MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015436	ATC	2	6	495584	495589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836391
10002	NC_015436	CGC	2	6	495665	495670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836391
10003	NC_015436	TTG	2	6	495672	495677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836391
10004	NC_015436	GAT	2	6	495686	495691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836391
10005	NC_015436	CAA	2	6	495703	495708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836391
10006	NC_015436	GGA	2	6	495740	495745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836391
10007	NC_015436	GCC	2	6	495783	495788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836391
10008	NC_015436	TCC	2	6	495834	495839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836391
10009	NC_015436	AAG	2	6	495863	495868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836391
10010	NC_015436	TGG	2	6	495876	495881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836391
10011	NC_015436	AGC	2	6	495896	495901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836391
10012	NC_015436	AAG	3	9	495974	495982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836391
10013	NC_015436	GAG	2	6	495989	495994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836391
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10015	NC_015436	GC	3	6	496036	496041	0 %	0 %	50 %	50 %	330836391
10016	NC_015436	CGT	2	6	496076	496081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836391
10017	NC_015436	GAT	2	6	496131	496136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836391
10018	NC_015436	CCT	2	6	496159	496164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836391
10019	NC_015436	GAT	2	6	496183	496188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836391
10020	NC_015436	GCG	2	6	496329	496334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836391
10021	NC_015436	CGC	2	6	496403	496408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836391
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10028	NC_015436	GCC	2	6	496756	496761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836392
10029	NC_015436	TGA	2	6	496770	496775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836392
10030	NC_015436	T	6	6	496790	496795	0 %	100 %	0 %	0 %	330836392
10031	NC_015436	TTCCTG	2	12	496813	496824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330836392
10032	NC_015436	ATG	3	9	496916	496924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836392
10033	NC_015436	TCCG	2	8	496934	496941	0 %	25 %	25 %	50 %	330836392
10034	NC_015436	CAA	2	6	497169	497174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836392
10035	NC_015436	TACCT	2	10	497182	497191	20 %	40 %	0 %	40 %	330836392
10036	NC_015436	AT	3	6	497274	497279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_015436	GATT	2	8	497327	497334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_015436	A	6	6	497354	497359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_015436	AAT	2	6	497479	497484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_015436	AGC	2	6	497489	497494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015436	AT	3	6	497613	497618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_015436	CCAG	2	8	497644	497651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_015436	CAT	2	6	497662	497667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_015436	TCTT	2	8	497808	497815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10045	NC_015436	CAT	2	6	497816	497821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10047	NC_015436	A	7	7	497876	497882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_015436	T	6	6	497904	497909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_015436	A	8	8	497910	497917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015436	TTG	2	6	498011	498016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_015436	GGAC	2	8	498030	498037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10052	NC_015436	GAAG	2	8	498259	498266	50 %	0 %	50 %	0 %	330836393
10053	NC_015436	AAGG	2	8	498293	498300	50 %	0 %	50 %	0 %	330836393
10054	NC_015436	CG	3	6	498338	498343	0 %	0 %	50 %	50 %	330836393
10055	NC_015436	GAAC	2	8	498415	498422	50 %	0 %	25 %	25 %	330836393
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10070	NC_015436	CCGAA	2	10	499005	499014	40 %	0 %	20 %	40 %	330836394
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10089	NC_015436	T	6	6	499842	499847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_015436	AT	3	6	499973	499978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_015436	CATG	2	8	500023	500030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10092	NC_015436	GGTT	2	8	500092	500099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_015436	GTTCA	2	10	500123	500132	20 %	40 %	20 %	20 %	330836395
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10102	NC_015436	GCC	2	6	500909	500914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836395
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10109	NC_015436	GCC	2	6	501151	501156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836395
10110	NC_015436	CCTG	2	8	501238	501245	0 %	25 %	25 %	50 %	330836395
10111	NC_015436	TGG	2	6	501249	501254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836395
10112	NC_015436	CTTC	2	8	501267	501274	0 %	50 %	0 %	50 %	330836395
10113	NC_015436	TCA	2	6	501285	501290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836395
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10118	NC_015436	TTGCT	2	10	501540	501549	0 %	60 %	20 %	20 %	330836395
10119	NC_015436	CAT	2	6	501625	501630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836395
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10122	NC_015436	GAAG	2	8	501772	501779	50 %	0 %	50 %	0 %	330836395
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10154	NC_015436	T	7	7	503365	503371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10233	NC_015436	TTC	2	6	507600	507605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836400
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10237	NC_015436	CCTG	2	8	507777	507784	0 %	25 %	25 %	50 %	330836400
