MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 33543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015594	GC	3	6	243514	243519	0 %	0 %	50 %	50 %	334342638
6002	NC_015594	TTG	2	6	243549	243554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342638
6003	NC_015594	CG	3	6	243565	243570	0 %	0 %	50 %	50 %	334342638
6004	NC_015594	CGG	2	6	243586	243591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342638
6005	NC_015594	CGA	2	6	243595	243600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6006	NC_015594	CGA	2	6	243605	243610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6007	NC_015594	GCT	2	6	243650	243655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6008	NC_015594	GC	3	6	243700	243705	0 %	0 %	50 %	50 %	334342638
6009	NC_015594	CGG	3	9	243733	243741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342638
6010	NC_015594	CCG	2	6	243792	243797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6011	NC_015594	GCC	2	6	243818	243823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6012	NC_015594	GGTC	2	8	243844	243851	0 %	25 %	50 %	25 %	334342638
6013	NC_015594	TGA	2	6	243874	243879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342638
6014	NC_015594	ATA	2	6	243911	243916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342638
6015	NC_015594	CGG	3	9	243943	243951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342638
6016	NC_015594	GCC	2	6	243977	243982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6017	NC_015594	GCC	2	6	243998	244003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6018	NC_015594	GCTG	2	8	244039	244046	0 %	25 %	50 %	25 %	334342638
6019	NC_015594	ATA	2	6	244178	244183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342638
6020	NC_015594	GCC	2	6	244211	244216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6021	NC_015594	CGG	2	6	244318	244323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342638
6022	NC_015594	CGT	2	6	244369	244374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6023	NC_015594	GGT	2	6	244378	244383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342638
6024	NC_015594	TTG	2	6	244425	244430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342638
6025	NC_015594	ATA	2	6	244448	244453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342638
6026	NC_015594	GTC	2	6	244490	244495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6027	NC_015594	CCG	3	9	244542	244550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6028	NC_015594	ACGC	2	8	244631	244638	25 %	0 %	25 %	50 %	334342638
6029	NC_015594	CGT	2	6	244651	244656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6030	NC_015594	GAT	2	6	244679	244684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342638
6031	NC_015594	GCC	2	6	244703	244708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342638
6032	NC_015594	CAG	2	6	244763	244768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6033	NC_015594	CTG	2	6	244772	244777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6034	NC_015594	TTG	2	6	244791	244796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342638
6035	NC_015594	GCG	2	6	244813	244818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342638
6036	NC_015594	CAG	2	6	244823	244828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6037	NC_015594	CGGG	2	8	244829	244836	0 %	0 %	75 %	25 %	334342638
6038	NC_015594	TCG	2	6	244878	244883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342638
6039	NC_015594	AGGA	2	8	244977	244984	50 %	0 %	50 %	0 %	334342638
6040	NC_015594	T	7	7	245023	245029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015594	AAT	2	6	245082	245087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015594	TAT	2	6	245088	245093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015594	G	6	6	245149	245154	0 %	0 %	100 %	0 %	334342639
6044	NC_015594	GCC	3	9	245159	245167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342639
6045	NC_015594	GC	3	6	245170	245175	0 %	0 %	50 %	50 %	334342639
6046	NC_015594	CGC	3	9	245221	245229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342639
6047	NC_015594	CGG	2	6	245308	245313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342639
6048	NC_015594	GCC	2	6	245327	245332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342639
6049	NC_015594	CAT	2	6	245359	245364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342639
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6051	NC_015594	CCG	2	6	245380	245385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342640
6052	NC_015594	TGC	2	6	245399	245404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342640
6053	NC_015594	AGA	2	6	245432	245437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342640
6054	NC_015594	CGC	2	6	245444	245449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342640
6055	NC_015594	GC	3	6	245448	245453	0 %	0 %	50 %	50 %	334342640
6056	NC_015594	CGAC	2	8	245476	245483	25 %	0 %	25 %	50 %	334342640
6057	NC_015594	CGA	2	6	245495	245500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342640
6058	NC_015594	CCG	2	6	245513	245518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342640
6059	NC_015594	GGC	3	9	245637	245645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342640
6060	NC_015594	GATC	2	8	245682	245689	25 %	25 %	25 %	25 %	334342640
6061	NC_015594	CCG	2	6	245728	245733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342640
6062	NC_015594	GTC	2	6	245793	245798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342640
6063	NC_015594	TTG	2	6	245842	245847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342640
6064	NC_015594	ACC	2	6	245848	245853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342640
6065	NC_015594	GC	3	6	245885	245890	0 %	0 %	50 %	50 %	334342640
6066	NC_015594	CAGG	2	8	245898	245905	25 %	0 %	50 %	25 %	334342640
6067	NC_015594	TGA	2	6	245908	245913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342640
6068	NC_015594	GGC	2	6	245994	245999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342640
6069	NC_015594	GAC	2	6	246066	246071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342640
6070	NC_015594	ATG	2	6	246085	246090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342640
6071	NC_015594	CTC	2	6	246094	246099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_015594	CCAA	2	8	246131	246138	50 %	0 %	0 %	50 %	334342641
6073	NC_015594	AAC	2	6	246200	246205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342641
6074	NC_015594	ATT	2	6	246219	246224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342641
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6076	NC_015594	GCA	2	6	246350	246355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342641
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6078	NC_015594	CAG	2	6	246528	246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342641
6079	NC_015594	GC	3	6	246577	246582	0 %	0 %	50 %	50 %	334342641
6080	NC_015594	TA	3	6	246591	246596	50 %	50 %	0 %	0 %	334342641
6081	NC_015594	GGC	2	6	246616	246621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342641
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6086	NC_015594	CAG	2	6	246726	246731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342641
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6092	NC_015594	CAG	2	6	246936	246941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342641
6093	NC_015594	TGA	2	6	247067	247072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342641
6094	NC_015594	CAG	2	6	247074	247079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342641
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6099	NC_015594	GCGG	2	8	247209	247216	0 %	0 %	75 %	25 %	334342642
