MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_015732	GCA	2	6	2611426	2611431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500917
50002	NC_015732	CTG	2	6	2611474	2611479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500917
50003	NC_015732	TC	3	6	2611511	2611516	0 %	50 %	0 %	50 %	339500917
50004	NC_015732	GGAA	2	8	2611551	2611558	50 %	0 %	50 %	0 %	339500917
50005	NC_015732	T	7	7	2611609	2611615	0 %	100 %	0 %	0 %	339500918
50006	NC_015732	GA	3	6	2611818	2611823	50 %	0 %	50 %	0 %	339500918
50007	NC_015732	AGA	2	6	2611850	2611855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500918
50008	NC_015732	AAT	2	6	2611862	2611867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500918
50009	NC_015732	TGA	2	6	2611876	2611881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500918
50010	NC_015732	TACCTC	2	12	2611960	2611971	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339500918
50011	NC_015732	TGACC	2	10	2612008	2612017	20 %	20 %	20 %	40 %	339500918
50012	NC_015732	CAT	2	6	2612056	2612061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500918
50013	NC_015732	ATT	2	6	2612073	2612078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500918
50014	NC_015732	AT	3	6	2612082	2612087	50 %	50 %	0 %	0 %	339500918
50015	NC_015732	AAT	2	6	2612147	2612152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50016	NC_015732	ACC	2	6	2612161	2612166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50017	NC_015732	C	7	7	2612165	2612171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50018	NC_015732	AGA	2	6	2612210	2612215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500919
50019	NC_015732	CTGGAC	2	12	2612251	2612262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339500919
50020	NC_015732	TGA	2	6	2612274	2612279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500919
50021	NC_015732	ATC	2	6	2612306	2612311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500919
50022	NC_015732	TCG	2	6	2612339	2612344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500919
50023	NC_015732	TTC	2	6	2612531	2612536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500919
50024	NC_015732	TGG	2	6	2612540	2612545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500919
50025	NC_015732	AAC	2	6	2612567	2612572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500919
50026	NC_015732	CTTT	2	8	2612652	2612659	0 %	75 %	0 %	25 %	339500919
50027	NC_015732	GGT	2	6	2612780	2612785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500919
50028	NC_015732	A	6	6	2612800	2612805	100 %	0 %	0 %	0 %	339500919
50029	NC_015732	GCG	2	6	2612823	2612828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500919
50030	NC_015732	GCCC	2	8	2612850	2612857	0 %	0 %	25 %	75 %	339500919
50031	NC_015732	AAC	2	6	2613086	2613091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500919
50032	NC_015732	ATC	2	6	2613134	2613139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500919
50033	NC_015732	G	6	6	2613153	2613158	0 %	0 %	100 %	0 %	339500919
50034	NC_015732	A	6	6	2613159	2613164	100 %	0 %	0 %	0 %	339500919
50035	NC_015732	CGG	2	6	2613192	2613197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500919
50036	NC_015732	CCG	2	6	2613397	2613402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500919
50037	NC_015732	GAG	2	6	2613553	2613558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500919
50038	NC_015732	TAA	2	6	2613562	2613567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500919
50039	NC_015732	TCA	2	6	2613673	2613678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500919
50040	NC_015732	TAG	2	6	2613797	2613802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500919
50041	NC_015732	TGG	2	6	2613830	2613835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500919
50042	NC_015732	AGG	2	6	2613909	2613914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500919
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50044	NC_015732	ACCA	2	8	2614061	2614068	50 %	0 %	0 %	50 %	339500919
50045	NC_015732	CAAGG	2	10	2614100	2614109	40 %	0 %	40 %	20 %	339500919
50046	NC_015732	TAG	2	6	2614148	2614153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500919
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50048	NC_015732	TAG	2	6	2614225	2614230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500919
50049	NC_015732	GCC	2	6	2614272	2614277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500919
50050	NC_015732	GATC	2	8	2614294	2614301	25 %	25 %	25 %	25 %	339500919
50051	NC_015732	TTA	2	6	2614359	2614364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500919
50052	NC_015732	TCCA	2	8	2614394	2614401	25 %	25 %	0 %	50 %	339500919
50053	NC_015732	AAG	2	6	2614499	2614504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500919
50054	NC_015732	ACT	2	6	2614527	2614532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500919
