MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015436	AGGA	2	8	2136939	2136946	50 %	0 %	50 %	0 %	330837744
43002	NC_015436	CAT	2	6	2137110	2137115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837744
43003	NC_015436	GCAT	2	8	2137145	2137152	25 %	25 %	25 %	25 %	330837744
43004	NC_015436	TTC	2	6	2137220	2137225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43005	NC_015436	CTT	2	6	2137234	2137239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43006	NC_015436	ATG	2	6	2137412	2137417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837744
43007	NC_015436	TCT	2	6	2137458	2137463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43008	NC_015436	GGC	2	6	2137489	2137494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
43009	NC_015436	GGCA	2	8	2137504	2137511	25 %	0 %	50 %	25 %	330837744
43010	NC_015436	AAG	2	6	2137621	2137626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837744
43011	NC_015436	GAG	2	6	2137645	2137650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837744
43012	NC_015436	CGTC	2	8	2137736	2137743	0 %	25 %	25 %	50 %	330837744
43013	NC_015436	GTC	2	6	2137763	2137768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43014	NC_015436	GAA	2	6	2137790	2137795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837744
43015	NC_015436	TC	4	8	2137822	2137829	0 %	50 %	0 %	50 %	330837744
43016	NC_015436	CAC	2	6	2137866	2137871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837744
43017	NC_015436	AAC	2	6	2137898	2137903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837744
43018	NC_015436	CGT	2	6	2137930	2137935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43019	NC_015436	CAT	2	6	2137956	2137961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837744
43020	NC_015436	CT	3	6	2138001	2138006	0 %	50 %	0 %	50 %	330837744
43021	NC_015436	TGA	2	6	2138154	2138159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837744
43022	NC_015436	CGT	2	6	2138334	2138339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43023	NC_015436	ATG	2	6	2138393	2138398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837744
43024	NC_015436	TCA	2	6	2138411	2138416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837744
43025	NC_015436	CAT	2	6	2138418	2138423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837744
43026	NC_015436	CTT	2	6	2138542	2138547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43027	NC_015436	TCT	2	6	2138556	2138561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43028	NC_015436	GAA	2	6	2138620	2138625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837744
43029	NC_015436	GAA	2	6	2138698	2138703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837744
43030	NC_015436	ATG	2	6	2138720	2138725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837744
43031	NC_015436	GGAA	2	8	2138767	2138774	50 %	0 %	50 %	0 %	330837744
43032	NC_015436	CCTT	2	8	2138801	2138808	0 %	50 %	0 %	50 %	330837744
43033	NC_015436	GCC	2	6	2138935	2138940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837744
43034	NC_015436	CATG	2	8	2139058	2139065	25 %	25 %	25 %	25 %	330837744
43035	NC_015436	ACA	2	6	2139068	2139073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837744
43036	NC_015436	CGACAT	2	12	2139084	2139095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330837744
43037	NC_015436	CAT	2	6	2139126	2139131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837744
43038	NC_015436	ATG	2	6	2139134	2139139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837744
43039	NC_015436	CGG	2	6	2139186	2139191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
43040	NC_015436	GCC	2	6	2139235	2139240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837744
43041	NC_015436	GGC	2	6	2139370	2139375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
43042	NC_015436	GAG	2	6	2139418	2139423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837744
43043	NC_015436	TCT	2	6	2139429	2139434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43044	NC_015436	CTT	2	6	2139439	2139444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43045	NC_015436	CGG	2	6	2139477	2139482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
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43049	NC_015436	GCG	2	6	2139662	2139667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
43050	NC_015436	CGA	2	6	2139732	2139737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43051	NC_015436	AGGAA	2	10	2139815	2139824	60 %	0 %	40 %	0 %	330837744
43052	NC_015436	CGC	2	6	2139889	2139894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837744
43053	NC_015436	TC	3	6	2140008	2140013	0 %	50 %	0 %	50 %	330837744
43054	NC_015436	CGT	2	6	2140069	2140074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43055	NC_015436	CGG	2	6	2140086	2140091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837744
43056	NC_015436	GC	3	6	2140095	2140100	0 %	0 %	50 %	50 %	330837744
43057	NC_015436	GCT	2	6	2140115	2140120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43058	NC_015436	CTT	2	6	2140153	2140158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837744
