MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015436	ATCTT	2	10	345799	345808	20 %	60 %	0 %	20 %	330836279
7002	NC_015436	GTC	2	6	345819	345824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836279
7003	NC_015436	GCG	2	6	345876	345881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836279
7004	NC_015436	ATG	2	6	345951	345956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836279
7005	NC_015436	TGA	2	6	346042	346047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836279
7006	NC_015436	CCT	2	6	346130	346135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836279
7007	NC_015436	TCC	2	6	346147	346152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836279
7008	NC_015436	GCT	2	6	346164	346169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836279
7009	NC_015436	TGTT	2	8	346183	346190	0 %	75 %	25 %	0 %	330836279
7010	NC_015436	TGA	2	6	346253	346258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_015436	TAAA	2	8	346329	346336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_015436	A	6	6	346379	346384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_015436	AAC	2	6	346402	346407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015436	ACC	2	6	346464	346469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_015436	CCG	2	6	346515	346520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_015436	CTG	2	6	346665	346670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_015436	GAT	2	6	346677	346682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_015436	TGTCCA	2	12	346745	346756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836280
7019	NC_015436	AATC	2	8	346903	346910	50 %	25 %	0 %	25 %	330836280
7020	NC_015436	TGA	2	6	346924	346929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836280
7021	NC_015436	TAC	2	6	346949	346954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
7022	NC_015436	A	7	7	346966	346972	100 %	0 %	0 %	0 %	330836280
7023	NC_015436	AGG	2	6	347003	347008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836280
7024	NC_015436	GTT	2	6	347024	347029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836280
7025	NC_015436	CAT	2	6	347038	347043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
7026	NC_015436	A	6	6	347066	347071	100 %	0 %	0 %	0 %	330836280
7027	NC_015436	TCA	2	6	347101	347106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836280
7028	NC_015436	CCA	2	6	347141	347146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_015436	A	6	6	347215	347220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_015436	ATT	2	6	347239	347244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_015436	AGA	2	6	347325	347330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_015436	GA	3	6	347348	347353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_015436	A	6	6	347360	347365	100 %	0 %	0 %	0 %	330836281
7034	NC_015436	GAAA	2	8	347443	347450	75 %	0 %	25 %	0 %	330836281
7035	NC_015436	CTG	2	6	347508	347513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836281
7036	NC_015436	TG	3	6	347602	347607	0 %	50 %	50 %	0 %	330836281
7037	NC_015436	CGGA	2	8	347712	347719	25 %	0 %	50 %	25 %	330836281
7038	NC_015436	CTG	2	6	347865	347870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836281
7039	NC_015436	TGT	2	6	347886	347891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836281
7040	NC_015436	GAT	2	6	347905	347910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836281
7041	NC_015436	AT	3	6	347932	347937	50 %	50 %	0 %	0 %	330836281
7042	NC_015436	CTT	2	6	347970	347975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836281
7043	NC_015436	TC	3	6	348033	348038	0 %	50 %	0 %	50 %	330836281
7044	NC_015436	TTC	2	6	348044	348049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836281
7045	NC_015436	GCAA	2	8	348055	348062	50 %	0 %	25 %	25 %	330836281
7046	NC_015436	TTCC	2	8	348087	348094	0 %	50 %	0 %	50 %	330836281
7047	NC_015436	CATC	2	8	348123	348130	25 %	25 %	0 %	50 %	330836281
7048	NC_015436	GGC	2	6	348151	348156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836281
7049	NC_015436	CTGG	2	8	348175	348182	0 %	25 %	50 %	25 %	330836281
7050	NC_015436	AGCA	2	8	348185	348192	50 %	0 %	25 %	25 %	330836281
7051	NC_015436	GTA	2	6	348236	348241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836281
7052	NC_015436	CAGA	2	8	348407	348414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7053	NC_015436	ATC	2	6	348559	348564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7054	NC_015436	CTT	2	6	348571	348576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836282
7055	NC_015436	TCA	2	6	348590	348595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7056	NC_015436	CAGG	2	8	348631	348638	25 %	0 %	50 %	25 %	330836282
7057	NC_015436	GAA	2	6	348654	348659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836282
7058	NC_015436	CTA	2	6	348690	348695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7059	NC_015436	TTC	2	6	348706	348711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836282
7060	NC_015436	CAT	2	6	348837	348842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7061	NC_015436	CCG	2	6	348847	348852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
7062	NC_015436	ATC	2	6	348871	348876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7063	NC_015436	TCA	2	6	348899	348904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7064	NC_015436	CTG	2	6	348913	348918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
7065	NC_015436	CTTT	2	8	348977	348984	0 %	75 %	0 %	25 %	330836282
7066	NC_015436	GTG	2	6	349007	349012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836282
7067	NC_015436	CGC	2	6	349044	349049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
7068	NC_015436	GTCC	2	8	349206	349213	0 %	25 %	25 %	50 %	330836282
7069	NC_015436	CCAT	2	8	349285	349292	25 %	25 %	0 %	50 %	330836282
7070	NC_015436	TCC	2	6	349304	349309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836282
7071	NC_015436	TCG	2	6	349366	349371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
7072	NC_015436	GCC	2	6	349390	349395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836282
7073	NC_015436	ATC	2	6	349438	349443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836282
7074	NC_015436	GTTG	2	8	349537	349544	0 %	50 %	50 %	0 %	330836282
7075	NC_015436	CGT	2	6	349651	349656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
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7077	NC_015436	GAA	2	6	349855	349860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836282
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7081	NC_015436	TGC	2	6	350064	350069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836282
