MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 33543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015594	AT	3	6	549734	549739	50 %	50 %	0 %	0 %	334342891
13002	NC_015594	CG	3	6	549755	549760	0 %	0 %	50 %	50 %	334342891
13003	NC_015594	CG	4	8	549773	549780	0 %	0 %	50 %	50 %	334342891
13004	NC_015594	GGC	2	6	549795	549800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342891
13005	NC_015594	ATC	2	6	549822	549827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342891
13006	NC_015594	GACG	2	8	549867	549874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13007	NC_015594	G	6	6	549874	549879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_015594	CCTAT	2	10	549899	549908	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13009	NC_015594	TCC	2	6	549909	549914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_015594	CG	3	6	549939	549944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_015594	GTG	2	6	549949	549954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_015594	CCA	2	6	549989	549994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_015594	GCG	2	6	550217	550222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13014	NC_015594	GTC	2	6	550256	550261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13015	NC_015594	TGC	2	6	550332	550337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13016	NC_015594	GCT	2	6	550342	550347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13017	NC_015594	GGC	2	6	550353	550358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13018	NC_015594	GCG	2	6	550366	550371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13019	NC_015594	CGG	2	6	550376	550381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13020	NC_015594	GGC	4	12	550396	550407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13021	NC_015594	ACG	2	6	550431	550436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13022	NC_015594	CTG	2	6	550442	550447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13023	NC_015594	GCT	2	6	550453	550458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13024	NC_015594	CGG	3	9	550467	550475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13025	NC_015594	GGC	2	6	550480	550485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13026	NC_015594	GC	3	6	550502	550507	0 %	0 %	50 %	50 %	334342892
13027	NC_015594	CGA	2	6	550510	550515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13028	NC_015594	CTGG	2	8	550543	550550	0 %	25 %	50 %	25 %	334342892
13029	NC_015594	GC	3	6	550603	550608	0 %	0 %	50 %	50 %	334342892
13030	NC_015594	GGGC	2	8	550613	550620	0 %	0 %	75 %	25 %	334342892
13031	NC_015594	GCG	2	6	550640	550645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13032	NC_015594	GTG	2	6	550679	550684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342892
13033	NC_015594	CGG	2	6	550701	550706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13034	NC_015594	GCT	3	9	550738	550746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13035	NC_015594	TGT	2	6	550794	550799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342892
13036	NC_015594	GAT	2	6	550804	550809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342892
13037	NC_015594	TGC	3	9	550842	550850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13038	NC_015594	CGG	2	6	550858	550863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13039	NC_015594	ATG	2	6	550952	550957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342892
13040	NC_015594	CTG	2	6	551054	551059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13041	NC_015594	GCG	2	6	551060	551065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13042	NC_015594	TCG	2	6	551163	551168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13043	NC_015594	TCC	2	6	551171	551176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342892
13044	NC_015594	TGC	2	6	551178	551183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13045	NC_015594	CGG	2	6	551187	551192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13046	NC_015594	GGC	2	6	551269	551274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13047	NC_015594	CTG	2	6	551278	551283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13048	NC_015594	TGC	2	6	551289	551294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13049	NC_015594	GAGCG	2	10	551297	551306	20 %	0 %	60 %	20 %	334342892
13050	NC_015594	GGC	3	9	551332	551340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13051	NC_015594	TCG	2	6	551367	551372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13052	NC_015594	GGC	2	6	551386	551391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13053	NC_015594	AGGC	2	8	551418	551425	25 %	0 %	50 %	25 %	334342892
13054	NC_015594	GGGCG	2	10	551426	551435	0 %	0 %	80 %	20 %	334342892
13055	NC_015594	GCT	2	6	551479	551484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342892
13056	NC_015594	GCG	2	6	551503	551508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13057	NC_015594	CTGG	2	8	551602	551609	0 %	25 %	50 %	25 %	334342892
13058	NC_015594	GGC	2	6	551616	551621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13059	NC_015594	CGGGCG	2	12	551627	551638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342892
13060	NC_015594	GC	3	6	551641	551646	0 %	0 %	50 %	50 %	334342892
13061	NC_015594	CGC	2	6	551650	551655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342892
13062	NC_015594	GCC	3	9	551704	551712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342892
13063	NC_015594	GCC	2	6	551716	551721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342892