43059	NC_015436	CTG	2	6	2140181	2140186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837744
43060	NC_015436	ATT	2	6	2140331	2140336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43061	NC_015436	T	7	7	2140335	2140341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43062	NC_015436	CAA	2	6	2140347	2140352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43063	NC_015436	CAT	2	6	2140474	2140479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43064	NC_015436	AAG	2	6	2140538	2140543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837745
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43066	NC_015436	CCG	2	6	2140799	2140804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837745
43067	NC_015436	GCC	2	6	2140823	2140828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837745
43068	NC_015436	CAG	2	6	2140840	2140845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837745
43069	NC_015436	CTT	2	6	2140918	2140923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837745
43070	NC_015436	CATC	2	8	2141023	2141030	25 %	25 %	0 %	50 %	330837745
43071	NC_015436	CAT	2	6	2141039	2141044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837745
43072	NC_015436	ACG	2	6	2141085	2141090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837745
43073	NC_015436	C	6	6	2141095	2141100	0 %	0 %	0 %	100 %	330837745
43074	NC_015436	ATC	2	6	2141162	2141167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837745
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43076	NC_015436	TCCA	2	8	2141296	2141303	25 %	25 %	0 %	50 %	330837745
43077	NC_015436	ATG	3	9	2141424	2141432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837745
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43081	NC_015436	GAAAA	2	10	2141697	2141706	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43082	NC_015436	AAGG	2	8	2141841	2141848	50 %	0 %	50 %	0 %	330837746
43083	NC_015436	TCCG	2	8	2141872	2141879	0 %	25 %	25 %	50 %	330837746
43084	NC_015436	ATG	2	6	2141888	2141893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837746
43085	NC_015436	GAG	2	6	2141894	2141899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837746
43086	NC_015436	CAT	2	6	2141986	2141991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837746
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43088	NC_015436	ATG	2	6	2142087	2142092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837746
43089	NC_015436	CGC	2	6	2142151	2142156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837746
43090	NC_015436	CGG	2	6	2142213	2142218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837746
43091	NC_015436	GGA	2	6	2142245	2142250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837746
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43095	NC_015436	AT	3	6	2142374	2142379	50 %	50 %	0 %	0 %	330837746
43096	NC_015436	CGA	2	6	2142458	2142463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837746
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43098	NC_015436	AAG	2	6	2142562	2142567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837746
43099	NC_015436	GCC	2	6	2142575	2142580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837746
43100	NC_015436	ATG	2	6	2142581	2142586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837746
43101	NC_015436	CTT	2	6	2142711	2142716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837746
43102	NC_015436	CGA	2	6	2142792	2142797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837746
43103	NC_015436	GCAT	2	8	2142836	2142843	25 %	25 %	25 %	25 %	330837746
43104	NC_015436	GAA	2	6	2142851	2142856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837746
43105	NC_015436	GAA	2	6	2142890	2142895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837746
43106	NC_015436	CCG	2	6	2142987	2142992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837746
43107	NC_015436	TTC	2	6	2143000	2143005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837746
43108	NC_015436	AGC	2	6	2143061	2143066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837746
43109	NC_015436	GAC	2	6	2143072	2143077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837746
43110	NC_015436	GTG	2	6	2143100	2143105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837746
43111	NC_015436	TGC	2	6	2143119	2143124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837746
43112	NC_015436	ATG	2	6	2143213	2143218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837746
43113	NC_015436	GCC	2	6	2143222	2143227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837746
43114	NC_015436	GAT	2	6	2143263	2143268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43115	NC_015436	GCC	2	6	2143396	2143401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837747
43116	NC_015436	AGGA	2	8	2143427	2143434	50 %	0 %	50 %	0 %	330837747
43117	NC_015436	TTTC	2	8	2143482	2143489	0 %	75 %	0 %	25 %	330837747
43118	NC_015436	TCT	2	6	2143519	2143524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837747
