MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 33543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015594	CTG	2	6	158369	158374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342575
4002	NC_015594	GCG	2	6	158428	158433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342575
4003	NC_015594	CAT	2	6	158443	158448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342575
4004	NC_015594	CGC	2	6	158451	158456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342575
4005	NC_015594	GCCC	2	8	158563	158570	0 %	0 %	25 %	75 %	334342575
4006	NC_015594	GGC	2	6	158618	158623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342575
4007	NC_015594	TGC	2	6	158628	158633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342575
4008	NC_015594	GC	3	6	158632	158637	0 %	0 %	50 %	50 %	334342575
4009	NC_015594	GC	3	6	158708	158713	0 %	0 %	50 %	50 %	334342575
4010	NC_015594	GCA	2	6	158779	158784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342575
4011	NC_015594	GGA	2	6	158794	158799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342575
4012	NC_015594	CGA	2	6	158872	158877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342575
4013	NC_015594	GGC	2	6	158917	158922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342575
4014	NC_015594	CGG	2	6	158961	158966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342575
4015	NC_015594	GCA	2	6	159003	159008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015594	C	6	6	159072	159077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4017	NC_015594	ATCA	2	8	159108	159115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_015594	GC	3	6	159139	159144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015594	CAC	2	6	159174	159179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015594	CCG	2	6	159194	159199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_015594	CCGA	2	8	159202	159209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015594	CGC	2	6	159213	159218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_015594	ATA	2	6	159270	159275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342576
4024	NC_015594	TCG	2	6	159277	159282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342576
4025	NC_015594	GCC	2	6	159326	159331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342576
4026	NC_015594	TAG	2	6	159375	159380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342576
4027	NC_015594	ATT	2	6	159470	159475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342576
4028	NC_015594	TGA	2	6	159499	159504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342576
4029	NC_015594	TTG	2	6	159531	159536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342576
4030	NC_015594	TAT	2	6	159562	159567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342576
4031	NC_015594	GC	3	6	159576	159581	0 %	0 %	50 %	50 %	334342576
4032	NC_015594	ACA	2	6	159604	159609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342576
4033	NC_015594	CGG	2	6	159675	159680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342576
4034	NC_015594	CGA	2	6	159712	159717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342576
4035	NC_015594	GCT	2	6	159729	159734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342576
4036	NC_015594	TGA	2	6	159768	159773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342576
4037	NC_015594	CAT	2	6	159824	159829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342576
4038	NC_015594	ACG	2	6	159889	159894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015594	TGC	2	6	159913	159918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_015594	TGC	2	6	159978	159983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015594	TCAGC	2	10	160001	160010	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4042	NC_015594	TCC	2	6	160018	160023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_015594	AGAAA	2	10	160029	160038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015594	GCC	2	6	160065	160070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_015594	CG	3	6	160099	160104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_015594	AGCC	2	8	160172	160179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_015594	GCG	2	6	160180	160185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015594	ACA	2	6	160187	160192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015594	TCGC	2	8	160205	160212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_015594	GC	3	6	160278	160283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_015594	AGC	2	6	160291	160296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015594	ACC	2	6	160305	160310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015594	CGA	2	6	160352	160357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015594	CGC	2	6	160511	160516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015594	AT	3	6	160557	160562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015594	TAT	2	6	160575	160580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015594	CTT	2	6	160605	160610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015594	GTG	2	6	160676	160681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015594	GAT	2	6	160709	160714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015594	CTG	2	6	160760	160765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015594	GGA	2	6	160767	160772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015594	TG	3	6	160834	160839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015594	GAT	2	6	160857	160862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342577
4064	NC_015594	CCG	2	6	160879	160884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342577
4065	NC_015594	CTGCG	2	10	161058	161067	0 %	20 %	40 %	40 %	334342577
4066	NC_015594	GC	3	6	161202	161207	0 %	0 %	50 %	50 %	334342577
4067	NC_015594	CCG	2	6	161234	161239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342577
4068	NC_015594	GCT	2	6	161260	161265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342577
4069	NC_015594	CGT	2	6	161270	161275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342577
4070	NC_015594	AGGA	2	8	161421	161428	50 %	0 %	50 %	0 %	334342577
4071	NC_015594	GC	3	6	161467	161472	0 %	0 %	50 %	50 %	334342577
4072	NC_015594	CGG	2	6	161540	161545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342577
4073	NC_015594	ATC	2	6	161602	161607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342577
4074	NC_015594	TCT	2	6	161621	161626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342577
4075	NC_015594	GC	3	6	161634	161639	0 %	0 %	50 %	50 %	334342577
4076	NC_015594	ATG	2	6	161649	161654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342577
4077	NC_015594	GCC	2	6	161679	161684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342577
4078	NC_015594	ATC	2	6	161716	161721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342577
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4080	NC_015594	CG	4	8	161819	161826	0 %	0 %	50 %	50 %	334342577
4081	NC_015594	ACA	2	6	161869	161874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342577
4082	NC_015594	TGC	2	6	161875	161880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342577
4083	NC_015594	GC	3	6	161902	161907	0 %	0 %	50 %	50 %	334342577
4084	NC_015594	GCGG	2	8	161944	161951	0 %	0 %	75 %	25 %	334342577
4085	NC_015594	CCG	2	6	161968	161973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342577
