MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015947	GGCGG	2	10	648205	648214	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17002	NC_015947	CCAT	2	8	648265	648272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17003	NC_015947	TGTC	2	8	648383	648390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17004	NC_015947	GGGT	2	8	648490	648497	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_015947	ATGG	2	8	648521	648528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_015947	ACCC	2	8	648576	648583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17007	NC_015947	GTT	2	6	648720	648725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205989
17008	NC_015947	CG	4	8	648833	648840	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17009	NC_015947	GGT	2	6	648846	648851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205989
17010	NC_015947	CGC	2	6	648872	648877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205989
17011	NC_015947	GC	4	8	648897	648904	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17012	NC_015947	TGC	2	6	648938	648943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205989
17013	NC_015947	GC	3	6	648942	648947	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17014	NC_015947	GCA	2	6	649008	649013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205989
17015	NC_015947	CCG	2	6	649082	649087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205989
17016	NC_015947	CTG	2	6	649135	649140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205989
17017	NC_015947	CGG	2	6	649187	649192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205989
17018	NC_015947	CG	3	6	649221	649226	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17019	NC_015947	CGT	2	6	649228	649233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205989
17020	NC_015947	GGCC	2	8	649302	649309	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17021	NC_015947	GCG	2	6	649396	649401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205989
17022	NC_015947	GC	3	6	649464	649469	0 %	0 %	50 %	50 %	344205989
17023	NC_015947	GCA	2	6	649476	649481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205989
17024	NC_015947	CGTCC	2	10	649527	649536	0 %	20 %	20 %	60 %	344205989
17025	NC_015947	GCC	2	6	649569	649574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205990
17026	NC_015947	TCG	2	6	649576	649581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17027	NC_015947	GCA	2	6	649597	649602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17028	NC_015947	TGCC	2	8	649610	649617	0 %	25 %	25 %	50 %	344205990
17029	NC_015947	GCCA	2	8	649710	649717	25 %	0 %	25 %	50 %	344205990
17030	NC_015947	CG	3	6	649723	649728	0 %	0 %	50 %	50 %	344205990
17031	NC_015947	TCG	2	6	649735	649740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17032	NC_015947	CGC	3	9	649763	649771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205990
17033	NC_015947	CAA	2	6	649772	649777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205990
17034	NC_015947	TGGC	2	8	649806	649813	0 %	25 %	50 %	25 %	344205990
17035	NC_015947	TCA	2	6	649816	649821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205990
17036	NC_015947	CTGC	2	8	649889	649896	0 %	25 %	25 %	50 %	344205990
17037	NC_015947	CGA	2	6	649931	649936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17038	NC_015947	GCC	2	6	649945	649950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205990
17039	NC_015947	TGA	2	6	649966	649971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205990
17040	NC_015947	TGC	2	6	649972	649977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17041	NC_015947	CTG	2	6	650061	650066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17042	NC_015947	ATG	2	6	650067	650072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205990
17043	NC_015947	CG	3	6	650074	650079	0 %	0 %	50 %	50 %	344205990
17044	NC_015947	GGACCT	2	12	650132	650143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17045	NC_015947	GC	3	6	650150	650155	0 %	0 %	50 %	50 %	344205990
17046	NC_015947	GGT	2	6	650171	650176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205990
17047	NC_015947	TTC	2	6	650238	650243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205990
17048	NC_015947	GC	3	6	650318	650323	0 %	0 %	50 %	50 %	344205990
17049	NC_015947	GCT	2	6	650372	650377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205990
17050	NC_015947	CCG	2	6	650414	650419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17051	NC_015947	ATC	2	6	650443	650448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205991
17052	NC_015947	ATG	2	6	650485	650490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205991
17053	NC_015947	CCA	2	6	650502	650507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205991
17054	NC_015947	CGA	2	6	650586	650591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17055	NC_015947	ACC	2	6	650600	650605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205991
17056	NC_015947	GC	3	6	650724	650729	0 %	0 %	50 %	50 %	344205991
17057	NC_015947	GGT	2	6	650736	650741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205991
17058	NC_015947	CTG	2	6	650806	650811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17059	NC_015947	ATC	2	6	650815	650820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205991
17060	NC_015947	ACC	2	6	650842	650847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205991