43119	NC_015436	CTT	2	6	2143555	2143560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837747
43120	NC_015436	TTCC	2	8	2143561	2143568	0 %	50 %	0 %	50 %	330837747
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43128	NC_015436	C	7	7	2143931	2143937	0 %	0 %	0 %	100 %	330837747
43129	NC_015436	CGCAA	2	10	2144075	2144084	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43130	NC_015436	TTCA	2	8	2144089	2144096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43131	NC_015436	TTCA	2	8	2144180	2144187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43132	NC_015436	TTCC	2	8	2144232	2144239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43133	NC_015436	TTCC	2	8	2144243	2144250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43144	NC_015436	GGCAA	2	10	2144704	2144713	40 %	0 %	40 %	20 %	330837748
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43149	NC_015436	CGT	2	6	2144857	2144862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837748
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43217	NC_015436	GTC	2	6	2148751	2148756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837750
43218	NC_015436	ATG	2	6	2148770	2148775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837750
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43223	NC_015436	T	6	6	2149017	2149022	0 %	100 %	0 %	0 %	330837750
43224	NC_015436	GAA	2	6	2149025	2149030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837750
43225	NC_015436	GA	3	6	2149099	2149104	50 %	0 %	50 %	0 %	330837750
43226	NC_015436	GCC	2	6	2149166	2149171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837750
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43228	NC_015436	CTG	2	6	2149235	2149240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837750
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43231	NC_015436	TTG	2	6	2149361	2149366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837750
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43233	NC_015436	ATG	3	9	2149431	2149439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837751
43234	NC_015436	AACCA	2	10	2149448	2149457	60 %	0 %	0 %	40 %	330837751
43235	NC_015436	AGGG	2	8	2149465	2149472	25 %	0 %	75 %	0 %	330837751
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43238	NC_015436	GAT	2	6	2149535	2149540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837751
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43334	NC_015436	CAA	2	6	2154335	2154340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43335	NC_015436	CTT	2	6	2154623	2154628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43337	NC_015436	TCT	3	9	2154670	2154678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43340	NC_015436	CTG	2	6	2154750	2154755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43341	NC_015436	AGC	2	6	2154831	2154836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43342	NC_015436	CTTT	2	8	2155010	2155017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43343	NC_015436	CTTT	2	8	2155025	2155032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43344	NC_015436	CTTT	2	8	2155040	2155047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43345	NC_015436	CTTC	2	8	2155055	2155062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43346	NC_015436	GCG	2	6	2155081	2155086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43347	NC_015436	CTTTC	2	10	2155127	2155136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43348	NC_015436	GCC	2	6	2155207	2155212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43349	NC_015436	TA	3	6	2155257	2155262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43351	NC_015436	GCTG	2	8	2155309	2155316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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43462	NC_015436	TCCT	2	8	2161239	2161246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43463	NC_015436	AT	3	6	2161247	2161252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43464	NC_015436	AGA	2	6	2161275	2161280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837759
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43466	NC_015436	CAA	2	6	2161334	2161339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837759
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43469	NC_015436	CAGG	2	8	2161441	2161448	25 %	0 %	50 %	25 %	330837759
43470	NC_015436	CTG	2	6	2161487	2161492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837759
43471	NC_015436	ACC	2	6	2161524	2161529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837759
43472	NC_015436	CGG	2	6	2161531	2161536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837759
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43475	NC_015436	ATC	2	6	2161733	2161738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837759
43476	NC_015436	CGT	2	6	2161741	2161746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837759
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43480	NC_015436	TCC	2	6	2161823	2161828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837759
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