MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015732	TGT	2	6	2527754	2527759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500839
48502	NC_015732	TAG	2	6	2527788	2527793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500839
48503	NC_015732	TGC	2	6	2528038	2528043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500839
48504	NC_015732	TGCA	2	8	2528082	2528089	25 %	25 %	25 %	25 %	339500839
48505	NC_015732	TA	3	6	2528090	2528095	50 %	50 %	0 %	0 %	339500839
48506	NC_015732	GTT	2	6	2528097	2528102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500839
48507	NC_015732	TTTC	2	8	2528169	2528176	0 %	75 %	0 %	25 %	339500839
48508	NC_015732	AGT	2	6	2528286	2528291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500839
48509	NC_015732	TCA	2	6	2528312	2528317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500839
48510	NC_015732	TCT	2	6	2528457	2528462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500839
48511	NC_015732	AC	3	6	2528509	2528514	50 %	0 %	0 %	50 %	339500839
48512	NC_015732	ACCT	2	8	2528587	2528594	25 %	25 %	0 %	50 %	339500839
48513	NC_015732	CAT	2	6	2528595	2528600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500839
48514	NC_015732	TGT	2	6	2528714	2528719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500839
48515	NC_015732	GGGC	2	8	2528730	2528737	0 %	0 %	75 %	25 %	339500839
48516	NC_015732	AAT	2	6	2528750	2528755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500839
48517	NC_015732	TTC	2	6	2528800	2528805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500839
48518	NC_015732	GAG	2	6	2528818	2528823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500839
48519	NC_015732	TGA	2	6	2528882	2528887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500839
48520	NC_015732	GAA	2	6	2528895	2528900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500839
48521	NC_015732	CAT	2	6	2528925	2528930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500839
48522	NC_015732	CGT	2	6	2529053	2529058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500839
48523	NC_015732	GCC	2	6	2529062	2529067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500839
48524	NC_015732	AAT	2	6	2529093	2529098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500839
48525	NC_015732	AAT	2	6	2529119	2529124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500839
48526	NC_015732	CTT	2	6	2529204	2529209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500839
48527	NC_015732	CAGA	2	8	2529211	2529218	50 %	0 %	25 %	25 %	339500839
48528	NC_015732	TGC	2	6	2529229	2529234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500839
48529	NC_015732	AGG	2	6	2529254	2529259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500839
48530	NC_015732	CCG	2	6	2529406	2529411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500839
48531	NC_015732	TTC	2	6	2529508	2529513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500839
48532	NC_015732	TCT	2	6	2529696	2529701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500839
48533	NC_015732	GAA	2	6	2529750	2529755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500839
48534	NC_015732	TAC	2	6	2529816	2529821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48535	NC_015732	CAT	2	6	2529852	2529857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500840
48536	NC_015732	T	6	6	2530091	2530096	0 %	100 %	0 %	0 %	339500840
48537	NC_015732	GCA	2	6	2530148	2530153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48538	NC_015732	TGC	2	6	2530237	2530242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48539	NC_015732	C	6	6	2530280	2530285	0 %	0 %	0 %	100 %	339500840
48540	NC_015732	ACC	2	6	2530381	2530386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500840
48541	NC_015732	TGC	2	6	2530393	2530398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48542	NC_015732	GCC	2	6	2530450	2530455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500840
48543	NC_015732	AAT	3	9	2530465	2530473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500840
48544	NC_015732	CAA	2	6	2530509	2530514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500840
48545	NC_015732	CGA	2	6	2530524	2530529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48546	NC_015732	GAT	2	6	2530570	2530575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500840
48547	NC_015732	CTG	2	6	2530597	2530602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48548	NC_015732	CAG	2	6	2530722	2530727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500840