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10241	NC_015436	GGC	2	6	507866	507871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836400
10242	NC_015436	TTG	2	6	507894	507899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836400
10243	NC_015436	ATT	2	6	507959	507964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836400
10244	NC_015436	AAT	2	6	507967	507972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836400
10245	NC_015436	GCT	2	6	508013	508018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836400
10246	NC_015436	TCT	2	6	508137	508142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836400
10247	NC_015436	GTC	2	6	508214	508219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836400
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10249	NC_015436	TTGA	2	8	508251	508258	25 %	50 %	25 %	0 %	330836400
10250	NC_015436	TGT	2	6	508279	508284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836400
10251	NC_015436	GTTCT	2	10	508306	508315	0 %	60 %	20 %	20 %	330836400
10252	NC_015436	TGA	2	6	508363	508368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836400
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10254	NC_015436	TTG	2	6	508405	508410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836400
10255	NC_015436	T	6	6	508507	508512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_015436	TATCA	2	10	508519	508528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10257	NC_015436	TCG	2	6	508536	508541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10258	NC_015436	CAT	2	6	508562	508567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_015436	AT	3	6	508569	508574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_015436	AAT	2	6	508603	508608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_015436	AT	4	8	508613	508620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_015436	CAAT	2	8	508633	508640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10263	NC_015436	CTATC	2	10	508694	508703	20 %	40 %	0 %	40 %	330836401
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10268	NC_015436	CGG	2	6	509020	509025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836401
10269	NC_015436	TGA	3	9	509087	509095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836401
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10281	NC_015436	GAT	2	6	509757	509762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836401
10282	NC_015436	TCA	2	6	509797	509802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836401
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10315	NC_015436	TTC	2	6	511280	511285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10316	NC_015436	ATC	2	6	511289	511294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10344	NC_015436	CGT	2	6	512937	512942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836403
10345	NC_015436	CATCA	2	10	513042	513051	40 %	20 %	0 %	40 %	330836403
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10348	NC_015436	TGACC	2	10	513133	513142	20 %	20 %	20 %	40 %	330836403
10349	NC_015436	CCCG	2	8	513213	513220	0 %	0 %	25 %	75 %	330836403
10350	NC_015436	GAG	2	6	513243	513248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836403
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10353	NC_015436	TGTA	2	8	513434	513441	25 %	50 %	25 %	0 %	330836403
10354	NC_015436	TTC	2	6	513571	513576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836403
10355	NC_015436	TGAC	2	8	513602	513609	25 %	25 %	25 %	25 %	330836403
10356	NC_015436	GA	3	6	513713	513718	50 %	0 %	50 %	0 %	330836403
10357	NC_015436	TAT	2	6	513773	513778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836403
10358	NC_015436	GTC	2	6	513865	513870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836403
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10360	NC_015436	TAG	2	6	513898	513903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836403
10361	NC_015436	GT	3	6	513918	513923	0 %	50 %	50 %	0 %	330836403
10362	NC_015436	GTC	2	6	513942	513947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836403
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10364	NC_015436	GGC	2	6	514038	514043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836403
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10368	NC_015436	TC	30	60	514277	514336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10373	NC_015436	T	6	6	514604	514609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10374	NC_015436	GGT	2	6	514631	514636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10398	NC_015436	ACAT	2	8	515631	515638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10401	NC_015436	CTG	2	6	515743	515748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836405
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10447	NC_015436	TC	3	6	517702	517707	0 %	50 %	0 %	50 %	330836406
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10452	NC_015436	TA	3	6	517936	517941	50 %	50 %	0 %	0 %	330836406
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10469	NC_015436	CATTGT	2	12	518767	518778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330836407
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10472	NC_015436	CTTT	2	8	518823	518830	0 %	75 %	0 %	25 %	330836407
10473	NC_015436	TTC	2	6	518888	518893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836407
10474	NC_015436	GGA	2	6	518968	518973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10475	NC_015436	ATG	2	6	518987	518992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10476	NC_015436	ATG	2	6	519051	519056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836408
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10478	NC_015436	GGAG	2	8	519128	519135	25 %	0 %	75 %	0 %	330836408
10479	NC_015436	AAG	2	6	519186	519191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836408
10480	NC_015436	GTC	2	6	519192	519197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836408
10481	NC_015436	ATCA	2	8	519213	519220	50 %	25 %	0 %	25 %	330836408
10482	NC_015436	TGA	2	6	519392	519397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836408
10483	NC_015436	AAG	2	6	519399	519404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836408
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