MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015436	CTT	2	6	870447	870452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_015436	AAG	2	6	870467	870472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_015436	CCT	2	6	870480	870485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17504	NC_015436	TCG	2	6	870571	870576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17505	NC_015436	AT	3	6	870660	870665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_015436	A	7	7	870691	870697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_015436	TACAG	2	10	870727	870736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17508	NC_015436	CGA	2	6	870741	870746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17509	NC_015436	CTT	2	6	870844	870849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836709
17510	NC_015436	CTG	2	6	870875	870880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836709
17511	NC_015436	GTCC	2	8	870886	870893	0 %	25 %	25 %	50 %	330836709
17512	NC_015436	CAT	2	6	870915	870920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836709
17513	NC_015436	CGC	2	6	870921	870926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836709
17514	NC_015436	GC	4	8	870925	870932	0 %	0 %	50 %	50 %	330836709
17515	NC_015436	CCTG	2	8	870933	870940	0 %	25 %	25 %	50 %	330836709
17516	NC_015436	ATG	2	6	870950	870955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836709
17517	NC_015436	TGG	2	6	871031	871036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836709
17518	NC_015436	CGG	2	6	871057	871062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836709
17519	NC_015436	TGCA	2	8	871070	871077	25 %	25 %	25 %	25 %	330836709
17520	NC_015436	TCC	2	6	871181	871186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836709
17521	NC_015436	CAC	2	6	871221	871226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836709
17522	NC_015436	GCC	2	6	871300	871305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836709
17523	NC_015436	AT	3	6	871329	871334	50 %	50 %	0 %	0 %	330836709
17524	NC_015436	GAAC	2	8	871368	871375	50 %	0 %	25 %	25 %	330836709
17525	NC_015436	CTT	2	6	871390	871395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836709
17526	NC_015436	ACG	2	6	871398	871403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836709
17527	NC_015436	CT	4	8	871427	871434	0 %	50 %	0 %	50 %	330836709
17528	NC_015436	GGC	2	6	871440	871445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836709
17529	NC_015436	AT	3	6	871464	871469	50 %	50 %	0 %	0 %	330836709
17530	NC_015436	TAC	2	6	871550	871555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17531	NC_015436	ACG	2	6	871571	871576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17532	NC_015436	GCG	2	6	871602	871607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836710
17533	NC_015436	TCA	2	6	871630	871635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836710
17534	NC_015436	C	6	6	871708	871713	0 %	0 %	0 %	100 %	330836710
17535	NC_015436	GGC	2	6	871745	871750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836710
17536	NC_015436	CAG	2	6	871790	871795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17537	NC_015436	A	6	6	871845	871850	100 %	0 %	0 %	0 %	330836710
17538	NC_015436	GAA	2	6	871947	871952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836710
17539	NC_015436	GAT	2	6	872100	872105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836710
17540	NC_015436	TG	3	6	872262	872267	0 %	50 %	50 %	0 %	330836710
17541	NC_015436	ATCA	2	8	872281	872288	50 %	25 %	0 %	25 %	330836710
17542	NC_015436	CAT	3	9	872321	872329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836710
17543	NC_015436	AGC	2	6	872405	872410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17544	NC_015436	GA	3	6	872436	872441	50 %	0 %	50 %	0 %	330836710
17545	NC_015436	GCA	2	6	872476	872481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17546	NC_015436	AGGATG	2	12	872503	872514	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330836710
17547	NC_015436	GCT	2	6	872520	872525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17548	NC_015436	CGAA	2	8	872598	872605	50 %	0 %	25 %	25 %	330836710
17549	NC_015436	CTG	2	6	872637	872642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17550	NC_015436	AC	3	6	872647	872652	50 %	0 %	0 %	50 %	330836710
17551	NC_015436	GGA	2	6	872667	872672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836710
17552	NC_015436	AGGA	2	8	872688	872695	50 %	0 %	50 %	0 %	330836710
17553	NC_015436	ATC	2	6	872706	872711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836710