4086	NC_015594	G	6	6	162040	162045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015594	CCG	2	6	162078	162083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_015594	CG	4	8	162271	162278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_015594	TCC	2	6	162345	162350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_015594	GCT	2	6	162351	162356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015594	TGA	3	9	162370	162378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015594	TCC	2	6	162393	162398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_015594	GCC	2	6	162601	162606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_015594	GCC	2	6	162733	162738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_015594	GCGG	2	8	162744	162751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_015594	CCG	2	6	162860	162865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342578
4097	NC_015594	GTC	2	6	162905	162910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342578
4098	NC_015594	GC	3	6	162940	162945	0 %	0 %	50 %	50 %	334342578
4099	NC_015594	TGG	2	6	162957	162962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342578
4100	NC_015594	TGA	2	6	162997	163002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342578
4101	NC_015594	GCC	2	6	163003	163008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342578
4102	NC_015594	GCA	2	6	163048	163053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342578
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4104	NC_015594	GCA	2	6	163123	163128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342578
4105	NC_015594	CGT	2	6	163171	163176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342578
4106	NC_015594	GAT	2	6	163199	163204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342578
4107	NC_015594	CAG	2	6	163229	163234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342578
4108	NC_015594	CTT	2	6	163273	163278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342578
4109	NC_015594	CG	3	6	163324	163329	0 %	0 %	50 %	50 %	334342578
4110	NC_015594	GCT	2	6	163426	163431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342578
4111	NC_015594	TCCA	2	8	163500	163507	25 %	25 %	0 %	50 %	334342578
4112	NC_015594	CTA	2	6	163520	163525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015594	CGAC	2	8	163577	163584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_015594	GTG	2	6	163595	163600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015594	CAA	2	6	163621	163626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015594	GCC	2	6	163641	163646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_015594	CAG	2	6	163753	163758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015594	CGG	2	6	163778	163783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015594	AGGC	2	8	163925	163932	25 %	0 %	50 %	25 %	334342579
4120	NC_015594	ATG	2	6	163942	163947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342579
4121	NC_015594	TCA	2	6	163997	164002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342579
4122	NC_015594	GGC	4	12	164004	164015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342579
4123	NC_015594	CCA	2	6	164064	164069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342579
4124	NC_015594	GGCT	2	8	164098	164105	0 %	25 %	50 %	25 %	334342579
4125	NC_015594	CCT	2	6	164165	164170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342579
4126	NC_015594	TCAC	2	8	164227	164234	25 %	25 %	0 %	50 %	334342579
4127	NC_015594	CAT	2	6	164235	164240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342579
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4140	NC_015594	TC	3	6	165004	165009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4249	NC_015594	CTT	2	6	170362	170367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342584
4250	NC_015594	CTC	2	6	170469	170474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342584
4251	NC_015594	TTC	2	6	170670	170675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342585
4252	NC_015594	CGAT	2	8	170699	170706	25 %	25 %	25 %	25 %	334342585
4253	NC_015594	TCG	2	6	170723	170728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342585
4254	NC_015594	GAT	2	6	170734	170739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342585
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4256	NC_015594	CAA	2	6	170886	170891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342585
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4259	NC_015594	CAG	2	6	171011	171016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342585
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4267	NC_015594	CAG	2	6	171303	171308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342585
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4270	NC_015594	ACG	2	6	171512	171517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342585
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4273	NC_015594	CTG	2	6	171643	171648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342585
4274	NC_015594	CAAG	2	8	171683	171690	50 %	0 %	25 %	25 %	334342585
4275	NC_015594	GCG	2	6	171700	171705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342585
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4318	NC_015594	CGG	3	9	173992	174000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4321	NC_015594	GA	3	6	174090	174095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4322	NC_015594	CG	3	6	174232	174237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4323	NC_015594	GCT	2	6	174285	174290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4325	NC_015594	AT	3	6	174480	174485	50 %	50 %	0 %	0 %	334342589
4326	NC_015594	GAA	2	6	174545	174550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342589
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4332	NC_015594	CGT	2	6	174831	174836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342590
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4336	NC_015594	ATCA	2	8	174955	174962	50 %	25 %	0 %	25 %	334342590
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4358	NC_015594	CAT	2	6	175835	175840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342591
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4360	NC_015594	GTGC	2	8	175915	175922	0 %	25 %	50 %	25 %	334342591
4361	NC_015594	CG	3	6	175923	175928	0 %	0 %	50 %	50 %	334342591
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4365	NC_015594	CAAG	2	8	176002	176009	50 %	0 %	25 %	25 %	334342591
4366	NC_015594	CGA	2	6	176089	176094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342591
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4368	NC_015594	CCG	2	6	176197	176202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4369	NC_015594	CACCT	2	10	176251	176260	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4371	NC_015594	GGC	2	6	176302	176307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342592
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4494	NC_015594	CTC	2	6	182529	182534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4497	NC_015594	GCA	2	6	182591	182596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_015594	CGG	2	6	182612	182617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_015594	CGG	2	6	182619	182624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_015594	CAG	2	6	182706	182711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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