48549	NC_015732	CCG	2	6	2530752	2530757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500840
48550	NC_015732	GAA	2	6	2530858	2530863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500840
48551	NC_015732	T	6	6	2530874	2530879	0 %	100 %	0 %	0 %	339500840
48552	NC_015732	GCG	2	6	2530889	2530894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500840
48553	NC_015732	CAA	2	6	2530941	2530946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500840
48554	NC_015732	CCG	2	6	2530959	2530964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500840
48555	NC_015732	ACC	2	6	2530978	2530983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500840
48556	NC_015732	CAT	2	6	2530989	2530994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500840
48557	NC_015732	CCG	2	6	2531006	2531011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500840
48558	NC_015732	AGCC	2	8	2531084	2531091	25 %	0 %	25 %	50 %	339500840
48559	NC_015732	TAA	2	6	2531112	2531117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500840
48560	NC_015732	TAA	2	6	2531127	2531132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500840
48561	NC_015732	ATGC	2	8	2531188	2531195	25 %	25 %	25 %	25 %	339500840
48562	NC_015732	GATT	2	8	2531204	2531211	25 %	50 %	25 %	0 %	339500840
48563	NC_015732	TCT	2	6	2531268	2531273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48564	NC_015732	CAG	2	6	2531277	2531282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48565	NC_015732	ATG	2	6	2531296	2531301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48566	NC_015732	TTG	2	6	2531316	2531321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48567	NC_015732	AAGC	2	8	2531342	2531349	50 %	0 %	25 %	25 %	339500841
48568	NC_015732	CCAGTT	2	12	2531359	2531370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339500841
48569	NC_015732	AGGT	2	8	2531373	2531380	25 %	25 %	50 %	0 %	339500841
48570	NC_015732	TGA	2	6	2531443	2531448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500841
48571	NC_015732	TGA	2	6	2531655	2531660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500841
48572	NC_015732	CAG	2	6	2531676	2531681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500841
48573	NC_015732	TCA	2	6	2531805	2531810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500841
48574	NC_015732	CAT	2	6	2531896	2531901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500841
48575	NC_015732	CTA	2	6	2532001	2532006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500841
48576	NC_015732	TA	3	6	2532005	2532010	50 %	50 %	0 %	0 %	339500841
48577	NC_015732	TATT	2	8	2532063	2532070	25 %	75 %	0 %	0 %	339500841
48578	NC_015732	TGG	2	6	2532214	2532219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500841
48579	NC_015732	G	6	6	2532218	2532223	0 %	0 %	100 %	0 %	339500841
48580	NC_015732	CGG	3	9	2532247	2532255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500841
48581	NC_015732	TGA	2	6	2532360	2532365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500841
48582	NC_015732	CTGC	2	8	2532391	2532398	0 %	25 %	25 %	50 %	339500841
48583	NC_015732	GCC	2	6	2532407	2532412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500841
48584	NC_015732	TCT	2	6	2532477	2532482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500841
48585	NC_015732	GTT	2	6	2532568	2532573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500841
48586	NC_015732	CTGG	2	8	2532615	2532622	0 %	25 %	50 %	25 %	339500842
48587	NC_015732	GGC	2	6	2532633	2532638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500842
48588	NC_015732	GGC	2	6	2532645	2532650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500842
48589	NC_015732	GCT	2	6	2532687	2532692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500842
48590	NC_015732	CCA	2	6	2532917	2532922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500842
48591	NC_015732	CGG	2	6	2533112	2533117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500842
48592	NC_015732	ATA	2	6	2533123	2533128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500842
48593	NC_015732	CGT	2	6	2533264	2533269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500842
48594	NC_015732	C	6	6	2533274	2533279	0 %	0 %	0 %	100 %	339500842
48595	NC_015732	ATC	2	6	2533287	2533292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500842
48596	NC_015732	ATGT	2	8	2533344	2533351	25 %	50 %	25 %	0 %	339500842
48597	NC_015732	ATG	2	6	2533436	2533441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500843
48598	NC_015732	TCG	2	6	2533457	2533462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500843
