MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 2855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015710	CAAA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	0 %	25 %	338731811
1002	NC_015710	TCA	3	9	46486	46494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731811
1003	NC_015710	CTT	2	6	46548	46553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731811
1004	NC_015710	A	6	6	46567	46572	100 %	0 %	0 %	0 %	338731811
1005	NC_015710	TCC	2	6	46582	46587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731811
1006	NC_015710	TGT	2	6	46817	46822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731812
1007	NC_015710	TAT	3	9	46850	46858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731812
1008	NC_015710	A	8	8	46870	46877	100 %	0 %	0 %	0 %	338731812
1009	NC_015710	A	8	8	47025	47032	100 %	0 %	0 %	0 %	338731812
1010	NC_015710	A	7	7	47130	47136	100 %	0 %	0 %	0 %	338731812
1011	NC_015710	A	6	6	47203	47208	100 %	0 %	0 %	0 %	338731812
1012	NC_015710	ATA	2	6	47227	47232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015710	AGT	2	6	47242	47247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015710	ACA	2	6	47292	47297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015710	GTT	2	6	47324	47329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015710	AC	3	6	47355	47360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_015710	T	7	7	47374	47380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015710	TCTT	2	8	47382	47389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_015710	TTTA	2	8	47393	47400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015710	TAT	2	6	47401	47406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015710	TGA	2	6	47419	47424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015710	AAT	2	6	47435	47440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015710	A	7	7	47468	47474	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1024	NC_015710	A	7	7	47479	47485	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1025	NC_015710	TGG	2	6	47488	47493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731813
1026	NC_015710	TGTTTC	2	12	47496	47507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338731813
1027	NC_015710	CTG	2	6	47516	47521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731813
1028	NC_015710	ACTA	2	8	47547	47554	50 %	25 %	0 %	25 %	338731813
1029	NC_015710	TGC	2	6	47562	47567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731813
1030	NC_015710	CCT	2	6	47614	47619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731813
1031	NC_015710	CTT	2	6	47629	47634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731813
1032	NC_015710	AATG	2	8	47704	47711	50 %	25 %	25 %	0 %	338731813
1033	NC_015710	CAT	2	6	47754	47759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731813
1034	NC_015710	TATC	2	8	47813	47820	25 %	50 %	0 %	25 %	338731813
1035	NC_015710	ATT	2	6	47914	47919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1036	NC_015710	TCG	2	6	47936	47941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731813
1037	NC_015710	TACA	2	8	47944	47951	50 %	25 %	0 %	25 %	338731813
1038	NC_015710	AAG	2	6	47963	47968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731813
1039	NC_015710	TGA	2	6	48021	48026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731813
1040	NC_015710	A	6	6	48026	48031	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1041	NC_015710	TAT	2	6	48072	48077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1042	NC_015710	CTT	2	6	48148	48153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731813
1043	NC_015710	T	7	7	48220	48226	0 %	100 %	0 %	0 %	338731813
1044	NC_015710	GTGTT	2	10	48242	48251	0 %	60 %	40 %	0 %	338731813
1045	NC_015710	TTG	2	6	48281	48286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
1046	NC_015710	CAA	2	6	48302	48307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731813
1047	NC_015710	AGC	2	6	48318	48323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731813
1048	NC_015710	CTTC	2	8	48412	48419	0 %	50 %	0 %	50 %	338731813
1049	NC_015710	A	7	7	48496	48502	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1050	NC_015710	GAA	2	6	48514	48519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731813
1051	NC_015710	CAA	2	6	48639	48644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731813
1052	NC_015710	CTT	2	6	48647	48652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731813
1053	NC_015710	AGGA	2	8	48740	48747	50 %	0 %	50 %	0 %	338731813
1054	NC_015710	TCA	2	6	48767	48772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731813
1055	NC_015710	GTT	2	6	48811	48816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
1056	NC_015710	GC	3	6	48854	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	338731813
1057	NC_015710	ATT	2	6	48865	48870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1058	NC_015710	TG	3	6	48878	48883	0 %	50 %	50 %	0 %	338731813
