MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 44602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015760	AAG	2	6	86	91	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015760	T	8	8	122	129	0 %	100 %	0 %	0 %	340397868
4	NC_015760	ATT	2	6	181	186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397868
5	NC_015760	TCA	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397868
6	NC_015760	AACA	2	8	380	387	75 %	0 %	0 %	25 %	340397868
7	NC_015760	TGC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397868
8	NC_015760	TAGCTG	2	12	517	528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340397868
9	NC_015760	TATT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	340397868
10	NC_015760	GGA	2	6	567	572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397868
11	NC_015760	TGT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397868
12	NC_015760	TGA	2	6	755	760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397868
13	NC_015760	A	6	6	777	782	100 %	0 %	0 %	0 %	340397868
14	NC_015760	AAT	3	9	834	842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397868
15	NC_015760	CAC	2	6	943	948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340397868
16	NC_015760	TAA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397868
17	NC_015760	TCC	2	6	1010	1015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340397868
18	NC_015760	GCT	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397868
19	NC_015760	ATGG	2	8	1164	1171	25 %	25 %	50 %	0 %	340397868
20	NC_015760	GGA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397868
21	NC_015760	CTA	5	15	1580	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015760	ATA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015760	TAA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015760	CAT	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397869
25	NC_015760	TAA	2	6	1641	1646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397869
26	NC_015760	TCG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397869
27	NC_015760	TCT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397869
28	NC_015760	AGA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397869
29	NC_015760	ATTA	2	8	1824	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	340397869
30	NC_015760	GTA	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397869
31	NC_015760	TGT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397869
32	NC_015760	GAA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397869
33	NC_015760	GCA	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397869
34	NC_015760	GTC	2	6	2096	2101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397869
35	NC_015760	GCCAAC	2	12	2180	2191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340397869
36	NC_015760	TGT	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397869
37	NC_015760	GAT	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397869
38	NC_015760	TCT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397869
39	NC_015760	CAAAT	2	10	2306	2315	60 %	20 %	0 %	20 %	340397869
40	NC_015760	TTTC	2	8	2336	2343	0 %	75 %	0 %	25 %	340397869
41	NC_015760	CAACC	2	10	2610	2619	40 %	0 %	0 %	60 %	340397869
42	NC_015760	TTTCA	2	10	2670	2679	20 %	60 %	0 %	20 %	340397869
43	NC_015760	CAG	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397869
44	NC_015760	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015760	AG	3	6	2799	2804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015760	TGAAA	2	10	2835	2844	60 %	20 %	20 %	0 %	340397870
47	NC_015760	A	6	6	2842	2847	100 %	0 %	0 %	0 %	340397870
48	NC_015760	A	7	7	2877	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	340397870
49	NC_015760	AATG	2	8	2887	2894	50 %	25 %	25 %	0 %	340397870
50	NC_015760	ATG	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397870
51	NC_015760	GTC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397870
52	NC_015760	AAG	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397870
53	NC_015760	TA	3	6	3020	3025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015760	TCT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015760	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015760	AAAT	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015760	CAG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397871
58	NC_015760	GCT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397871
59	NC_015760	ACTG	2	8	3371	3378	25 %	25 %	25 %	25 %	340397871
60	NC_015760	TTA	2	6	3382	3387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397871
61	NC_015760	GAT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
62	NC_015760	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	340397871
63	NC_015760	AAAGAT	2	12	3687	3698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340397871
64	NC_015760	TTC	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397871
65	NC_015760	AGA	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
66	NC_015760	GATT	2	8	3767	3774	25 %	50 %	25 %	0 %	340397871
67	NC_015760	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	340397871
68	NC_015760	ACA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397871
69	NC_015760	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
70	NC_015760	TGA	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
71	NC_015760	CAAA	2	8	3893	3900	75 %	0 %	0 %	25 %	340397871
72	NC_015760	AGT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
73	NC_015760	GAA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
74	NC_015760	GAT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
75	NC_015760	CTTG	2	8	4061	4068	0 %	50 %	25 %	25 %	340397871
76	NC_015760	ACTT	2	8	4077	4084	25 %	50 %	0 %	25 %	340397871
77	NC_015760	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397871
78	NC_015760	GTGC	2	8	4104	4111	0 %	25 %	50 %	25 %	340397871
79	NC_015760	AGC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397871
80	NC_015760	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
81	NC_015760	TTA	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397871
82	NC_015760	GAA	2	6	4266	4271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
83	NC_015760	TGT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397871
84	NC_015760	CAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397871
85	NC_015760	A	6	6	4334	4339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015760	AAT	2	6	4397	4402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397872
87	NC_015760	TAG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397872
88	NC_015760	GAA	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397872
89	NC_015760	ATCT	2	8	4603	4610	25 %	50 %	0 %	25 %	340397872
90	NC_015760	TTA	2	6	4637	4642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397872
91	NC_015760	GGA	2	6	4655	4660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397872
92	NC_015760	CAG	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397872
