MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015732	CCT	2	6	2664840	2664845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500958
51002	NC_015732	CGG	2	6	2664847	2664852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500958
51003	NC_015732	G	6	6	2664851	2664856	0 %	0 %	100 %	0 %	339500958
51004	NC_015732	ATA	2	6	2664954	2664959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500958
51005	NC_015732	A	6	6	2664995	2665000	100 %	0 %	0 %	0 %	339500958
51006	NC_015732	CTA	2	6	2665048	2665053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500958
51007	NC_015732	TCA	2	6	2665194	2665199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500958
51008	NC_015732	T	6	6	2665259	2665264	0 %	100 %	0 %	0 %	339500958
51009	NC_015732	TCA	2	6	2665296	2665301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500958
51010	NC_015732	T	7	7	2665325	2665331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51011	NC_015732	TAA	2	6	2665335	2665340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500959
51012	NC_015732	AGAT	2	8	2665345	2665352	50 %	25 %	25 %	0 %	339500959
51013	NC_015732	GAT	2	6	2665375	2665380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500959
51014	NC_015732	ATC	2	6	2665422	2665427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500959
51015	NC_015732	CCTTCT	2	12	2665431	2665442	0 %	50 %	0 %	50 %	339500959
51016	NC_015732	AGG	2	6	2665561	2665566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500959
51017	NC_015732	CTT	2	6	2665608	2665613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500959
51018	NC_015732	TTA	2	6	2665615	2665620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500959
51019	NC_015732	TTC	2	6	2665623	2665628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500959
51020	NC_015732	ACA	2	6	2665675	2665680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500959
51021	NC_015732	CCA	2	6	2665694	2665699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500959
51022	NC_015732	AGG	2	6	2665970	2665975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500959
51023	NC_015732	CTG	2	6	2665976	2665981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500959
51024	NC_015732	TAC	2	6	2666006	2666011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500959
51025	NC_015732	GGGA	2	8	2666178	2666185	25 %	0 %	75 %	0 %	339500959
51026	NC_015732	G	6	6	2666281	2666286	0 %	0 %	100 %	0 %	339500959
51027	NC_015732	GCT	2	6	2666324	2666329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500959
51028	NC_015732	ATTTTG	2	12	2666369	2666380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339500959
51029	NC_015732	TAA	2	6	2666750	2666755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500959
51030	NC_015732	TTC	2	6	2666767	2666772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500959
51031	NC_015732	TTG	2	6	2666785	2666790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500959
51032	NC_015732	AT	3	6	2666822	2666827	50 %	50 %	0 %	0 %	339500960
51033	NC_015732	GCT	2	6	2666885	2666890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500960
51034	NC_015732	T	6	6	2666900	2666905	0 %	100 %	0 %	0 %	339500960
51035	NC_015732	AAT	2	6	2667106	2667111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500960
51036	NC_015732	CAT	2	6	2667114	2667119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500960
51037	NC_015732	TGTT	2	8	2667251	2667258	0 %	75 %	25 %	0 %	339500960
51038	NC_015732	A	6	6	2667278	2667283	100 %	0 %	0 %	0 %	339500960
51039	NC_015732	TCA	2	6	2667324	2667329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500960
51040	NC_015732	AAG	2	6	2667353	2667358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500960
51041	NC_015732	T	6	6	2667366	2667371	0 %	100 %	0 %	0 %	339500960
51042	NC_015732	TCC	2	6	2667382	2667387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500961
51043	NC_015732	A	6	6	2667388	2667393	100 %	0 %	0 %	0 %	339500961
51044	NC_015732	A	6	6	2667405	2667410	100 %	0 %	0 %	0 %	339500961
51045	NC_015732	CAG	2	6	2667411	2667416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500961
51046	NC_015732	ACG	2	6	2667456	2667461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500961
51047	NC_015732	GCT	2	6	2667522	2667527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500961
51048	NC_015732	AT	3	6	2667546	2667551	50 %	50 %	0 %	0 %	339500961
51049	NC_015732	CCA	2	6	2667553	2667558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500961
51050	NC_015732	GTT	2	6	2667572	2667577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500961
