MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015947	GC	3	6	383019	383024	0 %	0 %	50 %	50 %	344205752
10003	NC_015947	CAC	2	6	383054	383059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205752
10004	NC_015947	CG	3	6	383067	383072	0 %	0 %	50 %	50 %	344205752
10005	NC_015947	GAT	3	9	383129	383137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205752
10006	NC_015947	CCA	2	6	383167	383172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205752
10007	NC_015947	CGC	2	6	383185	383190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205752
10008	NC_015947	CAG	3	9	383201	383209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205752
10009	NC_015947	CGG	2	6	383236	383241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205752
10010	NC_015947	CAG	2	6	383255	383260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205752
10011	NC_015947	CAG	2	6	383276	383281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205752
10012	NC_015947	GCA	2	6	383323	383328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205752
10013	NC_015947	CCA	2	6	383351	383356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205752
10014	NC_015947	GGGT	2	8	383364	383371	0 %	25 %	75 %	0 %	344205752
10015	NC_015947	CCAG	2	8	383398	383405	25 %	0 %	25 %	50 %	344205752
10016	NC_015947	GCCA	2	8	383451	383458	25 %	0 %	25 %	50 %	344205752
10017	NC_015947	GCC	2	6	383496	383501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205752
10018	NC_015947	GGGA	2	8	383514	383521	25 %	0 %	75 %	0 %	344205752
10019	NC_015947	GAC	2	6	383548	383553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_015947	A	6	6	383592	383597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_015947	CGT	2	6	383651	383656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_015947	GC	3	6	383676	383681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_015947	GCCG	2	8	383698	383705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_015947	GGCGCA	2	12	383706	383717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_015947	GA	4	8	383743	383750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015947	CCA	2	6	383770	383775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205753
10027	NC_015947	CTG	2	6	383790	383795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205753
10028	NC_015947	GCC	3	9	383820	383828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205753
10029	NC_015947	CGC	3	9	383837	383845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205753
10030	NC_015947	CG	3	6	383883	383888	0 %	0 %	50 %	50 %	344205753
10031	NC_015947	CCA	2	6	383932	383937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205753
10032	NC_015947	TGC	2	6	383971	383976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205753
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10034	NC_015947	CGG	2	6	384062	384067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205753
10035	NC_015947	ACA	2	6	384130	384135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205753
10036	NC_015947	TGACC	2	10	384320	384329	20 %	20 %	20 %	40 %	344205753
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10040	NC_015947	CCG	2	6	384409	384414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205753
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10042	NC_015947	GCC	2	6	384441	384446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205753
10043	NC_015947	CAG	2	6	384459	384464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205753
10044	NC_015947	CCG	2	6	384481	384486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205753
10045	NC_015947	ACG	2	6	384610	384615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205753
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10047	NC_015947	GCCGCT	2	12	384660	384671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205753
10048	NC_015947	CACC	2	8	384740	384747	25 %	0 %	0 %	75 %	344205753
10049	NC_015947	GTC	3	9	384813	384821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205753
10050	NC_015947	TGC	2	6	384850	384855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205753
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10053	NC_015947	ACC	2	6	384957	384962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205753
10054	NC_015947	ACC	2	6	384993	384998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205753
10055	NC_015947	GCG	2	6	385144	385149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205753
10056	NC_015947	GGC	2	6	385157	385162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205753
10057	NC_015947	AGG	2	6	385212	385217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015947	CG	3	6	385221	385226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_015947	CTTT	2	8	385235	385242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_015947	AGCTGG	2	12	385352	385363	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205754
10061	NC_015947	TCGCCG	2	12	385373	385384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205754
10062	NC_015947	CTG	2	6	385393	385398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205754
10063	NC_015947	CAA	2	6	385407	385412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205754
10064	NC_015947	TGG	2	6	385423	385428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205754
10065	NC_015947	TCG	2	6	385436	385441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205754
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10069	NC_015947	GCTGG	2	10	385527	385536	0 %	20 %	60 %	20 %	344205754
10070	NC_015947	GCG	2	6	385550	385555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205754
10071	NC_015947	GC	3	6	385562	385567	0 %	0 %	50 %	50 %	344205754
10072	NC_015947	CTGG	2	8	385605	385612	0 %	25 %	50 %	25 %	344205754
10073	NC_015947	CGC	2	6	385613	385618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205754
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10085	NC_015947	TGG	3	9	385944	385952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205755
