MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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104002	NC_015947	GC	3	6	4012491	4012496	0 %	0 %	50 %	50 %	344209020
104003	NC_015947	CAG	2	6	4012540	4012545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209020
104004	NC_015947	CGG	2	6	4012572	4012577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209020
104005	NC_015947	CGAAC	2	10	4012627	4012636	40 %	0 %	20 %	40 %	344209020
104006	NC_015947	CGCC	3	12	4012649	4012660	0 %	0 %	25 %	75 %	344209020
104007	NC_015947	GC	3	6	4012664	4012669	0 %	0 %	50 %	50 %	344209020
104008	NC_015947	CGT	2	6	4012689	4012694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209020
104009	NC_015947	GCG	2	6	4012757	4012762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209020
104010	NC_015947	GGT	2	6	4012780	4012785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209020
104011	NC_015947	GGCC	2	8	4012786	4012793	0 %	0 %	50 %	50 %	344209020
104012	NC_015947	CG	3	6	4012839	4012844	0 %	0 %	50 %	50 %	344209020
104013	NC_015947	GGC	2	6	4012921	4012926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209020
104014	NC_015947	GCT	2	6	4012993	4012998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209020
104015	NC_015947	GCCG	2	8	4012999	4013006	0 %	0 %	50 %	50 %	344209020
104016	NC_015947	GCC	2	6	4013024	4013029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209020
104017	NC_015947	CCT	2	6	4013031	4013036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209020
104018	NC_015947	ACA	2	6	4013103	4013108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209020
104019	NC_015947	CAT	2	6	4013119	4013124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209020
104020	NC_015947	TCC	2	6	4013126	4013131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209021
104021	NC_015947	GGCC	2	8	4013188	4013195	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104022	NC_015947	CGA	2	6	4013230	4013235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209021
104023	NC_015947	ATC	2	6	4013237	4013242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209021
104024	NC_015947	TGC	2	6	4013304	4013309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209021
104025	NC_015947	GC	3	6	4013311	4013316	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104026	NC_015947	GC	3	6	4013416	4013421	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104027	NC_015947	CG	3	6	4013476	4013481	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104028	NC_015947	CCG	3	9	4013554	4013562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209021
104029	NC_015947	TGGC	2	8	4013566	4013573	0 %	25 %	50 %	25 %	344209021
104030	NC_015947	GGC	2	6	4013596	4013601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209021
104031	NC_015947	GCG	2	6	4013631	4013636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209021
104032	NC_015947	CAG	3	9	4013666	4013674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209021
104033	NC_015947	CG	3	6	4013695	4013700	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104034	NC_015947	GAT	2	6	4013701	4013706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209021
104035	NC_015947	GGC	2	6	4013801	4013806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209021
104036	NC_015947	GC	3	6	4013845	4013850	0 %	0 %	50 %	50 %	344209021
104037	NC_015947	AGA	2	6	4013865	4013870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209021
104038	NC_015947	CAT	2	6	4013872	4013877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209021
104039	NC_015947	CCG	2	6	4013915	4013920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209021
104040	NC_015947	GC	4	8	4013984	4013991	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104041	NC_015947	CGA	2	6	4013995	4014000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104042	NC_015947	CAG	2	6	4014014	4014019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104043	NC_015947	CA	3	6	4014082	4014087	50 %	0 %	0 %	50 %	344209022
104044	NC_015947	ACC	2	6	4014099	4014104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209022
104045	NC_015947	CGGC	2	8	4014121	4014128	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104046	NC_015947	GCG	2	6	4014152	4014157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209022
104047	NC_015947	AAC	2	6	4014171	4014176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209022
104048	NC_015947	CAG	3	9	4014206	4014214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104049	NC_015947	CGC	2	6	4014233	4014238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209022
104050	NC_015947	CGT	2	6	4014250	4014255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104051	NC_015947	TTC	2	6	4014284	4014289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209022
104052	NC_015947	CCA	2	6	4014352	4014357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209022
104053	NC_015947	GAT	2	6	4014361	4014366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209022
104054	NC_015947	CGG	2	6	4014412	4014417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209022
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104057	NC_015947	GC	3	6	4014551	4014556	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104058	NC_015947	CAC	2	6	4014590	4014595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209022
104059	NC_015947	CAG	2	6	4014596	4014601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
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104061	NC_015947	AC	3	6	4014619	4014624	50 %	0 %	0 %	50 %	344209022
104062	NC_015947	CGG	2	6	4014658	4014663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209022
104063	NC_015947	GGC	2	6	4014700	4014705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209022
104064	NC_015947	CAG	2	6	4014713	4014718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104065	NC_015947	CG	4	8	4014773	4014780	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104066	NC_015947	GCC	2	6	4014785	4014790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209022
104067	NC_015947	GC	3	6	4014874	4014879	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104068	NC_015947	CAC	2	6	4014905	4014910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209022
104069	NC_015947	CAC	2	6	4014956	4014961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209022
104070	NC_015947	GCCAG	2	10	4014997	4015006	20 %	0 %	40 %	40 %	344209022
104071	NC_015947	GGCC	2	8	4015021	4015028	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104072	NC_015947	CG	3	6	4015033	4015038	0 %	0 %	50 %	50 %	344209022
104073	NC_015947	CAG	2	6	4015046	4015051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104074	NC_015947	CAG	2	6	4015061	4015066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104075	NC_015947	AGC	3	9	4015074	4015082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209022
104076	NC_015947	GGCA	2	8	4015131	4015138	25 %	0 %	50 %	25 %	344209022
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104078	NC_015947	CTG	2	6	4015309	4015314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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104082	NC_015947	GCC	2	6	4015464	4015469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209023
104083	NC_015947	CAG	2	6	4015537	4015542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209023
104084	NC_015947	GCC	2	6	4015580	4015585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209023
104085	NC_015947	GCT	2	6	4015590	4015595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104087	NC_015947	CAG	3	9	4015642	4015650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209023
104088	NC_015947	TGC	2	6	4015652	4015657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209023
104089	NC_015947	CCA	2	6	4015668	4015673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209023
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104091	NC_015947	CAG	2	6	4015747	4015752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104099	NC_015947	CCA	2	6	4016149	4016154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209023
104100	NC_015947	GCA	2	6	4016163	4016168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104102	NC_015947	CAGGG	2	10	4016219	4016228	20 %	0 %	60 %	20 %	344209023
104103	NC_015947	TCG	2	6	4016259	4016264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104105	NC_015947	GCGCC	2	10	4016311	4016320	0 %	0 %	40 %	60 %	344209023
104106	NC_015947	CTG	2	6	4016323	4016328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104109	NC_015947	CAG	2	6	4016386	4016391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209023
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104232	NC_015947	CGGC	2	8	4020982	4020989	0 %	0 %	50 %	50 %	344209027
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104340	NC_015947	GCTG	2	8	4024844	4024851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104341	NC_015947	TAA	2	6	4024865	4024870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104342	NC_015947	CCCCT	2	10	4024967	4024976	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
104343	NC_015947	CTG	2	6	4024996	4025001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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