51051	NC_015732	GAAG	2	8	2667716	2667723	50 %	0 %	50 %	0 %	339500961
51052	NC_015732	CTC	2	6	2667798	2667803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500961
51053	NC_015732	GTTC	2	8	2667843	2667850	0 %	50 %	25 %	25 %	339500961
51054	NC_015732	CTG	2	6	2667851	2667856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500961
51055	NC_015732	AG	3	6	2667858	2667863	50 %	0 %	50 %	0 %	339500961
51056	NC_015732	TAA	2	6	2667884	2667889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500961
51057	NC_015732	TGA	2	6	2667893	2667898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500961
51058	NC_015732	CCT	2	6	2667902	2667907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500961
51059	NC_015732	ACG	2	6	2668023	2668028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500961
51060	NC_015732	CAC	2	6	2668037	2668042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500961
51061	NC_015732	GTA	2	6	2668101	2668106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500961
51062	NC_015732	AACC	2	8	2668113	2668120	50 %	0 %	0 %	50 %	339500961
51063	NC_015732	TAA	2	6	2668151	2668156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500961
51064	NC_015732	TA	3	6	2668244	2668249	50 %	50 %	0 %	0 %	339500961
51065	NC_015732	CGG	2	6	2668267	2668272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500961
51066	NC_015732	CCA	2	6	2668361	2668366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500962
51067	NC_015732	GTT	2	6	2668475	2668480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500962
51068	NC_015732	CTT	2	6	2668495	2668500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500962
51069	NC_015732	CAA	2	6	2668522	2668527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500962
51070	NC_015732	ACC	3	9	2668535	2668543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500962
51071	NC_015732	TACCGA	2	12	2668654	2668665	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339500962
51072	NC_015732	CAC	2	6	2668757	2668762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500962
51073	NC_015732	T	6	6	2668986	2668991	0 %	100 %	0 %	0 %	339500962
51074	NC_015732	CCA	2	6	2668993	2668998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500962
51075	NC_015732	A	6	6	2669057	2669062	100 %	0 %	0 %	0 %	339500962
51076	NC_015732	CCAG	2	8	2669115	2669122	25 %	0 %	25 %	50 %	339500962
51077	NC_015732	CGC	2	6	2669212	2669217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500962
51078	NC_015732	T	7	7	2669254	2669260	0 %	100 %	0 %	0 %	339500962
51079	NC_015732	AGA	2	6	2669295	2669300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500962
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51081	NC_015732	AGT	2	6	2669441	2669446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500963
51082	NC_015732	CA	3	6	2669466	2669471	50 %	0 %	0 %	50 %	339500963
51083	NC_015732	TTC	2	6	2669499	2669504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500963
51084	NC_015732	CTA	2	6	2669532	2669537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500963
51085	NC_015732	GGA	2	6	2669550	2669555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500963
51086	NC_015732	GGA	2	6	2669572	2669577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500963
51087	NC_015732	CAA	2	6	2669653	2669658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500963
51088	NC_015732	AAG	2	6	2669833	2669838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500963
51089	NC_015732	ACA	3	9	2669862	2669870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500963
51090	NC_015732	TTC	2	6	2669896	2669901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500963
51091	NC_015732	CCA	2	6	2670117	2670122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500963
51092	NC_015732	TAC	2	6	2670141	2670146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500963
51093	NC_015732	CAA	2	6	2670195	2670200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500963
51094	NC_015732	TAC	2	6	2670220	2670225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500963
51095	NC_015732	AAAG	2	8	2670279	2670286	75 %	0 %	25 %	0 %	339500963
51096	NC_015732	AGC	3	9	2670296	2670304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500963
51097	NC_015732	TGA	2	6	2670312	2670317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500963
51098	NC_015732	A	7	7	2670350	2670356	100 %	0 %	0 %	0 %	339500964
51099	NC_015732	AGC	2	6	2670372	2670377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500964
51100	NC_015732	TAC	2	6	2670443	2670448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500964
