MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas sputigena ATCC 35185 chromosome

Total Repeats: 64422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015437	TTG	2	6	47	52	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015437	ACC	2	6	197	202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837867
3	NC_015437	TCGC	2	8	224	231	0 %	25 %	25 %	50 %	330837867
4	NC_015437	A	6	6	296	301	100 %	0 %	0 %	0 %	330837867
5	NC_015437	A	7	7	419	425	100 %	0 %	0 %	0 %	330837867
6	NC_015437	GCA	2	6	446	451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
7	NC_015437	A	7	7	454	460	100 %	0 %	0 %	0 %	330837867
8	NC_015437	CCG	2	6	485	490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837867
9	NC_015437	GCG	3	9	581	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837867
10	NC_015437	TCGCCG	2	12	591	602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330837867
11	NC_015437	CTT	2	6	628	633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837867
12	NC_015437	CGG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837867
13	NC_015437	TCA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837867
14	NC_015437	TCG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837867
15	NC_015437	GAA	2	6	850	855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837867
16	NC_015437	GAA	2	6	869	874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837867
17	NC_015437	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837867
18	NC_015437	ACG	2	6	900	905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
19	NC_015437	CAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837867
20	NC_015437	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837867
21	NC_015437	CG	3	6	942	947	0 %	0 %	50 %	50 %	330837867
22	NC_015437	TCA	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837867
23	NC_015437	GAAA	2	8	1047	1054	75 %	0 %	25 %	0 %	330837867
24	NC_015437	GATGT	2	10	1085	1094	20 %	40 %	40 %	0 %	330837867
25	NC_015437	ACA	3	9	1116	1124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837867
26	NC_015437	GTC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837867
27	NC_015437	AGC	2	6	1179	1184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
28	NC_015437	ACG	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
29	NC_015437	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837867
30	NC_015437	CG	3	6	1242	1247	0 %	0 %	50 %	50 %	330837867
31	NC_015437	AAG	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837867
32	NC_015437	TCG	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837867
33	NC_015437	GAT	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837867
34	NC_015437	AAG	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837867
35	NC_015437	CGG	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837867
36	NC_015437	ACG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
37	NC_015437	AGA	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837867
38	NC_015437	AGC	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837867
39	NC_015437	CCGT	2	8	1551	1558	0 %	25 %	25 %	50 %	330837868
40	NC_015437	CTA	3	9	1735	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015437	ATC	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015437	CAA	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837869
43	NC_015437	ACAA	2	8	1938	1945	75 %	0 %	0 %	25 %	330837869
44	NC_015437	CAT	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837869
45	NC_015437	CAT	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837869
46	NC_015437	AGG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837869
47	NC_015437	AGG	2	6	2050	2055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837869
48	NC_015437	CGC	2	6	2061	2066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837869
49	NC_015437	CGA	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837869
50	NC_015437	CTT	2	6	2148	2153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837869
51	NC_015437	CAT	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837869
52	NC_015437	GGC	2	6	2333	2338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837869
53	NC_015437	TC	3	6	2354	2359	0 %	50 %	0 %	50 %	330837869
54	NC_015437	A	7	7	2363	2369	100 %	0 %	0 %	0 %	330837869
55	NC_015437	ATC	2	6	2403	2408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837869
56	NC_015437	GC	3	6	2438	2443	0 %	0 %	50 %	50 %	330837869
57	NC_015437	CTG	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837869
58	NC_015437	TCG	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837869
59	NC_015437	CGT	2	6	2516	2521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837869
60	NC_015437	ACG	2	6	2589	2594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837869
61	NC_015437	CCG	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837869
62	NC_015437	GGC	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837869
63	NC_015437	TCG	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837869
64	NC_015437	TCG	2	6	2746	2751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837869
65	NC_015437	GAA	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837869
66	NC_015437	GGC	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837869
67	NC_015437	GAG	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837869
68	NC_015437	CGCA	2	8	2925	2932	25 %	0 %	25 %	50 %	330837869
69	NC_015437	GTCT	2	8	3004	3011	0 %	50 %	25 %	25 %	330837870
70	NC_015437	GCG	2	6	3081	3086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837870
71	NC_015437	CGAA	2	8	3102	3109	50 %	0 %	25 %	25 %	330837870
72	NC_015437	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837870
73	NC_015437	AATTTC	2	12	3196	3207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330837870
74	NC_015437	TCA	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837870
75	NC_015437	GA	3	6	3333	3338	50 %	0 %	50 %	0 %	330837870
76	NC_015437	CCT	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837870