13064	NC_015594	TCG	2	6	551792	551797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_015594	ACG	2	6	551798	551803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_015594	GGC	2	6	551880	551885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_015594	GGC	2	6	551889	551894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_015594	GC	4	8	551976	551983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_015594	TCT	2	6	551999	552004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_015594	GTC	2	6	552009	552014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_015594	GCG	2	6	552052	552057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_015594	GGT	2	6	552092	552097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_015594	CGG	2	6	552142	552147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_015594	GCC	2	6	552175	552180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_015594	GCG	2	6	552219	552224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_015594	TGACGG	2	12	552235	552246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13077	NC_015594	CTG	2	6	552267	552272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_015594	ATC	2	6	552306	552311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_015594	GACC	2	8	552341	552348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_015594	GCG	2	6	552377	552382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_015594	CGG	2	6	552398	552403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_015594	CAT	2	6	552410	552415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_015594	GCC	2	6	552467	552472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13084	NC_015594	ATG	2	6	552476	552481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342893
13085	NC_015594	TGC	2	6	552519	552524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342893
13086	NC_015594	CTG	2	6	552539	552544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342893
13087	NC_015594	TGT	2	6	552552	552557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342893
13088	NC_015594	GGC	2	6	552562	552567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13089	NC_015594	GCG	2	6	552619	552624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13090	NC_015594	TGG	2	6	552639	552644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342893
13091	NC_015594	GCG	2	6	552653	552658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13092	NC_015594	GGC	2	6	552661	552666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13093	NC_015594	GCG	2	6	552671	552676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13094	NC_015594	GTG	2	6	552677	552682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342893
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13099	NC_015594	GTC	2	6	552886	552891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342893
13100	NC_015594	TGA	2	6	552897	552902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342893
13101	NC_015594	GTG	2	6	552917	552922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342893
13102	NC_015594	GCG	2	6	552974	552979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
13103	NC_015594	TGC	2	6	553002	553007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342893
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13107	NC_015594	GC	4	8	553141	553148	0 %	0 %	50 %	50 %	334342893
13108	NC_015594	GTG	2	6	553193	553198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342893
13109	NC_015594	TGC	4	12	553212	553223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342893
13110	NC_015594	TCGT	2	8	553248	553255	0 %	50 %	25 %	25 %	334342893
13111	NC_015594	GCC	2	6	553299	553304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342893
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13116	NC_015594	GTCA	2	8	553427	553434	25 %	25 %	25 %	25 %	334342893
13117	NC_015594	CGC	2	6	553446	553451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342893
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13121	NC_015594	GCG	2	6	553552	553557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342893
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13241	NC_015594	GGC	2	6	557642	557647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342894
13242	NC_015594	GACGC	2	10	557682	557691	20 %	0 %	40 %	40 %	334342894
13243	NC_015594	CGG	2	6	557722	557727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342894
13244	NC_015594	TCG	2	6	557737	557742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13245	NC_015594	GCA	2	6	557776	557781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13246	NC_015594	GTC	2	6	557834	557839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
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13248	NC_015594	GCCC	2	8	557902	557909	0 %	0 %	25 %	75 %	334342894
13249	NC_015594	TCG	2	6	557932	557937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13250	NC_015594	CGCC	2	8	557938	557945	0 %	0 %	25 %	75 %	334342894
13251	NC_015594	CGT	2	6	557948	557953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13252	NC_015594	GCGGAT	2	12	557969	557980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342894
13253	NC_015594	CGT	3	9	557992	558000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13254	NC_015594	TCG	2	6	558022	558027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13255	NC_015594	CGCC	2	8	558088	558095	0 %	0 %	25 %	75 %	334342894
13256	NC_015594	GTG	2	6	558099	558104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342894