51101	NC_015732	GAA	2	6	2670506	2670511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500964
51102	NC_015732	ACCAA	2	10	2670541	2670550	60 %	0 %	0 %	40 %	339500964
51103	NC_015732	GCC	2	6	2670592	2670597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500964
51104	NC_015732	CAT	2	6	2670599	2670604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500964
51105	NC_015732	TGA	2	6	2670607	2670612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500964
51106	NC_015732	ATG	2	6	2670664	2670669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500964
51107	NC_015732	CGC	3	9	2670711	2670719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500964
51108	NC_015732	TCAGTA	2	12	2670742	2670753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339500964
51109	NC_015732	C	6	6	2670830	2670835	0 %	0 %	0 %	100 %	339500964
51110	NC_015732	A	6	6	2670840	2670845	100 %	0 %	0 %	0 %	339500964
51111	NC_015732	TCC	2	6	2670849	2670854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500964
51112	NC_015732	T	6	6	2670869	2670874	0 %	100 %	0 %	0 %	339500964
51113	NC_015732	AAG	2	6	2670903	2670908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500964
51114	NC_015732	GCC	2	6	2670933	2670938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500964
51115	NC_015732	GAT	2	6	2670966	2670971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500964
51116	NC_015732	TTC	2	6	2670990	2670995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500964
51117	NC_015732	ATC	2	6	2671059	2671064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500964
51118	NC_015732	TCC	2	6	2671144	2671149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500964
51119	NC_015732	CT	3	6	2671156	2671161	0 %	50 %	0 %	50 %	339500964
51120	NC_015732	AG	3	6	2671164	2671169	50 %	0 %	50 %	0 %	339500964
51121	NC_015732	TATT	2	8	2671178	2671185	25 %	75 %	0 %	0 %	339500964
51122	NC_015732	T	6	6	2671184	2671189	0 %	100 %	0 %	0 %	339500964
51123	NC_015732	AG	4	8	2671237	2671244	50 %	0 %	50 %	0 %	339500965
51124	NC_015732	ATC	2	6	2671455	2671460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500965
51125	NC_015732	GTTTT	2	10	2671472	2671481	0 %	80 %	20 %	0 %	339500965
51126	NC_015732	CTG	2	6	2671492	2671497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500965
51127	NC_015732	CAA	2	6	2671502	2671507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500965
51128	NC_015732	CCA	2	6	2671523	2671528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500965
51129	NC_015732	CAT	2	6	2671532	2671537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500965
51130	NC_015732	TCA	2	6	2671549	2671554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500965
51131	NC_015732	CAT	2	6	2671580	2671585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500965
51132	NC_015732	GGAT	2	8	2671692	2671699	25 %	25 %	50 %	0 %	339500965
51133	NC_015732	AAG	2	6	2671720	2671725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500965
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51135	NC_015732	AAAG	2	8	2671810	2671817	75 %	0 %	25 %	0 %	339500965
51136	NC_015732	GTT	2	6	2671819	2671824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500965
51137	NC_015732	TTC	2	6	2671845	2671850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500965
51138	NC_015732	CTGA	2	8	2671868	2671875	25 %	25 %	25 %	25 %	339500965
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51145	NC_015732	ATT	2	6	2672405	2672410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500966
51146	NC_015732	CTA	2	6	2672454	2672459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500966
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51148	NC_015732	CGA	2	6	2672499	2672504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500966
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51157	NC_015732	AGA	2	6	2673115	2673120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500966
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51159	NC_015732	ATG	2	6	2673186	2673191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500966
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51164	NC_015732	GCCC	2	8	2673613	2673620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51165	NC_015732	A	6	6	2673632	2673637	100 %	0 %	0 %	0 %	339500967
51166	NC_015732	TC	3	6	2673794	2673799	0 %	50 %	0 %	50 %	339500967
51167	NC_015732	TCGT	2	8	2673817	2673824	0 %	50 %	25 %	25 %	339500967
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51171	NC_015732	TAA	2	6	2674085	2674090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500967
