MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_015433	AGTC	2	8	1831113	1831120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37002	NC_015433	AT	4	8	1831136	1831143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37003	NC_015433	C	7	7	1831219	1831225	0 %	0 %	0 %	100 %	330833607
37004	NC_015433	T	6	6	1831295	1831300	0 %	100 %	0 %	0 %	330833607
37005	NC_015433	AAC	2	6	1831318	1831323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833607
37006	NC_015433	ATT	2	6	1831327	1831332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833607
37007	NC_015433	TCG	2	6	1831455	1831460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833607
37008	NC_015433	CAT	2	6	1831518	1831523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833607
37009	NC_015433	TCT	2	6	1831550	1831555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833607
37010	NC_015433	TCT	2	6	1831719	1831724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37011	NC_015433	CGACA	2	10	1831726	1831735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37012	NC_015433	CCG	2	6	1831766	1831771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37013	NC_015433	TCT	2	6	1831929	1831934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833608
37014	NC_015433	GGCTTG	2	12	1832058	1832069	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	330833608
37015	NC_015433	CT	3	6	1832114	1832119	0 %	50 %	0 %	50 %	330833608
37016	NC_015433	AGCC	2	8	1832229	1832236	25 %	0 %	25 %	50 %	330833608
37017	NC_015433	TGCAAG	2	12	1832446	1832457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330833608
37018	NC_015433	GCA	2	6	1832465	1832470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833608
37019	NC_015433	CTG	2	6	1832490	1832495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833608
37020	NC_015433	TCC	2	6	1832558	1832563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833608
37021	NC_015433	TTTGA	2	10	1832578	1832587	20 %	60 %	20 %	0 %	330833608
37022	NC_015433	GGTC	2	8	1832679	1832686	0 %	25 %	50 %	25 %	330833608
37023	NC_015433	GCT	2	6	1832694	1832699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833608
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37025	NC_015433	GCT	2	6	1832738	1832743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833608
37026	NC_015433	TAGT	2	8	1832837	1832844	25 %	50 %	25 %	0 %	330833608
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37028	NC_015433	GCTT	2	8	1833045	1833052	0 %	50 %	25 %	25 %	330833608
37029	NC_015433	CAC	2	6	1833069	1833074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833608
37030	NC_015433	CGA	2	6	1833147	1833152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833608
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37032	NC_015433	GAT	2	6	1833235	1833240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833609
37033	NC_015433	TTC	2	6	1833250	1833255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833609
37034	NC_015433	TGGT	2	8	1833346	1833353	0 %	50 %	50 %	0 %	330833609
37035	NC_015433	CCA	2	6	1833383	1833388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833609
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37037	NC_015433	CAT	2	6	1833476	1833481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833609
37038	NC_015433	GGAA	2	8	1833506	1833513	50 %	0 %	50 %	0 %	330833609
37039	NC_015433	CT	3	6	1833753	1833758	0 %	50 %	0 %	50 %	330833610
37040	NC_015433	AAGA	2	8	1833767	1833774	75 %	0 %	25 %	0 %	330833610
37041	NC_015433	GACC	2	8	1833828	1833835	25 %	0 %	25 %	50 %	330833610
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37044	NC_015433	ATC	2	6	1833902	1833907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833610
37045	NC_015433	ATG	2	6	1833911	1833916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833610
37046	NC_015433	TCA	2	6	1833990	1833995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833610
37047	NC_015433	TCA	2	6	1834029	1834034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833610
37048	NC_015433	TAG	2	6	1834104	1834109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833610
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37051	NC_015433	GCTTT	2	10	1834460	1834469	0 %	60 %	20 %	20 %	330833611
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37053	NC_015433	GAA	2	6	1834514	1834519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833611
37054	NC_015433	CAAT	2	8	1834532	1834539	50 %	25 %	0 %	25 %	330833611
37055	NC_015433	TCG	2	6	1834580	1834585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833611
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37057	NC_015433	CAT	2	6	1834679	1834684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833612
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37059	NC_015433	ATA	2	6	1834954	1834959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833612
