MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831850
2	NC_015433	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	330831850
3	NC_015433	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	330831850
4	NC_015433	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	330831850
5	NC_015433	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831850
6	NC_015433	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
7	NC_015433	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831850
8	NC_015433	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831850
9	NC_015433	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831850
10	NC_015433	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831850
11	NC_015433	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831850
12	NC_015433	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	330831850
13	NC_015433	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	330831850
14	NC_015433	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831850
15	NC_015433	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	330831850
16	NC_015433	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831850
17	NC_015433	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831850
18	NC_015433	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
19	NC_015433	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	330831850
20	NC_015433	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831850
21	NC_015433	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	330831850
22	NC_015433	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	330831850
23	NC_015433	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831850
24	NC_015433	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	330831850
25	NC_015433	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	330831850
26	NC_015433	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	330831850
27	NC_015433	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	330831850
28	NC_015433	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	330831850
29	NC_015433	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831850
30	NC_015433	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831850
31	NC_015433	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	330831850
32	NC_015433	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015433	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015433	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015433	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015433	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015433	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015433	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
39	NC_015433	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	330831851
40	NC_015433	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831851
41	NC_015433	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831851
42	NC_015433	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	330831851
43	NC_015433	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831851
44	NC_015433	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831851
45	NC_015433	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831851
46	NC_015433	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	330831851
47	NC_015433	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831851
48	NC_015433	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
49	NC_015433	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
50	NC_015433	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831851
51	NC_015433	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	330831851
52	NC_015433	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	330831851
53	NC_015433	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831851
54	NC_015433	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
55	NC_015433	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
56	NC_015433	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831851
57	NC_015433	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	330831851
58	NC_015433	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831851
59	NC_015433	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	330831851
60	NC_015433	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831851
61	NC_015433	AGG	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015433	GTT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015433	T	7	7	2814	2820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015433	TTTAT	2	10	2847	2856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015433	A	6	6	2860	2865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015433	TA	3	6	2884	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015433	TA	4	8	2915	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	330831852
68	NC_015433	CTG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831852
69	NC_015433	CATAT	2	10	2959	2968	40 %	40 %	0 %	20 %	330831852
70	NC_015433	AAAG	2	8	2977	2984	75 %	0 %	25 %	0 %	330831852
71	NC_015433	A	6	6	3035	3040	100 %	0 %	0 %	0 %	330831852
72	NC_015433	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831852
73	NC_015433	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
74	NC_015433	AT	3	6	3247	3252	50 %	50 %	0 %	0 %	330831852
75	NC_015433	A	7	7	3343	3349	100 %	0 %	0 %	0 %	330831852
76	NC_015433	ATT	2	6	3405	3410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
77	NC_015433	TGA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831852
78	NC_015433	T	6	6	3475	3480	0 %	100 %	0 %	0 %	330831852
79	NC_015433	TGG	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831852
80	NC_015433	GAAG	2	8	3549	3556	50 %	0 %	50 %	0 %	330831852
81	NC_015433	TTA	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
82	NC_015433	TCT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831852
83	NC_015433	ATT	3	9	3696	3704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831852
84	NC_015433	GA	3	6	3716	3721	50 %	0 %	50 %	0 %	330831852
85	NC_015433	GTAT	2	8	3764	3771	25 %	50 %	25 %	0 %	330831852
86	NC_015433	AGG	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831852
87	NC_015433	GTAT	2	8	3785	3792	25 %	50 %	25 %	0 %	330831853
88	NC_015433	TCA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831853
89	NC_015433	AAG	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831853
90	NC_015433	ATG	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831853
91	NC_015433	A	6	6	3956	3961	100 %	0 %	0 %	0 %	330831853
92	NC_015433	CTG	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015433	A	6	6	4073	4078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015433	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015433	TGG	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831854
96	NC_015433	AAC	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831854
97	NC_015433	AATG	2	8	4330	4337	50 %	25 %	25 %	0 %	330831854
98	NC_015433	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831854
99	NC_015433	CT	3	6	4403	4408	0 %	50 %	0 %	50 %	330831854
100	NC_015433	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015433	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015433	A	6	6	4564	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015433	CAG	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
104	NC_015433	TCG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831855
105	NC_015433	TGG	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831855
106	NC_015433	TCA	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831855
107	NC_015433	AAAT	2	8	4831	4838	75 %	25 %	0 %	0 %	330831855
108	NC_015433	TTG	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831855
109	NC_015433	AG	3	6	4993	4998	50 %	0 %	50 %	0 %	330831855
110	NC_015433	CAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831855
111	NC_015433	A	6	6	5025	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	330831855
112	NC_015433	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	330831855
113	NC_015433	AGA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
114	NC_015433	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
115	NC_015433	A	6	6	5148	5153	100 %	0 %	0 %	0 %	330831855
116	NC_015433	GTG	3	9	5291	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831855
117	NC_015433	GAA	3	9	5315	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
118	NC_015433	CGA	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
119	NC_015433	CTTG	2	8	5419	5426	0 %	50 %	25 %	25 %	330831855
120	NC_015433	CAG	2	6	5445	5450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831855
121	NC_015433	AGG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831855
122	NC_015433	CTC	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831855
123	NC_015433	GAT	2	6	5567	5572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831855
124	NC_015433	AAG	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
125	NC_015433	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831855
126	NC_015433	CAT	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831855
127	NC_015433	TTC	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015433	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015433	GAT	2	6	5789	5794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015433	TTGG	2	8	5798	5805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015433	A	6	6	5839	5844	100 %	0 %	0 %	0 %	330831856
132	NC_015433	ATC	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831856
133	NC_015433	AAACA	2	10	5893	5902	80 %	0 %	0 %	20 %	330831856
134	NC_015433	TGC	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831856
135	NC_015433	A	6	6	6010	6015	100 %	0 %	0 %	0 %	330831856
136	NC_015433	TCTA	2	8	6016	6023	25 %	50 %	0 %	25 %	330831856
137	NC_015433	TTA	2	6	6080	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831856
138	NC_015433	TAG	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831856
139	NC_015433	ATG	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831856
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271	NC_015433	GAAG	2	8	12308	12315	50 %	0 %	50 %	0 %	330831862
272	NC_015433	CCA	2	6	12338	12343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330831862
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275	NC_015433	AGG	2	6	12386	12391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831862
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278	NC_015433	AAT	2	6	12627	12632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831862
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299	NC_015433	TA	4	8	13234	13241	50 %	50 %	0 %	0 %	330831862
300	NC_015433	AAC	2	6	13257	13262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_015433	AATC	2	8	17865	17872	50 %	25 %	0 %	25 %	330831866
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422	NC_015433	AGA	2	6	19336	19341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015433	AGA	2	6	19348	19353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015433	CAG	2	6	19410	19415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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