17554	NC_015436	GAT	2	6	872742	872747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836710
17555	NC_015436	A	6	6	872806	872811	100 %	0 %	0 %	0 %	330836710
17556	NC_015436	CG	3	6	872814	872819	0 %	0 %	50 %	50 %	330836710
17557	NC_015436	CCAA	2	8	872830	872837	50 %	0 %	0 %	50 %	330836710
17558	NC_015436	A	7	7	872904	872910	100 %	0 %	0 %	0 %	330836710
17559	NC_015436	CTT	2	6	872921	872926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836710
17560	NC_015436	TTGA	2	8	872931	872938	25 %	50 %	25 %	0 %	330836710
17561	NC_015436	AG	3	6	872946	872951	50 %	0 %	50 %	0 %	330836710
17562	NC_015436	GTT	2	6	872954	872959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836710
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17564	NC_015436	TAG	2	6	872998	873003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836710
17565	NC_015436	GCA	2	6	873076	873081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836710
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17568	NC_015436	GAT	2	6	873195	873200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836710
17569	NC_015436	TGA	2	6	873214	873219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836710
17570	NC_015436	CGT	2	6	873251	873256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836710
17571	NC_015436	GCAC	2	8	873294	873301	25 %	0 %	25 %	50 %	330836710
17572	NC_015436	GGA	2	6	873305	873310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836710
17573	NC_015436	CT	3	6	873320	873325	0 %	50 %	0 %	50 %	330836710
17574	NC_015436	GAA	2	6	873330	873335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836710
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17581	NC_015436	AGA	2	6	873602	873607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_015436	AT	3	6	873617	873622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_015436	ATA	2	6	873627	873632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17586	NC_015436	TGCC	2	8	873861	873868	0 %	25 %	25 %	50 %	330836711
17587	NC_015436	CTG	2	6	873907	873912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836711
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17590	NC_015436	GC	3	6	874059	874064	0 %	0 %	50 %	50 %	330836712
17591	NC_015436	TC	3	6	874168	874173	0 %	50 %	0 %	50 %	330836712
17592	NC_015436	ACG	2	6	874190	874195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836712
17593	NC_015436	T	6	6	874226	874231	0 %	100 %	0 %	0 %	330836712
17594	NC_015436	TCA	2	6	874244	874249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836712
17595	NC_015436	TCA	2	6	874307	874312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836712
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17598	NC_015436	TTC	2	6	874423	874428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836712
17599	NC_015436	TTC	2	6	874451	874456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836712
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17601	NC_015436	TTG	2	6	874680	874685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836712
17602	NC_015436	ACC	2	6	874696	874701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836712
17603	NC_015436	TA	3	6	874755	874760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17604	NC_015436	ATTT	2	8	874805	874812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_015436	AT	3	6	874839	874844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17606	NC_015436	TATATG	2	12	874882	874893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17607	NC_015436	AT	3	6	874914	874919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17608	NC_015436	TC	3	6	874995	875000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17609	NC_015436	TGCC	2	8	875005	875012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17610	NC_015436	ATA	2	6	875055	875060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836713
17611	NC_015436	TCA	2	6	875194	875199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836713
17612	NC_015436	ATC	2	6	875253	875258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836713
17613	NC_015436	CGA	2	6	875276	875281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836713
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17615	NC_015436	TGA	2	6	875510	875515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836713
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17618	NC_015436	CT	3	6	875658	875663	0 %	50 %	0 %	50 %	330836713
17619	NC_015436	GTTC	2	8	875858	875865	0 %	50 %	25 %	25 %	330836713
17620	NC_015436	ACAG	2	8	875907	875914	50 %	0 %	25 %	25 %	330836713
17621	NC_015436	CTGT	2	8	876011	876018	0 %	50 %	25 %	25 %	330836713
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