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13260	NC_015594	CGT	2	6	558281	558286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
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13264	NC_015594	GTT	2	6	558377	558382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342894
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13268	NC_015594	CGT	2	6	558586	558591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342894
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13272	NC_015594	TAA	3	9	558675	558683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342894
13273	NC_015594	CCCG	2	8	558686	558693	0 %	0 %	25 %	75 %	334342894
13274	NC_015594	CGA	2	6	558727	558732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342894
13275	NC_015594	CGGG	2	8	558798	558805	0 %	0 %	75 %	25 %	334342894
13276	NC_015594	GCC	2	6	558818	558823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342894
13277	NC_015594	CGC	3	9	558829	558837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342894
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13281	NC_015594	TGT	2	6	558907	558912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342894
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13284	NC_015594	CGGTC	2	10	558947	558956	0 %	20 %	40 %	40 %	334342894
13285	NC_015594	GAT	2	6	558971	558976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342894
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13287	NC_015594	TCT	2	6	559237	559242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13288	NC_015594	CCA	2	6	559243	559248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13289	NC_015594	CTTGCG	2	12	559281	559292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13290	NC_015594	CGAT	2	8	559345	559352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13291	NC_015594	GCCGT	2	10	559382	559391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13292	NC_015594	GATCCC	2	12	559409	559420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13293	NC_015594	GCC	2	6	559505	559510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342895
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13304	NC_015594	TGA	2	6	559941	559946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342895
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13310	NC_015594	GC	3	6	560190	560195	0 %	0 %	50 %	50 %	334342895
13311	NC_015594	CGC	2	6	560200	560205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342895
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13322	NC_015594	GCC	2	6	560594	560599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342895
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13330	NC_015594	AGC	2	6	561024	561029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342895
13331	NC_015594	GC	3	6	561139	561144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13332	NC_015594	ACA	2	6	561172	561177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13333	NC_015594	CTG	2	6	561215	561220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
13334	NC_015594	GCG	2	6	561224	561229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342896
13335	NC_015594	GCT	2	6	561241	561246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
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13337	NC_015594	CAT	2	6	561298	561303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342896
13338	NC_015594	TGC	2	6	561333	561338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
13339	NC_015594	GAAGGT	2	12	561355	561366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	334342896
13340	NC_015594	ACA	2	6	561369	561374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342896
13341	NC_015594	CGAC	2	8	561408	561415	25 %	0 %	25 %	50 %	334342896
13342	NC_015594	CGC	2	6	561436	561441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342896
13343	NC_015594	GAC	2	6	561442	561447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342896
13344	NC_015594	GCGG	2	8	561462	561469	0 %	0 %	75 %	25 %	334342896
13345	NC_015594	G	6	6	561482	561487	0 %	0 %	100 %	0 %	334342896
13346	NC_015594	TGC	2	6	561513	561518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
13347	NC_015594	GGAAG	2	10	561553	561562	40 %	0 %	60 %	0 %	334342896
13348	NC_015594	CGGGG	2	10	561577	561586	0 %	0 %	80 %	20 %	334342896
13349	NC_015594	AT	3	6	561745	561750	50 %	50 %	0 %	0 %	334342896
13350	NC_015594	ACC	2	6	561761	561766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342896
13351	NC_015594	CCG	2	6	561780	561785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342896
13352	NC_015594	TCC	2	6	561871	561876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13353	NC_015594	GC	3	6	561879	561884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13354	NC_015594	CG	3	6	561902	561907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13355	NC_015594	GTG	2	6	561912	561917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13356	NC_015594	CCA	2	6	561951	561956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13357	NC_015594	GGC	2	6	561965	561970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13358	NC_015594	AG	3	6	561976	561981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_015594	CT	3	6	561990	561995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13360	NC_015594	ATAGG	2	10	562026	562035	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_015594	GGC	2	6	562088	562093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13478	NC_015594	TCC	2	6	566628	566633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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