6100	NC_015594	TGC	2	6	247222	247227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342642
6101	NC_015594	GACG	2	8	247322	247329	25 %	0 %	50 %	25 %	334342642
6102	NC_015594	CATGGC	2	12	247334	247345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342642
6103	NC_015594	CTG	2	6	247373	247378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342642
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6105	NC_015594	CGA	2	6	247423	247428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342642
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6108	NC_015594	CATGG	2	10	247496	247505	20 %	20 %	40 %	20 %	334342642
6109	NC_015594	GCC	2	6	247535	247540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342642
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6111	NC_015594	GC	3	6	247555	247560	0 %	0 %	50 %	50 %	334342642
6112	NC_015594	GCC	2	6	247595	247600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342642
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6119	NC_015594	GCG	2	6	247890	247895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342642
6120	NC_015594	GCC	2	6	247941	247946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342642
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6122	NC_015594	GGGC	2	8	247957	247964	0 %	0 %	75 %	25 %	334342642
6123	NC_015594	GC	3	6	247963	247968	0 %	0 %	50 %	50 %	334342642
6124	NC_015594	TCC	2	6	247989	247994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342642
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6131	NC_015594	GCC	2	6	248367	248372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342642
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6145	NC_015594	CGCC	2	8	248971	248978	0 %	0 %	25 %	75 %	334342642
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6155	NC_015594	CTG	2	6	249335	249340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342642
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6174	NC_015594	TCG	2	6	250117	250122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342644
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6202	NC_015594	AG	3	6	251123	251128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6203	NC_015594	GGC	2	6	251192	251197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342645
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6230	NC_015594	CGC	3	9	251992	252000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342645
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6234	NC_015594	TAT	2	6	252098	252103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342645
6235	NC_015594	TCG	2	6	252144	252149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342645
6236	NC_015594	ATCGCC	2	12	252280	252291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334342646
6237	NC_015594	GCT	4	12	252294	252305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342646
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6239	NC_015594	CCATCG	2	12	252314	252325	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334342646
6240	NC_015594	AAG	2	6	252370	252375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342646
6241	NC_015594	ATC	2	6	252376	252381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342646
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6243	NC_015594	GCA	2	6	252501	252506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342646
6244	NC_015594	TCG	2	6	252563	252568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342646
6245	NC_015594	CGG	2	6	252590	252595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342646
6246	NC_015594	CGCC	2	8	252741	252748	0 %	0 %	25 %	75 %	334342646
6247	NC_015594	TCG	2	6	252764	252769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342646
6248	NC_015594	GC	3	6	252783	252788	0 %	0 %	50 %	50 %	334342646
6249	NC_015594	GC	3	6	252803	252808	0 %	0 %	50 %	50 %	334342646
6250	NC_015594	CG	4	8	252840	252847	0 %	0 %	50 %	50 %	334342646
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6255	NC_015594	CCAGC	2	10	253139	253148	20 %	0 %	20 %	60 %	334342647
6256	NC_015594	CTG	2	6	253227	253232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342647
6257	NC_015594	CGG	2	6	253235	253240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342647
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6260	NC_015594	CGT	2	6	253370	253375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342647
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6271	NC_015594	GC	3	6	253716	253721	0 %	0 %	50 %	50 %	334342647
6272	NC_015594	CGG	2	6	253777	253782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342647
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6274	NC_015594	CGG	2	6	253811	253816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342647
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6278	NC_015594	GGCG	2	8	254153	254160	0 %	0 %	75 %	25 %	334342647
6279	NC_015594	GTC	2	6	254210	254215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342647
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6281	NC_015594	CGG	2	6	254237	254242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342647
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6293	NC_015594	CGAC	2	8	254509	254516	25 %	0 %	25 %	50 %	334342647
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6297	NC_015594	TGC	2	6	254650	254655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342647
6298	NC_015594	CGG	2	6	254786	254791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6299	NC_015594	GC	3	6	254855	254860	0 %	0 %	50 %	50 %	334342648
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6333	NC_015594	CCG	2	6	256322	256327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342648
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6337	NC_015594	ATC	2	6	256482	256487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342649
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6348	NC_015594	CTT	2	6	256874	256879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6349	NC_015594	TCC	2	6	256884	256889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6350	NC_015594	AG	3	6	256914	256919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6351	NC_015594	CT	3	6	256928	256933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6352	NC_015594	CGC	2	6	256938	256943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6353	NC_015594	GGT	2	6	256951	256956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6354	NC_015594	CCA	2	6	256991	256996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6355	NC_015594	CG	3	6	257002	257007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6356	NC_015594	ATG	2	6	257039	257044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6357	NC_015594	GGC	2	6	257101	257106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342650
6358	NC_015594	TGCG	2	8	257139	257146	0 %	25 %	50 %	25 %	334342650
6359	NC_015594	CGC	2	6	257164	257169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342650
6360	NC_015594	TCC	2	6	257184	257189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342650
6361	NC_015594	CA	3	6	257203	257208	50 %	0 %	0 %	50 %	334342650
6362	NC_015594	TCCGCC	2	12	257223	257234	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334342650
6363	NC_015594	TGGCGA	2	12	257299	257310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342650
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6365	NC_015594	GCCGC	2	10	257410	257419	0 %	0 %	40 %	60 %	334342650
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6490	NC_015594	CCG	2	6	261175	261180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342652
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