MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015947	GCG	2	6	569133	569138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205928
15003	NC_015947	ACC	2	6	569154	569159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205928
15004	NC_015947	CGG	2	6	569160	569165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205928
15005	NC_015947	TGA	2	6	569166	569171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205928
15006	NC_015947	CG	3	6	569191	569196	0 %	0 %	50 %	50 %	344205928
15007	NC_015947	GGA	2	6	569248	569253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205928
15008	NC_015947	CTGG	2	8	569340	569347	0 %	25 %	50 %	25 %	344205929
15009	NC_015947	GTT	2	6	569456	569461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205929
15010	NC_015947	TGT	2	6	569527	569532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205929
15011	NC_015947	TCG	2	6	569533	569538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205929
15012	NC_015947	TCC	2	6	569545	569550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205929
15013	NC_015947	CG	3	6	569577	569582	0 %	0 %	50 %	50 %	344205929
15014	NC_015947	AAG	2	6	569616	569621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205929
15015	NC_015947	TCA	2	6	569683	569688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205929
15016	NC_015947	GGT	2	6	569846	569851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205929
15017	NC_015947	GT	3	6	569854	569859	0 %	50 %	50 %	0 %	344205929
15018	NC_015947	CTG	2	6	569871	569876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205929
15019	NC_015947	TTC	2	6	569892	569897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205929
15020	NC_015947	TCCG	2	8	569923	569930	0 %	25 %	25 %	50 %	344205929
15021	NC_015947	ACG	2	6	569952	569957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205929
15022	NC_015947	ATC	2	6	569958	569963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205929
15023	NC_015947	TGG	2	6	570006	570011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205929
15024	NC_015947	GGCAG	2	10	570017	570026	20 %	0 %	60 %	20 %	344205929
15025	NC_015947	GCC	2	6	570030	570035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205929
15026	NC_015947	CTGC	2	8	570047	570054	0 %	25 %	25 %	50 %	344205929
15027	NC_015947	CTT	2	6	570144	570149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205930
15028	NC_015947	TCT	2	6	570160	570165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205930
15029	NC_015947	CAA	2	6	570197	570202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205930
15030	NC_015947	GC	4	8	570323	570330	0 %	0 %	50 %	50 %	344205930
15031	NC_015947	GTT	2	6	570396	570401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205930
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15033	NC_015947	CGG	2	6	570482	570487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205930
15034	NC_015947	TTG	2	6	570534	570539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205930
15035	NC_015947	GGT	2	6	570566	570571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205930
15036	NC_015947	GCG	2	6	570573	570578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205930
15037	NC_015947	GTC	2	6	570585	570590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205930
15038	NC_015947	GGT	2	6	570614	570619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205930
15039	NC_015947	CCCG	2	8	570630	570637	0 %	0 %	25 %	75 %	344205930
15040	NC_015947	CGG	2	6	570767	570772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205931
15041	NC_015947	GAG	2	6	570820	570825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205931
15042	NC_015947	ACC	2	6	570833	570838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205931
15043	NC_015947	CGG	2	6	570852	570857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205931
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15046	NC_015947	GGCA	2	8	570989	570996	25 %	0 %	50 %	25 %	344205931
15047	NC_015947	CTA	2	6	571026	571031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205931
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15049	NC_015947	CTG	2	6	571153	571158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
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15051	NC_015947	GAT	2	6	571414	571419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205931
15052	NC_015947	TGGT	2	8	571449	571456	0 %	50 %	50 %	0 %	344205931
15053	NC_015947	ATCC	2	8	571495	571502	25 %	25 %	0 %	50 %	344205931
15054	NC_015947	GCT	2	6	571503	571508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
15055	NC_015947	GCG	2	6	571550	571555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205931
15056	NC_015947	TCC	2	6	571560	571565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205931
15057	NC_015947	ATG	2	6	571586	571591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205931
15058	NC_015947	TCG	2	6	571616	571621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
15059	NC_015947	GCT	2	6	571635	571640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
15060	NC_015947	CTG	2	6	571654	571659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
15061	NC_015947	CTG	2	6	571669	571674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
15062	NC_015947	CGG	3	9	571677	571685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205931
15063	NC_015947	TCG	2	6	571700	571705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
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15069	NC_015947	CAG	2	6	571903	571908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205931
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15091	NC_015947	GGAC	2	8	572684	572691	25 %	0 %	50 %	25 %	344205932
15092	NC_015947	AAG	2	6	572709	572714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205932
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15102	NC_015947	TCAC	2	8	573140	573147	25 %	25 %	0 %	50 %	344205932
15103	NC_015947	TGGC	2	8	573200	573207	0 %	25 %	50 %	25 %	344205932
15104	NC_015947	ATG	2	6	573248	573253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205932
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15116	NC_015947	CGA	2	6	573612	573617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205933
15117	NC_015947	GCAC	2	8	573659	573666	25 %	0 %	25 %	50 %	344205933
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15119	NC_015947	GCC	2	6	573695	573700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205933
