MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31355	NC_015433	AGC	2	6	1550373	1550378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833339
31356	NC_015433	CTT	2	6	1550444	1550449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833339
31357	NC_015433	TCA	2	6	1550513	1550518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833339
31358	NC_015433	TTC	2	6	1550535	1550540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833339
31359	NC_015433	TC	3	6	1550591	1550596	0 %	50 %	0 %	50 %	330833339
31360	NC_015433	G	6	6	1550600	1550605	0 %	0 %	100 %	0 %	330833339
31361	NC_015433	TTC	2	6	1550610	1550615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833339
31362	NC_015433	CAA	2	6	1550660	1550665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833339
31363	NC_015433	TTC	2	6	1550706	1550711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833339
31364	NC_015433	T	7	7	1550755	1550761	0 %	100 %	0 %	0 %	330833339
31365	NC_015433	CA	3	6	1550795	1550800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31366	NC_015433	TCC	2	6	1550888	1550893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833340
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31368	NC_015433	TTCAT	2	10	1550931	1550940	20 %	60 %	0 %	20 %	330833340
31369	NC_015433	TCC	2	6	1550987	1550992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833340
31370	NC_015433	CTT	2	6	1551004	1551009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833340
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31372	NC_015433	CT	3	6	1551108	1551113	0 %	50 %	0 %	50 %	330833340
31373	NC_015433	A	6	6	1551121	1551126	100 %	0 %	0 %	0 %	330833340
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31378	NC_015433	TA	3	6	1551350	1551355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31379	NC_015433	TCTT	2	8	1551384	1551391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31387	NC_015433	TCA	2	6	1551920	1551925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833341
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31413	NC_015433	TCT	2	6	1553060	1553065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833342
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31420	NC_015433	TTA	2	6	1553408	1553413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31421	NC_015433	TCT	2	6	1553580	1553585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833343
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31424	NC_015433	T	6	6	1553880	1553885	0 %	100 %	0 %	0 %	330833343
31425	NC_015433	CTT	2	6	1553931	1553936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833343
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31435	NC_015433	ACA	2	6	1554575	1554580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833343
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31443	NC_015433	T	6	6	1555230	1555235	0 %	100 %	0 %	0 %	330833343
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31447	NC_015433	TGGC	2	8	1555367	1555374	0 %	25 %	50 %	25 %	330833343
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31450	NC_015433	T	6	6	1555722	1555727	0 %	100 %	0 %	0 %	330833343
31451	NC_015433	ATC	2	6	1555745	1555750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833343
31452	NC_015433	TCC	2	6	1555787	1555792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833343
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31456	NC_015433	CTC	2	6	1555882	1555887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833343
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31458	NC_015433	TCA	2	6	1556003	1556008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833343
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31460	NC_015433	A	6	6	1556081	1556086	100 %	0 %	0 %	0 %	330833343
31461	NC_015433	ATCT	2	8	1556149	1556156	25 %	50 %	0 %	25 %	330833343
31462	NC_015433	GACG	2	8	1556265	1556272	25 %	0 %	50 %	25 %	330833343
31463	NC_015433	TGT	2	6	1556282	1556287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833343
31464	NC_015433	TCT	2	6	1556294	1556299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833343
31465	NC_015433	CAT	2	6	1556331	1556336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833343
31466	NC_015433	T	6	6	1556336	1556341	0 %	100 %	0 %	0 %	330833343
31467	NC_015433	A	6	6	1556342	1556347	100 %	0 %	0 %	0 %	330833343
31468	NC_015433	GTAA	2	8	1556431	1556438	50 %	25 %	25 %	0 %	330833343
31469	NC_015433	GAA	2	6	1556484	1556489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833343
31470	NC_015433	CAGT	2	8	1556490	1556497	25 %	25 %	25 %	25 %	330833343
31471	NC_015433	CTT	2	6	1556523	1556528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833343
31472	NC_015433	CAT	2	6	1556545	1556550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833343
31473	NC_015433	ATC	2	6	1556584	1556589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31474	NC_015433	AT	3	6	1556604	1556609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31475	NC_015433	A	7	7	1556669	1556675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31476	NC_015433	CAG	2	6	1556679	1556684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31477	NC_015433	ATA	2	6	1556714	1556719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833344
31478	NC_015433	TTGC	2	8	1556725	1556732	0 %	50 %	25 %	25 %	330833344
31479	NC_015433	AAC	2	6	1556792	1556797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833344
31480	NC_015433	ACT	2	6	1556802	1556807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833344
31481	NC_015433	CCAA	2	8	1556826	1556833	50 %	0 %	0 %	50 %	330833344
31482	NC_015433	AGA	2	6	1556848	1556853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833344
31483	NC_015433	CA	3	6	1556858	1556863	50 %	0 %	0 %	50 %	330833344
31484	NC_015433	GCAAG	2	10	1556869	1556878	40 %	0 %	40 %	20 %	330833344
31485	NC_015433	CCCA	2	8	1556901	1556908	25 %	0 %	0 %	75 %	330833344
31486	NC_015433	AGGG	2	8	1556932	1556939	25 %	0 %	75 %	0 %	330833344
31487	NC_015433	A	6	6	1556996	1557001	100 %	0 %	0 %	0 %	330833344
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31490	NC_015433	ATC	3	9	1557052	1557060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833345
31491	NC_015433	A	6	6	1557110	1557115	100 %	0 %	0 %	0 %	330833345
31492	NC_015433	ACC	2	6	1557165	1557170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833345
31493	NC_015433	ACTG	2	8	1557263	1557270	25 %	25 %	25 %	25 %	330833345
31494	NC_015433	A	6	6	1557288	1557293	100 %	0 %	0 %	0 %	330833345
31495	NC_015433	TGA	2	6	1557294	1557299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833345
31496	NC_015433	AAAG	2	8	1557301	1557308	75 %	0 %	25 %	0 %	330833345
31497	NC_015433	A	6	6	1557316	1557321	100 %	0 %	0 %	0 %	330833345
31498	NC_015433	TACCA	2	10	1557342	1557351	40 %	20 %	0 %	40 %	330833345
31499	NC_015433	A	6	6	1557396	1557401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31500	NC_015433	TTCCGT	2	12	1557419	1557430	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330833346

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