MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015436	CCTTG	2	10	321729	321738	0 %	40 %	20 %	40 %	330836258
6502	NC_015436	TGA	2	6	321797	321802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
6503	NC_015436	TGC	2	6	321816	321821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836258
6504	NC_015436	CATTTT	2	12	321831	321842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836258
6505	NC_015436	T	7	7	321839	321845	0 %	100 %	0 %	0 %	330836258
6506	NC_015436	CCT	2	6	321846	321851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836258
6507	NC_015436	GC	3	6	321882	321887	0 %	0 %	50 %	50 %	330836258
6508	NC_015436	TGA	2	6	321917	321922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
6509	NC_015436	TCA	2	6	321977	321982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836258
6510	NC_015436	TG	3	6	322063	322068	0 %	50 %	50 %	0 %	330836258
6511	NC_015436	GTG	2	6	322099	322104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836258
6512	NC_015436	TGA	2	6	322121	322126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
6513	NC_015436	TTC	2	6	322138	322143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836258
6514	NC_015436	TGA	2	6	322178	322183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
6515	NC_015436	CAG	2	6	322392	322397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836258
6516	NC_015436	AGA	2	6	322506	322511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836258
6517	NC_015436	TCT	2	6	322519	322524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836258
6518	NC_015436	AAC	2	6	322603	322608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836259
6519	NC_015436	A	6	6	322613	322618	100 %	0 %	0 %	0 %	330836259
6520	NC_015436	CAG	2	6	322657	322662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
6521	NC_015436	CT	3	6	322703	322708	0 %	50 %	0 %	50 %	330836259
6522	NC_015436	TCGCCA	2	12	322769	322780	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330836259
6523	NC_015436	GCA	2	6	322799	322804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
6524	NC_015436	CAG	2	6	322848	322853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
6525	NC_015436	ACC	3	9	322854	322862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836259
6526	NC_015436	TGCT	2	8	322945	322952	0 %	50 %	25 %	25 %	330836259
6527	NC_015436	ACA	2	6	322972	322977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836259
6528	NC_015436	GCTT	2	8	322985	322992	0 %	50 %	25 %	25 %	330836259
6529	NC_015436	TGA	2	6	323039	323044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
6530	NC_015436	TCT	2	6	323054	323059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
6531	NC_015436	CCTG	2	8	323063	323070	0 %	25 %	25 %	50 %	330836259
6532	NC_015436	GCC	3	9	323088	323096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836259
6533	NC_015436	ATCT	2	8	323127	323134	25 %	50 %	0 %	25 %	330836259
6534	NC_015436	TGA	2	6	323177	323182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
6535	NC_015436	TTC	2	6	323215	323220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
6536	NC_015436	GCC	2	6	323226	323231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836259
6537	NC_015436	GAC	2	6	323241	323246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
6538	NC_015436	GGTT	2	8	323296	323303	0 %	50 %	50 %	0 %	330836259
6539	NC_015436	TTC	2	6	323324	323329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
6540	NC_015436	GA	3	6	323365	323370	50 %	0 %	50 %	0 %	330836259
6541	NC_015436	CCA	2	6	323399	323404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836259
6542	NC_015436	GCA	2	6	323443	323448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
6543	NC_015436	TGA	2	6	323450	323455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
6544	NC_015436	GCAG	2	8	323486	323493	25 %	0 %	50 %	25 %	330836259
6545	NC_015436	GAA	2	6	323505	323510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836259
6546	NC_015436	GAA	2	6	323555	323560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836259
6547	NC_015436	TGA	3	9	323562	323570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
6548	NC_015436	TGA	2	6	323637	323642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6549	NC_015436	GAT	2	6	323653	323658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6550	NC_015436	ATG	2	6	323726	323731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6551	NC_015436	ATG	3	9	323783	323791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6552	NC_015436	TCC	3	9	323824	323832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836260
6553	NC_015436	AG	3	6	323844	323849	50 %	0 %	50 %	0 %	330836260
6554	NC_015436	GGC	2	6	323920	323925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836260
6555	NC_015436	CGC	2	6	323928	323933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836260
6556	NC_015436	TGT	2	6	323988	323993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836260
6557	NC_015436	TCA	2	6	324180	324185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836260
6558	NC_015436	GCCATG	2	12	324209	324220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330836260
6559	NC_015436	TGA	3	9	324252	324260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6560	NC_015436	GAT	2	6	324274	324279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6561	NC_015436	CAT	2	6	324358	324363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836260
6562	NC_015436	GAT	2	6	324463	324468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
6563	NC_015436	CAG	2	6	324546	324551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_015436	AATCC	2	10	324572	324581	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6565	NC_015436	GGA	2	6	324597	324602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_015436	ATG	2	6	324606	324611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015436	GGA	2	6	324672	324677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015436	CCTTGA	2	12	324696	324707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836261
6569	NC_015436	ATG	2	6	324797	324802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
6570	NC_015436	TGA	2	6	324806	324811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
6571	NC_015436	GAC	2	6	324815	324820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836261
6572	NC_015436	TGA	2	6	324912	324917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
6573	NC_015436	TGA	2	6	324980	324985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
6574	NC_015436	CGC	2	6	325029	325034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836261
