MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110501	NC_015947	AGA	2	6	4255896	4255901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209249
110502	NC_015947	GAA	2	6	4255998	4256003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209249
110503	NC_015947	GGA	2	6	4256064	4256069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110504	NC_015947	CCTG	3	12	4256144	4256155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110505	NC_015947	CCT	2	6	4256189	4256194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110506	NC_015947	TCC	3	9	4256220	4256228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110507	NC_015947	GATA	2	8	4256250	4256257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110508	NC_015947	GAA	3	9	4256315	4256323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110509	NC_015947	GAAAA	2	10	4256340	4256349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110510	NC_015947	CCAT	2	8	4256384	4256391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110511	NC_015947	GCG	2	6	4256450	4256455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110512	NC_015947	GC	3	6	4256475	4256480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110513	NC_015947	CTT	2	6	4256587	4256592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209250
110514	NC_015947	C	6	6	4256603	4256608	0 %	0 %	0 %	100 %	344209250
110515	NC_015947	AGGC	2	8	4256622	4256629	25 %	0 %	50 %	25 %	344209250
110516	NC_015947	GAT	2	6	4256641	4256646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209250
110517	NC_015947	CTG	2	6	4256660	4256665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209250
110518	NC_015947	AGT	2	6	4256692	4256697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209250
110519	NC_015947	GCC	2	6	4256779	4256784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209251
110520	NC_015947	TC	3	6	4256813	4256818	0 %	50 %	0 %	50 %	344209251
110521	NC_015947	ACC	2	6	4256833	4256838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209251
110522	NC_015947	ATG	2	6	4256878	4256883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209251
110523	NC_015947	GCT	2	6	4257070	4257075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209251
110524	NC_015947	TGC	2	6	4257200	4257205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209251
110525	NC_015947	C	6	6	4257208	4257213	0 %	0 %	0 %	100 %	344209251
110526	NC_015947	AGC	2	6	4257226	4257231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209251
110527	NC_015947	CTTG	2	8	4257277	4257284	0 %	50 %	25 %	25 %	344209251
110528	NC_015947	CAC	2	6	4257313	4257318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209251
110529	NC_015947	TGG	2	6	4257338	4257343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209251
110530	NC_015947	CCCAT	2	10	4257349	4257358	20 %	20 %	0 %	60 %	344209251
110531	NC_015947	ACT	2	6	4257363	4257368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209251
110532	NC_015947	TCT	2	6	4257418	4257423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209251
110533	NC_015947	GCCA	2	8	4257450	4257457	25 %	0 %	25 %	50 %	344209251
110534	NC_015947	CG	3	6	4257531	4257536	0 %	0 %	50 %	50 %	344209252
110535	NC_015947	CCG	2	6	4257563	4257568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209252
110536	NC_015947	GAA	2	6	4257603	4257608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209252
110537	NC_015947	CGTA	2	8	4257614	4257621	25 %	25 %	25 %	25 %	344209252
110538	NC_015947	ACC	2	6	4257664	4257669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209252
110539	NC_015947	AGC	2	6	4257804	4257809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110540	NC_015947	CTA	2	6	4257832	4257837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110541	NC_015947	TCA	2	6	4257883	4257888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110542	NC_015947	GAC	2	6	4257906	4257911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110543	NC_015947	AT	4	8	4257939	4257946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110544	NC_015947	T	6	6	4258096	4258101	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
110545	NC_015947	GCCCT	2	10	4258120	4258129	0 %	20 %	20 %	60 %	344209253
110546	NC_015947	T	6	6	4258232	4258237	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
110547	NC_015947	CCT	2	6	4258244	4258249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209253
110548	NC_015947	T	6	6	4258260	4258265	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
110549	NC_015947	C	6	6	4258320	4258325	0 %	0 %	0 %	100 %	344209253
110550	NC_015947	GGC	2	6	4258340	4258345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209253
110551	NC_015947	ACG	2	6	4258349	4258354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209253
110552	NC_015947	ATC	2	6	4258399	4258404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209253
110553	NC_015947	CAC	2	6	4258449	4258454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209253
