18365	NC_015947	GACC	2	8	702753	702760	25 %	0 %	25 %	50 %	344206034
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18473	NC_015947	GGTGC	2	10	707439	707448	0 %	20 %	60 %	20 %	344206037
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18479	NC_015947	ATC	2	6	707649	707654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344206037
18480	NC_015947	CGT	2	6	707657	707662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206037
18481	NC_015947	GCT	2	6	707766	707771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206038
18482	NC_015947	ATC	2	6	707779	707784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344206038
18483	NC_015947	GTG	2	6	707803	707808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206038
18484	NC_015947	TGG	2	6	707810	707815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206038
18485	NC_015947	TGA	2	6	707834	707839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344206038
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