MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015436	GAG	2	6	596668	596673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_015436	TTG	2	6	596696	596701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836480
12004	NC_015436	GCG	2	6	596794	596799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836480
12005	NC_015436	AGAC	2	8	596926	596933	50 %	0 %	25 %	25 %	330836481
12006	NC_015436	GTC	2	6	596990	596995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836481
12007	NC_015436	AAG	2	6	597023	597028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836481
12008	NC_015436	GAA	2	6	597031	597036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836481
12009	NC_015436	GCT	2	6	597197	597202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836481
12010	NC_015436	TAT	2	6	597221	597226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836481
12011	NC_015436	TTA	2	6	597349	597354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836481
12012	NC_015436	TGA	2	6	597582	597587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836482
12013	NC_015436	AAGGAA	2	12	597736	597747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836482
12014	NC_015436	TTGA	2	8	597889	597896	25 %	50 %	25 %	0 %	330836482
12015	NC_015436	AGA	2	6	597924	597929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836482
12016	NC_015436	A	6	6	597990	597995	100 %	0 %	0 %	0 %	330836482
12017	NC_015436	TAT	2	6	598007	598012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836482
12018	NC_015436	TCA	2	6	598020	598025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836482
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12020	NC_015436	CTG	2	6	598090	598095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836482
12021	NC_015436	TGT	2	6	598101	598106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836482
12022	NC_015436	AAC	2	6	598319	598324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836483
12023	NC_015436	TCG	2	6	598333	598338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836483
12024	NC_015436	C	6	6	598401	598406	0 %	0 %	0 %	100 %	330836483
12025	NC_015436	AGGTCG	2	12	598416	598427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330836483
12026	NC_015436	TAC	2	6	598460	598465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836483
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12028	NC_015436	ATG	2	6	598537	598542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836483
12029	NC_015436	TTCT	2	8	598560	598567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12030	NC_015436	T	6	6	598594	598599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_015436	ATT	2	6	598601	598606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_015436	ATT	2	6	598610	598615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_015436	CGC	2	6	598621	598626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12034	NC_015436	GAGG	2	8	598714	598721	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_015436	GAA	2	6	598763	598768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836484
12036	NC_015436	CATTC	2	10	598833	598842	20 %	40 %	0 %	40 %	330836484
12037	NC_015436	GA	3	6	598846	598851	50 %	0 %	50 %	0 %	330836484
12038	NC_015436	ATA	2	6	598857	598862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836484
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12040	NC_015436	ATG	2	6	599089	599094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836484
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12043	NC_015436	CTC	2	6	599204	599209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836485
12044	NC_015436	GCA	2	6	599235	599240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836485
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12048	NC_015436	TG	3	6	599410	599415	0 %	50 %	50 %	0 %	330836485
12049	NC_015436	AG	3	6	599429	599434	50 %	0 %	50 %	0 %	330836485
12050	NC_015436	TCGG	2	8	599471	599478	0 %	25 %	50 %	25 %	330836485
12051	NC_015436	GAA	2	6	599574	599579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836485
12052	NC_015436	GGA	2	6	599586	599591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836485
12053	NC_015436	AATG	2	8	599600	599607	50 %	25 %	25 %	0 %	330836485
12054	NC_015436	AG	3	6	599619	599624	50 %	0 %	50 %	0 %	330836486
12055	NC_015436	TTC	2	6	599629	599634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836486
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12057	NC_015436	ATC	2	6	599673	599678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836486
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12059	NC_015436	TGCT	2	8	599773	599780	0 %	50 %	25 %	25 %	330836486
12060	NC_015436	AGC	2	6	599932	599937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836486
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12062	NC_015436	GGC	2	6	600017	600022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836486
12063	NC_015436	ATG	2	6	600042	600047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836486
12064	NC_015436	A	7	7	600133	600139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_015436	CG	3	6	600190	600195	0 %	0 %	50 %	50 %	330836487
12066	NC_015436	GT	3	6	600244	600249	0 %	50 %	50 %	0 %	330836487
12067	NC_015436	TTC	2	6	600269	600274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836487
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12069	NC_015436	GAA	2	6	600331	600336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836487
12070	NC_015436	ACA	2	6	600345	600350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836487
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12072	NC_015436	TGA	2	6	600421	600426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836488
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12074	NC_015436	TC	3	6	600666	600671	0 %	50 %	0 %	50 %	330836489
12075	NC_015436	GA	3	6	600674	600679	50 %	0 %	50 %	0 %	330836489
12076	NC_015436	AGA	2	6	600702	600707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836489
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12078	NC_015436	TTCT	2	8	600763	600770	0 %	75 %	0 %	25 %	330836489
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12081	NC_015436	TCA	2	6	600972	600977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836489
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12088	NC_015436	GCT	2	6	601216	601221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836489
12089	NC_015436	GTA	2	6	601271	601276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836489
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12091	NC_015436	CCA	2	6	601363	601368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836489
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12093	NC_015436	GA	3	6	601511	601516	50 %	0 %	50 %	0 %	330836490