17061	NC_015947	GCC	3	9	650948	650956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205991
17062	NC_015947	CTG	2	6	650983	650988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17063	NC_015947	GCT	2	6	650991	650996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17064	NC_015947	CG	3	6	651045	651050	0 %	0 %	50 %	50 %	344205991
17065	NC_015947	CGC	2	6	651065	651070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205991
17066	NC_015947	GGC	2	6	651141	651146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205991
17067	NC_015947	GC	3	6	651160	651165	0 %	0 %	50 %	50 %	344205991
17068	NC_015947	CAG	2	6	651322	651327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17069	NC_015947	GCA	2	6	651344	651349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205991
17070	NC_015947	ACT	2	6	651404	651409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205991
17071	NC_015947	CACC	2	8	651444	651451	25 %	0 %	0 %	75 %	344205991
17072	NC_015947	CGC	2	6	651473	651478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205991
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17077	NC_015947	CCGACA	2	12	651745	651756	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344205992
17078	NC_015947	CGG	2	6	651845	651850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205992
17079	NC_015947	GCC	2	6	651855	651860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205992
17080	NC_015947	GCTCA	2	10	651863	651872	20 %	20 %	20 %	40 %	344205992
17081	NC_015947	TCG	2	6	651886	651891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205992
17082	NC_015947	TGC	2	6	651928	651933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205992
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17084	NC_015947	GC	3	6	651952	651957	0 %	0 %	50 %	50 %	344205992
17085	NC_015947	CAG	2	6	651980	651985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205992
17086	NC_015947	GT	3	6	652019	652024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17087	NC_015947	AAGA	2	8	652090	652097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_015947	CGC	2	6	652161	652166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17089	NC_015947	GCC	2	6	652199	652204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_015947	TCC	2	6	652216	652221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17091	NC_015947	AAT	2	6	652289	652294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_015947	TCA	2	6	652302	652307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_015947	TCC	2	6	652414	652419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17094	NC_015947	GCC	2	6	652495	652500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205993
17095	NC_015947	GCC	2	6	652510	652515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205993
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17099	NC_015947	GCC	2	6	652751	652756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205993
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17101	NC_015947	TGCAGC	2	12	652793	652804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205993
17102	NC_015947	AAC	2	6	652816	652821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205993
17103	NC_015947	CTGGC	2	10	652850	652859	0 %	20 %	40 %	40 %	344205993
17104	NC_015947	ACT	2	6	652913	652918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205993
17105	NC_015947	TAC	2	6	652927	652932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205993
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17107	NC_015947	CAG	2	6	652965	652970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205993
17108	NC_015947	ATC	2	6	652984	652989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205993
17109	NC_015947	TCG	3	9	652999	653007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17110	NC_015947	GTA	2	6	653072	653077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_015947	GCT	3	9	653107	653115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205994
17112	NC_015947	GTG	2	6	653159	653164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205994
17113	NC_015947	GC	3	6	653198	653203	0 %	0 %	50 %	50 %	344205994
17114	NC_015947	GCG	2	6	653268	653273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205994
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17116	NC_015947	ACA	2	6	653292	653297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205994
17117	NC_015947	CGC	2	6	653319	653324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205994
17118	NC_015947	CG	4	8	653329	653336	0 %	0 %	50 %	50 %	344205994
17119	NC_015947	TCT	2	6	653370	653375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205994
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17121	NC_015947	GCC	2	6	653434	653439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205994
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17222	NC_015947	CCTG	2	8	657671	657678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17223	NC_015947	CTG	2	6	657721	657726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17235	NC_015947	CG	3	6	658218	658223	0 %	0 %	50 %	50 %	344205997
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17239	NC_015947	CG	3	6	658369	658374	0 %	0 %	50 %	50 %	344205997
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17481	NC_015947	CAG	2	6	667506	667511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206002
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