15120	NC_015947	ATC	2	6	573718	573723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205933
15121	NC_015947	CTG	2	6	573731	573736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205933
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15221	NC_015947	CG	3	6	578115	578120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15222	NC_015947	CAT	2	6	578165	578170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15223	NC_015947	GAT	2	6	578264	578269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15225	NC_015947	TGG	2	6	578403	578408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205935
15226	NC_015947	TGC	2	6	578424	578429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205935
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15229	NC_015947	GCGCG	2	10	578633	578642	0 %	0 %	60 %	40 %	344205935
15230	NC_015947	GCACTG	2	12	578657	578668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205935
15231	NC_015947	CGT	2	6	578680	578685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205935
15232	NC_015947	TC	3	6	578691	578696	0 %	50 %	0 %	50 %	344205935
15233	NC_015947	AGT	2	6	578701	578706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205935
15234	NC_015947	GGCC	2	8	578721	578728	0 %	0 %	50 %	50 %	344205935
15235	NC_015947	GGT	2	6	578767	578772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205935
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15239	NC_015947	TGGG	2	8	578948	578955	0 %	25 %	75 %	0 %	344205935
15240	NC_015947	G	6	6	578953	578958	0 %	0 %	100 %	0 %	344205935
15241	NC_015947	TGC	2	6	578991	578996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205935
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15243	NC_015947	TGGT	2	8	579148	579155	0 %	50 %	50 %	0 %	344205935
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15263	NC_015947	CGTC	2	8	579925	579932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15357	NC_015947	GGT	2	6	584120	584125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205939
15358	NC_015947	GTGCCT	2	12	584170	584181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15359	NC_015947	GGT	2	6	584262	584267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205939
15360	NC_015947	GGTC	2	8	584272	584279	0 %	25 %	50 %	25 %	344205939
15361	NC_015947	CG	3	6	584289	584294	0 %	0 %	50 %	50 %	344205939
15362	NC_015947	GAA	2	6	584315	584320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205939
15363	NC_015947	TGC	2	6	584324	584329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15364	NC_015947	GCA	2	6	584342	584347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15365	NC_015947	CAA	3	9	584387	584395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205939
15366	NC_015947	GCG	2	6	584430	584435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205939
15367	NC_015947	AGGC	2	8	584521	584528	25 %	0 %	50 %	25 %	344205939
15368	NC_015947	GAT	2	6	584549	584554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205939
15369	NC_015947	CGA	2	6	584573	584578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15370	NC_015947	CAT	2	6	584642	584647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205939
15371	NC_015947	TGGC	2	8	584731	584738	0 %	25 %	50 %	25 %	344205939
15372	NC_015947	AGC	2	6	584769	584774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15373	NC_015947	CGT	2	6	584792	584797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15374	NC_015947	CAGG	2	8	584837	584844	25 %	0 %	50 %	25 %	344205939
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15376	NC_015947	GCC	2	6	584937	584942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205939
15377	NC_015947	CG	3	6	584945	584950	0 %	0 %	50 %	50 %	344205939
15378	NC_015947	AGGT	2	8	585031	585038	25 %	25 %	50 %	0 %	344205939
15379	NC_015947	CAC	2	6	585066	585071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205939
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15381	NC_015947	TGCC	2	8	585138	585145	0 %	25 %	25 %	50 %	344205939
15382	NC_015947	GAT	2	6	585177	585182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205939
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15384	NC_015947	CGG	2	6	585230	585235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205939
15385	NC_015947	TGC	2	6	585297	585302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15386	NC_015947	CAG	2	6	585332	585337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15387	NC_015947	GC	3	6	585358	585363	0 %	0 %	50 %	50 %	344205939
15388	NC_015947	GAT	2	6	585365	585370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205939
15389	NC_015947	CAG	2	6	585429	585434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15390	NC_015947	CAG	2	6	585456	585461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205939
15391	NC_015947	TG	3	6	585478	585483	0 %	50 %	50 %	0 %	344205939
15392	NC_015947	GCAA	2	8	585493	585500	50 %	0 %	25 %	25 %	344205939
15393	NC_015947	TC	3	6	585555	585560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15394	NC_015947	CCA	2	6	585748	585753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205940
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15397	NC_015947	GAT	2	6	585887	585892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205940
15398	NC_015947	GC	3	6	585948	585953	0 %	0 %	50 %	50 %	344205940
15399	NC_015947	CGG	2	6	585964	585969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205940
15400	NC_015947	CGC	2	6	586024	586029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205940
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15403	NC_015947	CGA	2	6	586096	586101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205940
15404	NC_015947	GGCAG	2	10	586116	586125	20 %	0 %	60 %	20 %	344205940
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15410	NC_015947	CACG	2	8	586331	586338	25 %	0 %	25 %	50 %	344205940
15411	NC_015947	GGT	2	6	586358	586363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205940
15412	NC_015947	GCG	2	6	586411	586416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205940
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15417	NC_015947	TGGCGG	2	12	586582	586593	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344205940
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15419	NC_015947	TGC	2	6	586707	586712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205941
15420	NC_015947	CGGCG	2	10	586720	586729	0 %	0 %	60 %	40 %	344205941
15421	NC_015947	GGT	2	6	586735	586740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205941
