MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015436	CTT	2	6	672212	672217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836556
13502	NC_015436	TA	3	6	672255	672260	50 %	50 %	0 %	0 %	330836556
13503	NC_015436	GTGG	2	8	672268	672275	0 %	25 %	75 %	0 %	330836556
13504	NC_015436	TCA	2	6	672286	672291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836556
13505	NC_015436	ACTG	2	8	672318	672325	25 %	25 %	25 %	25 %	330836556
13506	NC_015436	GAA	2	6	672336	672341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836556
13507	NC_015436	GGT	2	6	672412	672417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836556
13508	NC_015436	CGG	2	6	672427	672432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836556
13509	NC_015436	CTT	2	6	672469	672474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836556
13510	NC_015436	AGGA	2	8	672480	672487	50 %	0 %	50 %	0 %	330836556
13511	NC_015436	CCG	2	6	672510	672515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836556
13512	NC_015436	CCT	2	6	672655	672660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_015436	CG	3	6	672704	672709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_015436	ATT	2	6	672745	672750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_015436	AG	3	6	672769	672774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_015436	T	6	6	672776	672781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_015436	ACA	2	6	672782	672787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_015436	GAA	2	6	672796	672801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_015436	TGA	2	6	672897	672902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13520	NC_015436	ACAG	2	8	672906	672913	50 %	0 %	25 %	25 %	330836557
13521	NC_015436	TTC	2	6	672919	672924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13522	NC_015436	ACG	2	6	672929	672934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13523	NC_015436	TCTG	2	8	672950	672957	0 %	50 %	25 %	25 %	330836557
13524	NC_015436	T	6	6	672985	672990	0 %	100 %	0 %	0 %	330836557
13525	NC_015436	TCT	2	6	673037	673042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13526	NC_015436	TGGA	2	8	673145	673152	25 %	25 %	50 %	0 %	330836557
13527	NC_015436	GAC	2	6	673319	673324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13528	NC_015436	T	6	6	673603	673608	0 %	100 %	0 %	0 %	330836557
13529	NC_015436	GCC	2	6	673611	673616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836557
13530	NC_015436	CAT	2	6	673777	673782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836557
13531	NC_015436	GAT	2	6	673847	673852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13532	NC_015436	CAGG	2	8	673862	673869	25 %	0 %	50 %	25 %	330836557
13533	NC_015436	CAA	2	6	673912	673917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836557
13534	NC_015436	TCT	2	6	673924	673929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13535	NC_015436	TTCC	2	8	673951	673958	0 %	50 %	0 %	50 %	330836557
13536	NC_015436	ATGT	2	8	674081	674088	25 %	50 %	25 %	0 %	330836557
13537	NC_015436	GGA	2	6	674095	674100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836557
13538	NC_015436	A	6	6	674133	674138	100 %	0 %	0 %	0 %	330836557
13539	NC_015436	A	6	6	674205	674210	100 %	0 %	0 %	0 %	330836557
13540	NC_015436	TCC	2	6	674228	674233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836557
13541	NC_015436	TTCTT	2	10	674253	674262	0 %	80 %	0 %	20 %	330836557
13542	NC_015436	AGG	2	6	674265	674270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836557
13543	NC_015436	TGG	2	6	674368	674373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836557
13544	NC_015436	AGC	2	6	674444	674449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13545	NC_015436	CATA	2	8	674501	674508	50 %	25 %	0 %	25 %	330836557
13546	NC_015436	TTC	2	6	674524	674529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13547	NC_015436	GATT	2	8	674596	674603	25 %	50 %	25 %	0 %	330836557
13548	NC_015436	TTC	2	6	674637	674642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13549	NC_015436	GAT	2	6	674668	674673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13550	NC_015436	TGT	2	6	674773	674778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836557
13551	NC_015436	GCC	2	6	674822	674827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836557
13552	NC_015436	GAC	2	6	674872	674877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13553	NC_015436	CGG	2	6	674921	674926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836557
13554	NC_015436	TACT	2	8	675111	675118	25 %	50 %	0 %	25 %	330836557
13555	NC_015436	CCGA	2	8	675137	675144	25 %	0 %	25 %	50 %	330836557
13556	NC_015436	AGC	2	6	675182	675187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13557	NC_015436	AGG	2	6	675217	675222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836557
13558	NC_015436	CAG	2	6	675247	675252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13559	NC_015436	ATA	2	6	675381	675386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836557
13560	NC_015436	GGAG	2	8	675395	675402	25 %	0 %	75 %	0 %	330836557
13561	NC_015436	TGC	2	6	675427	675432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13562	NC_015436	ATTT	2	8	675445	675452	25 %	75 %	0 %	0 %	330836557
13563	NC_015436	A	6	6	675521	675526	100 %	0 %	0 %	0 %	330836557
13564	NC_015436	TGA	2	6	675595	675600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13565	NC_015436	CTT	2	6	675612	675617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13566	NC_015436	GGAC	2	8	675636	675643	25 %	0 %	50 %	25 %	330836557
13567	NC_015436	CAC	2	6	675697	675702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836557
13568	NC_015436	GGA	2	6	675811	675816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836557
13569	NC_015436	CGG	2	6	675831	675836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836557
13570	NC_015436	TGA	2	6	675847	675852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13571	NC_015436	CTT	2	6	675863	675868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13572	NC_015436	CAT	2	6	675919	675924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836557
