MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015436	CGA	2	6	2062465	2062470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41502	NC_015436	TCG	2	6	2062530	2062535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41503	NC_015436	CTC	2	6	2062541	2062546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837687
41504	NC_015436	CGC	2	6	2062564	2062569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837687
41505	NC_015436	CG	4	8	2062595	2062602	0 %	0 %	50 %	50 %	330837687
41506	NC_015436	ACG	2	6	2062632	2062637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41507	NC_015436	GTG	2	6	2062711	2062716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837687
41508	NC_015436	GCC	2	6	2062743	2062748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837687
41509	NC_015436	GAC	2	6	2062799	2062804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41510	NC_015436	GATT	2	8	2062937	2062944	25 %	50 %	25 %	0 %	330837687
41511	NC_015436	CAA	2	6	2062975	2062980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837687
41512	NC_015436	TGA	2	6	2062987	2062992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837687
41513	NC_015436	ACGG	2	8	2063074	2063081	25 %	0 %	50 %	25 %	330837687
41514	NC_015436	CCA	2	6	2063158	2063163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837687
41515	NC_015436	ATC	2	6	2063187	2063192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837687
41516	NC_015436	CAACGA	2	12	2063260	2063271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330837687
41517	NC_015436	GCAG	2	8	2063301	2063308	25 %	0 %	50 %	25 %	330837687
41518	NC_015436	GAC	2	6	2063336	2063341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41519	NC_015436	ACG	2	6	2063370	2063375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41520	NC_015436	GCC	2	6	2063405	2063410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837687
41521	NC_015436	TCG	2	6	2063433	2063438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41522	NC_015436	TCG	2	6	2063440	2063445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41523	NC_015436	CAATGT	2	12	2063461	2063472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330837687
41524	NC_015436	ATC	2	6	2063520	2063525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837687
41525	NC_015436	CGC	2	6	2063578	2063583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837687
41526	NC_015436	TGG	2	6	2063584	2063589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837687
41527	NC_015436	ATC	2	6	2063616	2063621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837687
41528	NC_015436	AGC	2	6	2063639	2063644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837687
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41530	NC_015436	CAA	2	6	2063806	2063811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837687
41531	NC_015436	TGC	2	6	2063815	2063820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837687
41532	NC_015436	GAG	2	6	2063918	2063923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837687
41533	NC_015436	TTG	2	6	2063949	2063954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837687
41534	NC_015436	CGA	2	6	2064051	2064056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837688
41535	NC_015436	GACACC	2	12	2064061	2064072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330837688
41536	NC_015436	TCT	2	6	2064075	2064080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837688
41537	NC_015436	ATGG	2	8	2064151	2064158	25 %	25 %	50 %	0 %	330837688
41538	NC_015436	TCA	2	6	2064245	2064250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837688
41539	NC_015436	ATG	2	6	2064278	2064283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837688
41540	NC_015436	ATG	2	6	2064302	2064307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837688
41541	NC_015436	CAG	2	6	2064342	2064347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837688
41542	NC_015436	GCAT	2	8	2064356	2064363	25 %	25 %	25 %	25 %	330837688
41543	NC_015436	CAT	2	6	2064400	2064405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837688
41544	NC_015436	GCT	2	6	2064412	2064417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837688
41545	NC_015436	ACCG	2	8	2064484	2064491	25 %	0 %	25 %	50 %	330837688
41546	NC_015436	CCA	2	6	2064519	2064524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837688
41547	NC_015436	CAT	2	6	2064543	2064548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837688
41548	NC_015436	TC	3	6	2064655	2064660	0 %	50 %	0 %	50 %	330837688
41549	NC_015436	TC	3	6	2064720	2064725	0 %	50 %	0 %	50 %	330837688
41550	NC_015436	AAG	2	6	2064751	2064756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837688
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41552	NC_015436	CAT	2	6	2064820	2064825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837688
41553	NC_015436	TCG	2	6	2064829	2064834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837688
41554	NC_015436	CATC	2	8	2064986	2064993	25 %	25 %	0 %	50 %	330837689
41555	NC_015436	TTC	2	6	2064994	2064999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837689
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41557	NC_015436	CTTC	2	8	2065076	2065083	0 %	50 %	0 %	50 %	330837689
41558	NC_015436	TCC	2	6	2065161	2065166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41559	NC_015436	CTT	2	6	2065188	2065193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41560	NC_015436	CTA	2	6	2065195	2065200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41561	NC_015436	T	6	6	2065212	2065217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41562	NC_015436	AGG	2	6	2065254	2065259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41563	NC_015436	GGC	2	6	2065327	2065332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837690
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41565	NC_015436	AT	3	6	2065454	2065459	50 %	50 %	0 %	0 %	330837690
41566	NC_015436	CAT	2	6	2065540	2065545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837690
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41574	NC_015436	GC	3	6	2065974	2065979	0 %	0 %	50 %	50 %	330837690
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41581	NC_015436	TA	4	8	2066341	2066348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41582	NC_015436	GGA	2	6	2066358	2066363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41583	NC_015436	CATA	2	8	2066418	2066425	50 %	25 %	0 %	25 %	330837691
