MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 33543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015594	GTCG	2	8	530347	530354	0 %	25 %	50 %	25 %	334342876
12502	NC_015594	GGT	2	6	530400	530405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_015594	CTG	2	6	530428	530433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_015594	GGCGC	2	10	530539	530548	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12505	NC_015594	TCC	2	6	530641	530646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_015594	AG	3	6	530672	530677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_015594	CT	3	6	530686	530691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_015594	TGG	2	6	530707	530712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_015594	CCA	2	6	530745	530750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_015594	CG	3	6	530756	530761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_015594	GGA	2	6	530786	530791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_015594	GTC	2	6	530801	530806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_015594	GCA	2	6	530876	530881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342877
12514	NC_015594	CAG	2	6	530910	530915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342877
12515	NC_015594	GCC	2	6	531033	531038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342877
12516	NC_015594	CCG	2	6	531092	531097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342877
12517	NC_015594	CCT	2	6	531146	531151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342877
12518	NC_015594	GGCGG	2	10	531153	531162	0 %	0 %	80 %	20 %	334342877
12519	NC_015594	CGGGCG	2	12	531191	531202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342877
12520	NC_015594	GCA	2	6	531227	531232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342877
12521	NC_015594	C	9	9	531238	531246	0 %	0 %	0 %	100 %	334342877
12522	NC_015594	CGCC	2	8	531281	531288	0 %	0 %	25 %	75 %	334342877
12523	NC_015594	CGA	2	6	531374	531379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342877
12524	NC_015594	TCC	3	9	531421	531429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342877
12525	NC_015594	CAG	2	6	531432	531437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342877
12526	NC_015594	CGCC	2	8	531497	531504	0 %	0 %	25 %	75 %	334342877
12527	NC_015594	GCG	2	6	531514	531519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342877
12528	NC_015594	CGGTC	2	10	531615	531624	0 %	20 %	40 %	40 %	334342877
12529	NC_015594	CGA	2	6	531670	531675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12530	NC_015594	CGG	2	6	531694	531699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12531	NC_015594	CTT	2	6	531794	531799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342878
12532	NC_015594	CG	3	6	531817	531822	0 %	0 %	50 %	50 %	334342878
12533	NC_015594	CAT	2	6	531878	531883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342878
12534	NC_015594	TGA	2	6	531931	531936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342878
12535	NC_015594	TCA	2	6	531955	531960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342878
12536	NC_015594	CGG	2	6	531981	531986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12537	NC_015594	CAG	2	6	532058	532063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12538	NC_015594	CGG	2	6	532156	532161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12539	NC_015594	GTCG	2	8	532202	532209	0 %	25 %	50 %	25 %	334342878
12540	NC_015594	GCG	2	6	532232	532237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12541	NC_015594	GCA	2	6	532249	532254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12542	NC_015594	CGC	2	6	532259	532264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342878
12543	NC_015594	GCC	2	6	532301	532306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342878
12544	NC_015594	ACC	2	6	532338	532343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342878
12545	NC_015594	GTCG	2	8	532349	532356	0 %	25 %	50 %	25 %	334342878
12546	NC_015594	CGC	2	6	532397	532402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342878
12547	NC_015594	GTTGAC	2	12	532418	532429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334342878
12548	NC_015594	GGC	2	6	532492	532497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12549	NC_015594	GCA	2	6	532501	532506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12550	NC_015594	CGG	2	6	532549	532554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12551	NC_015594	G	7	7	532558	532564	0 %	0 %	100 %	0 %	334342878
12552	NC_015594	GGAGG	2	10	532703	532712	20 %	0 %	80 %	0 %	334342878
12553	NC_015594	GTG	2	6	532911	532916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342878
12554	NC_015594	ATCGGG	2	12	532941	532952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342878
12555	NC_015594	GATGCC	2	12	532964	532975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12556	NC_015594	CGT	2	6	533008	533013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12557	NC_015594	GGC	2	6	533101	533106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12558	NC_015594	GC	3	6	533129	533134	0 %	0 %	50 %	50 %	334342878
12559	NC_015594	CGG	2	6	533158	533163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12560	NC_015594	CGA	2	6	533218	533223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12561	NC_015594	GAA	2	6	533246	533251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342878
12562	NC_015594	CAG	2	6	533309	533314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12563	NC_015594	CTG	2	6	533327	533332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12564	NC_015594	GCG	2	6	533370	533375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12565	NC_015594	ATC	2	6	533391	533396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342878
12566	NC_015594	GGC	2	6	533413	533418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342878
12567	NC_015594	CGT	2	6	533437	533442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12568	NC_015594	TGA	2	6	533458	533463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342878
12569	NC_015594	GCA	2	6	533467	533472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12570	NC_015594	TGG	2	6	533484	533489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342878
12571	NC_015594	TCC	2	6	533511	533516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342878
