MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015947	GAT	2	6	610793	610798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_015947	GGTG	2	8	610855	610862	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_015947	CCG	2	6	610873	610878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_015947	TTGG	2	8	610894	610901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_015947	GCG	2	6	610915	610920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_015947	CG	3	6	610930	610935	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16007	NC_015947	GGCC	2	8	610947	610954	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16008	NC_015947	ACC	2	6	610997	611002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205965
16009	NC_015947	GC	5	10	611089	611098	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16010	NC_015947	CAG	2	6	611134	611139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16011	NC_015947	CGG	3	9	611160	611168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16012	NC_015947	CGG	2	6	611170	611175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16013	NC_015947	GCCA	2	8	611192	611199	25 %	0 %	25 %	50 %	344205965
16014	NC_015947	CCTG	2	8	611298	611305	0 %	25 %	25 %	50 %	344205965
16015	NC_015947	CGCAC	2	10	611339	611348	20 %	0 %	20 %	60 %	344205965
16016	NC_015947	TCGGCC	2	12	611375	611386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205965
16017	NC_015947	CGG	3	9	611409	611417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16018	NC_015947	CCAGGC	2	12	611451	611462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205965
16019	NC_015947	GCG	2	6	611463	611468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16020	NC_015947	TGA	2	6	611493	611498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205965
16021	NC_015947	GCA	2	6	611514	611519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16022	NC_015947	GCA	2	6	611523	611528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16023	NC_015947	CAG	2	6	611545	611550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16024	NC_015947	TCGGCG	2	12	611567	611578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205965
16025	NC_015947	CAG	2	6	611665	611670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16026	NC_015947	CGG	2	6	611706	611711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16027	NC_015947	GC	3	6	611725	611730	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16028	NC_015947	GCA	2	6	611780	611785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16029	NC_015947	TCA	2	6	611796	611801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205965
16030	NC_015947	TTG	2	6	611828	611833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205965
16031	NC_015947	GCG	2	6	611900	611905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16032	NC_015947	AGCGC	2	10	611913	611922	20 %	0 %	40 %	40 %	344205965
16033	NC_015947	GCA	2	6	611936	611941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16034	NC_015947	TCT	2	6	611979	611984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205965
16035	NC_015947	CCA	2	6	611985	611990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205965
16036	NC_015947	GCC	2	6	612007	612012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205965
16037	NC_015947	GAT	2	6	612052	612057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205965
16038	NC_015947	TCT	2	6	612096	612101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205965
16039	NC_015947	GC	3	6	612187	612192	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16040	NC_015947	AGA	3	9	612198	612206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205965
16041	NC_015947	CGA	2	6	612232	612237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16042	NC_015947	GAG	2	6	612317	612322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205965
16043	NC_015947	CAC	2	6	612358	612363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205965
16044	NC_015947	GTT	2	6	612376	612381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205965
16045	NC_015947	CGAC	2	8	612407	612414	25 %	0 %	25 %	50 %	344205965
16046	NC_015947	AGC	2	6	612417	612422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16047	NC_015947	GGC	2	6	612430	612435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16048	NC_015947	CAC	2	6	612464	612469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205965
16049	NC_015947	GGC	2	6	612474	612479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16050	NC_015947	TGT	2	6	612498	612503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205965
16051	NC_015947	CGG	2	6	612535	612540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16052	NC_015947	GTC	2	6	612592	612597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16053	NC_015947	GGTC	2	8	612615	612622	0 %	25 %	50 %	25 %	344205965
16054	NC_015947	CGC	2	6	612654	612659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205965
16055	NC_015947	GC	3	6	612733	612738	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16056	NC_015947	GCC	2	6	612788	612793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205965
16057	NC_015947	ATC	2	6	612812	612817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205965
16058	NC_015947	CGG	2	6	612932	612937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16059	NC_015947	GCA	2	6	612948	612953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16060	NC_015947	CAG	2	6	613021	613026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16061	NC_015947	GTG	2	6	613040	613045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205965
16062	NC_015947	CCG	3	9	613287	613295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205965
16063	NC_015947	TGC	2	6	613320	613325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16064	NC_015947	CGG	2	6	613335	613340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16065	NC_015947	GGC	2	6	613350	613355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16066	NC_015947	CTG	2	6	613384	613389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16067	NC_015947	ACC	2	6	613478	613483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205965
16068	NC_015947	GGT	2	6	613548	613553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205965
16069	NC_015947	CTG	2	6	613579	613584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16070	NC_015947	CGG	3	9	613621	613629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205965
16071	NC_015947	CAG	2	6	613630	613635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205965
16072	NC_015947	GGCC	2	8	613674	613681	0 %	0 %	50 %	50 %	344205965
16073	NC_015947	GGTC	2	8	613701	613708	0 %	25 %	50 %	25 %	344205965
16074	NC_015947	GC	3	6	613799	613804	0 %	0 %	50 %	50 %	344205966
16075	NC_015947	TCT	2	6	613809	613814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205966
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16077	NC_015947	GGC	2	6	613855	613860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205966
16078	NC_015947	CAGC	2	8	613864	613871	25 %	0 %	25 %	50 %	344205966
16079	NC_015947	GAA	2	6	613930	613935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205966
16080	NC_015947	CAG	2	6	613963	613968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205966