48599	NC_015732	CGATA	2	10	2533549	2533558	40 %	20 %	20 %	20 %	339500843
48600	NC_015732	CCA	2	6	2533560	2533565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500843
48601	NC_015732	AT	3	6	2533725	2533730	50 %	50 %	0 %	0 %	339500843
48602	NC_015732	AAG	2	6	2533732	2533737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500843
48603	NC_015732	GCA	2	6	2533868	2533873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500843
48604	NC_015732	ATG	2	6	2534105	2534110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500843
48605	NC_015732	CCG	2	6	2534112	2534117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500843
48606	NC_015732	CGA	2	6	2534134	2534139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500843
48607	NC_015732	ACA	2	6	2534207	2534212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500843
48608	NC_015732	AAT	2	6	2534227	2534232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500843
48609	NC_015732	ACC	2	6	2534320	2534325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500843
48610	NC_015732	AGAACC	2	12	2534408	2534419	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339500843
48611	NC_015732	TCC	2	6	2534480	2534485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500843
48612	NC_015732	TCCGC	2	10	2534487	2534496	0 %	20 %	20 %	60 %	339500843
48613	NC_015732	AC	3	6	2534533	2534538	50 %	0 %	0 %	50 %	339500843
48614	NC_015732	A	6	6	2534560	2534565	100 %	0 %	0 %	0 %	339500843
48615	NC_015732	GATG	2	8	2534635	2534642	25 %	25 %	50 %	0 %	339500843
48616	NC_015732	CAGTAC	2	12	2534680	2534691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339500843
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48619	NC_015732	GATG	2	8	2534821	2534828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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48972	NC_015732	ACC	2	6	2554488	2554493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500862
48973	NC_015732	CGG	2	6	2554494	2554499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500862
48974	NC_015732	GCA	2	6	2554503	2554508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500862
48975	NC_015732	TCA	2	6	2554642	2554647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500862
48976	NC_015732	GAAG	2	8	2554652	2554659	50 %	0 %	50 %	0 %	339500862
48977	NC_015732	GCTT	2	8	2554847	2554854	0 %	50 %	25 %	25 %	339500862
48978	NC_015732	TCC	2	6	2554979	2554984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500862
48979	NC_015732	AGG	2	6	2555047	2555052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500862
48980	NC_015732	TCTA	2	8	2555133	2555140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48981	NC_015732	T	8	8	2555234	2555241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48982	NC_015732	AAG	2	6	2555394	2555399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48983	NC_015732	AAG	2	6	2555405	2555410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48984	NC_015732	A	6	6	2555421	2555426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48985	NC_015732	CAG	2	6	2555465	2555470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48986	NC_015732	CAGGTT	2	12	2555559	2555570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339500863
48987	NC_015732	TA	3	6	2555606	2555611	50 %	50 %	0 %	0 %	339500863
48988	NC_015732	AAAT	2	8	2555612	2555619	75 %	25 %	0 %	0 %	339500863
48989	NC_015732	ATC	2	6	2555650	2555655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500863
48990	NC_015732	TGC	2	6	2555711	2555716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500863
48991	NC_015732	ATC	2	6	2555788	2555793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500863
48992	NC_015732	GAAGTA	2	12	2555852	2555863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339500863
48993	NC_015732	CTC	2	6	2555912	2555917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500863
48994	NC_015732	TTC	2	6	2555997	2556002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500863
48995	NC_015732	TAAT	2	8	2556029	2556036	50 %	50 %	0 %	0 %	339500863
48996	NC_015732	TATTTT	2	12	2556048	2556059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339500863
48997	NC_015732	CAT	2	6	2556139	2556144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500863
48998	NC_015732	T	6	6	2556169	2556174	0 %	100 %	0 %	0 %	339500863
48999	NC_015732	GTA	2	6	2556176	2556181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500863
49000	NC_015732	ATA	2	6	2556215	2556220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500863

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