MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 2919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015595	CGGCGA	2	12	82864	82875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334346602
2002	NC_015595	TGA	2	6	82963	82968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346602
2003	NC_015595	CAT	2	6	82981	82986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346602
2004	NC_015595	GAA	2	6	83002	83007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346602
2005	NC_015595	CGG	2	6	83032	83037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346602
2006	NC_015595	CCG	2	6	83054	83059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346603
2007	NC_015595	CGA	2	6	83101	83106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346603
2008	NC_015595	CCT	2	6	83116	83121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346603
2009	NC_015595	CCGG	2	8	83143	83150	0 %	0 %	50 %	50 %	334346603
2010	NC_015595	TGT	2	6	83158	83163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346603
2011	NC_015595	TTG	2	6	83208	83213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346603
2012	NC_015595	TTGCCG	2	12	83217	83228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346603
2013	NC_015595	GGC	2	6	83255	83260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346603
2014	NC_015595	CGA	2	6	83266	83271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346603
2015	NC_015595	GC	3	6	83284	83289	0 %	0 %	50 %	50 %	334346603
2016	NC_015595	AAG	2	6	83307	83312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346603
2017	NC_015595	CG	3	6	83467	83472	0 %	0 %	50 %	50 %	334346603
2018	NC_015595	CG	3	6	83518	83523	0 %	0 %	50 %	50 %	334346603
2019	NC_015595	AGA	2	6	83667	83672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346603
2020	NC_015595	TCGG	2	8	83724	83731	0 %	25 %	50 %	25 %	334346603
2021	NC_015595	GC	3	6	83734	83739	0 %	0 %	50 %	50 %	334346603
2022	NC_015595	GCC	3	9	83745	83753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346603
2023	NC_015595	CGCC	2	8	83784	83791	0 %	0 %	25 %	75 %	334346603
2024	NC_015595	CCT	2	6	83850	83855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346603
2025	NC_015595	CTG	2	6	83920	83925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346603
2026	NC_015595	CCG	2	6	83992	83997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346603
2027	NC_015595	CGC	2	6	84030	84035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346603
2028	NC_015595	GCC	2	6	84042	84047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346603
2029	NC_015595	C	6	6	84173	84178	0 %	0 %	0 %	100 %	334346603
2030	NC_015595	GGA	2	6	84257	84262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346603
2031	NC_015595	TG	3	6	84294	84299	0 %	50 %	50 %	0 %	334346604
2032	NC_015595	CGC	2	6	84388	84393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346604
2033	NC_015595	CCA	2	6	84418	84423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346604
2034	NC_015595	GAC	3	9	84428	84436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2035	NC_015595	TCG	2	6	84441	84446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2036	NC_015595	TCCG	2	8	84476	84483	0 %	25 %	25 %	50 %	334346604
2037	NC_015595	AT	3	6	84494	84499	50 %	50 %	0 %	0 %	334346604
2038	NC_015595	CGA	2	6	84619	84624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2039	NC_015595	CG	3	6	84702	84707	0 %	0 %	50 %	50 %	334346604
2040	NC_015595	CGT	2	6	84718	84723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2041	NC_015595	CG	3	6	84829	84834	0 %	0 %	50 %	50 %	334346604
2042	NC_015595	GTG	2	6	84837	84842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346604
2043	NC_015595	GGTC	2	8	84854	84861	0 %	25 %	50 %	25 %	334346604
2044	NC_015595	CGGCGA	2	12	84898	84909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334346604
2045	NC_015595	TCG	2	6	84957	84962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2046	NC_015595	CGA	2	6	84997	85002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2047	NC_015595	CGA	2	6	85030	85035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346604
2048	NC_015595	CG	3	6	85042	85047	0 %	0 %	50 %	50 %	334346604
2049	NC_015595	CGGA	2	8	85051	85058	25 %	0 %	50 %	25 %	334346604
2050	NC_015595	GCC	2	6	85086	85091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346604
2051	NC_015595	GC	3	6	85105	85110	0 %	0 %	50 %	50 %	334346604
2052	NC_015595	ATG	2	6	85113	85118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346604
2053	NC_015595	GCG	2	6	85119	85124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346604
2054	NC_015595	TCGGTC	2	12	85271	85282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346605
2055	NC_015595	TGA	2	6	85323	85328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346605
2056	NC_015595	CG	3	6	85344	85349	0 %	0 %	50 %	50 %	334346605
2057	NC_015595	TTG	2	6	85397	85402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346605
2058	NC_015595	GCT	2	6	85425	85430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346605
2059	NC_015595	TTC	2	6	85471	85476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346605
2060	NC_015595	GGT	2	6	85597	85602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346605
2061	NC_015595	GAC	2	6	85627	85632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346605
2062	NC_015595	TGC	2	6	85672	85677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346605
2063	NC_015595	AGCGC	2	10	85725	85734	20 %	0 %	40 %	40 %	334346605
2064	NC_015595	TCCTG	2	10	85743	85752	0 %	40 %	20 %	40 %	334346605
2065	NC_015595	TCA	2	6	85817	85822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346605
2066	NC_015595	GTC	2	6	85865	85870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_015595	GACGGC	2	12	85878	85889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_015595	CGG	2	6	85891	85896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_015595	GCG	2	6	85897	85902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_015595	GTGG	2	8	85921	85928	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_015595	GGT	2	6	85935	85940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_015595	GCG	2	6	85945	85950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_015595	GTG	2	6	85965	85970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_015595	CAGG	2	8	85987	85994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2075	NC_015595	CTT	2	6	86048	86053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_015595	GCG	2	6	86117	86122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_015595	ATG	3	9	86160	86168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_015595	CGC	2	6	86177	86182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346606
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2080	NC_015595	CGA	2	6	86199	86204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346606
