MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_015947	TGGA	2	8	4236194	4236201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110002	NC_015947	CACC	2	8	4236222	4236229	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110003	NC_015947	CGG	2	6	4236234	4236239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110004	NC_015947	CATC	2	8	4236275	4236282	25 %	25 %	0 %	50 %	344209233
110005	NC_015947	CCGG	2	8	4236287	4236294	0 %	0 %	50 %	50 %	344209233
110006	NC_015947	GGTG	2	8	4236347	4236354	0 %	25 %	75 %	0 %	344209233
110007	NC_015947	AC	3	6	4236359	4236364	50 %	0 %	0 %	50 %	344209233
110008	NC_015947	CAG	2	6	4236375	4236380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110009	NC_015947	TGT	2	6	4236398	4236403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209233
110010	NC_015947	CGA	2	6	4236468	4236473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110011	NC_015947	GC	3	6	4236537	4236542	0 %	0 %	50 %	50 %	344209233
110012	NC_015947	TTG	2	6	4236547	4236552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209233
110013	NC_015947	GGC	2	6	4236603	4236608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209233
110014	NC_015947	GCT	2	6	4236636	4236641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110015	NC_015947	TCG	2	6	4236652	4236657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110016	NC_015947	CGCCGA	2	12	4236713	4236724	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344209233
110017	NC_015947	CGA	2	6	4236821	4236826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110018	NC_015947	GCA	2	6	4236875	4236880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110019	NC_015947	CAG	2	6	4236909	4236914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110020	NC_015947	GC	3	6	4236936	4236941	0 %	0 %	50 %	50 %	344209233
110021	NC_015947	CCG	2	6	4236986	4236991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209233
110022	NC_015947	CGC	2	6	4237016	4237021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209233
110023	NC_015947	GCT	2	6	4237025	4237030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110024	NC_015947	CAGC	2	8	4237032	4237039	25 %	0 %	25 %	50 %	344209233
110025	NC_015947	TCG	2	6	4237165	4237170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110026	NC_015947	CAG	2	6	4237182	4237187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110027	NC_015947	TGC	2	6	4237201	4237206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110028	NC_015947	CGG	2	6	4237268	4237273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209233
110029	NC_015947	C	6	6	4237313	4237318	0 %	0 %	0 %	100 %	344209233
110030	NC_015947	GAT	2	6	4237334	4237339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209233
110031	NC_015947	TGGC	2	8	4237363	4237370	0 %	25 %	50 %	25 %	344209233
110032	NC_015947	CGG	2	6	4237373	4237378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209233
110033	NC_015947	GGC	2	6	4237458	4237463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209233
110034	NC_015947	GCA	2	6	4237499	4237504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209233
110035	NC_015947	GC	3	6	4237513	4237518	0 %	0 %	50 %	50 %	344209233
110036	NC_015947	GCG	2	6	4237527	4237532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209233
110037	NC_015947	GTA	2	6	4237799	4237804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209234
110038	NC_015947	GC	3	6	4237811	4237816	0 %	0 %	50 %	50 %	344209234
110039	NC_015947	TGG	2	6	4237909	4237914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110040	NC_015947	TGC	2	6	4237924	4237929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110041	NC_015947	GTTGTA	2	12	4237949	4237960	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344209234
110042	NC_015947	GGT	4	12	4238027	4238038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110043	NC_015947	AGT	2	6	4238056	4238061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209234
110044	NC_015947	TGCC	2	8	4238092	4238099	0 %	25 %	25 %	50 %	344209234
110045	NC_015947	CGGT	2	8	4238130	4238137	0 %	25 %	50 %	25 %	344209234
110046	NC_015947	TCC	2	6	4238220	4238225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209234
110047	NC_015947	GGC	2	6	4238278	4238283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209234
110048	NC_015947	GTG	2	6	4238325	4238330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110049	NC_015947	TGG	2	6	4238332	4238337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110050	NC_015947	TGC	2	6	4238443	4238448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110051	NC_015947	GCC	2	6	4238529	4238534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209234
110052	NC_015947	TGC	2	6	4238536	4238541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110053	NC_015947	CTGG	2	8	4238561	4238568	0 %	25 %	50 %	25 %	344209234
110054	NC_015947	GC	3	6	4238652	4238657	0 %	0 %	50 %	50 %	344209234
110055	NC_015947	CAC	2	6	4238683	4238688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209234
110056	NC_015947	GGCGTT	2	12	4238747	4238758	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344209234
110057	NC_015947	GGC	2	6	4238776	4238781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209234
110058	NC_015947	GGCCG	2	10	4238804	4238813	0 %	0 %	60 %	40 %	344209234
110059	NC_015947	TTC	2	6	4238832	4238837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209234
110060	NC_015947	ACG	2	6	4238866	4238871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110061	NC_015947	CGC	2	6	4238905	4238910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209234
110062	NC_015947	CCA	2	6	4238916	4238921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209234
110063	NC_015947	GGT	2	6	4239011	4239016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110064	NC_015947	GGT	3	9	4239029	4239037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209234
110065	NC_015947	CGG	2	6	4239147	4239152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209234
110066	NC_015947	ACGCG	2	10	4239341	4239350	20 %	0 %	40 %	40 %	344209234
110067	NC_015947	CGG	2	6	4239379	4239384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209234
110068	NC_015947	ATG	2	6	4239414	4239419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209234
110069	NC_015947	TGA	2	6	4239421	4239426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209234
110070	NC_015947	GCA	2	6	4239472	4239477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110071	NC_015947	GCC	2	6	4239522	4239527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209234
110072	NC_015947	GC	3	6	4239529	4239534	0 %	0 %	50 %	50 %	344209234
110073	NC_015947	AGC	2	6	4239546	4239551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110074	NC_015947	GC	3	6	4239550	4239555	0 %	0 %	50 %	50 %	344209234
110075	NC_015947	CGA	2	6	4239567	4239572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110076	NC_015947	CAC	2	6	4239665	4239670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209234