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7085	NC_015436	GAC	2	6	350177	350182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836282
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7087	NC_015436	AAT	2	6	350269	350274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836283
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7089	NC_015436	GAT	2	6	350398	350403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
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7091	NC_015436	GAT	2	6	350559	350564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
7092	NC_015436	CGG	2	6	350616	350621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836283
7093	NC_015436	CAG	3	9	350623	350631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836283
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7095	NC_015436	TTC	2	6	350672	350677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836283
7096	NC_015436	CAG	2	6	350877	350882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836283
7097	NC_015436	TGTC	2	8	350945	350952	0 %	50 %	25 %	25 %	330836283
7098	NC_015436	GAT	2	6	351082	351087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836283
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7104	NC_015436	AT	3	6	351449	351454	50 %	50 %	0 %	0 %	330836284
7105	NC_015436	GA	3	6	351469	351474	50 %	0 %	50 %	0 %	330836284
7106	NC_015436	TCC	2	6	351479	351484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836284
7107	NC_015436	GAT	2	6	351543	351548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836284
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7109	NC_015436	GCC	3	9	351570	351578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836284
7110	NC_015436	TCA	2	6	351657	351662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836284
7111	NC_015436	GGA	2	6	351663	351668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836284
7112	NC_015436	CGC	2	6	351674	351679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836284
7113	NC_015436	TCA	2	6	351784	351789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836284
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7115	NC_015436	T	6	6	351856	351861	0 %	100 %	0 %	0 %	330836284
7116	NC_015436	GCG	2	6	351957	351962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836284
7117	NC_015436	AT	3	6	351997	352002	50 %	50 %	0 %	0 %	330836284
7118	NC_015436	ACG	2	6	352050	352055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836284
7119	NC_015436	CAT	2	6	352158	352163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_015436	AT	3	6	352162	352167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_015436	ATA	2	6	352177	352182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_015436	TAT	2	6	352197	352202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_015436	GCT	2	6	352256	352261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836285
7124	NC_015436	GGT	2	6	352338	352343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836285
7125	NC_015436	TTG	2	6	352388	352393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836285
7126	NC_015436	GCTT	2	8	352468	352475	0 %	50 %	25 %	25 %	330836285
7127	NC_015436	CGT	2	6	352676	352681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836285
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7129	NC_015436	CT	3	6	352998	353003	0 %	50 %	0 %	50 %	330836285
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7153	NC_015436	A	7	7	354558	354564	100 %	0 %	0 %	0 %	330836287
7154	NC_015436	CTC	2	6	354620	354625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7155	NC_015436	TGG	2	6	354723	354728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836288
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7171	NC_015436	T	6	6	355607	355612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7172	NC_015436	GAA	2	6	355698	355703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7173	NC_015436	TCGT	2	8	355745	355752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7174	NC_015436	A	6	6	355761	355766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7230	NC_015436	AGA	2	6	358270	358275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7231	NC_015436	TGAA	2	8	358319	358326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7232	NC_015436	GAA	2	6	358339	358344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7233	NC_015436	GGA	2	6	358372	358377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7242	NC_015436	AG	3	6	358657	358662	50 %	0 %	50 %	0 %	330836292
7243	NC_015436	A	6	6	358679	358684	100 %	0 %	0 %	0 %	330836292
7244	NC_015436	TCC	2	6	358738	358743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836292
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7247	NC_015436	AGGA	2	8	358809	358816	50 %	0 %	50 %	0 %	330836292
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7252	NC_015436	GGA	2	6	359171	359176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836292
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7261	NC_015436	AC	3	6	359467	359472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7360	NC_015436	GTGCT	2	10	365145	365154	0 %	40 %	40 %	20 %	330836297
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7368	NC_015436	GTT	2	6	365543	365548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836297
7369	NC_015436	GTAC	2	8	365618	365625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7370	NC_015436	AT	3	6	365628	365633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7393	NC_015436	ATC	2	6	367487	367492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836299
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7472	NC_015436	GAT	2	6	371172	371177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836301
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7482	NC_015436	CGA	2	6	371630	371635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836301
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7488	NC_015436	GCTT	2	8	371945	371952	0 %	50 %	25 %	25 %	330836301
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7491	NC_015436	GTC	2	6	372034	372039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836301
7492	NC_015436	ATTG	2	8	372081	372088	25 %	50 %	25 %	0 %	330836301
7493	NC_015436	ATG	2	6	372192	372197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836302
7494	NC_015436	TCA	2	6	372216	372221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836302
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7496	NC_015436	TTA	2	6	372534	372539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836302
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7500	NC_015436	CCG	2	6	372783	372788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836302

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