1059	NC_015710	ATCGC	2	10	48924	48933	20 %	20 %	20 %	40 %	338731813
1060	NC_015710	TTG	2	6	48941	48946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
1061	NC_015710	GGA	2	6	49011	49016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731813
1062	NC_015710	TTG	2	6	49055	49060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
1063	NC_015710	GAT	2	6	49071	49076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731813
1064	NC_015710	CAC	2	6	49082	49087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731813
1065	NC_015710	ACTC	2	8	49111	49118	25 %	25 %	0 %	50 %	338731813
1066	NC_015710	TGA	2	6	49142	49147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731813
1067	NC_015710	GAA	2	6	49264	49269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731813
1068	NC_015710	CAG	2	6	49304	49309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731813
1069	NC_015710	ATG	2	6	49382	49387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731813
1070	NC_015710	AAG	2	6	49400	49405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731813
1071	NC_015710	AGG	2	6	49511	49516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731813
1072	NC_015710	ATA	2	6	49532	49537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731813
1073	NC_015710	TTC	2	6	49563	49568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731813
1074	NC_015710	ATT	2	6	49581	49586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1075	NC_015710	ATT	2	6	49588	49593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1076	NC_015710	TTTC	2	8	49639	49646	0 %	75 %	0 %	25 %	338731813
1077	NC_015710	GGAT	2	8	49686	49693	25 %	25 %	50 %	0 %	338731813
1078	NC_015710	A	6	6	49741	49746	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1079	NC_015710	CCT	2	6	49747	49752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731813
1080	NC_015710	T	7	7	49788	49794	0 %	100 %	0 %	0 %	338731813
1081	NC_015710	TTA	2	6	49805	49810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731813
1082	NC_015710	ACT	2	6	49894	49899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731813
1083	NC_015710	GTT	3	9	49903	49911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
1084	NC_015710	TATCA	2	10	49945	49954	40 %	40 %	0 %	20 %	338731813
1085	NC_015710	T	7	7	49957	49963	0 %	100 %	0 %	0 %	338731813
1086	NC_015710	GTT	2	6	50017	50022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731813
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1088	NC_015710	A	8	8	50148	50155	100 %	0 %	0 %	0 %	338731813
1089	NC_015710	GAA	2	6	50208	50213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731814
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1091	NC_015710	TGC	2	6	50282	50287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731814
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1093	NC_015710	T	6	6	50316	50321	0 %	100 %	0 %	0 %	338731814
1094	NC_015710	A	6	6	50323	50328	100 %	0 %	0 %	0 %	338731814
1095	NC_015710	AGA	2	6	50342	50347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731814
1096	NC_015710	CA	3	6	50432	50437	50 %	0 %	0 %	50 %	338731814
1097	NC_015710	CAG	2	6	50487	50492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731814
1098	NC_015710	CTA	2	6	50570	50575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731814
1099	NC_015710	TAT	2	6	50615	50620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731814
1100	NC_015710	GAT	2	6	50715	50720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731814
1101	NC_015710	GAT	2	6	50762	50767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731814
1102	NC_015710	CTTT	2	8	50835	50842	0 %	75 %	0 %	25 %	338731814
1103	NC_015710	ATT	2	6	50852	50857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731814
1104	NC_015710	TTC	2	6	50867	50872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731814
1105	NC_015710	GAATC	2	10	50896	50905	40 %	20 %	20 %	20 %	338731814
1106	NC_015710	AT	3	6	50989	50994	50 %	50 %	0 %	0 %	338731814
1107	NC_015710	AGA	2	6	51066	51071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731814
1108	NC_015710	AAAAGC	2	12	51080	51091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338731814
1109	NC_015710	GAT	2	6	51111	51116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731814
1110	NC_015710	CAA	2	6	51133	51138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731814
1111	NC_015710	T	6	6	51278	51283	0 %	100 %	0 %	0 %	338731814
1112	NC_015710	AGAA	2	8	51374	51381	75 %	0 %	25 %	0 %	338731814
1113	NC_015710	T	6	6	51434	51439	0 %	100 %	0 %	0 %	338731815
1114	NC_015710	A	7	7	51493	51499	100 %	0 %	0 %	0 %	338731815
1115	NC_015710	A	7	7	51512	51518	100 %	0 %	0 %	0 %	338731815
1116	NC_015710	CCA	2	6	51528	51533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731815
1117	NC_015710	ACA	2	6	51575	51580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731815