93	NC_015760	GCC	2	6	4807	4812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340397872
94	NC_015760	GAT	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397872
95	NC_015760	GAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
96	NC_015760	TCA	2	6	4998	5003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
97	NC_015760	T	7	7	5205	5211	0 %	100 %	0 %	0 %	340397873
98	NC_015760	GAT	2	6	5215	5220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
99	NC_015760	GTA	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
100	NC_015760	TCTCG	2	10	5266	5275	0 %	40 %	20 %	40 %	340397873
101	NC_015760	T	6	6	5286	5291	0 %	100 %	0 %	0 %	340397873
102	NC_015760	GGA	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397873
103	NC_015760	TC	3	6	5469	5474	0 %	50 %	0 %	50 %	340397873
104	NC_015760	ACTG	2	8	5520	5527	25 %	25 %	25 %	25 %	340397873
105	NC_015760	T	6	6	5551	5556	0 %	100 %	0 %	0 %	340397873
106	NC_015760	GAGAT	2	10	5558	5567	40 %	20 %	40 %	0 %	340397873
107	NC_015760	GAT	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
108	NC_015760	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
109	NC_015760	GAG	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397873
110	NC_015760	TC	3	6	5800	5805	0 %	50 %	0 %	50 %	340397873
111	NC_015760	TGA	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
112	NC_015760	TCA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
113	NC_015760	CAGC	2	8	6007	6014	25 %	0 %	25 %	50 %	340397873
114	NC_015760	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
115	NC_015760	AGC	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397873
116	NC_015760	GAA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
117	NC_015760	GATTTA	2	12	6226	6237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340397873
118	NC_015760	TAG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
119	NC_015760	A	6	6	6361	6366	100 %	0 %	0 %	0 %	340397873
120	NC_015760	CGT	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
121	NC_015760	TGT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397873
122	NC_015760	ACT	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
123	NC_015760	TGC	2	6	6546	6551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
124	NC_015760	TC	3	6	6585	6590	0 %	50 %	0 %	50 %	340397873
125	NC_015760	GTAT	2	8	6594	6601	25 %	50 %	25 %	0 %	340397873
126	NC_015760	CGGA	2	8	6605	6612	25 %	0 %	50 %	25 %	340397873
127	NC_015760	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397873
128	NC_015760	ATG	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
129	NC_015760	AAGC	2	8	6672	6679	50 %	0 %	25 %	25 %	340397873
130	NC_015760	GAT	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
131	NC_015760	GAT	3	9	6757	6765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
132	NC_015760	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
133	NC_015760	TGC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
134	NC_015760	ATG	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
135	NC_015760	ACA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397873
136	NC_015760	A	6	6	7066	7071	100 %	0 %	0 %	0 %	340397873
137	NC_015760	ATT	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
138	NC_015760	CTG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
139	NC_015760	TGA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
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141	NC_015760	ATT	2	6	7324	7329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
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153	NC_015760	CT	3	6	8265	8270	0 %	50 %	0 %	50 %	340397873
154	NC_015760	TTC	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397873
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158	NC_015760	TAAG	2	8	8478	8485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015760	CTATA	2	10	8491	8500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015760	CTTTT	2	10	8514	8523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015760	A	7	7	8604	8610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015760	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015760	AAG	2	6	8713	8718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397874
164	NC_015760	A	6	6	8856	8861	100 %	0 %	0 %	0 %	340397874
165	NC_015760	AAG	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397874
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170	NC_015760	GAT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397875
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172	NC_015760	TTA	2	6	9274	9279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397875
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190	NC_015760	A	8	8	10158	10165	100 %	0 %	0 %	0 %	340397877
191	NC_015760	TTATCA	2	12	10166	10177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340397877
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223	NC_015760	A	7	7	11911	11917	100 %	0 %	0 %	0 %	340397878
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244	NC_015760	GGTAA	2	10	12770	12779	40 %	20 %	40 %	0 %	340397880
245	NC_015760	GTA	2	6	12804	12809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397880
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252	NC_015760	TACC	2	8	13034	13041	25 %	25 %	0 %	50 %	340397880
253	NC_015760	TTC	2	6	13061	13066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397880
254	NC_015760	ATG	2	6	13073	13078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397880
255	NC_015760	GGT	2	6	13085	13090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340397880
256	NC_015760	TCAA	2	8	13132	13139	50 %	25 %	0 %	25 %	340397880
257	NC_015760	GAA	3	9	13181	13189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397880
258	NC_015760	AGA	2	6	13192	13197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397880
259	NC_015760	TGCT	2	8	13308	13315	0 %	50 %	25 %	25 %	340397880
260	NC_015760	CTTT	2	8	13344	13351	0 %	75 %	0 %	25 %	340397880
261	NC_015760	TGTCGG	2	12	13384	13395	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340397880
262	NC_015760	AAG	2	6	13430	13435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397880
263	NC_015760	TAT	2	6	13447	13452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397880
264	NC_015760	TGA	2	6	13459	13464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397880
265	NC_015760	GTC	3	9	13479	13487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397880
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395	NC_015760	AT	3	6	20795	20800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_015760	GGA	2	6	20815	20820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
397	NC_015760	GCGT	2	8	20874	20881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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403	NC_015760	GTA	2	6	21340	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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