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10089	NC_015947	GCTG	2	8	386082	386089	0 %	25 %	50 %	25 %	344205755
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10092	NC_015947	TGCA	2	8	386150	386157	25 %	25 %	25 %	25 %	344205755
10093	NC_015947	TGA	2	6	386194	386199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205755
10094	NC_015947	GC	4	8	386353	386360	0 %	0 %	50 %	50 %	344205755
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10099	NC_015947	GC	4	8	386647	386654	0 %	0 %	50 %	50 %	344205755
10100	NC_015947	GCTG	2	8	386658	386665	0 %	25 %	50 %	25 %	344205755
10101	NC_015947	GGC	2	6	386743	386748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205755
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10104	NC_015947	GC	3	6	386778	386783	0 %	0 %	50 %	50 %	344205755
10105	NC_015947	CG	3	6	386811	386816	0 %	0 %	50 %	50 %	344205755
10106	NC_015947	GCA	3	9	386836	386844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205755
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10108	NC_015947	TGC	2	6	386889	386894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205755
10109	NC_015947	GCGG	2	8	386947	386954	0 %	0 %	75 %	25 %	344205755
10110	NC_015947	CGC	2	6	386976	386981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205755
10111	NC_015947	GGCTC	2	10	387027	387036	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10112	NC_015947	GAAGCA	2	12	387042	387053	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10113	NC_015947	A	6	6	387055	387060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_015947	T	6	6	387077	387082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_015947	TCACCG	2	12	387155	387166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344205756
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10121	NC_015947	GCC	2	6	387201	387206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205756
10122	NC_015947	GCC	2	6	387237	387242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205756
10123	NC_015947	ACC	2	6	387259	387264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205756
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10127	NC_015947	CGG	2	6	387524	387529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205756
10128	NC_015947	CGG	3	9	387536	387544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205756
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10130	NC_015947	GCGTCG	2	12	387601	387612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205756
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10140	NC_015947	CGG	2	6	387950	387955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205756
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10145	NC_015947	CGGC	2	8	388070	388077	0 %	0 %	50 %	50 %	344205756
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10151	NC_015947	GTA	2	6	388263	388268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205756
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10154	NC_015947	CGG	2	6	388379	388384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205756
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10201	NC_015947	G	6	6	390240	390245	0 %	0 %	100 %	0 %	344205756
10202	NC_015947	CAG	2	6	390264	390269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205756
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10205	NC_015947	GGT	2	6	390422	390427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10206	NC_015947	GT	3	6	390435	390440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10208	NC_015947	GCA	2	6	390504	390509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10209	NC_015947	GCTGCG	2	12	390639	390650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205757
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10228	NC_015947	GCCTG	2	10	391237	391246	0 %	20 %	40 %	40 %	344205758
10229	NC_015947	TC	3	6	391259	391264	0 %	50 %	0 %	50 %	344205758
10230	NC_015947	ATC	2	6	391269	391274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205758
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10233	NC_015947	ATC	2	6	391410	391415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205758
10234	NC_015947	GGCC	2	8	391432	391439	0 %	0 %	50 %	50 %	344205758
10235	NC_015947	GCC	2	6	391555	391560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205758
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10240	NC_015947	GCTGG	2	10	391727	391736	0 %	20 %	60 %	20 %	344205758
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10353	NC_015947	CTGTTC	2	12	395392	395403	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344205762
10354	NC_015947	GCAG	2	8	395423	395430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10355	NC_015947	GCC	2	6	395442	395447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205763
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10359	NC_015947	GTA	2	6	395577	395582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205763
10360	NC_015947	GACGAT	2	12	395604	395615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344205763
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10384	NC_015947	CGGC	2	8	396478	396485	0 %	0 %	50 %	50 %	344205765
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10478	NC_015947	CGT	2	6	399745	399750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205768
10479	NC_015947	CGG	2	6	399775	399780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205768
10480	NC_015947	GCC	2	6	399806	399811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205768
10481	NC_015947	TGC	2	6	399885	399890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205768
10482	NC_015947	CCG	2	6	399897	399902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205768
10483	NC_015947	CCG	2	6	399908	399913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205768
10484	NC_015947	GCCG	2	8	400073	400080	0 %	0 %	50 %	50 %	344205768
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