MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015732	GGACT	2	10	2866609	2866618	20 %	20 %	40 %	20 %	339501107
55002	NC_015732	TGG	2	6	2866732	2866737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501107
55003	NC_015732	TGAA	2	8	2866843	2866850	50 %	25 %	25 %	0 %	339501107
55004	NC_015732	GTA	2	6	2866872	2866877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501107
55005	NC_015732	TGA	2	6	2866903	2866908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501107
55006	NC_015732	GTA	2	6	2866965	2866970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501107
55007	NC_015732	AGA	2	6	2866988	2866993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501107
55008	NC_015732	CGC	2	6	2867030	2867035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501107
55009	NC_015732	AGT	2	6	2867048	2867053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501107
55010	NC_015732	GTAA	2	8	2867063	2867070	50 %	25 %	25 %	0 %	339501107
55011	NC_015732	GGT	2	6	2867078	2867083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501107
55012	NC_015732	ATT	2	6	2867093	2867098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501107
55013	NC_015732	GAT	2	6	2867102	2867107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501107
55014	NC_015732	GGT	2	6	2867168	2867173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501107
55015	NC_015732	ATT	2	6	2867228	2867233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501107
55016	NC_015732	TGG	2	6	2867251	2867256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501107
55017	NC_015732	CAC	3	9	2867335	2867343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501107
55018	NC_015732	C	6	6	2867364	2867369	0 %	0 %	0 %	100 %	339501107
55019	NC_015732	ATT	2	6	2867417	2867422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501107
55020	NC_015732	TTA	2	6	2867454	2867459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501107
55021	NC_015732	CGA	2	6	2867471	2867476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501107
55022	NC_015732	CTA	2	6	2867491	2867496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501107
55023	NC_015732	GAAG	2	8	2867508	2867515	50 %	0 %	50 %	0 %	339501107
55024	NC_015732	GCG	2	6	2867535	2867540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501107
55025	NC_015732	TTG	2	6	2867578	2867583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501107
55026	NC_015732	ATATAG	2	12	2867613	2867624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339501107
55027	NC_015732	ATTAAA	2	12	2867657	2867668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501107
55028	NC_015732	TGAA	2	8	2867669	2867676	50 %	25 %	25 %	0 %	339501107
55029	NC_015732	T	6	6	2867740	2867745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_015732	AGTA	2	8	2867751	2867758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55031	NC_015732	TCCA	2	8	2867801	2867808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55032	NC_015732	TTA	2	6	2867834	2867839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_015732	ACA	2	6	2867849	2867854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55034	NC_015732	ATT	2	6	2867868	2867873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55035	NC_015732	TAC	2	6	2867901	2867906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55036	NC_015732	GTC	2	6	2867929	2867934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501108
55037	NC_015732	GAT	2	6	2867935	2867940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501108
55038	NC_015732	A	6	6	2867964	2867969	100 %	0 %	0 %	0 %	339501108
55039	NC_015732	AGC	2	6	2868009	2868014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501108
55040	NC_015732	CAT	2	6	2868046	2868051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501108
55041	NC_015732	T	6	6	2868105	2868110	0 %	100 %	0 %	0 %	339501108
55042	NC_015732	TCA	2	6	2868152	2868157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501108
55043	NC_015732	CAT	2	6	2868222	2868227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501108
55044	NC_015732	ATC	2	6	2868271	2868276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501108
55045	NC_015732	AT	3	6	2868302	2868307	50 %	50 %	0 %	0 %	339501109
55046	NC_015732	ACA	2	6	2868396	2868401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501109
55047	NC_015732	AT	3	6	2868415	2868420	50 %	50 %	0 %	0 %	339501109
55048	NC_015732	GTG	2	6	2868451	2868456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501109
55049	NC_015732	AGA	2	6	2868476	2868481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501109
55050	NC_015732	TGA	3	9	2868533	2868541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501109
55051	NC_015732	GAA	2	6	2868603	2868608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501109
55052	NC_015732	TATCA	2	10	2868620	2868629	40 %	40 %	0 %	20 %	339501109
55053	NC_015732	CTA	2	6	2868634	2868639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501109
55054	NC_015732	CAT	2	6	2868689	2868694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501109