16081	NC_015947	CGG	2	6	614023	614028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205967
16082	NC_015947	CG	3	6	614062	614067	0 %	0 %	50 %	50 %	344205967
16083	NC_015947	TCG	2	6	614124	614129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205967
16084	NC_015947	CCT	3	9	614194	614202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205967
16085	NC_015947	CAG	2	6	614261	614266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205967
16086	NC_015947	GGCCTG	2	12	614282	614293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205967
16087	NC_015947	CGT	2	6	614326	614331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205967
16088	NC_015947	GC	3	6	614339	614344	0 %	0 %	50 %	50 %	344205967
16089	NC_015947	CAGG	2	8	614434	614441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_015947	CTGG	2	8	614466	614473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16091	NC_015947	GGCC	2	8	614478	614485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_015947	CAG	2	6	614538	614543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16093	NC_015947	GGC	2	6	614552	614557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
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16096	NC_015947	GCC	2	6	614679	614684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205968
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16099	NC_015947	CAG	2	6	614784	614789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16100	NC_015947	GTC	2	6	614802	614807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16101	NC_015947	TGCT	2	8	614809	614816	0 %	50 %	25 %	25 %	344205968
16102	NC_015947	CGG	2	6	614825	614830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
16103	NC_015947	TGG	2	6	614833	614838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205968
16104	NC_015947	CGGC	2	8	614888	614895	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968
16105	NC_015947	GGC	2	6	614936	614941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
16106	NC_015947	CGGA	2	8	614999	615006	25 %	0 %	50 %	25 %	344205968
16107	NC_015947	CCG	2	6	615038	615043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205968
16108	NC_015947	CAC	4	12	615045	615056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205968
16109	NC_015947	CGA	2	6	615089	615094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16110	NC_015947	GCC	2	6	615147	615152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205968
16111	NC_015947	CAG	2	6	615288	615293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16112	NC_015947	TCG	2	6	615325	615330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16113	NC_015947	CGT	2	6	615350	615355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
16114	NC_015947	AGT	2	6	615404	615409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205968
16115	NC_015947	CGG	2	6	615411	615416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
16116	NC_015947	CGG	2	6	615449	615454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
16117	NC_015947	TGGCC	2	10	615458	615467	0 %	20 %	40 %	40 %	344205968
16118	NC_015947	CGT	2	6	615485	615490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
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16120	NC_015947	CTT	3	9	615531	615539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205968
16121	NC_015947	AGC	2	6	615564	615569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
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16123	NC_015947	GC	3	6	615650	615655	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968
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16125	NC_015947	GC	4	8	615677	615684	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968
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16234	NC_015947	GGCAAG	2	12	619534	619545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344205972
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16237	NC_015947	TGC	2	6	619748	619753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205972
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16239	NC_015947	TGG	2	6	619793	619798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205972
16240	NC_015947	CG	3	6	619799	619804	0 %	0 %	50 %	50 %	344205972
16241	NC_015947	CGCC	2	8	619824	619831	0 %	0 %	25 %	75 %	344205972
16242	NC_015947	CG	3	6	619838	619843	0 %	0 %	50 %	50 %	344205972
16243	NC_015947	TCT	3	9	619925	619933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16244	NC_015947	CGC	2	6	619966	619971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205973
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16312	NC_015947	CG	3	6	622987	622992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16313	NC_015947	GA	3	6	623060	623065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16314	NC_015947	TCA	2	6	623093	623098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16316	NC_015947	GC	3	6	623159	623164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16317	NC_015947	CGG	2	6	623168	623173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16318	NC_015947	CGG	2	6	623178	623183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16319	NC_015947	CGGG	2	8	623235	623242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16320	NC_015947	CACC	2	8	623323	623330	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16321	NC_015947	A	6	6	623376	623381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16322	NC_015947	TCGCT	2	10	623399	623408	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16323	NC_015947	CGGC	2	8	623450	623457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16324	NC_015947	GGGT	2	8	623522	623529	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16325	NC_015947	ATGG	2	8	623553	623560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16326	NC_015947	ACCC	2	8	623608	623615	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16327	NC_015947	CTG	2	6	623634	623639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16328	NC_015947	GTTGCT	2	12	623651	623662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16329	NC_015947	CGG	2	6	623682	623687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16330	NC_015947	GCC	2	6	623697	623702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16331	NC_015947	ATG	2	6	623770	623775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205975
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16345	NC_015947	ATG	2	6	624364	624369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205975
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16349	NC_015947	CAG	2	6	624481	624486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205975
16350	NC_015947	GCA	2	6	624492	624497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205975
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16356	NC_015947	CGG	2	6	624861	624866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205975
16357	NC_015947	TGC	2	6	624867	624872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205975
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16482	NC_015947	GC	3	6	630006	630011	0 %	0 %	50 %	50 %	344205976
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