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2082	NC_015595	GACGC	2	10	86237	86246	20 %	0 %	40 %	40 %	334346606
2083	NC_015595	GCG	2	6	86307	86312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346606
2084	NC_015595	GGCG	2	8	86336	86343	0 %	0 %	75 %	25 %	334346606
2085	NC_015595	GAA	3	9	86348	86356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346606
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2089	NC_015595	GAA	2	6	86528	86533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346606
2090	NC_015595	ATG	2	6	86586	86591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346606
2091	NC_015595	AGCC	2	8	86647	86654	25 %	0 %	25 %	50 %	334346606
2092	NC_015595	ATGT	2	8	86712	86719	25 %	50 %	25 %	0 %	334346606
2093	NC_015595	ACTAT	2	10	86745	86754	40 %	40 %	0 %	20 %	334346606
2094	NC_015595	TTGA	2	8	86759	86766	25 %	50 %	25 %	0 %	334346606
2095	NC_015595	GTC	2	6	86771	86776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346606
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2098	NC_015595	CGT	2	6	86882	86887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346606
2099	NC_015595	GCA	2	6	86889	86894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346606
2100	NC_015595	CAG	2	6	86900	86905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346606
2101	NC_015595	TGA	2	6	86950	86955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346606
2102	NC_015595	AAC	2	6	87023	87028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334346606
2103	NC_015595	AG	3	6	87103	87108	50 %	0 %	50 %	0 %	334346606
2104	NC_015595	TCA	2	6	87155	87160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_015595	CGA	2	6	87324	87329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_015595	GTC	2	6	87361	87366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346607
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2109	NC_015595	TTC	2	6	87549	87554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346607
2110	NC_015595	CGG	2	6	87560	87565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346607
2111	NC_015595	GCC	2	6	87589	87594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346607
2112	NC_015595	CG	3	6	87611	87616	0 %	0 %	50 %	50 %	334346607
2113	NC_015595	GC	3	6	87655	87660	0 %	0 %	50 %	50 %	334346607
2114	NC_015595	CGAG	2	8	87737	87744	25 %	0 %	50 %	25 %	334346607
2115	NC_015595	CGA	2	6	87762	87767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346607
2116	NC_015595	GAT	2	6	87832	87837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346607
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2118	NC_015595	GATC	2	8	87914	87921	25 %	25 %	25 %	25 %	334346607
2119	NC_015595	TTC	2	6	87934	87939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346607
2120	NC_015595	TGC	2	6	88035	88040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346607
2121	NC_015595	GCT	2	6	88091	88096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346608
2122	NC_015595	GTC	2	6	88125	88130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346608
2123	NC_015595	GAG	2	6	88155	88160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346608
2124	NC_015595	GTG	2	6	88174	88179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346608
2125	NC_015595	TCG	2	6	88198	88203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346608
2126	NC_015595	GCC	2	6	88209	88214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346608
2127	NC_015595	CCA	2	6	88226	88231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346608
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2132	NC_015595	AGCGC	2	10	88415	88424	20 %	0 %	40 %	40 %	334346608
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2217	NC_015595	GA	3	6	92045	92050	50 %	0 %	50 %	0 %	334346612
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2219	NC_015595	GGCGAG	2	12	92110	92121	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334346612
2220	NC_015595	GA	3	6	92167	92172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2221	NC_015595	CT	3	6	92219	92224	0 %	50 %	0 %	50 %	334346613
2222	NC_015595	C	6	6	92255	92260	0 %	0 %	0 %	100 %	334346613
2223	NC_015595	G	6	6	92265	92270	0 %	0 %	100 %	0 %	334346613
2224	NC_015595	GGTCG	2	10	92317	92326	0 %	20 %	60 %	20 %	334346613
2225	NC_015595	GCG	2	6	92340	92345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346613
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2229	NC_015595	CAGC	2	8	92510	92517	25 %	0 %	25 %	50 %	334346613
2230	NC_015595	GAT	2	6	92534	92539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346613
2231	NC_015595	CGT	2	6	92647	92652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346613
2232	NC_015595	GC	4	8	92929	92936	0 %	0 %	50 %	50 %	334346613
2233	NC_015595	CAG	2	6	92939	92944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346613
2234	NC_015595	GGC	2	6	92999	93004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346613
2235	NC_015595	TGC	2	6	93081	93086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346613
2236	NC_015595	TCG	2	6	93096	93101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346613
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2238	NC_015595	CGC	2	6	93121	93126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346613
2239	NC_015595	CTC	2	6	93153	93158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346614
2240	NC_015595	TGC	2	6	93160	93165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2241	NC_015595	CG	3	6	93208	93213	0 %	0 %	50 %	50 %	334346614
2242	NC_015595	GCT	2	6	93216	93221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2243	NC_015595	CG	3	6	93222	93227	0 %	0 %	50 %	50 %	334346614
2244	NC_015595	GTC	2	6	93232	93237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2245	NC_015595	CGA	2	6	93255	93260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2246	NC_015595	CTG	2	6	93325	93330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2247	NC_015595	CGA	2	6	93390	93395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346614
2248	NC_015595	GC	3	6	93437	93442	0 %	0 %	50 %	50 %	334346614
2249	NC_015595	CG	3	6	93489	93494	0 %	0 %	50 %	50 %	334346614
2250	NC_015595	GCG	3	9	93492	93500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346614
2251	NC_015595	CGTG	2	8	93543	93550	0 %	25 %	50 %	25 %	334346614
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2378	NC_015595	TCG	2	6	99443	99448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346621
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2499	NC_015595	CCG	2	6	105288	105293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346625
2500	NC_015595	CGG	2	6	105404	105409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346625

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