12572	NC_015594	GTC	2	6	533546	533551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342878
12573	NC_015594	GTCAT	2	10	533562	533571	20 %	40 %	20 %	20 %	334342878
12574	NC_015594	GGC	2	6	533691	533696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_015594	CTT	3	9	533718	533726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342879
12576	NC_015594	CGC	2	6	533738	533743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342879
12577	NC_015594	GGT	3	9	533781	533789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342879
12578	NC_015594	TCG	3	9	533926	533934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12579	NC_015594	CAG	2	6	533940	533945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12580	NC_015594	CGT	2	6	534005	534010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12581	NC_015594	AT	3	6	534019	534024	50 %	50 %	0 %	0 %	334342879
12582	NC_015594	TCG	2	6	534196	534201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12583	NC_015594	CGG	2	6	534202	534207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342879
12584	NC_015594	GCC	2	6	534210	534215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342879
12585	NC_015594	CGT	2	6	534411	534416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12586	NC_015594	AGC	2	6	534427	534432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12587	NC_015594	GGC	3	9	534439	534447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342879
12588	NC_015594	GC	3	6	534465	534470	0 %	0 %	50 %	50 %	334342879
12589	NC_015594	GCA	2	6	534476	534481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342879
12590	NC_015594	CCA	2	6	534536	534541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342879
12591	NC_015594	ATC	2	6	534607	534612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342879
12592	NC_015594	AGA	2	6	534646	534651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_015594	GGA	2	6	534677	534682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_015594	ATT	2	6	534717	534722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342880
12595	NC_015594	GGC	2	6	534723	534728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12596	NC_015594	TCCG	2	8	534821	534828	0 %	25 %	25 %	50 %	334342880
12597	NC_015594	GGA	3	9	534831	534839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342880
12598	NC_015594	TCG	2	6	534845	534850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12599	NC_015594	CCG	2	6	534865	534870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342880
12600	NC_015594	CGC	2	6	534872	534877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342880
12601	NC_015594	GTT	2	6	534891	534896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342880
12602	NC_015594	GC	3	6	534946	534951	0 %	0 %	50 %	50 %	334342880
12603	NC_015594	GCA	2	6	534993	534998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12604	NC_015594	CGGT	2	8	535045	535052	0 %	25 %	50 %	25 %	334342880
12605	NC_015594	CCGAG	2	10	535061	535070	20 %	0 %	40 %	40 %	334342880
12606	NC_015594	GCGG	3	12	535096	535107	0 %	0 %	75 %	25 %	334342880
12607	NC_015594	CGG	2	6	535118	535123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12608	NC_015594	GC	3	6	535127	535132	0 %	0 %	50 %	50 %	334342880
12609	NC_015594	TCG	2	6	535178	535183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12610	NC_015594	GTC	2	6	535206	535211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12611	NC_015594	GGC	2	6	535232	535237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12612	NC_015594	GGCT	2	8	535246	535253	0 %	25 %	50 %	25 %	334342880
12613	NC_015594	TCG	2	6	535277	535282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12614	NC_015594	AGC	2	6	535301	535306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342880
12615	NC_015594	GCG	2	6	535329	535334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12616	NC_015594	CGG	2	6	535367	535372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12617	NC_015594	GGC	2	6	535424	535429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
12618	NC_015594	GAT	2	6	535458	535463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342880
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12620	NC_015594	GCG	2	6	535538	535543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342880
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12859	NC_015594	CCA	2	6	544218	544223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12973	NC_015594	GTC	2	6	548784	548789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342891
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12981	NC_015594	GGA	2	6	549017	549022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342891
12982	NC_015594	GAT	2	6	549047	549052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342891
12983	NC_015594	TCA	2	6	549064	549069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342891
12984	NC_015594	GC	3	6	549129	549134	0 %	0 %	50 %	50 %	334342891
12985	NC_015594	CGA	2	6	549143	549148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342891
12986	NC_015594	TCA	2	6	549154	549159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342891
12987	NC_015594	TCA	2	6	549175	549180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342891
12988	NC_015594	ATC	2	6	549204	549209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342891
12989	NC_015594	GTC	2	6	549210	549215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342891
12990	NC_015594	TGG	2	6	549262	549267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342891
12991	NC_015594	GCGG	2	8	549320	549327	0 %	0 %	75 %	25 %	334342891
12992	NC_015594	CTT	2	6	549344	549349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342891
12993	NC_015594	CTG	2	6	549378	549383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342891
12994	NC_015594	TGA	2	6	549412	549417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342891
12995	NC_015594	GGCG	2	8	549461	549468	0 %	0 %	75 %	25 %	334342891
12996	NC_015594	CGA	2	6	549482	549487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342891
12997	NC_015594	GCG	2	6	549631	549636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342891
12998	NC_015594	CCG	3	9	549643	549651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342891
12999	NC_015594	GCC	2	6	549660	549665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342891
13000	NC_015594	GGCGG	2	10	549723	549732	0 %	0 %	80 %	20 %	334342891

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