MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015436	TCC	2	6	2037548	2037553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837670
41002	NC_015436	CCA	2	6	2037564	2037569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837670
41003	NC_015436	TGA	2	6	2037583	2037588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837670
41004	NC_015436	CAT	2	6	2037624	2037629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837670
41005	NC_015436	GCA	2	6	2037782	2037787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837670
41006	NC_015436	CGA	2	6	2037834	2037839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837670
41007	NC_015436	CAT	2	6	2037868	2037873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837670
41008	NC_015436	G	6	6	2037879	2037884	0 %	0 %	100 %	0 %	330837670
41009	NC_015436	C	6	6	2037890	2037895	0 %	0 %	0 %	100 %	330837670
41010	NC_015436	TAC	2	6	2037904	2037909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837670
41011	NC_015436	CGTG	2	8	2037910	2037917	0 %	25 %	50 %	25 %	330837670
41012	NC_015436	CGCAA	2	10	2038052	2038061	40 %	0 %	20 %	40 %	330837670
41013	NC_015436	ATG	2	6	2038127	2038132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837670
41014	NC_015436	GGT	2	6	2038180	2038185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837670
41015	NC_015436	GGC	2	6	2038204	2038209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837670
41016	NC_015436	CAA	2	6	2038248	2038253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837670
41017	NC_015436	T	7	7	2038261	2038267	0 %	100 %	0 %	0 %	330837670
41018	NC_015436	CG	3	6	2038268	2038273	0 %	0 %	50 %	50 %	330837670
41019	NC_015436	TCA	2	6	2038283	2038288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837670
41020	NC_015436	CAG	2	6	2038351	2038356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837670
41021	NC_015436	TCGG	2	8	2038411	2038418	0 %	25 %	50 %	25 %	330837670
41022	NC_015436	GGA	2	6	2038548	2038553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837670
41023	NC_015436	CAT	2	6	2038563	2038568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837670
41024	NC_015436	TCC	2	6	2038589	2038594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837670
41025	NC_015436	GCC	2	6	2038606	2038611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837670
41026	NC_015436	TCG	2	6	2038826	2038831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837670
41027	NC_015436	GGA	2	6	2038903	2038908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330837670
41028	NC_015436	TCC	2	6	2038984	2038989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837670
41029	NC_015436	TCT	2	6	2039037	2039042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837670
41030	NC_015436	GAT	2	6	2039137	2039142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837670
41031	NC_015436	CAA	2	6	2039194	2039199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837670
41032	NC_015436	CTC	2	6	2039203	2039208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837670
41033	NC_015436	TTC	2	6	2039266	2039271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837670
41034	NC_015436	TCCC	2	8	2039298	2039305	0 %	25 %	0 %	75 %	330837670
41035	NC_015436	TCT	2	6	2039346	2039351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837670
41036	NC_015436	GGCTTC	2	12	2039356	2039367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837670
41037	NC_015436	TGA	2	6	2039418	2039423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837670
41038	NC_015436	C	6	6	2039552	2039557	0 %	0 %	0 %	100 %	330837670
41039	NC_015436	TGG	2	6	2039559	2039564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837670
41040	NC_015436	GGATTG	2	12	2039675	2039686	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	330837670
41041	NC_015436	CTT	2	6	2039706	2039711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837670
41042	NC_015436	CATG	2	8	2039892	2039899	25 %	25 %	25 %	25 %	330837671
41043	NC_015436	ATC	2	6	2039915	2039920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837671
41044	NC_015436	CGG	2	6	2039928	2039933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837671
41045	NC_015436	ACCGT	2	10	2040012	2040021	20 %	20 %	20 %	40 %	330837671
41046	NC_015436	TGA	2	6	2040040	2040045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837671
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41048	NC_015436	ATG	2	6	2040149	2040154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837671
41049	NC_015436	TGGA	2	8	2040408	2040415	25 %	25 %	50 %	0 %	330837671
41050	NC_015436	GCC	2	6	2040452	2040457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837671
41051	NC_015436	CTGGG	2	10	2040461	2040470	0 %	20 %	60 %	20 %	330837671
41052	NC_015436	TGG	2	6	2040481	2040486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837671
41053	NC_015436	CGG	2	6	2040535	2040540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837671
41054	NC_015436	TCC	2	6	2040681	2040686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837671
41055	NC_015436	GAC	2	6	2040706	2040711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837671
41056	NC_015436	TGG	2	6	2040889	2040894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837671
41057	NC_015436	ACT	2	6	2040903	2040908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837671
41058	NC_015436	ACCT	2	8	2041035	2041042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41059	NC_015436	TGAA	2	8	2041153	2041160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41060	NC_015436	T	7	7	2041170	2041176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41061	NC_015436	T	6	6	2041227	2041232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41062	NC_015436	ACA	2	6	2041235	2041240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41063	NC_015436	TTC	2	6	2041279	2041284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_015436	T	6	6	2041295	2041300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_015436	TAT	2	6	2041369	2041374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41066	NC_015436	TAC	2	6	2041457	2041462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41067	NC_015436	TCA	2	6	2041483	2041488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41068	NC_015436	TCT	2	6	2041489	2041494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41069	NC_015436	GA	19	38	2041511	2041548	50 %	0 %	50 %	0 %	330837672