110077	NC_015947	ACG	2	6	4239673	4239678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209234
110078	NC_015947	CG	3	6	4239788	4239793	0 %	0 %	50 %	50 %	344209234
110079	NC_015947	TGGG	2	8	4239822	4239829	0 %	25 %	75 %	0 %	344209234
110080	NC_015947	CGC	2	6	4239830	4239835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209234
110081	NC_015947	CCG	2	6	4239844	4239849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209234
110082	NC_015947	CCT	2	6	4239885	4239890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209234
110083	NC_015947	AGG	2	6	4239912	4239917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110084	NC_015947	GGA	2	6	4239959	4239964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110085	NC_015947	ACA	2	6	4239992	4239997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110086	NC_015947	GC	3	6	4240010	4240015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110087	NC_015947	ACGC	2	8	4240137	4240144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110088	NC_015947	GCCGTT	4	24	4240169	4240192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209235
110089	NC_015947	GCCGTC	3	18	4240193	4240210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344209235
110090	NC_015947	GCCG	2	8	4240230	4240237	0 %	0 %	50 %	50 %	344209235
110091	NC_015947	GAAC	2	8	4240252	4240259	50 %	0 %	25 %	25 %	344209235
110092	NC_015947	GGC	2	6	4240265	4240270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209235
110093	NC_015947	ACC	2	6	4240275	4240280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209235
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110095	NC_015947	CAA	2	6	4240430	4240435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209235
110096	NC_015947	GC	3	6	4240507	4240512	0 %	0 %	50 %	50 %	344209235
110097	NC_015947	AAC	2	6	4240515	4240520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209235
110098	NC_015947	CAG	2	6	4240523	4240528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209235
110099	NC_015947	AGC	2	6	4240572	4240577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209235
110100	NC_015947	ATC	2	6	4240584	4240589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209235
110101	NC_015947	ATC	2	6	4240593	4240598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209235
110102	NC_015947	CGT	3	9	4240627	4240635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110103	NC_015947	TTG	2	6	4240676	4240681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110104	NC_015947	CCTG	2	8	4240733	4240740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110105	NC_015947	GGCA	2	8	4240793	4240800	25 %	0 %	50 %	25 %	344209236
110106	NC_015947	CGC	3	9	4240856	4240864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209236
110107	NC_015947	GGT	2	6	4240922	4240927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209236
110108	NC_015947	ACC	2	6	4241022	4241027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209236
110109	NC_015947	GCG	2	6	4241031	4241036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209236
110110	NC_015947	GGA	2	6	4241132	4241137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209236
110111	NC_015947	CTGC	2	8	4241146	4241153	0 %	25 %	25 %	50 %	344209236
110112	NC_015947	GGC	2	6	4241229	4241234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209236
110113	NC_015947	TGC	2	6	4241304	4241309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209236
110114	NC_015947	TGG	2	6	4241324	4241329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209236
110115	NC_015947	CGCTG	2	10	4241342	4241351	0 %	20 %	40 %	40 %	344209236
110116	NC_015947	GC	3	6	4241359	4241364	0 %	0 %	50 %	50 %	344209236
110117	NC_015947	GC	3	6	4241406	4241411	0 %	0 %	50 %	50 %	344209236
110118	NC_015947	TGG	2	6	4241419	4241424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209236
110119	NC_015947	CGG	2	6	4241432	4241437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209236
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110144	NC_015947	CTG	2	6	4242391	4242396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209237
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110209	NC_015947	CAG	2	6	4245397	4245402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209240
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110224	NC_015947	GCG	2	6	4245889	4245894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209240
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110227	NC_015947	CCG	2	6	4245963	4245968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209240
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110344	NC_015947	GCG	2	6	4250189	4250194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209245
110345	NC_015947	CCCA	2	8	4250195	4250202	25 %	0 %	0 %	75 %	344209245
110346	NC_015947	GGC	2	6	4250247	4250252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209245
110347	NC_015947	ACC	2	6	4250270	4250275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209245
110348	NC_015947	GTA	2	6	4250305	4250310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209245
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110351	NC_015947	AGGTCG	2	12	4250387	4250398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344209245
110352	NC_015947	GTC	2	6	4250437	4250442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209245
110353	NC_015947	CAG	2	6	4250506	4250511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209245
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110371	NC_015947	G	6	6	4251085	4251090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110372	NC_015947	GCCC	2	8	4251151	4251158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110373	NC_015947	CGGCG	2	10	4251172	4251181	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110374	NC_015947	AGT	2	6	4251215	4251220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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110376	NC_015947	TGC	2	6	4251291	4251296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110377	NC_015947	CG	3	6	4251317	4251322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110378	NC_015947	TCA	2	6	4251325	4251330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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110380	NC_015947	CTG	2	6	4251357	4251362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209246
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110446	NC_015947	GC	3	6	4253386	4253391	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
110447	NC_015947	TGG	2	6	4253396	4253401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209247
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110452	NC_015947	CAT	2	6	4253571	4253576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209247
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