110554	NC_015947	ATGG	2	8	4258490	4258497	25 %	25 %	50 %	0 %	344209253
110555	NC_015947	AAC	2	6	4258523	4258528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209253
110556	NC_015947	CTG	2	6	4258546	4258551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209253
110557	NC_015947	AGCGC	2	10	4258560	4258569	20 %	0 %	40 %	40 %	344209253
110558	NC_015947	ACACC	2	10	4258578	4258587	40 %	0 %	0 %	60 %	344209253
110559	NC_015947	TTG	2	6	4258637	4258642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209253
110560	NC_015947	GATC	2	8	4258674	4258681	25 %	25 %	25 %	25 %	344209253
110561	NC_015947	CG	3	6	4258686	4258691	0 %	0 %	50 %	50 %	344209253
110562	NC_015947	GAT	2	6	4258701	4258706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209253
110563	NC_015947	CCAG	2	8	4258776	4258783	25 %	0 %	25 %	50 %	344209253
110564	NC_015947	CTG	3	9	4258789	4258797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209253
110565	NC_015947	AGT	2	6	4258815	4258820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209253
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110567	NC_015947	CCGG	2	8	4258871	4258878	0 %	0 %	50 %	50 %	344209253
110568	NC_015947	GCA	2	6	4258884	4258889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209253
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110570	NC_015947	TGC	2	6	4258986	4258991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209253
110571	NC_015947	TGG	2	6	4258998	4259003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209253
110572	NC_015947	GC	3	6	4259026	4259031	0 %	0 %	50 %	50 %	344209253
110573	NC_015947	CACCG	2	10	4259123	4259132	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110574	NC_015947	CTGG	2	8	4259164	4259171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110575	NC_015947	TGA	2	6	4259244	4259249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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110577	NC_015947	CAA	2	6	4259423	4259428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110578	NC_015947	AGT	2	6	4259439	4259444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110579	NC_015947	C	6	6	4259464	4259469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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110581	NC_015947	TCA	2	6	4259613	4259618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209254
110582	NC_015947	CCA	2	6	4259624	4259629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209254
110583	NC_015947	GGT	2	6	4259635	4259640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209254
110584	NC_015947	GAA	2	6	4259653	4259658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209254
110585	NC_015947	TTA	2	6	4259724	4259729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209254
110586	NC_015947	TG	3	6	4259807	4259812	0 %	50 %	50 %	0 %	344209254
110587	NC_015947	CCCT	2	8	4259957	4259964	0 %	25 %	0 %	75 %	344209254
110588	NC_015947	GTAC	2	8	4260047	4260054	25 %	25 %	25 %	25 %	344209254
110589	NC_015947	TCCC	2	8	4260058	4260065	0 %	25 %	0 %	75 %	344209254
110590	NC_015947	AAC	2	6	4260135	4260140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209254
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110593	NC_015947	CCATCC	2	12	4260198	4260209	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	344209254
110594	NC_015947	TGC	2	6	4260250	4260255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209254
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110597	NC_015947	GAT	2	6	4260313	4260318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209254
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110599	NC_015947	CTG	3	9	4260401	4260409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209254
110600	NC_015947	AGT	2	6	4260427	4260432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209254
110601	NC_015947	TCG	2	6	4260453	4260458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209254
110602	NC_015947	CCGG	2	8	4260483	4260490	0 %	0 %	50 %	50 %	344209254
110603	NC_015947	GCA	2	6	4260496	4260501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209254
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110606	NC_015947	TGG	2	6	4260610	4260615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209254
110607	NC_015947	GC	3	6	4260638	4260643	0 %	0 %	50 %	50 %	344209254
110608	NC_015947	CGG	2	6	4260655	4260660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209254
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110612	NC_015947	GGC	2	6	4260796	4260801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209254
110613	NC_015947	CGT	2	6	4260808	4260813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209254
110614	NC_015947	CCG	2	6	4260832	4260837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209254
110615	NC_015947	TTC	2	6	4260849	4260854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209254
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