MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_015433	ATC	4	12	1631822	1631833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833420
33003	NC_015433	CCAC	2	8	1631862	1631869	25 %	0 %	0 %	75 %	330833420
33004	NC_015433	CA	3	6	1631956	1631961	50 %	0 %	0 %	50 %	330833420
33005	NC_015433	T	7	7	1632154	1632160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_015433	ATC	2	6	1632200	1632205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33007	NC_015433	TCA	2	6	1632286	1632291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33008	NC_015433	AGT	2	6	1632293	1632298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33009	NC_015433	ACTG	2	8	1632312	1632319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33010	NC_015433	A	6	6	1632327	1632332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33011	NC_015433	T	6	6	1632394	1632399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33012	NC_015433	T	6	6	1632450	1632455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33013	NC_015433	T	6	6	1632605	1632610	0 %	100 %	0 %	0 %	330833421
33014	NC_015433	GCT	2	6	1632681	1632686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833421
33015	NC_015433	TAG	2	6	1632773	1632778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833421
33016	NC_015433	CGGT	2	8	1632798	1632805	0 %	25 %	50 %	25 %	330833421
33017	NC_015433	TAGT	2	8	1632838	1632845	25 %	50 %	25 %	0 %	330833421
33018	NC_015433	CT	3	6	1632879	1632884	0 %	50 %	0 %	50 %	330833421
33019	NC_015433	TA	3	6	1632910	1632915	50 %	50 %	0 %	0 %	330833421
33020	NC_015433	ATC	2	6	1632959	1632964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833421
33021	NC_015433	A	6	6	1633053	1633058	100 %	0 %	0 %	0 %	330833421
33022	NC_015433	CCAT	2	8	1633104	1633111	25 %	25 %	0 %	50 %	330833421
33023	NC_015433	AAT	2	6	1633118	1633123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833421
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33025	NC_015433	GAAA	2	8	1633170	1633177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33026	NC_015433	A	7	7	1633175	1633181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33027	NC_015433	A	7	7	1633288	1633294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33028	NC_015433	TTA	2	6	1633319	1633324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833422
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33030	NC_015433	ATC	2	6	1633525	1633530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833422
33031	NC_015433	GAA	2	6	1633581	1633586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833422
33032	NC_015433	CAT	2	6	1633599	1633604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833422
33033	NC_015433	TGA	2	6	1633626	1633631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833422
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33037	NC_015433	ATTG	2	8	1633686	1633693	25 %	50 %	25 %	0 %	330833422
33038	NC_015433	A	6	6	1633741	1633746	100 %	0 %	0 %	0 %	330833422
33039	NC_015433	TAT	2	6	1633752	1633757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833422
33040	NC_015433	TTC	2	6	1633855	1633860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833422
33041	NC_015433	CAT	2	6	1633923	1633928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833422
33042	NC_015433	TGC	2	6	1633929	1633934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833422
33043	NC_015433	TGC	2	6	1633986	1633991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833422
33044	NC_015433	TCAA	2	8	1634020	1634027	50 %	25 %	0 %	25 %	330833422
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33046	NC_015433	TCCT	2	8	1634096	1634103	0 %	50 %	0 %	50 %	330833422
33047	NC_015433	TGT	2	6	1634202	1634207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833422
33048	NC_015433	TGC	2	6	1634214	1634219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833422
33049	NC_015433	TGA	2	6	1634258	1634263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833422
33050	NC_015433	AGA	3	9	1634394	1634402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833422
33051	NC_015433	TAT	2	6	1634466	1634471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833422
33052	NC_015433	TTG	2	6	1634477	1634482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833422
33053	NC_015433	GCTACC	2	12	1634515	1634526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330833422
33054	NC_015433	CT	3	6	1634533	1634538	0 %	50 %	0 %	50 %	330833422
33055	NC_015433	GAA	2	6	1634611	1634616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833422
33056	NC_015433	GCAC	2	8	1634631	1634638	25 %	0 %	25 %	50 %	330833422
33057	NC_015433	T	7	7	1634649	1634655	0 %	100 %	0 %	0 %	330833422
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33059	NC_015433	GGTC	2	8	1634677	1634684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33060	NC_015433	GTT	2	6	1634723	1634728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833423
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33062	NC_015433	T	7	7	1634858	1634864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33063	NC_015433	T	6	6	1634866	1634871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33064	NC_015433	TCA	2	6	1634929	1634934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33065	NC_015433	T	6	6	1635146	1635151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33066	NC_015433	TTGC	2	8	1635203	1635210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33068	NC_015433	TAT	2	6	1635343	1635348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33069	NC_015433	CT	3	6	1635369	1635374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33070	NC_015433	ACC	2	6	1635463	1635468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833424
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33073	NC_015433	TTG	2	6	1635911	1635916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833424
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33084	NC_015433	GTCCA	2	10	1636973	1636982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33085	NC_015433	GGCATG	2	12	1637034	1637045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330833426
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33088	NC_015433	ACGCTC	2	12	1637149	1637160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330833426
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33091	NC_015433	GATTG	2	10	1637266	1637275	20 %	40 %	40 %	0 %	330833426
33092	NC_015433	GACT	2	8	1637295	1637302	25 %	25 %	25 %	25 %	330833426
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33095	NC_015433	ATC	2	6	1637509	1637514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833426
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33099	NC_015433	GAT	2	6	1637680	1637685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833426
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33101	NC_015433	TGA	2	6	1637802	1637807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833426
33102	NC_015433	CTT	2	6	1637814	1637819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833426
33103	NC_015433	TCA	2	6	1637874	1637879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833426
33104	NC_015433	GA	3	6	1637890	1637895	50 %	0 %	50 %	0 %	330833426
33105	NC_015433	TAGA	2	8	1637896	1637903	50 %	25 %	25 %	0 %	330833426
33106	NC_015433	GAC	2	6	1637928	1637933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833426
33107	NC_015433	ACG	2	6	1637962	1637967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833426
33108	NC_015433	AC	3	6	1637993	1637998	50 %	0 %	0 %	50 %	330833426
33109	NC_015433	CCA	2	6	1638002	1638007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833426
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33114	NC_015433	CG	3	6	1638314	1638319	0 %	0 %	50 %	50 %	330833426
33115	NC_015433	GGTT	2	8	1638327	1638334	0 %	50 %	50 %	0 %	330833426
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33118	NC_015433	T	6	6	1638415	1638420	0 %	100 %	0 %	0 %	330833426
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33477	NC_015433	TGG	2	6	1655988	1655993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833438
33478	NC_015433	TCAC	2	8	1656024	1656031	25 %	25 %	0 %	50 %	330833438
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