37060	NC_015433	ATA	2	6	1835063	1835068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37061	NC_015433	ATC	2	6	1835095	1835100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37062	NC_015433	AAC	2	6	1835149	1835154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37063	NC_015433	AAT	2	6	1835158	1835163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37064	NC_015433	T	7	7	1835252	1835258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37065	NC_015433	A	6	6	1835274	1835279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37066	NC_015433	TCA	2	6	1835298	1835303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37067	NC_015433	TA	3	6	1835368	1835373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37068	NC_015433	ACAAG	2	10	1835388	1835397	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37069	NC_015433	AATA	2	8	1835407	1835414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37070	NC_015433	CTT	2	6	1835437	1835442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37071	NC_015433	T	6	6	1835469	1835474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37072	NC_015433	CTATT	2	10	1835495	1835504	20 %	60 %	0 %	20 %	330833613
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37090	NC_015433	ATC	2	6	1836407	1836412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833613
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37101	NC_015433	AACCA	2	10	1836995	1837004	60 %	0 %	0 %	40 %	330833613
37102	NC_015433	CCT	2	6	1837165	1837170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833613
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37104	NC_015433	CTC	2	6	1837268	1837273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833613
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37117	NC_015433	TCC	2	6	1837986	1837991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833613
37118	NC_015433	ACA	2	6	1838055	1838060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833613
37119	NC_015433	AGA	2	6	1838120	1838125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833613
37120	NC_015433	GCG	2	6	1838159	1838164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833613
37121	NC_015433	TCC	2	6	1838235	1838240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833613
37122	NC_015433	TTAATG	2	12	1838268	1838279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330833613
37123	NC_015433	CAGA	2	8	1838296	1838303	50 %	0 %	25 %	25 %	330833613
37124	NC_015433	GAA	2	6	1838363	1838368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833613
37125	NC_015433	ATG	2	6	1838373	1838378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833613
37126	NC_015433	TCC	2	6	1838610	1838615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833613
37127	NC_015433	ATG	2	6	1838622	1838627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833613
37128	NC_015433	TAA	2	6	1838629	1838634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833613
37129	NC_015433	CAT	2	6	1838641	1838646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833613
37130	NC_015433	GCT	2	6	1838689	1838694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833613
37131	NC_015433	TTGTT	2	10	1838775	1838784	0 %	80 %	20 %	0 %	330833613
37132	NC_015433	CTCCAA	2	12	1838801	1838812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330833613
37133	NC_015433	ATA	2	6	1838891	1838896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833613
37134	NC_015433	TCT	2	6	1838920	1838925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833613
37135	NC_015433	TGG	2	6	1838937	1838942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833613
37136	NC_015433	CCA	2	6	1838959	1838964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833613
37137	NC_015433	TC	3	6	1839075	1839080	0 %	50 %	0 %	50 %	330833613
37138	NC_015433	TA	3	6	1839110	1839115	50 %	50 %	0 %	0 %	330833613
37139	NC_015433	CAT	2	6	1839218	1839223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833613
37140	NC_015433	AGG	2	6	1839227	1839232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833613
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37142	NC_015433	TCT	2	6	1839303	1839308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833613
37143	NC_015433	GATA	2	8	1839316	1839323	50 %	25 %	25 %	0 %	330833613
37144	NC_015433	TCA	2	6	1839396	1839401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833613
37145	NC_015433	A	6	6	1839450	1839455	100 %	0 %	0 %	0 %	330833613
37146	NC_015433	AAGC	2	8	1839466	1839473	50 %	0 %	25 %	25 %	330833613
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37148	NC_015433	C	6	6	1839702	1839707	0 %	0 %	0 %	100 %	330833613
37149	NC_015433	TTCC	2	8	1839733	1839740	0 %	50 %	0 %	50 %	330833613
37150	NC_015433	CAT	2	6	1839745	1839750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833613
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37155	NC_015433	GCTCGA	2	12	1839929	1839940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330833614
37156	NC_015433	TCG	2	6	1839946	1839951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833614
37157	NC_015433	ATG	2	6	1839952	1839957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833614
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37160	NC_015433	GTT	2	6	1840083	1840088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833614
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37164	NC_015433	ATT	2	6	1840268	1840273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833614