50055	NC_015732	GTG	2	6	2614547	2614552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500919
50056	NC_015732	GCT	2	6	2614594	2614599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500919
50057	NC_015732	ACTG	2	8	2614606	2614613	25 %	25 %	25 %	25 %	339500919
50058	NC_015732	T	6	6	2614621	2614626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50059	NC_015732	TTC	3	9	2614664	2614672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500920
50060	NC_015732	T	6	6	2614692	2614697	0 %	100 %	0 %	0 %	339500920
50061	NC_015732	TCA	2	6	2614757	2614762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
50062	NC_015732	AATAA	2	10	2614789	2614798	80 %	20 %	0 %	0 %	339500920
50063	NC_015732	ATC	2	6	2614879	2614884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
50064	NC_015732	TCA	2	6	2614959	2614964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
50065	NC_015732	GTA	2	6	2615021	2615026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
50066	NC_015732	GTA	2	6	2615102	2615107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
50067	NC_015732	CAG	2	6	2615157	2615162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50068	NC_015732	TAC	2	6	2615334	2615339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
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50070	NC_015732	CTG	2	6	2615453	2615458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50071	NC_015732	GCA	2	6	2615615	2615620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500920
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50077	NC_015732	ACAA	2	8	2616301	2616308	75 %	0 %	0 %	25 %	339500920
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50082	NC_015732	GAACG	2	10	2616552	2616561	40 %	0 %	40 %	20 %	339500920
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50086	NC_015732	CAT	2	6	2616801	2616806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
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50088	NC_015732	ACC	3	9	2616905	2616913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500920
50089	NC_015732	TGA	2	6	2616996	2617001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
50090	NC_015732	TAG	2	6	2617014	2617019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
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50100	NC_015732	TCA	2	6	2617544	2617549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
50101	NC_015732	CAC	2	6	2617562	2617567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500920
50102	NC_015732	TTA	2	6	2617617	2617622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500920
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50105	NC_015732	TGG	2	6	2618055	2618060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500920
50106	NC_015732	CGT	2	6	2618215	2618220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50107	NC_015732	TCC	2	6	2618285	2618290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500920
50108	NC_015732	GAT	2	6	2618307	2618312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
50109	NC_015732	T	6	6	2618327	2618332	0 %	100 %	0 %	0 %	339500920
50110	NC_015732	GCC	2	6	2618373	2618378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500920
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50112	NC_015732	ACC	2	6	2618494	2618499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500920
50113	NC_015732	CTTC	2	8	2618501	2618508	0 %	50 %	0 %	50 %	339500920
50114	NC_015732	AAG	2	6	2618602	2618607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500920
50115	NC_015732	GTG	2	6	2618615	2618620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500920
50116	NC_015732	TCG	2	6	2618634	2618639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50117	NC_015732	T	7	7	2618683	2618689	0 %	100 %	0 %	0 %	339500920
50118	NC_015732	AAG	2	6	2618692	2618697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500920
50119	NC_015732	TTC	2	6	2618848	2618853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500920
50120	NC_015732	TGT	2	6	2618945	2618950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500920
50121	NC_015732	TA	3	6	2619099	2619104	50 %	50 %	0 %	0 %	339500920
50122	NC_015732	CATC	2	8	2619117	2619124	25 %	25 %	0 %	50 %	339500920
50123	NC_015732	T	6	6	2619197	2619202	0 %	100 %	0 %	0 %	339500920
50124	NC_015732	ACA	2	6	2619209	2619214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500920
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50126	NC_015732	T	8	8	2619479	2619486	0 %	100 %	0 %	0 %	339500920
50127	NC_015732	GCT	2	6	2619515	2619520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50128	NC_015732	TGGAT	2	10	2619530	2619539	20 %	40 %	40 %	0 %	339500920
50129	NC_015732	TAC	2	6	2619588	2619593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
50130	NC_015732	TTC	2	6	2619742	2619747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500920
