MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_015436	CCG	2	6	821904	821909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16502	NC_015436	CGG	2	6	821916	821921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_015436	TCT	2	6	821960	821965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_015436	TTC	2	6	821974	821979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_015436	CTT	3	9	821985	821993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_015436	CTT	2	6	822018	822023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_015436	TCTT	2	8	822026	822033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16508	NC_015436	GACC	2	8	822063	822070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16509	NC_015436	ACG	2	6	822088	822093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_015436	TGGG	2	8	822215	822222	0 %	25 %	75 %	0 %	330836670
16511	NC_015436	GGC	2	6	822259	822264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836670
16512	NC_015436	GCT	2	6	822274	822279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836670
16513	NC_015436	TC	4	8	822288	822295	0 %	50 %	0 %	50 %	330836670
16514	NC_015436	ATG	2	6	822302	822307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836670
16515	NC_015436	GAA	2	6	822334	822339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836670
16516	NC_015436	GCAA	2	8	822364	822371	50 %	0 %	25 %	25 %	330836670
16517	NC_015436	GAT	2	6	822406	822411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836670
16518	NC_015436	GTG	2	6	822430	822435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836670
16519	NC_015436	CCG	2	6	822443	822448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836670
16520	NC_015436	GCT	3	9	822465	822473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836670
16521	NC_015436	CAT	2	6	822486	822491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836670
16522	NC_015436	TGA	2	6	822528	822533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836670
16523	NC_015436	ATC	2	6	822541	822546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836670
16524	NC_015436	GAC	2	6	822570	822575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836670
16525	NC_015436	CTTC	2	8	822703	822710	0 %	50 %	0 %	50 %	330836670
16526	NC_015436	CAC	2	6	822789	822794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836670
16527	NC_015436	T	7	7	822810	822816	0 %	100 %	0 %	0 %	330836670
16528	NC_015436	AG	3	6	822846	822851	50 %	0 %	50 %	0 %	330836670
16529	NC_015436	AAGAT	2	10	822860	822869	60 %	20 %	20 %	0 %	330836670
16530	NC_015436	CAT	2	6	822894	822899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836670
16531	NC_015436	TCCC	3	12	823052	823063	0 %	25 %	0 %	75 %	330836670
16532	NC_015436	CA	3	6	823100	823105	50 %	0 %	0 %	50 %	330836670
16533	NC_015436	TCA	2	6	823142	823147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836670
16534	NC_015436	CGT	2	6	823176	823181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836670
16535	NC_015436	CTC	2	6	823297	823302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836670
16536	NC_015436	CATG	2	8	823380	823387	25 %	25 %	25 %	25 %	330836670
16537	NC_015436	A	6	6	823409	823414	100 %	0 %	0 %	0 %	330836670
16538	NC_015436	GTC	2	6	823447	823452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836670
16539	NC_015436	CT	3	6	823456	823461	0 %	50 %	0 %	50 %	330836670
16540	NC_015436	A	6	6	823543	823548	100 %	0 %	0 %	0 %	330836670
16541	NC_015436	AG	3	6	823661	823666	50 %	0 %	50 %	0 %	330836671
16542	NC_015436	AAT	2	6	823678	823683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836671
16543	NC_015436	CAC	2	6	823686	823691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836671
16544	NC_015436	TAAA	2	8	823704	823711	75 %	25 %	0 %	0 %	330836671
16545	NC_015436	CAT	2	6	823737	823742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836671
16546	NC_015436	AGC	2	6	823817	823822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836671
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16548	NC_015436	CGA	2	6	823855	823860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836671
16549	NC_015436	CCT	2	6	823878	823883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836671
16550	NC_015436	GAT	2	6	823900	823905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836671
16551	NC_015436	TTC	2	6	823966	823971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836671
16552	NC_015436	G	6	6	824007	824012	0 %	0 %	100 %	0 %	330836671
16553	NC_015436	GA	3	6	824060	824065	50 %	0 %	50 %	0 %	330836671
16554	NC_015436	T	7	7	824116	824122	0 %	100 %	0 %	0 %	330836671
16555	NC_015436	AAT	2	6	824429	824434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836671
16556	NC_015436	A	8	8	824463	824470	100 %	0 %	0 %	0 %	330836671
16557	NC_015436	TCCA	2	8	824478	824485	25 %	25 %	0 %	50 %	330836671
16558	NC_015436	GTC	2	6	824531	824536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836671
16559	NC_015436	AGAA	2	8	824553	824560	75 %	0 %	25 %	0 %	330836671
16560	NC_015436	GAC	2	6	824676	824681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836672