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37167	NC_015433	TGA	2	6	1840411	1840416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833614
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37175	NC_015433	GAT	2	6	1840984	1840989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833614
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37181	NC_015433	TTA	2	6	1841266	1841271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833615
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37183	NC_015433	T	7	7	1841289	1841295	0 %	100 %	0 %	0 %	330833615
37184	NC_015433	TCC	2	6	1841385	1841390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833615
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37187	NC_015433	GCAA	2	8	1841502	1841509	50 %	0 %	25 %	25 %	330833616
37188	NC_015433	A	6	6	1841534	1841539	100 %	0 %	0 %	0 %	330833616
37189	NC_015433	AG	3	6	1841546	1841551	50 %	0 %	50 %	0 %	330833616
37190	NC_015433	CTG	2	6	1841557	1841562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833616
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37195	NC_015433	TTTTC	2	10	1841788	1841797	0 %	80 %	0 %	20 %	330833616
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37198	NC_015433	CAA	2	6	1841953	1841958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37199	NC_015433	GCAG	2	8	1842093	1842100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37200	NC_015433	TAAA	2	8	1842141	1842148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37201	NC_015433	GAA	2	6	1842161	1842166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37202	NC_015433	T	6	6	1842195	1842200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37203	NC_015433	ATC	2	6	1842246	1842251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37204	NC_015433	CCA	2	6	1842454	1842459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37205	NC_015433	AGA	2	6	1842677	1842682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37206	NC_015433	TC	3	6	1842688	1842693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37207	NC_015433	AGC	2	6	1842704	1842709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37208	NC_015433	CAT	2	6	1842715	1842720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37209	NC_015433	CCT	2	6	1842757	1842762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37210	NC_015433	GTTCT	2	10	1842767	1842776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37211	NC_015433	AGCG	2	8	1842827	1842834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37212	NC_015433	TTG	2	6	1842872	1842877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37213	NC_015433	TCC	2	6	1842918	1842923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37214	NC_015433	AT	3	6	1842978	1842983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37215	NC_015433	GAA	2	6	1843139	1843144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37216	NC_015433	ATA	2	6	1843190	1843195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37217	NC_015433	TAA	2	6	1843202	1843207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37218	NC_015433	GCA	2	6	1843251	1843256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37219	NC_015433	AAG	2	6	1843296	1843301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37220	NC_015433	CTG	2	6	1843318	1843323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37221	NC_015433	ATT	2	6	1843337	1843342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37222	NC_015433	TCC	2	6	1843428	1843433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37223	NC_015433	CGT	2	6	1843448	1843453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37224	NC_015433	GAAGTT	2	12	1843458	1843469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37225	NC_015433	TAC	2	6	1843478	1843483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37226	NC_015433	GTT	2	6	1843485	1843490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37227	NC_015433	GTC	2	6	1843500	1843505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37228	NC_015433	TAT	2	6	1843540	1843545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37229	NC_015433	CAA	2	6	1843558	1843563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37230	NC_015433	GTT	2	6	1843653	1843658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37231	NC_015433	CAG	3	9	1843678	1843686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37232	NC_015433	TGC	2	6	1843781	1843786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37233	NC_015433	AGT	2	6	1843835	1843840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37234	NC_015433	CTG	2	6	1843846	1843851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37235	NC_015433	AACCA	2	10	1844108	1844117	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37236	NC_015433	CGTCT	2	10	1844138	1844147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37237	NC_015433	GCC	2	6	1844154	1844159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37238	NC_015433	AAC	2	6	1844205	1844210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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