MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015436	A	6	6	22745	22750	100 %	0 %	0 %	0 %	330836004
502	NC_015436	CGG	2	6	22778	22783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836004
503	NC_015436	CGGA	2	8	22834	22841	25 %	0 %	50 %	25 %	330836004
504	NC_015436	T	7	7	22852	22858	0 %	100 %	0 %	0 %	330836004
505	NC_015436	GTTTT	2	10	22930	22939	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015436	T	6	6	22936	22941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015436	ATAC	2	8	22953	22960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_015436	CT	3	6	23010	23015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015436	T	6	6	23017	23022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015436	TA	3	6	23075	23080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015436	AG	3	6	23115	23120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015436	T	7	7	23165	23171	0 %	100 %	0 %	0 %	330836005
513	NC_015436	TAT	2	6	23210	23215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836005
514	NC_015436	TGC	2	6	23226	23231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836005
515	NC_015436	A	6	6	23399	23404	100 %	0 %	0 %	0 %	330836005
516	NC_015436	T	6	6	23416	23421	0 %	100 %	0 %	0 %	330836005
517	NC_015436	ATG	2	6	23442	23447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836005
518	NC_015436	TCT	2	6	23549	23554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836005
519	NC_015436	GAC	2	6	23608	23613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836005
520	NC_015436	TTG	2	6	23645	23650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836005
521	NC_015436	AAT	2	6	23666	23671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836005
522	NC_015436	AGA	2	6	23689	23694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836005
523	NC_015436	GGAT	2	8	23749	23756	25 %	25 %	50 %	0 %	330836005
524	NC_015436	CT	3	6	23821	23826	0 %	50 %	0 %	50 %	330836005
525	NC_015436	ATG	2	6	23829	23834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836005
526	NC_015436	CTT	2	6	23856	23861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836005
527	NC_015436	GTT	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836005
528	NC_015436	A	6	6	23897	23902	100 %	0 %	0 %	0 %	330836005
529	NC_015436	TAC	2	6	23945	23950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015436	T	6	6	24026	24031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015436	TCA	2	6	24051	24056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015436	T	7	7	24059	24065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015436	CAA	2	6	24081	24086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015436	GGA	2	6	24272	24277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015436	GAT	2	6	24336	24341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836006
536	NC_015436	TGG	2	6	24388	24393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836006
537	NC_015436	AGC	2	6	24418	24423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836006
538	NC_015436	GAA	2	6	24426	24431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836006
539	NC_015436	A	6	6	24430	24435	100 %	0 %	0 %	0 %	330836006
540	NC_015436	TTG	2	6	24486	24491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836006
541	NC_015436	CAA	2	6	24499	24504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836006
542	NC_015436	ATG	2	6	24538	24543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836006
543	NC_015436	CAAA	2	8	24566	24573	75 %	0 %	0 %	25 %	330836006
544	NC_015436	CT	3	6	24642	24647	0 %	50 %	0 %	50 %	330836006
545	NC_015436	CAA	2	6	24679	24684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836006
546	NC_015436	ATG	2	6	24814	24819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836006
547	NC_015436	TCA	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836006
548	NC_015436	CG	4	8	24995	25002	0 %	0 %	50 %	50 %	330836006
549	NC_015436	CAT	2	6	25007	25012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836006
550	NC_015436	TGA	2	6	25013	25018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836006
551	NC_015436	GA	3	6	25017	25022	50 %	0 %	50 %	0 %	330836006
552	NC_015436	ACG	2	6	25030	25035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836006
553	NC_015436	A	7	7	25284	25290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015436	AT	3	6	25303	25308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015436	ATG	2	6	25515	25520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
556	NC_015436	TGA	2	6	25549	25554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
557	NC_015436	T	6	6	25555	25560	0 %	100 %	0 %	0 %	330836007
558	NC_015436	TTTC	2	8	25577	25584	0 %	75 %	0 %	25 %	330836007
559	NC_015436	GTA	2	6	25706	25711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
560	NC_015436	GCC	3	9	25757	25765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836007
561	NC_015436	TGCC	2	8	25767	25774	0 %	25 %	25 %	50 %	330836007
562	NC_015436	CCG	2	6	25779	25784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836007
563	NC_015436	GAT	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
564	NC_015436	TTC	2	6	25804	25809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836007
565	NC_015436	CGG	2	6	25828	25833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836007
566	NC_015436	GCC	2	6	25835	25840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836007
567	NC_015436	ATA	2	6	25868	25873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836007
568	NC_015436	GTTC	2	8	25895	25902	0 %	50 %	25 %	25 %	330836007
569	NC_015436	CTC	2	6	25949	25954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836007
570	NC_015436	TGG	2	6	25977	25982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836007
571	NC_015436	AATC	2	8	25996	26003	50 %	25 %	0 %	25 %	330836007
572	NC_015436	GTAGC	2	10	26160	26169	20 %	20 %	40 %	20 %	330836007
573	NC_015436	ATG	2	6	26175	26180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
574	NC_015436	CGG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836007
575	NC_015436	CTT	2	6	26305	26310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836007
576	NC_015436	TGA	2	6	26329	26334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
577	NC_015436	ATC	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836007
578	NC_015436	ATG	2	6	26391	26396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836007
579	NC_015436	AAG	2	6	26465	26470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