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16562	NC_015436	CGG	2	6	824800	824805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836672
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16564	NC_015436	CGC	2	6	824892	824897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836672
16565	NC_015436	CGA	2	6	824922	824927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836672
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16567	NC_015436	TTC	2	6	824998	825003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16568	NC_015436	TTC	2	6	825124	825129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16569	NC_015436	TCA	2	6	825233	825238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836672
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16571	NC_015436	TTC	2	6	825270	825275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16572	NC_015436	TC	3	6	825284	825289	0 %	50 %	0 %	50 %	330836672
16573	NC_015436	TCT	2	6	825339	825344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16574	NC_015436	GTC	2	6	825407	825412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836672
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16578	NC_015436	CTTC	2	8	825561	825568	0 %	50 %	0 %	50 %	330836672
16579	NC_015436	TCG	2	6	825593	825598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836672
16580	NC_015436	TGC	2	6	825600	825605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836672
16581	NC_015436	TGA	2	6	825636	825641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836672
16582	NC_015436	GTCAC	2	10	825725	825734	20 %	20 %	20 %	40 %	330836672
16583	NC_015436	AT	3	6	825771	825776	50 %	50 %	0 %	0 %	330836672
16584	NC_015436	CAT	2	6	825801	825806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836672
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16587	NC_015436	TGT	2	6	825951	825956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836672
16588	NC_015436	CCA	2	6	826000	826005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836672
16589	NC_015436	GTT	2	6	826189	826194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836672
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16591	NC_015436	AG	3	6	826239	826244	50 %	0 %	50 %	0 %	330836672
16592	NC_015436	TCT	2	6	826819	826824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16593	NC_015436	TTC	2	6	826826	826831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836672
16594	NC_015436	TCA	2	6	826841	826846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836672
16595	NC_015436	CA	3	6	826851	826856	50 %	0 %	0 %	50 %	330836672
16596	NC_015436	ATTG	2	8	826859	826866	25 %	50 %	25 %	0 %	330836672
16597	NC_015436	AAG	2	6	826912	826917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16599	NC_015436	TAA	2	6	827071	827076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836673
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16602	NC_015436	ATC	2	6	827117	827122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836673
16603	NC_015436	GCCATT	2	12	827126	827137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836673
16604	NC_015436	CAC	2	6	827140	827145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836673
16605	NC_015436	TCG	2	6	827154	827159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836673
16606	NC_015436	CGT	2	6	827179	827184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836673
16607	NC_015436	AGA	2	6	827253	827258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836673
16608	NC_015436	AGT	2	6	827278	827283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836673
16609	NC_015436	TGA	2	6	827353	827358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836673
16610	NC_015436	CAT	2	6	827389	827394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836673
16611	NC_015436	TGAA	2	8	827454	827461	50 %	25 %	25 %	0 %	330836673
16612	NC_015436	CAG	2	6	827573	827578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836673
16613	NC_015436	TCA	2	6	827718	827723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836673
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16615	NC_015436	ACA	2	6	827742	827747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836673
16616	NC_015436	AAG	2	6	827790	827795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836673
16617	NC_015436	TCG	2	6	827850	827855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836673
16618	NC_015436	ATG	2	6	827862	827867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836673
16619	NC_015436	GGA	2	6	827920	827925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836673
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16621	NC_015436	GGA	2	6	828029	828034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836673
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16998	NC_015436	TCCG	2	8	847546	847553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16999	NC_015436	ATG	2	6	847594	847599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836688
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