MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 33543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015594	GTC	2	6	460927	460932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342818
11002	NC_015594	TCT	2	6	461011	461016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342818
11003	NC_015594	GGC	2	6	461141	461146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342818
11004	NC_015594	GGA	2	6	461155	461160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342818
11005	NC_015594	CGA	2	6	461251	461256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342818
11006	NC_015594	GTT	2	6	461305	461310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342818
11007	NC_015594	CCT	2	6	461313	461318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342818
11008	NC_015594	AAG	2	6	461322	461327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342818
11009	NC_015594	TC	3	6	461332	461337	0 %	50 %	0 %	50 %	334342818
11010	NC_015594	AGC	2	6	461409	461414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342818
11011	NC_015594	GTG	2	6	461534	461539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342818
11012	NC_015594	CG	3	6	461563	461568	0 %	0 %	50 %	50 %	334342818
11013	NC_015594	GC	3	6	461626	461631	0 %	0 %	50 %	50 %	334342818
11014	NC_015594	CTG	2	6	461680	461685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342818
11015	NC_015594	ACG	2	6	461735	461740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342818
11016	NC_015594	C	6	6	461772	461777	0 %	0 %	0 %	100 %	334342818
11017	NC_015594	GCG	2	6	461790	461795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342818
11018	NC_015594	ATG	2	6	461805	461810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342818
11019	NC_015594	TGA	2	6	461826	461831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342818
11020	NC_015594	AGT	2	6	461861	461866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342818
11021	NC_015594	TTC	2	6	461870	461875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342818
11022	NC_015594	CG	3	6	461895	461900	0 %	0 %	50 %	50 %	334342818
11023	NC_015594	GGAA	2	8	461978	461985	50 %	0 %	50 %	0 %	334342818
11024	NC_015594	TAT	2	6	461999	462004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342818
11025	NC_015594	CGAC	2	8	462146	462153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_015594	GCA	2	6	462236	462241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342819
11027	NC_015594	GTG	2	6	462263	462268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342819
11028	NC_015594	AAT	2	6	462282	462287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342819
11029	NC_015594	CAG	2	6	462288	462293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342819
11030	NC_015594	GCT	2	6	462308	462313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342819
11031	NC_015594	ATC	2	6	462324	462329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342819
11032	NC_015594	TCG	2	6	462343	462348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342819
11033	NC_015594	CGAG	2	8	462361	462368	25 %	0 %	50 %	25 %	334342819
11034	NC_015594	GAA	2	6	462398	462403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342819
11035	NC_015594	CGT	2	6	462485	462490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342819
11036	NC_015594	TTC	2	6	462498	462503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342819
11037	NC_015594	AT	3	6	462599	462604	50 %	50 %	0 %	0 %	334342819
11038	NC_015594	GC	4	8	462691	462698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_015594	AGG	2	6	462703	462708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_015594	GTG	2	6	462746	462751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342820
11041	NC_015594	GCC	3	9	462776	462784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342820
11042	NC_015594	AAG	2	6	462801	462806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342820
11043	NC_015594	TTG	2	6	462867	462872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342820
11044	NC_015594	GAC	2	6	462920	462925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342820
11045	NC_015594	ATG	2	6	462935	462940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342820
11046	NC_015594	CGA	2	6	462941	462946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342820
11047	NC_015594	TGC	2	6	462988	462993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342820
11048	NC_015594	GCC	2	6	463000	463005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342820
11049	NC_015594	CGGG	2	8	463113	463120	0 %	0 %	75 %	25 %	334342820
11050	NC_015594	GGT	2	6	463123	463128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342820
11051	NC_015594	CCG	2	6	463143	463148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342820
11052	NC_015594	GCA	2	6	463172	463177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342820
11053	NC_015594	CGT	2	6	463215	463220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342820
11054	NC_015594	CGC	2	6	463234	463239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342820
11055	NC_015594	GC	3	6	463238	463243	0 %	0 %	50 %	50 %	334342820
11056	NC_015594	GGT	2	6	463333	463338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342820
11057	NC_015594	GCG	2	6	463346	463351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342820
11058	NC_015594	GGC	2	6	463374	463379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342820
11059	NC_015594	CGG	2	6	463432	463437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342820
11060	NC_015594	TC	3	6	463474	463479	0 %	50 %	0 %	50 %	334342820
11061	NC_015594	AT	3	6	463511	463516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_015594	ACC	2	6	463668	463673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342821
11063	NC_015594	ATC	2	6	463731	463736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342821
11064	NC_015594	TCC	2	6	463786	463791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342821
11065	NC_015594	GAGC	2	8	463816	463823	25 %	0 %	50 %	25 %	334342821
11066	NC_015594	TCC	2	6	463881	463886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342821
11067	NC_015594	TGGT	2	8	463908	463915	0 %	50 %	50 %	0 %	334342821
11068	NC_015594	ATA	2	6	463937	463942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342821
11069	NC_015594	GAT	2	6	463956	463961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342821
11070	NC_015594	ATCA	2	8	464003	464010	50 %	25 %	0 %	25 %	334342821
11071	NC_015594	CCA	2	6	464019	464024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342821
11072	NC_015594	ATT	2	6	464027	464032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342821
