MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015436	GAGCA	2	10	621675	621684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12502	NC_015436	A	7	7	621684	621690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_015436	TCC	2	6	621721	621726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_015436	GTA	2	6	621781	621786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_015436	CTTT	2	8	621826	621833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12506	NC_015436	TTC	2	6	621888	621893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836505
12507	NC_015436	GTG	2	6	621913	621918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836505
12508	NC_015436	CCT	2	6	621936	621941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836505
12509	NC_015436	ATCTTT	2	12	621977	621988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836505
12510	NC_015436	TTG	2	6	622043	622048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836505
12511	NC_015436	AAG	2	6	622057	622062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836505
12512	NC_015436	GGA	2	6	622084	622089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836505
12513	NC_015436	TCC	2	6	622103	622108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836505
12514	NC_015436	TTC	2	6	622112	622117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836505
12515	NC_015436	AAAG	2	8	622123	622130	75 %	0 %	25 %	0 %	330836505
12516	NC_015436	A	6	6	622145	622150	100 %	0 %	0 %	0 %	330836505
12517	NC_015436	AG	3	6	622181	622186	50 %	0 %	50 %	0 %	330836505
12518	NC_015436	CCT	2	6	622223	622228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836505
12519	NC_015436	TTCC	2	8	622355	622362	0 %	50 %	0 %	50 %	330836505
12520	NC_015436	TCGC	2	8	622444	622451	0 %	25 %	25 %	50 %	330836505
12521	NC_015436	GCC	2	6	622504	622509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836505
12522	NC_015436	GAT	2	6	622525	622530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
12523	NC_015436	T	6	6	622559	622564	0 %	100 %	0 %	0 %	330836505
12524	NC_015436	GGA	2	6	622575	622580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836505
12525	NC_015436	GGA	2	6	622632	622637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836505
12526	NC_015436	ACA	2	6	622730	622735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
12527	NC_015436	CGCC	2	8	622752	622759	0 %	0 %	25 %	75 %	330836505
12528	NC_015436	GCTTAC	2	12	622761	622772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836505
12529	NC_015436	AGAA	2	8	622792	622799	75 %	0 %	25 %	0 %	330836505
12530	NC_015436	CGG	2	6	622890	622895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836505
12531	NC_015436	AAC	2	6	622934	622939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
12532	NC_015436	TGA	2	6	622943	622948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
12533	NC_015436	CAG	2	6	622975	622980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
12534	NC_015436	ACG	2	6	622991	622996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
12535	NC_015436	TG	3	6	623063	623068	0 %	50 %	50 %	0 %	330836505
12536	NC_015436	ATT	2	6	623151	623156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836505
12537	NC_015436	CTGC	2	8	623163	623170	0 %	25 %	25 %	50 %	330836505
12538	NC_015436	CAT	2	6	623220	623225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836505
12539	NC_015436	CGT	2	6	623256	623261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836505
12540	NC_015436	AAG	2	6	623266	623271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836505
12541	NC_015436	A	6	6	623336	623341	100 %	0 %	0 %	0 %	330836505
12542	NC_015436	GAA	2	6	623385	623390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836505
12543	NC_015436	ACA	2	6	623448	623453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
12544	NC_015436	TTCC	2	8	623504	623511	0 %	50 %	0 %	50 %	330836505
12545	NC_015436	TGA	2	6	623550	623555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
12546	NC_015436	GAC	2	6	623565	623570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
12547	NC_015436	CTTG	2	8	623637	623644	0 %	50 %	25 %	25 %	330836505
12548	NC_015436	GAA	2	6	623803	623808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
12549	NC_015436	AGA	2	6	623814	623819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
12550	NC_015436	ATTC	2	8	623964	623971	25 %	50 %	0 %	25 %	330836506
12551	NC_015436	GAA	2	6	623989	623994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
12552	NC_015436	GAT	2	6	624002	624007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
12553	NC_015436	GAT	2	6	624041	624046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
12554	NC_015436	GGC	2	6	624202	624207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836506
12555	NC_015436	GGCG	2	8	624352	624359	0 %	0 %	75 %	25 %	330836506
12556	NC_015436	CGA	2	6	624445	624450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836506
12557	NC_015436	GGA	2	6	624475	624480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836506
12558	NC_015436	GGT	2	6	624506	624511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836506
12559	NC_015436	GGA	2	6	624515	624520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836506
12560	NC_015436	CAGT	2	8	624601	624608	25 %	25 %	25 %	25 %	330836506
12561	NC_015436	TAT	2	6	624659	624664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836506
12562	NC_015436	ACAGGA	2	12	624673	624684	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330836506
12563	NC_015436	A	6	6	624706	624711	100 %	0 %	0 %	0 %	330836506
12564	NC_015436	ATGG	2	8	624815	624822	25 %	25 %	50 %	0 %	330836506
12565	NC_015436	GAT	2	6	624830	624835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
12566	NC_015436	TCC	2	6	624849	624854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836506
12567	NC_015436	AT	3	6	624918	624923	50 %	50 %	0 %	0 %	330836507
12568	NC_015436	TGCTCA	3	18	624926	624943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836507
12569	NC_015436	GGC	2	6	624961	624966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
12570	NC_015436	GGC	2	6	625029	625034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
12571	NC_015436	T	6	6	625064	625069	0 %	100 %	0 %	0 %	330836507
12572	NC_015436	TCT	2	6	625122	625127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836507
12573	NC_015436	ACA	2	6	625149	625154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836507
12574	NC_015436	AT	3	6	625188	625193	50 %	50 %	0 %	0 %	330836507
12575	NC_015436	GTT	2	6	625260	625265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836507
12576	NC_015436	GAGG	2	8	625270	625277	25 %	0 %	75 %	0 %	330836507
12577	NC_015436	CTG	2	6	625324	625329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12578	NC_015436	GTC	2	6	625330	625335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12579	NC_015436	GAA	2	6	625348	625353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836507