41070	NC_015436	GA	3	6	2041559	2041564	50 %	0 %	50 %	0 %	330837672
41071	NC_015436	TAC	2	6	2041621	2041626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837672
41072	NC_015436	TTG	2	6	2041627	2041632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330837672
41073	NC_015436	TGG	2	6	2041759	2041764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330837672
41074	NC_015436	CGC	2	6	2041790	2041795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837672
41075	NC_015436	GACC	2	8	2041796	2041803	25 %	0 %	25 %	50 %	330837672
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41077	NC_015436	CA	3	6	2041913	2041918	50 %	0 %	0 %	50 %	330837672
41078	NC_015436	CTA	2	6	2041934	2041939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330837672
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41083	NC_015436	TC	3	6	2042122	2042127	0 %	50 %	0 %	50 %	330837672
41084	NC_015436	ACC	2	6	2042133	2042138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330837672
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41086	NC_015436	GTC	2	6	2042259	2042264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837672
41087	NC_015436	GCG	2	6	2042315	2042320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837672
41088	NC_015436	ACA	2	6	2042347	2042352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837672
41089	NC_015436	TCC	2	6	2042364	2042369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330837672
41090	NC_015436	GCT	2	6	2042412	2042417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837672
41091	NC_015436	AGCGT	2	10	2042421	2042430	20 %	20 %	40 %	20 %	330837672
41092	NC_015436	ACA	2	6	2042479	2042484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837672
41093	NC_015436	CGG	3	9	2042497	2042505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330837672
41094	NC_015436	CCTTT	2	10	2042594	2042603	0 %	60 %	0 %	40 %	330837672
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41097	NC_015436	GTC	2	6	2042823	2042828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330837672
41098	NC_015436	CCG	2	6	2042839	2042844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330837672
41099	NC_015436	GAT	2	6	2042858	2042863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
41100	NC_015436	GACG	2	8	2042870	2042877	25 %	0 %	50 %	25 %	330837672
41101	NC_015436	ATG	2	6	2042905	2042910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
41102	NC_015436	ATA	2	6	2042929	2042934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330837672
41103	NC_015436	CGA	2	6	2042978	2042983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837672
41104	NC_015436	GA	3	6	2043016	2043021	50 %	0 %	50 %	0 %	330837672
41105	NC_015436	GAT	2	6	2043029	2043034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
41106	NC_015436	AAG	2	6	2043039	2043044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837672
41107	NC_015436	ACA	2	6	2043070	2043075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330837672
41108	NC_015436	TGA	2	6	2043098	2043103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
41109	NC_015436	CGA	2	6	2043149	2043154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330837672
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41112	NC_015436	TCCA	2	8	2043302	2043309	25 %	25 %	0 %	50 %	330837672
41113	NC_015436	GAT	2	6	2043365	2043370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
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41115	NC_015436	GAT	2	6	2043432	2043437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
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41117	NC_015436	GA	3	6	2043505	2043510	50 %	0 %	50 %	0 %	330837672
41118	NC_015436	GAT	2	6	2043518	2043523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837672
41119	NC_015436	GAA	2	6	2043527	2043532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837672
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41219	NC_015436	CT	3	6	2048140	2048145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41220	NC_015436	AAG	2	6	2048198	2048203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330837676
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41232	NC_015436	CTT	2	6	2048729	2048734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330837676
41233	NC_015436	CGGTA	2	10	2048777	2048786	20 %	20 %	40 %	20 %	330837676
41234	NC_015436	GAT	2	6	2048798	2048803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837676
41235	NC_015436	ATG	2	6	2049003	2049008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330837676
41236	NC_015436	TCTT	2	8	2049010	2049017	0 %	75 %	0 %	25 %	330837676
41237	NC_015436	CCT	2	6	2049076	2049081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41238	NC_015436	ATG	2	6	2049142	2049147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41240	NC_015436	AGAA	2	8	2049212	2049219	75 %	0 %	25 %	0 %	330837677
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41272	NC_015436	CA	3	6	2050645	2050650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41273	NC_015436	AT	4	8	2050704	2050711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41274	NC_015436	ACTC	2	8	2050733	2050740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41275	NC_015436	ACCCT	2	10	2050791	2050800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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41463	NC_015436	TTC	2	6	2060794	2060799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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