11073	NC_015594	CT	3	6	464039	464044	0 %	50 %	0 %	50 %	334342821
11074	NC_015594	GATAC	2	10	464078	464087	40 %	20 %	20 %	20 %	334342821
11075	NC_015594	CGG	2	6	464137	464142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342821
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11077	NC_015594	TGT	2	6	464332	464337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_015594	CA	3	6	464389	464394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_015594	ATT	2	6	464437	464442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_015594	CG	3	6	464456	464461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11081	NC_015594	TCAA	2	8	464464	464471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11082	NC_015594	GGC	2	6	464562	464567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342822
11083	NC_015594	TGC	2	6	464666	464671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342822
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11085	NC_015594	CG	3	6	464911	464916	0 %	0 %	50 %	50 %	334342822
11086	NC_015594	CTG	2	6	464920	464925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11087	NC_015594	CAT	2	6	464938	464943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342822
11088	NC_015594	GTC	2	6	464962	464967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11089	NC_015594	CGC	2	6	465086	465091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342822
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11091	NC_015594	CGG	2	6	465168	465173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342822
11092	NC_015594	CGA	3	9	465174	465182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11093	NC_015594	TGA	2	6	465267	465272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342822
11094	NC_015594	CAC	2	6	465345	465350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342822
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11097	NC_015594	CCGA	2	8	465496	465503	25 %	0 %	25 %	50 %	334342822
11098	NC_015594	ACGC	2	8	465548	465555	25 %	0 %	25 %	50 %	334342822
11099	NC_015594	ATG	2	6	465556	465561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342822
11100	NC_015594	GGAG	2	8	465690	465697	25 %	0 %	75 %	0 %	334342822
11101	NC_015594	CAA	2	6	465735	465740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342822
11102	NC_015594	AT	3	6	465759	465764	50 %	50 %	0 %	0 %	334342822
11103	NC_015594	CGA	2	6	465777	465782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11104	NC_015594	CCA	2	6	465798	465803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342822
11105	NC_015594	CTGGGC	2	12	465822	465833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334342822
11106	NC_015594	GAAA	2	8	465915	465922	75 %	0 %	25 %	0 %	334342822
11107	NC_015594	GC	3	6	465928	465933	0 %	0 %	50 %	50 %	334342822
11108	NC_015594	CCA	2	6	465954	465959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342822
11109	NC_015594	CGT	2	6	465960	465965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11110	NC_015594	CGA	2	6	465977	465982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11111	NC_015594	CAA	2	6	466033	466038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342822
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11114	NC_015594	ACG	2	6	466165	466170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342822
11115	NC_015594	C	6	6	466180	466185	0 %	0 %	0 %	100 %	334342822
11116	NC_015594	CCA	2	6	466292	466297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342822
11117	NC_015594	CGC	3	9	466371	466379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342822
11118	NC_015594	CGG	2	6	466392	466397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342822
11119	NC_015594	GAAA	2	8	466406	466413	75 %	0 %	25 %	0 %	334342822
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11121	NC_015594	CGG	2	6	466487	466492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342822
11122	NC_015594	TC	3	6	466500	466505	0 %	50 %	0 %	50 %	334342822
11123	NC_015594	CGGC	2	8	466532	466539	0 %	0 %	50 %	50 %	334342822
11124	NC_015594	GGA	2	6	466549	466554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342822
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11231	NC_015594	GCG	2	6	472317	472322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342826
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11244	NC_015594	CTT	2	6	472887	472892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342826
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11266	NC_015594	GCC	2	6	474020	474025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11343	NC_015594	GAA	2	6	478290	478295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342830
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11350	NC_015594	TTTCG	2	10	478601	478610	0 %	60 %	20 %	20 %	334342830
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11356	NC_015594	TGGA	2	8	478872	478879	25 %	25 %	50 %	0 %	334342830
11357	NC_015594	TG	3	6	478948	478953	0 %	50 %	50 %	0 %	334342830
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11484	NC_015594	GCC	2	6	485230	485235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342836
11485	NC_015594	GCC	2	6	485252	485257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342836
11486	NC_015594	CGG	2	6	485272	485277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342836
11487	NC_015594	CAT	2	6	485307	485312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342836
11488	NC_015594	TCC	2	6	485339	485344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342836
11489	NC_015594	CGCAGG	2	12	485381	485392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334342836
11490	NC_015594	GCGAC	2	10	485418	485427	20 %	0 %	40 %	40 %	334342836
11491	NC_015594	TCA	2	6	485474	485479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342836
11492	NC_015594	ACG	2	6	485498	485503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342836
11493	NC_015594	TGC	2	6	485535	485540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342836
11494	NC_015594	CCCG	2	8	485593	485600	0 %	0 %	25 %	75 %	334342836
11495	NC_015594	CGAG	2	8	485605	485612	25 %	0 %	50 %	25 %	334342836
11496	NC_015594	GCCG	2	8	485719	485726	0 %	0 %	50 %	50 %	334342836
11497	NC_015594	ATC	2	6	485729	485734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342836
11498	NC_015594	CG	3	6	485736	485741	0 %	0 %	50 %	50 %	334342836
11499	NC_015594	GACAT	2	10	485861	485870	40 %	20 %	20 %	20 %	334342836
11500	NC_015594	GCCT	2	8	485875	485882	0 %	25 %	25 %	50 %	334342836

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