12580	NC_015436	CTT	2	6	625481	625486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836507
12581	NC_015436	GGT	2	6	625524	625529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836507
12582	NC_015436	CTG	2	6	625580	625585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12583	NC_015436	GGAC	2	8	625605	625612	25 %	0 %	50 %	25 %	330836507
12584	NC_015436	TGC	2	6	625728	625733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12585	NC_015436	TCAC	2	8	625789	625796	25 %	25 %	0 %	50 %	330836507
12586	NC_015436	CAAC	2	8	625831	625838	50 %	0 %	0 %	50 %	330836507
12587	NC_015436	T	7	7	625902	625908	0 %	100 %	0 %	0 %	330836507
12588	NC_015436	GAC	2	6	625923	625928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12589	NC_015436	ACAACC	2	12	625929	625940	50 %	0 %	0 %	50 %	330836507
12590	NC_015436	CTG	2	6	626029	626034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
12591	NC_015436	CATC	2	8	626036	626043	25 %	25 %	0 %	50 %	330836507
12592	NC_015436	ACAT	2	8	626047	626054	50 %	25 %	0 %	25 %	330836507
12593	NC_015436	TCA	2	6	626066	626071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836507
12594	NC_015436	ATG	2	6	626077	626082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836507
12595	NC_015436	TCC	2	6	626103	626108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836507
12596	NC_015436	GGC	2	6	626114	626119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
12597	NC_015436	TGT	2	6	626183	626188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836507
12598	NC_015436	TGA	3	9	626221	626229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836507
12599	NC_015436	ATG	2	6	626292	626297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836508
12600	NC_015436	T	7	7	626302	626308	0 %	100 %	0 %	0 %	330836508
12601	NC_015436	GAA	2	6	626309	626314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836508
12602	NC_015436	GAAA	2	8	626449	626456	75 %	0 %	25 %	0 %	330836508
12603	NC_015436	ACC	2	6	626537	626542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836508
12604	NC_015436	TCATTT	2	12	626560	626571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836508
12605	NC_015436	GCC	2	6	626597	626602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836508
12606	NC_015436	GCC	2	6	626618	626623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836508
12607	NC_015436	GGT	2	6	626701	626706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836508
12608	NC_015436	ATG	2	6	626709	626714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836508
12609	NC_015436	CAT	2	6	626746	626751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
12610	NC_015436	ATA	2	6	626778	626783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836508
12611	NC_015436	ATC	2	6	626822	626827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
12612	NC_015436	AAG	2	6	626858	626863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836508
12613	NC_015436	TCA	2	6	626920	626925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
12614	NC_015436	TGC	2	6	626968	626973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836508
12615	NC_015436	CT	3	6	627083	627088	0 %	50 %	0 %	50 %	330836508
12616	NC_015436	GTAA	2	8	627103	627110	50 %	25 %	25 %	0 %	330836508
12617	NC_015436	TCC	2	6	627195	627200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836509
12618	NC_015436	GAT	2	6	627268	627273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
12619	NC_015436	TGA	2	6	627280	627285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
12620	NC_015436	GAC	2	6	627326	627331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836509
12621	NC_015436	AATG	2	8	627349	627356	50 %	25 %	25 %	0 %	330836509
12622	NC_015436	TGA	2	6	627453	627458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
12623	NC_015436	TGA	2	6	627472	627477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
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12630	NC_015436	TTGC	2	8	627752	627759	0 %	50 %	25 %	25 %	330836509
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12635	NC_015436	CGGA	2	8	628045	628052	25 %	0 %	50 %	25 %	330836509
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12641	NC_015436	TCC	2	6	628522	628527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836510
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12643	NC_015436	CAAG	2	8	628612	628619	50 %	0 %	25 %	25 %	330836510
12644	NC_015436	CCT	2	6	628661	628666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836510
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12647	NC_015436	GA	3	6	628816	628821	50 %	0 %	50 %	0 %	330836510
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12660	NC_015436	CTG	3	9	629493	629501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836511
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12712	NC_015436	AGCA	2	8	632399	632406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12713	NC_015436	TCA	2	6	632450	632455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836514
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12735	NC_015436	A	6	6	633620	633625	100 %	0 %	0 %	0 %	330836516
12736	NC_015436	CCTG	2	8	633665	633672	0 %	25 %	25 %	50 %	330836516
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12739	NC_015436	ATGT	2	8	633703	633710	25 %	50 %	25 %	0 %	330836516
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12864	NC_015436	TGT	2	6	640315	640320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836524
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12866	NC_015436	GGAT	2	8	640405	640412	25 %	25 %	50 %	0 %	330836524
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12868	NC_015436	CT	3	6	640451	640456	0 %	50 %	0 %	50 %	330836524
12869	NC_015436	GAA	2	6	640479	640484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836524
12870	NC_015436	TTCC	2	8	640539	640546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12871	NC_015436	ATG	2	6	640548	640553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12872	NC_015436	GTA	2	6	640577	640582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12873	NC_015436	ATTA	2	8	640584	640591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12874	NC_015436	GTTTCG	2	12	640616	640627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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12876	NC_015436	GTCAG	2	10	640639	640648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12877	NC_015436	A	6	6	640700	640705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12878	NC_015436	AAC	2	6	640809	640814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12879	NC_015436	TGC	2	6	640936	640941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12885	NC_015436	TGCC	2	8	641414	641421	0 %	25 %	25 %	50 %	330836525
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12889	NC_015436	AACA	2	8	641627	641634	75 %	0 %	0 %	25 %	330836525
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