12094	NC_015436	GCC	2	6	601661	601666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836490
12095	NC_015436	GCT	2	6	601725	601730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836490
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12097	NC_015436	TCA	2	6	601820	601825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836490
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12100	NC_015436	GAAC	2	8	601904	601911	50 %	0 %	25 %	25 %	330836490
12101	NC_015436	CAG	2	6	601912	601917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836490
12102	NC_015436	TC	3	6	601954	601959	0 %	50 %	0 %	50 %	330836490
12103	NC_015436	AG	3	6	602064	602069	50 %	0 %	50 %	0 %	330836490
12104	NC_015436	AGG	2	6	602088	602093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836490
12105	NC_015436	GCG	2	6	602108	602113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836490
12106	NC_015436	TG	3	6	602132	602137	0 %	50 %	50 %	0 %	330836490
12107	NC_015436	AGC	2	6	602261	602266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836490
12108	NC_015436	TCCAG	2	10	602309	602318	20 %	20 %	20 %	40 %	330836490
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12110	NC_015436	GTCTT	2	10	602345	602354	0 %	60 %	20 %	20 %	330836490
12111	NC_015436	TGA	2	6	602448	602453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836490
12112	NC_015436	ACG	2	6	602542	602547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836490
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12119	NC_015436	GCGG	2	8	602894	602901	0 %	0 %	75 %	25 %	330836490
12120	NC_015436	G	6	6	602900	602905	0 %	0 %	100 %	0 %	330836490
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12122	NC_015436	GTC	2	6	602933	602938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12243	NC_015436	CGCAGT	2	12	608975	608986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330836494
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12358	NC_015436	TGT	2	6	614674	614679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12359	NC_015436	TAG	2	6	614686	614691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12360	NC_015436	AAG	2	6	614712	614717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12361	NC_015436	TGA	2	6	614845	614850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836498
12362	NC_015436	TGAT	2	8	614856	614863	25 %	50 %	25 %	0 %	330836498
12363	NC_015436	AT	3	6	614914	614919	50 %	50 %	0 %	0 %	330836498
12364	NC_015436	CTG	2	6	614942	614947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836498
12365	NC_015436	CG	3	6	615022	615027	0 %	0 %	50 %	50 %	330836498
12366	NC_015436	ATC	2	6	615029	615034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836498
12367	NC_015436	TGA	2	6	615103	615108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836498
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12370	NC_015436	CT	3	6	615189	615194	0 %	50 %	0 %	50 %	330836498
12371	NC_015436	CTG	2	6	615218	615223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836498
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12373	NC_015436	GAT	2	6	615313	615318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836498
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12375	NC_015436	GAT	2	6	615631	615636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836498
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12380	NC_015436	G	6	6	615872	615877	0 %	0 %	100 %	0 %	330836498
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12383	NC_015436	A	7	7	616040	616046	100 %	0 %	0 %	0 %	330836498
12384	NC_015436	GCA	3	9	616063	616071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836498
12385	NC_015436	TAAG	2	8	616100	616107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12386	NC_015436	TTC	2	6	616141	616146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836499
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12390	NC_015436	TG	3	6	616361	616366	0 %	50 %	50 %	0 %	330836499
12391	NC_015436	TGCT	2	8	616397	616404	0 %	50 %	25 %	25 %	330836499
12392	NC_015436	T	6	6	616425	616430	0 %	100 %	0 %	0 %	330836499
12393	NC_015436	T	6	6	616438	616443	0 %	100 %	0 %	0 %	330836499
12394	NC_015436	GCTT	2	8	616464	616471	0 %	50 %	25 %	25 %	330836499
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12404	NC_015436	TCC	2	6	617097	617102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12405	NC_015436	GTT	2	6	617104	617109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12406	NC_015436	GTAT	2	8	617117	617124	25 %	50 %	25 %	0 %	330836500
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12452	NC_015436	CTTT	2	8	619336	619343	0 %	75 %	0 %	25 %	330836501
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12467	NC_015436	GAAG	2	8	619969	619976	50 %	0 %	50 %	0 %	330836502
12468	NC_015436	CGG	2	6	620074	620079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836502
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12480	NC_015436	TGT	2	6	620489	620494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836503
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12482	NC_015436	TCT	2	6	620509	620514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836503
12483	NC_015436	CCG	2	6	620597	620602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836503
12484	NC_015436	CCT	2	6	620748	620753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836503
12485	NC_015436	TCA	2	6	620858	620863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836503
12486	NC_015436	TCC	2	6	620878	620883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836503
12487	NC_015436	AGG	2	6	620913	620918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836503
12488	NC_015436	CATTC	2	10	620945	620954	20 %	40 %	0 %	40 %	330836503
12489	NC_015436	TTA	2	6	621013	621018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836504
12490	NC_015436	CTTGTC	2	12	621039	621050	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330836504
12491	NC_015436	GCT	2	6	621111	621116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836504
12492	NC_015436	GGCA	2	8	621230	621237	25 %	0 %	50 %	25 %	330836504
12493	NC_015436	TGT	2	6	621257	621262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836504
12494	NC_015436	CTGA	2	8	621318	621325	25 %	25 %	25 %	25 %	330836504
12495	NC_015436	ATT	2	6	621351	621356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836504
12496	NC_015436	CT	3	6	621385	621390	0 %	50 %	0 %	50 %	330836504
12497	NC_015436	CTTT	2	8	621416	621423	0 %	75 %	0 %	25 %	330836504
12498	NC_015436	CTT	2	6	621462	621467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836504
12499	NC_015436	TTCGT	2	10	621507	621516	0 %	60 %	20 %	20 %	330836504
12500	NC_015436	GTA	2	6	621589	621594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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