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41585	NC_015436	GAA	2	6	2066567	2066572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837691
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41588	NC_015436	GGC	3	9	2066597	2066605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837691
41589	NC_015436	GCTT	2	8	2066671	2066678	0 %	50 %	25 %	25 %	330837691
41590	NC_015436	GGCTGG	2	12	2066759	2066770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330837691
41591	NC_015436	ATGG	2	8	2066834	2066841	25 %	25 %	50 %	0 %	330837691
41592	NC_015436	TAC	2	6	2066885	2066890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837691
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41594	NC_015436	GAA	2	6	2066950	2066955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837691
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41596	NC_015436	TCC	2	6	2067064	2067069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41597	NC_015436	T	6	6	2067070	2067075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41598	NC_015436	T	6	6	2067088	2067093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41599	NC_015436	TAT	2	6	2067171	2067176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41600	NC_015436	ATA	2	6	2067193	2067198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41601	NC_015436	CAC	2	6	2067224	2067229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41602	NC_015436	TAC	2	6	2067249	2067254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41603	NC_015436	TCA	2	6	2067275	2067280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41604	NC_015436	TCT	2	6	2067281	2067286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41605	NC_015436	GA	14	28	2067312	2067339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41606	NC_015436	CTT	2	6	2067378	2067383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837692
41607	NC_015436	TTCAT	2	10	2067390	2067399	20 %	60 %	0 %	20 %	330837692
41608	NC_015436	CAA	2	6	2067569	2067574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837692
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41612	NC_015436	ACC	2	6	2067891	2067896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837692
41613	NC_015436	CAA	2	6	2067914	2067919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837692
41614	NC_015436	CGG	2	6	2067926	2067931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837692
41615	NC_015436	ACG	2	6	2067999	2068004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837692
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41617	NC_015436	TACA	2	8	2068172	2068179	50 %	25 %	0 %	25 %	330837692
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41770	NC_015436	TCT	2	6	2074967	2074972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41850	NC_015436	CAT	2	6	2078936	2078941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837702
41851	NC_015436	TCC	2	6	2079075	2079080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837702
41852	NC_015436	TGG	2	6	2079113	2079118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837702
41853	NC_015436	CAG	2	6	2079216	2079221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837702
41854	NC_015436	CTT	2	6	2079288	2079293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837702
41855	NC_015436	GC	3	6	2079304	2079309	0 %	0 %	50 %	50 %	330837702
41856	NC_015436	TGG	2	6	2079350	2079355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837702
41857	NC_015436	GC	3	6	2079366	2079371	0 %	0 %	50 %	50 %	330837702
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41862	NC_015436	CCAGA	2	10	2079586	2079595	40 %	0 %	20 %	40 %	330837702
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41865	NC_015436	TGT	2	6	2079737	2079742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837702
41866	NC_015436	GAC	2	6	2079747	2079752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837702
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41871	NC_015436	T	6	6	2080126	2080131	0 %	100 %	0 %	0 %	330837702
41872	NC_015436	CATAGG	2	12	2080143	2080154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330837702
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41881	NC_015436	CAC	2	6	2080458	2080463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837703
41882	NC_015436	AGGA	2	8	2080497	2080504	50 %	0 %	50 %	0 %	330837703
41883	NC_015436	T	7	7	2080524	2080530	0 %	100 %	0 %	0 %	330837703
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41886	NC_015436	GGAA	2	8	2080641	2080648	50 %	0 %	50 %	0 %	330837703
41887	NC_015436	CT	3	6	2080668	2080673	0 %	50 %	0 %	50 %	330837703
41888	NC_015436	TCT	2	6	2080697	2080702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837703
41889	NC_015436	GATG	2	8	2080739	2080746	25 %	25 %	50 %	0 %	330837703
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41898	NC_015436	ATCT	2	8	2081097	2081104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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41948	NC_015436	GACC	2	8	2083820	2083827	25 %	0 %	25 %	50 %	330837705
41949	NC_015436	TCCA	2	8	2083835	2083842	25 %	25 %	0 %	50 %	330837705
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41953	NC_015436	TTTCT	2	10	2084118	2084127	0 %	80 %	0 %	20 %	330837705
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41955	NC_015436	CTT	2	6	2084261	2084266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837705
41956	NC_015436	GGCG	2	8	2084296	2084303	0 %	0 %	75 %	25 %	330837705
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41965	NC_015436	CCA	2	6	2084638	2084643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837705
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41968	NC_015436	TTTCC	2	10	2084850	2084859	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41969	NC_015436	TA	3	6	2084890	2084895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41970	NC_015436	TAT	2	6	2084907	2084912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41971	NC_015436	CAT	2	6	2084913	2084918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41972	NC_015436	GAT	2	6	2084942	2084947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41973	NC_015436	AT	3	6	2084966	2084971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41975	NC_015436	AT	3	6	2085029	2085034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41976	NC_015436	ATC	2	6	2085038	2085043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41979	NC_015436	CAT	2	6	2085215	2085220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837706
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