MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_015433	CAT	2	6	1681581	1681586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833463
34002	NC_015433	TTC	2	6	1681675	1681680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833463
34003	NC_015433	TCA	2	6	1681683	1681688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833463
34004	NC_015433	AAC	2	6	1681696	1681701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833463
34005	NC_015433	TGA	2	6	1681887	1681892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833463
34006	NC_015433	TCT	2	6	1681928	1681933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833463
34007	NC_015433	AGC	2	6	1681948	1681953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34008	NC_015433	CGT	2	6	1681989	1681994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34009	NC_015433	CTG	2	6	1682055	1682060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34010	NC_015433	GCT	2	6	1682093	1682098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34011	NC_015433	GCAC	2	8	1682210	1682217	25 %	0 %	25 %	50 %	330833463
34012	NC_015433	GCA	2	6	1682240	1682245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34013	NC_015433	CTT	2	6	1682286	1682291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833463
34014	NC_015433	GCT	2	6	1682300	1682305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34015	NC_015433	CAG	2	6	1682313	1682318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833463
34016	NC_015433	CAT	2	6	1682470	1682475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833463
34017	NC_015433	T	6	6	1682518	1682523	0 %	100 %	0 %	0 %	330833463
34018	NC_015433	GAT	2	6	1682530	1682535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833463
34019	NC_015433	CTT	2	6	1682541	1682546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833463
34020	NC_015433	ATT	2	6	1682588	1682593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833463
34021	NC_015433	TCG	2	6	1682635	1682640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34022	NC_015433	T	6	6	1682669	1682674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34023	NC_015433	CTTT	2	8	1682701	1682708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34024	NC_015433	AACCA	2	10	1682729	1682738	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34025	NC_015433	GAT	2	6	1683043	1683048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34026	NC_015433	AGT	2	6	1683060	1683065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34027	NC_015433	TGA	2	6	1683084	1683089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34028	NC_015433	ACC	2	6	1683112	1683117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833464
34029	NC_015433	TTC	2	6	1683158	1683163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833464
34030	NC_015433	GAT	2	6	1683172	1683177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34031	NC_015433	CTT	2	6	1683246	1683251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833464
34032	NC_015433	CAG	2	6	1683252	1683257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833464
34033	NC_015433	ATG	2	6	1683293	1683298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34034	NC_015433	CTT	3	9	1683369	1683377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833464
34035	NC_015433	T	6	6	1683376	1683381	0 %	100 %	0 %	0 %	330833464
34036	NC_015433	AAG	2	6	1683404	1683409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833464
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34038	NC_015433	GAT	2	6	1683434	1683439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34039	NC_015433	ACC	2	6	1683479	1683484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833464
34040	NC_015433	CCA	3	9	1683593	1683601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833464
34041	NC_015433	TGA	2	6	1683654	1683659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833464
34042	NC_015433	AGTCA	2	10	1683670	1683679	40 %	20 %	20 %	20 %	330833464
34043	NC_015433	CCG	2	6	1683809	1683814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833464
34044	NC_015433	TTC	2	6	1683865	1683870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833464
34045	NC_015433	T	6	6	1683924	1683929	0 %	100 %	0 %	0 %	330833464
34046	NC_015433	TAC	2	6	1683982	1683987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34047	NC_015433	GTAG	2	8	1684044	1684051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34048	NC_015433	CTT	2	6	1684091	1684096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34049	NC_015433	TTC	2	6	1684325	1684330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833465
34050	NC_015433	CTT	3	9	1684405	1684413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833465
34051	NC_015433	CTT	2	6	1684516	1684521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833465
34052	NC_015433	T	6	6	1684525	1684530	0 %	100 %	0 %	0 %	330833465
34053	NC_015433	CGT	2	6	1684546	1684551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833465
34054	NC_015433	TGC	3	9	1684586	1684594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833465
34055	NC_015433	TAG	2	6	1684618	1684623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833465
34056	NC_015433	GTT	2	6	1684655	1684660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833465
34057	NC_015433	GAA	2	6	1684667	1684672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833465
34058	NC_015433	TAG	2	6	1684732	1684737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833465
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34060	NC_015433	CACC	2	8	1684801	1684808	25 %	0 %	0 %	75 %	330833465
34061	NC_015433	ACC	3	9	1684820	1684828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833465
34062	NC_015433	ACC	2	6	1684883	1684888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833465
34063	NC_015433	CAT	2	6	1684931	1684936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833465
34064	NC_015433	CGTGAC	2	12	1684966	1684977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330833465
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34066	NC_015433	GAT	2	6	1684994	1684999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833465
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34068	NC_015433	TTG	2	6	1685126	1685131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833465
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34072	NC_015433	T	6	6	1685298	1685303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34073	NC_015433	T	6	6	1685342	1685347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34074	NC_015433	TCTT	2	8	1685377	1685384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34075	NC_015433	ATTT	2	8	1685422	1685429	25 %	75 %	0 %	0 %	330833466
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34083	NC_015433	TTTCC	2	10	1685702	1685711	0 %	60 %	0 %	40 %	330833466
34084	NC_015433	TC	4	8	1685779	1685786	0 %	50 %	0 %	50 %	330833466
34085	NC_015433	AGA	2	6	1685888	1685893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833466
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34089	NC_015433	AATC	2	8	1686032	1686039	50 %	25 %	0 %	25 %	330833466
34090	NC_015433	TAT	3	9	1686095	1686103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34096	NC_015433	CTAC	2	8	1686300	1686307	25 %	25 %	0 %	50 %	330833467
34097	NC_015433	TGA	2	6	1686337	1686342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833467
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34099	NC_015433	CAT	2	6	1686379	1686384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833467
34100	NC_015433	ACC	2	6	1686407	1686412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833467
34101	NC_015433	CTG	2	6	1686445	1686450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833467
34102	NC_015433	CAT	2	6	1686508	1686513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833467
34103	NC_015433	CTG	2	6	1686517	1686522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833467
34104	NC_015433	CAC	2	6	1686535	1686540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833467
34105	NC_015433	GTA	2	6	1686564	1686569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833467
34106	NC_015433	CCT	2	6	1686600	1686605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833467
34107	NC_015433	CAC	2	6	1686622	1686627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833467
34108	NC_015433	ATTG	2	8	1686629	1686636	25 %	50 %	25 %	0 %	330833467
34109	NC_015433	CAT	2	6	1686661	1686666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833467
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34111	NC_015433	TCG	2	6	1686847	1686852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833467
34112	NC_015433	TAA	2	6	1686889	1686894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833467
34113	NC_015433	ATTG	2	8	1686896	1686903	25 %	50 %	25 %	0 %	330833467
34114	NC_015433	CTG	2	6	1686904	1686909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833467
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34352	NC_015433	GTA	2	6	1698498	1698503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833481
34353	NC_015433	TA	3	6	1698574	1698579	50 %	50 %	0 %	0 %	330833481
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