55055	NC_015732	AGAC	2	8	2868819	2868826	50 %	0 %	25 %	25 %	339501110
55056	NC_015732	GAA	2	6	2868830	2868835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501110
55057	NC_015732	TAT	2	6	2868858	2868863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501110
55058	NC_015732	GAT	2	6	2868871	2868876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501110
55059	NC_015732	GCC	2	6	2868965	2868970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501110
55060	NC_015732	CTT	2	6	2869020	2869025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501110
55061	NC_015732	TCTT	2	8	2869050	2869057	0 %	75 %	0 %	25 %	339501110
55062	NC_015732	GGA	2	6	2869079	2869084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501110
55063	NC_015732	ACT	2	6	2869123	2869128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501110
55064	NC_015732	TTA	2	6	2869175	2869180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501110
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55066	NC_015732	ATAA	2	8	2869313	2869320	75 %	25 %	0 %	0 %	339501110
55067	NC_015732	CTT	2	6	2869331	2869336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501110
55068	NC_015732	T	7	7	2869407	2869413	0 %	100 %	0 %	0 %	339501110
55069	NC_015732	AAC	2	6	2869422	2869427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501110
55070	NC_015732	TTCA	2	8	2869495	2869502	25 %	50 %	0 %	25 %	339501110
55071	NC_015732	ACAAA	2	10	2869525	2869534	80 %	0 %	0 %	20 %	339501110
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55083	NC_015732	ATT	2	6	2870435	2870440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501110
55084	NC_015732	GAT	2	6	2870453	2870458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501110
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55086	NC_015732	A	6	6	2870583	2870588	100 %	0 %	0 %	0 %	339501110
55087	NC_015732	A	6	6	2870645	2870650	100 %	0 %	0 %	0 %	339501110
55088	NC_015732	AAG	2	6	2870679	2870684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501110
55089	NC_015732	TAT	2	6	2870701	2870706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501110
55090	NC_015732	CTG	2	6	2870730	2870735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501110
55091	NC_015732	GTG	2	6	2870769	2870774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55092	NC_015732	TAT	2	6	2870805	2870810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501111
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55099	NC_015732	CTG	2	6	2871182	2871187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501111
55100	NC_015732	GCC	2	6	2871314	2871319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501111
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55102	NC_015732	GACC	2	8	2871361	2871368	25 %	0 %	25 %	50 %	339501111
55103	NC_015732	TC	3	6	2871400	2871405	0 %	50 %	0 %	50 %	339501111
55104	NC_015732	TGA	2	6	2871418	2871423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501111
55105	NC_015732	ATG	2	6	2871459	2871464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501111
55106	NC_015732	CGA	2	6	2871661	2871666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501111
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55108	NC_015732	ACC	2	6	2871746	2871751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501111
55109	NC_015732	AATA	2	8	2871789	2871796	75 %	25 %	0 %	0 %	339501111
55110	NC_015732	ACG	2	6	2871840	2871845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501112
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55113	NC_015732	CGGC	2	8	2872094	2872101	0 %	0 %	50 %	50 %	339501112
55114	NC_015732	CCA	2	6	2872134	2872139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501112
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55116	NC_015732	TGG	2	6	2872242	2872247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501112
55117	NC_015732	TGG	2	6	2872328	2872333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501112
55118	NC_015732	GCCA	2	8	2872369	2872376	25 %	0 %	25 %	50 %	339501112
55119	NC_015732	CCA	2	6	2872446	2872451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501112
55120	NC_015732	CGC	2	6	2872587	2872592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501112
55121	NC_015732	G	6	6	2872607	2872612	0 %	0 %	100 %	0 %	339501112
55122	NC_015732	ACCA	2	8	2872669	2872676	50 %	0 %	0 %	50 %	339501112
55123	NC_015732	TC	3	6	2872686	2872691	0 %	50 %	0 %	50 %	339501112
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55130	NC_015732	GAT	3	9	2873065	2873073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501113
55131	NC_015732	ATG	2	6	2873108	2873113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501113
55132	NC_015732	CTGG	2	8	2873119	2873126	0 %	25 %	50 %	25 %	339501113
55133	NC_015732	GGC	2	6	2873140	2873145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501113
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55135	NC_015732	TGC	2	6	2873253	2873258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501113