15422	NC_015947	CGG	2	6	586752	586757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205941
15423	NC_015947	CTTGGC	2	12	586798	586809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205941
15424	NC_015947	ATG	2	6	586814	586819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205941
15425	NC_015947	TGA	2	6	586830	586835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205941
15426	NC_015947	GGT	2	6	586861	586866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205941
15427	NC_015947	ACC	2	6	586868	586873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205941
15428	NC_015947	GCGG	2	8	586974	586981	0 %	0 %	75 %	25 %	344205941
15429	NC_015947	CGT	3	9	587019	587027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205941
15430	NC_015947	GTGC	2	8	587090	587097	0 %	25 %	50 %	25 %	344205941
15431	NC_015947	TGG	2	6	587202	587207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205941
15432	NC_015947	CGCAGG	2	12	587240	587251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344205941
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15436	NC_015947	CTG	3	9	587603	587611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15437	NC_015947	CTG	2	6	587642	587647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15438	NC_015947	CAG	2	6	587707	587712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15439	NC_015947	GGC	2	6	587726	587731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205942
15440	NC_015947	GGGC	2	8	587823	587830	0 %	0 %	75 %	25 %	344205942
15441	NC_015947	GGTC	2	8	587875	587882	0 %	25 %	50 %	25 %	344205942
15442	NC_015947	CT	3	6	587923	587928	0 %	50 %	0 %	50 %	344205942
15443	NC_015947	GCT	3	9	588052	588060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15444	NC_015947	GGC	2	6	588168	588173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205942
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15446	NC_015947	CTG	2	6	588200	588205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15447	NC_015947	CTT	2	6	588236	588241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205942
15448	NC_015947	CAA	3	9	588292	588300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205942
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15451	NC_015947	GCC	2	6	588474	588479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205942
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15456	NC_015947	CTG	2	6	588746	588751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205942
15457	NC_015947	GCG	2	6	588791	588796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205942
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15459	NC_015947	GCC	2	6	588809	588814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205942
15460	NC_015947	CGG	2	6	588942	588947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205943
15461	NC_015947	GTC	2	6	589003	589008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205943
15462	NC_015947	GC	3	6	589106	589111	0 %	0 %	50 %	50 %	344205943
15463	NC_015947	CGCC	2	8	589116	589123	0 %	0 %	25 %	75 %	344205943
15464	NC_015947	CGC	2	6	589161	589166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205943
15465	NC_015947	TGG	2	6	589223	589228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205943
15466	NC_015947	CTG	2	6	589240	589245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205943
15467	NC_015947	CGTG	2	8	589251	589258	0 %	25 %	50 %	25 %	344205943
15468	NC_015947	ACT	2	6	589259	589264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205943
15469	NC_015947	GCCG	2	8	589275	589282	0 %	0 %	50 %	50 %	344205943
15470	NC_015947	CGA	2	6	589320	589325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205943
15471	NC_015947	GGC	2	6	589407	589412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205943
15472	NC_015947	ACC	2	6	589418	589423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205943
15473	NC_015947	GTGC	2	8	589426	589433	0 %	25 %	50 %	25 %	344205943
15474	NC_015947	CCA	2	6	589437	589442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205943
15475	NC_015947	ACC	2	6	589465	589470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205943
15476	NC_015947	CAA	2	6	589479	589484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205943
15477	NC_015947	GCTG	2	8	589539	589546	0 %	25 %	50 %	25 %	344205943
15478	NC_015947	CGG	2	6	589668	589673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205943
15479	NC_015947	GTG	2	6	589699	589704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205943
15480	NC_015947	CTG	2	6	589720	589725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205943
15481	NC_015947	GCC	2	6	589733	589738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205943
15482	NC_015947	CG	4	8	589739	589746	0 %	0 %	50 %	50 %	344205943
15483	NC_015947	GCA	2	6	589760	589765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205943
15484	NC_015947	CCG	2	6	589803	589808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205943
15485	NC_015947	GAA	2	6	589833	589838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205943
15486	NC_015947	CTGGG	2	10	589843	589852	0 %	20 %	60 %	20 %	344205943
15487	NC_015947	CAC	2	6	589965	589970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205943
15488	NC_015947	CAT	2	6	590009	590014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205944
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15490	NC_015947	AGCA	2	8	590064	590071	50 %	0 %	25 %	25 %	344205944
15491	NC_015947	GCT	2	6	590072	590077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205944
15492	NC_015947	GAT	2	6	590096	590101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205944
15493	NC_015947	CTA	2	6	590102	590107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205944
15494	NC_015947	ATC	2	6	590151	590156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205944
15495	NC_015947	GTT	2	6	590177	590182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205944
15496	NC_015947	CAG	2	6	590184	590189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205944
15497	NC_015947	CTG	2	6	590190	590195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205944
15498	NC_015947	TGGCC	2	10	590252	590261	0 %	20 %	40 %	40 %	344205944
15499	NC_015947	ACA	2	6	590323	590328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205944
15500	NC_015947	CCACGG	2	12	590333	590344	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205944

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