77	NC_015437	GAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837870
78	NC_015437	GGAAA	2	10	3462	3471	60 %	0 %	40 %	0 %	330837870
79	NC_015437	AGC	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837870
80	NC_015437	TCG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837870
81	NC_015437	GAAA	2	8	3593	3600	75 %	0 %	25 %	0 %	330837870
82	NC_015437	GCC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837870
83	NC_015437	TAA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330837870
84	NC_015437	GGA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837870
85	NC_015437	CGA	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837870
86	NC_015437	GCA	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837870
87	NC_015437	TTC	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837870
88	NC_015437	GAGC	2	8	3902	3909	25 %	0 %	50 %	25 %	330837870
89	NC_015437	AG	3	6	3951	3956	50 %	0 %	50 %	0 %	330837870
90	NC_015437	AGAA	2	8	4086	4093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015437	CGC	2	6	4134	4139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837871
92	NC_015437	A	6	6	4153	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	330837871
93	NC_015437	AAG	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837871
94	NC_015437	CG	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	330837871
95	NC_015437	TCG	2	6	4252	4257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837871
96	NC_015437	CG	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	330837871
97	NC_015437	A	6	6	4431	4436	100 %	0 %	0 %	0 %	330837871
98	NC_015437	GAA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837871
99	NC_015437	GAG	3	9	4533	4541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837871
100	NC_015437	AGG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837871
101	NC_015437	AAG	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837871
102	NC_015437	TC	3	6	4566	4571	0 %	50 %	0 %	50 %	330837871
103	NC_015437	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837871
104	NC_015437	AT	3	6	4606	4611	50 %	50 %	0 %	0 %	330837871
105	NC_015437	GCG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837871
106	NC_015437	AAG	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837871
107	NC_015437	CTT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837871
108	NC_015437	CCTGCA	2	12	4711	4722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330837871
109	NC_015437	GCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837871
110	NC_015437	CGC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837871
111	NC_015437	CGC	2	6	4752	4757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837871
112	NC_015437	GC	3	6	4779	4784	0 %	0 %	50 %	50 %	330837871
113	NC_015437	ATC	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837871
114	NC_015437	CGCC	2	8	4816	4823	0 %	0 %	25 %	75 %	330837871
115	NC_015437	CGC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837871
116	NC_015437	CGCT	2	8	4926	4933	0 %	25 %	25 %	50 %	330837871
117	NC_015437	AGC	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837871
118	NC_015437	GGA	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837871
119	NC_015437	CGT	2	6	4958	4963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837871
120	NC_015437	CGC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837871
121	NC_015437	GGAA	2	8	5000	5007	50 %	0 %	50 %	0 %	330837871
122	NC_015437	GGGA	2	8	5077	5084	25 %	0 %	75 %	0 %	330837871
123	NC_015437	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	330837872
124	NC_015437	GA	3	6	5165	5170	50 %	0 %	50 %	0 %	330837872
125	NC_015437	GAA	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837872
126	NC_015437	TGCAG	2	10	5340	5349	20 %	20 %	40 %	20 %	330837872
127	NC_015437	A	7	7	5394	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	330837873
128	NC_015437	GAG	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837873
129	NC_015437	GCG	2	6	5474	5479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837873
130	NC_015437	GGA	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837873
131	NC_015437	CGA	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837873
132	NC_015437	CGG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837873
133	NC_015437	TCAGAT	2	12	5590	5601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330837873
134	NC_015437	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837873
135	NC_015437	GGT	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837873
136	NC_015437	TCGA	2	8	5702	5709	25 %	25 %	25 %	25 %	330837873
137	NC_015437	TGACG	2	10	5740	5749	20 %	20 %	40 %	20 %	330837873
138	NC_015437	ACA	2	6	5760	5765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837873
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140	NC_015437	GTC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837873
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142	NC_015437	CGG	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837873
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251	NC_015437	T	6	6	9913	9918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015437	CGT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_015437	AGT	2	6	10065	10070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_015437	AGT	2	6	10155	10160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015437	CGC	2	6	10195	10200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_015437	TCT	2	6	10274	10279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015437	TGA	2	6	10356	10361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015437	GAGG	2	8	10390	10397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015437	CGC	2	6	10452	10457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_015437	CGT	2	6	10465	10470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_015437	AGG	2	6	15721	15726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837882
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