13573	NC_015436	TCG	2	6	675998	676003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13574	NC_015436	CCTT	2	8	676048	676055	0 %	50 %	0 %	50 %	330836557
13575	NC_015436	CTG	2	6	676089	676094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13576	NC_015436	CCG	2	6	676104	676109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836557
13577	NC_015436	TGTTT	2	10	676129	676138	0 %	80 %	20 %	0 %	330836557
13578	NC_015436	ACG	2	6	676160	676165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
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13581	NC_015436	GCT	2	6	676444	676449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13582	NC_015436	CTT	2	6	676691	676696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13583	NC_015436	CTT	2	6	676712	676717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13584	NC_015436	ACC	2	6	676838	676843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836557
13585	NC_015436	GAT	2	6	676862	676867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836557
13586	NC_015436	CCG	2	6	677049	677054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836557
13587	NC_015436	TAT	2	6	677075	677080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836557
13588	NC_015436	CTTT	2	8	677114	677121	0 %	75 %	0 %	25 %	330836557
13589	NC_015436	GA	3	6	677126	677131	50 %	0 %	50 %	0 %	330836557
13590	NC_015436	GCT	2	6	677384	677389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13591	NC_015436	TCT	2	6	677400	677405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836557
13592	NC_015436	TCAA	2	8	677453	677460	50 %	25 %	0 %	25 %	330836557
13593	NC_015436	ACG	2	6	677683	677688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13594	NC_015436	GAC	2	6	677705	677710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13595	NC_015436	GAC	2	6	677743	677748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836557
13596	NC_015436	CA	3	6	677773	677778	50 %	0 %	0 %	50 %	330836557
13597	NC_015436	GAG	2	6	677861	677866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_015436	AAG	2	6	677878	677883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836558
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13601	NC_015436	TGG	2	6	677959	677964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836558
13602	NC_015436	AAT	2	6	678013	678018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836558
13603	NC_015436	CCA	2	6	678020	678025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836558
13604	NC_015436	A	7	7	678054	678060	100 %	0 %	0 %	0 %	330836558
13605	NC_015436	ATT	2	6	678119	678124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836558
13606	NC_015436	TC	3	6	678137	678142	0 %	50 %	0 %	50 %	330836558
13607	NC_015436	ACGA	2	8	678237	678244	50 %	0 %	25 %	25 %	330836558
13608	NC_015436	AGA	2	6	678257	678262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836558
13609	NC_015436	TAC	2	6	678331	678336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836558
13610	NC_015436	CGT	2	6	678360	678365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836558
13611	NC_015436	GACA	2	8	678430	678437	50 %	0 %	25 %	25 %	330836558
13612	NC_015436	TCC	2	6	678481	678486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836558
13613	NC_015436	AC	3	6	678554	678559	50 %	0 %	0 %	50 %	330836558
13614	NC_015436	TGC	2	6	678585	678590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836558
13615	NC_015436	ATA	2	6	678656	678661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836558
13616	NC_015436	AGA	2	6	678696	678701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836558
13617	NC_015436	AGC	2	6	678761	678766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836558
13618	NC_015436	AT	3	6	678864	678869	50 %	50 %	0 %	0 %	330836558
13619	NC_015436	GAG	2	6	678904	678909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836558
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13621	NC_015436	CAG	2	6	678949	678954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836558
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13858	NC_015436	CATTC	2	10	691947	691956	20 %	40 %	0 %	40 %	330836568
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13981	NC_015436	GTT	2	6	698751	698756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836573
13982	NC_015436	CATG	2	8	698805	698812	25 %	25 %	25 %	25 %	330836573
13983	NC_015436	GCC	2	6	698873	698878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836573
13984	NC_015436	T	6	6	698899	698904	0 %	100 %	0 %	0 %	330836573
13985	NC_015436	AAG	2	6	698963	698968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836573
13986	NC_015436	TCT	2	6	699013	699018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836573
13987	NC_015436	GTG	2	6	699040	699045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836573
13988	NC_015436	T	6	6	699070	699075	0 %	100 %	0 %	0 %	330836573
13989	NC_015436	CGCTGT	2	12	699076	699087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836573
13990	NC_015436	GGC	2	6	699151	699156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836573
13991	NC_015436	CCA	2	6	699212	699217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13992	NC_015436	TCA	2	6	699360	699365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836574
13993	NC_015436	T	6	6	699401	699406	0 %	100 %	0 %	0 %	330836574
13994	NC_015436	TGT	2	6	699462	699467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836574
13995	NC_015436	TCC	2	6	699548	699553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836574
13996	NC_015436	CTT	2	6	699559	699564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836574
13997	NC_015436	GAG	2	6	699577	699582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836574
13998	NC_015436	CAT	2	6	699847	699852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836574
13999	NC_015436	CAT	2	6	699906	699911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836574
14000	NC_015436	TGA	2	6	699918	699923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836574

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