50131	NC_015732	CAG	2	6	2619832	2619837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500920
50132	NC_015732	AATTGA	2	12	2619866	2619877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339500920
50133	NC_015732	ACT	2	6	2619889	2619894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500920
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50137	NC_015732	GAT	2	6	2620045	2620050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500920
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50139	NC_015732	A	8	8	2620212	2620219	100 %	0 %	0 %	0 %	339500920
50140	NC_015732	AAT	2	6	2620231	2620236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500920
50141	NC_015732	TAT	2	6	2620266	2620271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50142	NC_015732	ACT	2	6	2620274	2620279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50143	NC_015732	TA	3	6	2620373	2620378	50 %	50 %	0 %	0 %	339500921
50144	NC_015732	TTC	2	6	2620624	2620629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500921
50145	NC_015732	ACC	2	6	2620630	2620635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500921
50146	NC_015732	CTGC	2	8	2620661	2620668	0 %	25 %	25 %	50 %	339500921
50147	NC_015732	TCA	2	6	2620826	2620831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500921
50148	NC_015732	GAC	2	6	2620836	2620841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500921
50149	NC_015732	CTT	2	6	2620899	2620904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500921
50150	NC_015732	T	6	6	2620910	2620915	0 %	100 %	0 %	0 %	339500921
50151	NC_015732	ATA	2	6	2620955	2620960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500921
50152	NC_015732	GGC	2	6	2620997	2621002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500921
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50157	NC_015732	GTG	2	6	2621265	2621270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500921
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50164	NC_015732	ACCAAT	2	12	2621509	2621520	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	339500921
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50170	NC_015732	CCT	2	6	2621648	2621653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500921
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50172	NC_015732	AGA	2	6	2621710	2621715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500921
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50181	NC_015732	AT	3	6	2622217	2622222	50 %	50 %	0 %	0 %	339500921
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50183	NC_015732	CTG	2	6	2622241	2622246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500921
50184	NC_015732	TCT	2	6	2622248	2622253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500921
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50186	NC_015732	ACC	3	9	2622352	2622360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500921
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50188	NC_015732	TCGAA	2	10	2622563	2622572	40 %	20 %	20 %	20 %	339500921
50189	NC_015732	TGACA	2	10	2622667	2622676	40 %	20 %	20 %	20 %	339500921
50190	NC_015732	ATT	2	6	2622700	2622705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500921
50191	NC_015732	ATC	2	6	2622709	2622714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500921
50192	NC_015732	CAT	2	6	2622843	2622848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500921
50193	NC_015732	ACCC	2	8	2622913	2622920	25 %	0 %	0 %	75 %	339500921
50194	NC_015732	CCA	2	6	2623043	2623048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500921
50195	NC_015732	TCCAA	2	10	2623054	2623063	40 %	20 %	0 %	40 %	339500921
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50197	NC_015732	GGCC	2	8	2623173	2623180	0 %	0 %	50 %	50 %	339500921
50198	NC_015732	ATG	2	6	2623262	2623267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500921
50199	NC_015732	A	7	7	2623310	2623316	100 %	0 %	0 %	0 %	339500921
50200	NC_015732	A	6	6	2623386	2623391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50201	NC_015732	GCT	3	9	2623445	2623453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50202	NC_015732	AC	3	6	2623497	2623502	50 %	0 %	0 %	50 %	339500922
50203	NC_015732	AAT	2	6	2623510	2623515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500922
50204	NC_015732	T	6	6	2623636	2623641	0 %	100 %	0 %	0 %	339500922
50205	NC_015732	ACG	2	6	2623797	2623802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500922
50206	NC_015732	TTC	2	6	2623870	2623875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500922
50207	NC_015732	CCTT	2	8	2623883	2623890	0 %	50 %	0 %	50 %	339500922
50208	NC_015732	GATAG	2	10	2623969	2623978	40 %	20 %	40 %	0 %	339500922
50209	NC_015732	GGGA	2	8	2623988	2623995	25 %	0 %	75 %	0 %	339500922
50210	NC_015732	C	6	6	2624023	2624028	0 %	0 %	0 %	100 %	339500922
50211	NC_015732	GGT	2	6	2624059	2624064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500922