51172	NC_015732	TA	3	6	2674119	2674124	50 %	50 %	0 %	0 %	339500967
51173	NC_015732	AAG	2	6	2674154	2674159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51174	NC_015732	AAT	2	6	2674176	2674181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500968
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51191	NC_015732	CAG	2	6	2674611	2674616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500968
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51205	NC_015732	AAC	2	6	2675411	2675416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500968
51206	NC_015732	TG	3	6	2675451	2675456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51207	NC_015732	T	6	6	2675530	2675535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51208	NC_015732	ATG	2	6	2675577	2675582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500969
51209	NC_015732	GCT	2	6	2675718	2675723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500969
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51211	NC_015732	TCCTGC	2	12	2675906	2675917	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339500969
51212	NC_015732	TAG	2	6	2675944	2675949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500969
51213	NC_015732	ATA	2	6	2675951	2675956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500969
51214	NC_015732	CCT	2	6	2676014	2676019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51215	NC_015732	C	6	6	2676030	2676035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51216	NC_015732	A	6	6	2676095	2676100	100 %	0 %	0 %	0 %	339500970
51217	NC_015732	GAA	2	6	2676107	2676112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500970
51218	NC_015732	C	6	6	2676213	2676218	0 %	0 %	0 %	100 %	339500970
51219	NC_015732	ATCC	2	8	2676261	2676268	25 %	25 %	0 %	50 %	339500970
51220	NC_015732	GAA	2	6	2676317	2676322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500970
51221	NC_015732	CAA	2	6	2676334	2676339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500970
51222	NC_015732	AAG	2	6	2676362	2676367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500970
51223	NC_015732	GGTT	2	8	2676439	2676446	0 %	50 %	50 %	0 %	339500970
51224	NC_015732	TCGG	2	8	2676581	2676588	0 %	25 %	50 %	25 %	339500970
51225	NC_015732	A	6	6	2676647	2676652	100 %	0 %	0 %	0 %	339500970
51226	NC_015732	CGG	2	6	2676706	2676711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500970
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51228	NC_015732	GAA	2	6	2676727	2676732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500970
51229	NC_015732	GGCT	2	8	2676776	2676783	0 %	25 %	50 %	25 %	339500970
51230	NC_015732	GTC	2	6	2676836	2676841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500970
51231	NC_015732	GCC	2	6	2676845	2676850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500970
51232	NC_015732	TACC	2	8	2676891	2676898	25 %	25 %	0 %	50 %	339500970
51233	NC_015732	GAT	2	6	2676929	2676934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500970
51234	NC_015732	CTT	2	6	2676994	2676999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500970
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51354	NC_015732	TTGT	2	8	2683460	2683467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51355	NC_015732	T	7	7	2683499	2683505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51356	NC_015732	TAA	2	6	2683532	2683537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51357	NC_015732	TA	3	6	2683576	2683581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51358	NC_015732	CAT	2	6	2683589	2683594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51360	NC_015732	AAACA	2	10	2683748	2683757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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51364	NC_015732	AT	3	6	2683909	2683914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51393	NC_015732	CTT	2	6	2685492	2685497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500977
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51402	NC_015732	TTGC	2	8	2686161	2686168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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51476	NC_015732	CGG	2	6	2689910	2689915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500981
51477	NC_015732	CGGTG	2	10	2690019	2690028	0 %	20 %	60 %	20 %	339500981
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51480	NC_015732	CCGG	2	8	2690096	2690103	0 %	0 %	50 %	50 %	339500981
51481	NC_015732	CGG	2	6	2690112	2690117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500981
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