580	NC_015436	GAA	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
581	NC_015436	A	6	6	26530	26535	100 %	0 %	0 %	0 %	330836007
582	NC_015436	AAG	2	6	26539	26544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836007
583	NC_015436	CGT	2	6	26623	26628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015436	GAT	2	6	26650	26655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015436	GA	3	6	26660	26665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015436	GGA	2	6	26695	26700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015436	CAT	2	6	26710	26715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836008
588	NC_015436	CGT	2	6	26808	26813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836008
589	NC_015436	CCAT	2	8	26854	26861	25 %	25 %	0 %	50 %	330836008
590	NC_015436	TTC	2	6	26996	27001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
591	NC_015436	CCG	2	6	27035	27040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836008
592	NC_015436	TAT	2	6	27041	27046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836008
593	NC_015436	A	6	6	27072	27077	100 %	0 %	0 %	0 %	330836008
594	NC_015436	TC	3	6	27091	27096	0 %	50 %	0 %	50 %	330836008
595	NC_015436	AGG	2	6	27106	27111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
596	NC_015436	AGG	2	6	27127	27132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
597	NC_015436	GGACGG	2	12	27182	27193	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330836008
598	NC_015436	AC	3	6	27201	27206	50 %	0 %	0 %	50 %	330836008
599	NC_015436	CAG	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836008
600	NC_015436	GTACG	2	10	27236	27245	20 %	20 %	40 %	20 %	330836008
601	NC_015436	TGA	2	6	27302	27307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836008
602	NC_015436	CTT	2	6	27340	27345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
603	NC_015436	ACA	2	6	27388	27393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836008
604	NC_015436	TGA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836008
605	NC_015436	GGA	2	6	27418	27423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836008
606	NC_015436	GCG	2	6	27493	27498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836008
607	NC_015436	TGCC	2	8	27566	27573	0 %	25 %	25 %	50 %	330836008
608	NC_015436	AGA	2	6	27622	27627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836008
609	NC_015436	TTC	2	6	27630	27635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836008
610	NC_015436	GCC	2	6	27869	27874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836009
611	NC_015436	ATC	2	6	27984	27989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
612	NC_015436	GGT	2	6	27990	27995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836009
613	NC_015436	GCG	2	6	28027	28032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836009
614	NC_015436	ACT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
615	NC_015436	CCCG	2	8	28102	28109	0 %	0 %	25 %	75 %	330836009
616	NC_015436	GTT	2	6	28197	28202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836009
617	NC_015436	TGA	2	6	28256	28261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
618	NC_015436	ATG	2	6	28360	28365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
619	NC_015436	TGT	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836009
620	NC_015436	AGA	2	6	28409	28414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836009
621	NC_015436	GAT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836009
622	NC_015436	GAA	2	6	28525	28530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836009
623	NC_015436	CAT	2	6	28610	28615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836009
624	NC_015436	GT	3	6	28670	28675	0 %	50 %	50 %	0 %	330836009
625	NC_015436	CGTTTG	2	12	28741	28752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330836009
626	NC_015436	TCAG	2	8	28753	28760	25 %	25 %	25 %	25 %	330836009
627	NC_015436	TGATG	2	10	28812	28821	20 %	40 %	40 %	0 %	330836009
628	NC_015436	GT	3	6	28832	28837	0 %	50 %	50 %	0 %	330836009
629	NC_015436	GGC	2	6	29028	29033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836010
630	NC_015436	AGGC	2	8	29051	29058	25 %	0 %	50 %	25 %	330836010
631	NC_015436	CAA	2	6	29087	29092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836010
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660	NC_015436	AAG	2	6	30540	30545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_015436	GTAC	2	8	31796	31803	25 %	25 %	25 %	25 %	330836012
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692	NC_015436	GCC	2	6	31885	31890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
693	NC_015436	A	7	7	31928	31934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
694	NC_015436	TAAA	2	8	31935	31942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
695	NC_015436	A	6	6	31989	31994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
696	NC_015436	A	6	6	32004	32009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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702	NC_015436	GAAAA	2	10	32316	32325	80 %	0 %	20 %	0 %	330836013
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751	NC_015436	GCG	2	6	34831	34836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836015
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756	NC_015436	CCAG	2	8	35087	35094	25 %	0 %	25 %	50 %	330836015
757	NC_015436	GAG	2	6	35136	35141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836015
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761	NC_015436	CAA	2	6	35410	35415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_015436	GGAT	2	8	35425	35432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
763	NC_015436	ATGG	2	8	35444	35451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
764	NC_015436	CAT	2	6	35460	35465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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873	NC_015436	TAC	2	6	41636	41641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836022
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876	NC_015436	GAA	2	6	41916	41921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836022
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880	NC_015436	A	6	6	42061	42066	100 %	0 %	0 %	0 %	330836023
881	NC_015436	AT	3	6	42087	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	330836023
882	NC_015436	CAT	2	6	42166	42171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836023
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