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55142	NC_015732	AGTC	2	8	2873484	2873491	25 %	25 %	25 %	25 %	339501113
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55144	NC_015732	TCT	2	6	2873588	2873593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501113
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55147	NC_015732	A	6	6	2873763	2873768	100 %	0 %	0 %	0 %	339501113
55148	NC_015732	CTG	2	6	2873851	2873856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501113
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55163	NC_015732	TTG	2	6	2874649	2874654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501114
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55165	NC_015732	TCT	2	6	2874717	2874722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501114
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55172	NC_015732	CAT	2	6	2874832	2874837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501114
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55174	NC_015732	TAA	2	6	2874931	2874936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55175	NC_015732	CAC	2	6	2874984	2874989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55181	NC_015732	CTTT	2	8	2875244	2875251	0 %	75 %	0 %	25 %	339501115
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55200	NC_015732	GGT	2	6	2876190	2876195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501115
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55202	NC_015732	CGG	2	6	2876255	2876260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501115
55203	NC_015732	GCG	2	6	2876518	2876523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501115
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55205	NC_015732	CTA	2	6	2876615	2876620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501115
55206	NC_015732	TCC	2	6	2876643	2876648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55207	NC_015732	TATCA	2	10	2876655	2876664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55208	NC_015732	T	6	6	2876679	2876684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55209	NC_015732	ACA	2	6	2876762	2876767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55210	NC_015732	TCG	2	6	2876777	2876782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55211	NC_015732	TAA	2	6	2876815	2876820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55212	NC_015732	ATG	2	6	2876866	2876871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501116
55213	NC_015732	AAC	2	6	2876905	2876910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501116
55214	NC_015732	AAG	2	6	2876918	2876923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501116
55215	NC_015732	ATT	2	6	2877015	2877020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501116
55216	NC_015732	AAG	2	6	2877032	2877037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501116
55217	NC_015732	GGT	2	6	2877186	2877191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501116
55218	NC_015732	AGC	2	6	2877192	2877197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501116
55219	NC_015732	CTCC	2	8	2877240	2877247	0 %	25 %	0 %	75 %	339501116
55220	NC_015732	CTG	2	6	2877365	2877370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501116
55221	NC_015732	GATT	2	8	2877420	2877427	25 %	50 %	25 %	0 %	339501116
55222	NC_015732	AGA	2	6	2877507	2877512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501116
55223	NC_015732	GCC	2	6	2877601	2877606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501116
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55225	NC_015732	GCG	2	6	2877719	2877724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501117
55226	NC_015732	AT	3	6	2877735	2877740	50 %	50 %	0 %	0 %	339501117
55227	NC_015732	CTT	2	6	2877818	2877823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501117
55228	NC_015732	ATC	2	6	2877917	2877922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501117
55229	NC_015732	CAC	2	6	2877923	2877928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501117
55230	NC_015732	AGGAG	2	10	2877940	2877949	40 %	0 %	60 %	0 %	339501117
55231	NC_015732	CCG	2	6	2877950	2877955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501117
55232	NC_015732	TCT	2	6	2878002	2878007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501117
55233	NC_015732	CTG	2	6	2878019	2878024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501117
55234	NC_015732	TTTTC	2	10	2878084	2878093	0 %	80 %	0 %	20 %	339501117
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55472	NC_015732	TG	3	6	2892318	2892323	0 %	50 %	50 %	0 %	339501129
55473	NC_015732	CGC	2	6	2892324	2892329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501129
55474	NC_015732	GTG	2	6	2892343	2892348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501129
55475	NC_015732	GGC	2	6	2892355	2892360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501129
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