6575	NC_015436	GCC	2	6	325126	325131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836261
6576	NC_015436	GCG	2	6	325168	325173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836261
6577	NC_015436	CTC	2	6	325193	325198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836261
6578	NC_015436	GTTG	2	8	325260	325267	0 %	50 %	50 %	0 %	330836261
6579	NC_015436	A	6	6	325364	325369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_015436	GACTT	2	10	325370	325379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6581	NC_015436	GAT	2	6	325406	325411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_015436	GAA	2	6	325436	325441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_015436	CAA	2	6	325461	325466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_015436	AAT	2	6	325475	325480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015436	GCT	2	6	325502	325507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_015436	AGG	2	6	325510	325515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_015436	TGA	2	6	325528	325533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836262
6588	NC_015436	GAT	2	6	325673	325678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836262
6589	NC_015436	AGC	2	6	325741	325746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836262
6590	NC_015436	GAA	2	6	325808	325813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836262
6591	NC_015436	GAA	2	6	325865	325870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836262
6592	NC_015436	CCTGA	2	10	325887	325896	20 %	20 %	20 %	40 %	330836262
6593	NC_015436	TCCG	2	8	325906	325913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_015436	T	6	6	325938	325943	0 %	100 %	0 %	0 %	330836263
6595	NC_015436	CGTG	2	8	325946	325953	0 %	25 %	50 %	25 %	330836263
6596	NC_015436	GCA	2	6	326018	326023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836263
6597	NC_015436	GCC	2	6	326085	326090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836263
6598	NC_015436	ACAG	2	8	326169	326176	50 %	0 %	25 %	25 %	330836263
6599	NC_015436	CCG	2	6	326192	326197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836263
6600	NC_015436	CGGAGG	2	12	326252	326263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330836263
6601	NC_015436	CCT	2	6	326279	326284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836263
6602	NC_015436	TTCT	2	8	326325	326332	0 %	75 %	0 %	25 %	330836263
6603	NC_015436	GCA	2	6	326411	326416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836263
6604	NC_015436	AAT	2	6	326529	326534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836263
6605	NC_015436	CAT	2	6	326546	326551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836263
6606	NC_015436	TTC	2	6	326702	326707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836264
6607	NC_015436	GGAC	2	8	326791	326798	25 %	0 %	50 %	25 %	330836264
6608	NC_015436	GGA	2	6	326990	326995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836264
6609	NC_015436	GAT	2	6	326997	327002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836264
6610	NC_015436	CT	3	6	327011	327016	0 %	50 %	0 %	50 %	330836264
6611	NC_015436	AGG	2	6	327018	327023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836264
6612	NC_015436	GGC	2	6	327122	327127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836264
6613	NC_015436	GCCA	2	8	327143	327150	25 %	0 %	25 %	50 %	330836264
6614	NC_015436	GACT	2	8	327252	327259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_015436	GAA	2	6	327260	327265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_015436	TCC	2	6	327266	327271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_015436	TGAA	2	8	327316	327323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_015436	TGC	2	6	327366	327371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_015436	AG	3	6	327442	327447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_015436	GAA	2	6	327628	327633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836265
6621	NC_015436	GAG	2	6	327658	327663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836265
6622	NC_015436	TTC	2	6	327696	327701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836265
6623	NC_015436	TGA	2	6	327717	327722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836265
6624	NC_015436	TCA	2	6	327843	327848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836265
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6626	NC_015436	ATG	2	6	327914	327919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836265
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6631	NC_015436	GCC	2	6	328144	328149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836265
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6633	NC_015436	GA	3	6	328238	328243	50 %	0 %	50 %	0 %	330836265
6634	NC_015436	GGA	2	6	328250	328255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836265
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6643	NC_015436	TGA	2	6	328656	328661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836265
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6645	NC_015436	AGCTG	2	10	328718	328727	20 %	20 %	40 %	20 %	330836266
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6651	NC_015436	AGAAA	2	10	328919	328928	80 %	0 %	20 %	0 %	330836266
6652	NC_015436	A	6	6	328926	328931	100 %	0 %	0 %	0 %	330836266
6653	NC_015436	GGA	2	6	328977	328982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836266
6654	NC_015436	TTC	2	6	329015	329020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836266
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6658	NC_015436	TCATGG	2	12	329179	329190	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330836266
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6697	NC_015436	GCAA	2	8	330899	330906	50 %	0 %	25 %	25 %	330836267
6698	NC_015436	TA	3	6	330934	330939	50 %	50 %	0 %	0 %	330836267
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6702	NC_015436	GATT	2	8	331308	331315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6703	NC_015436	TTC	2	6	331407	331412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836268
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6729	NC_015436	AGT	2	6	332828	332833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836268
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6733	NC_015436	CTG	2	6	332931	332936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836268
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6866	NC_015436	TGA	2	6	339506	339511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836275
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