1118	NC_015710	GCTC	2	8	51583	51590	0 %	25 %	25 %	50 %	338731815
1119	NC_015710	GA	3	6	51644	51649	50 %	0 %	50 %	0 %	338731815
1120	NC_015710	TTG	2	6	51726	51731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731815
1121	NC_015710	CT	3	6	51738	51743	0 %	50 %	0 %	50 %	338731815
1122	NC_015710	TAA	2	6	51853	51858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731815
1123	NC_015710	GGC	2	6	51871	51876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338731815
1124	NC_015710	AG	3	6	51878	51883	50 %	0 %	50 %	0 %	338731815
1125	NC_015710	A	7	7	51937	51943	100 %	0 %	0 %	0 %	338731815
1126	NC_015710	CTTT	2	8	51960	51967	0 %	75 %	0 %	25 %	338731815
1127	NC_015710	TCTT	2	8	52054	52061	0 %	75 %	0 %	25 %	338731815
1128	NC_015710	GGGTTT	2	12	52062	52073	0 %	50 %	50 %	0 %	338731815
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1130	NC_015710	GAA	2	6	52364	52369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731815
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1258	NC_015710	GCT	2	6	58581	58586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731819
1259	NC_015710	GTT	2	6	58647	58652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731819
1260	NC_015710	CAA	2	6	58669	58674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731819
1261	NC_015710	GAG	2	6	58682	58687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731819
1262	NC_015710	CTTC	2	8	58692	58699	0 %	50 %	0 %	50 %	338731819
1263	NC_015710	AGA	2	6	58725	58730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731819
1264	NC_015710	CG	4	8	58774	58781	0 %	0 %	50 %	50 %	338731819
1265	NC_015710	AGT	2	6	58915	58920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731819
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1282	NC_015710	TGC	2	6	59879	59884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731819
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1292	NC_015710	AAC	2	6	60132	60137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731820
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1301	NC_015710	TCC	3	9	60542	60550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731821
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1322	NC_015710	CAA	2	6	61811	61816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1346	NC_015710	GAT	4	12	62670	62681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731824
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1351	NC_015710	AAT	2	6	62793	62798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1352	NC_015710	TCT	2	6	62829	62834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1353	NC_015710	T	8	8	62834	62841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1354	NC_015710	TAA	2	6	62866	62871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731825
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1357	NC_015710	ATC	2	6	62944	62949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731825
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1359	NC_015710	CAT	2	6	63051	63056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731825
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1361	NC_015710	AAG	2	6	63149	63154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731826
1362	NC_015710	CAC	2	6	63213	63218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731826
1363	NC_015710	TAA	2	6	63285	63290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731826
1364	NC_015710	TCT	2	6	63354	63359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731826
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1366	NC_015710	TCT	2	6	63371	63376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731826
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1370	NC_015710	GCAGA	2	10	63580	63589	40 %	0 %	40 %	20 %	338731826
1371	NC_015710	A	6	6	63600	63605	100 %	0 %	0 %	0 %	338731826
1372	NC_015710	CT	3	6	63628	63633	0 %	50 %	0 %	50 %	338731826
1373	NC_015710	CT	4	8	63699	63706	0 %	50 %	0 %	50 %	338731826
1374	NC_015710	GAA	2	6	63844	63849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731826
1375	NC_015710	ATG	2	6	63872	63877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731826
1376	NC_015710	GCT	2	6	63931	63936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731826
1377	NC_015710	GT	3	6	64010	64015	0 %	50 %	50 %	0 %	338731826
1378	NC_015710	TTAGC	2	10	64034	64043	20 %	40 %	20 %	20 %	338731826
1379	NC_015710	A	6	6	64205	64210	100 %	0 %	0 %	0 %	338731826
1380	NC_015710	ACTCT	2	10	64241	64250	20 %	40 %	0 %	40 %	338731826
1381	NC_015710	ACA	2	6	64254	64259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731826
1382	NC_015710	GAA	2	6	64306	64311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731826
1383	NC_015710	A	7	7	64318	64324	100 %	0 %	0 %	0 %	338731826
1384	NC_015710	TTTG	2	8	64410	64417	0 %	75 %	25 %	0 %	338731826
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