50212	NC_015732	CAG	2	6	2624077	2624082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500922
50213	NC_015732	G	6	6	2624082	2624087	0 %	0 %	100 %	0 %	339500922
50214	NC_015732	CAA	2	6	2624184	2624189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500922
50215	NC_015732	TCA	2	6	2624234	2624239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500922
50216	NC_015732	TAC	2	6	2624259	2624264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500922
50217	NC_015732	GGT	2	6	2624332	2624337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500922
50218	NC_015732	CCAT	2	8	2624402	2624409	25 %	25 %	0 %	50 %	339500922
50219	NC_015732	TAA	2	6	2624433	2624438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500922
50220	NC_015732	CCAA	2	8	2624495	2624502	50 %	0 %	0 %	50 %	339500922
50221	NC_015732	GAA	2	6	2624531	2624536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500922
50222	NC_015732	ATC	2	6	2624560	2624565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500922
50223	NC_015732	TTG	2	6	2624663	2624668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500923
50224	NC_015732	TTAA	2	8	2624744	2624751	50 %	50 %	0 %	0 %	339500923
50225	NC_015732	A	6	6	2624785	2624790	100 %	0 %	0 %	0 %	339500923
50226	NC_015732	TCA	2	6	2624801	2624806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500923
50227	NC_015732	AAT	2	6	2624827	2624832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500923
50228	NC_015732	CTA	2	6	2624838	2624843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500923
50229	NC_015732	T	7	7	2625043	2625049	0 %	100 %	0 %	0 %	339500923
50230	NC_015732	ATT	2	6	2625149	2625154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500924
50231	NC_015732	AT	3	6	2625278	2625283	50 %	50 %	0 %	0 %	339500924
50232	NC_015732	AAATT	2	10	2625342	2625351	60 %	40 %	0 %	0 %	339500924
50233	NC_015732	GTAA	2	8	2625430	2625437	50 %	25 %	25 %	0 %	339500924
50234	NC_015732	AAT	2	6	2625466	2625471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500924
50235	NC_015732	CTC	2	6	2625560	2625565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500924
50236	NC_015732	TA	3	6	2625629	2625634	50 %	50 %	0 %	0 %	339500924
50237	NC_015732	TGT	2	6	2625639	2625644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500924
50238	NC_015732	CT	3	6	2625692	2625697	0 %	50 %	0 %	50 %	339500924
50239	NC_015732	A	8	8	2625699	2625706	100 %	0 %	0 %	0 %	339500924
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50244	NC_015732	A	7	7	2625887	2625893	100 %	0 %	0 %	0 %	339500924
50245	NC_015732	ATA	2	6	2625925	2625930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500924
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50248	NC_015732	TGC	2	6	2626315	2626320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500925
50249	NC_015732	CTG	2	6	2626324	2626329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500925
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50282	NC_015732	T	6	6	2627322	2627327	0 %	100 %	0 %	0 %	339500925
50283	NC_015732	TCA	2	6	2627354	2627359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500925
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50285	NC_015732	GATA	2	8	2627456	2627463	50 %	25 %	25 %	0 %	339500925
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50288	NC_015732	CCT	2	6	2627693	2627698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50332	NC_015732	GTT	2	6	2629778	2629783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500928
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50338	NC_015732	TA	3	6	2629992	2629997	50 %	50 %	0 %	0 %	339500928
50339	NC_015732	TGA	2	6	2629999	2630004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500928
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50342	NC_015732	CCATA	2	10	2630080	2630089	40 %	20 %	0 %	40 %	339500928
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50349	NC_015732	TAC	2	6	2630539	2630544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500928
50350	NC_015732	TCAG	2	8	2630601	2630608	25 %	25 %	25 %	25 %	339500928
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50352	NC_015732	TGT	2	6	2630805	2630810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500928
50353	NC_015732	AGCAG	2	10	2630820	2630829	40 %	0 %	40 %	20 %	339500928
50354	NC_015732	TAA	2	6	2630865	2630870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500929
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50451	NC_015732	GAT	2	6	2635146	2635151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500933
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50465	NC_015732	TAT	2	6	2635658	2635663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500933
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50469	NC_015732	ATCC	2	8	2635753	2635760	25 %	25 %	0 %	50 %	339500933
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