MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_015433	ATA	2	6	1360519	1360524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833136
27503	NC_015433	GAA	2	6	1360619	1360624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833136
27504	NC_015433	TCC	2	6	1360635	1360640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833136
27505	NC_015433	ATA	2	6	1360681	1360686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833136
27506	NC_015433	T	6	6	1360703	1360708	0 %	100 %	0 %	0 %	330833137
27507	NC_015433	CT	3	6	1360813	1360818	0 %	50 %	0 %	50 %	330833137
27508	NC_015433	CTT	2	6	1360825	1360830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833137
27509	NC_015433	CAT	2	6	1360854	1360859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833137
27510	NC_015433	TCA	2	6	1360862	1360867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833137
27511	NC_015433	ATTC	2	8	1360872	1360879	25 %	50 %	0 %	25 %	330833137
27512	NC_015433	TG	3	6	1360913	1360918	0 %	50 %	50 %	0 %	330833137
27513	NC_015433	GTA	2	6	1360927	1360932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833137
27514	NC_015433	AAT	2	6	1360962	1360967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833137
27515	NC_015433	AAT	2	6	1360975	1360980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833137
27516	NC_015433	GCT	2	6	1361072	1361077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833137
27517	NC_015433	TCA	2	6	1361078	1361083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833137
27518	NC_015433	T	7	7	1361107	1361113	0 %	100 %	0 %	0 %	330833137
27519	NC_015433	ATG	2	6	1361114	1361119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833137
27520	NC_015433	T	6	6	1361128	1361133	0 %	100 %	0 %	0 %	330833137
27521	NC_015433	CTC	2	6	1361146	1361151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833137
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27524	NC_015433	TCA	2	6	1361261	1361266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833137
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27528	NC_015433	T	6	6	1361394	1361399	0 %	100 %	0 %	0 %	330833137
27529	NC_015433	GAA	2	6	1361405	1361410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833137
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27532	NC_015433	AT	3	6	1361466	1361471	50 %	50 %	0 %	0 %	330833137
27533	NC_015433	TTA	2	6	1361480	1361485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833137
27534	NC_015433	TAAAA	2	10	1361550	1361559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27535	NC_015433	AT	3	6	1361583	1361588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27536	NC_015433	ATT	2	6	1361650	1361655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27537	NC_015433	A	6	6	1361674	1361679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27538	NC_015433	TAA	2	6	1361682	1361687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27539	NC_015433	AAT	2	6	1361732	1361737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27540	NC_015433	CTT	2	6	1361757	1361762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27541	NC_015433	T	8	8	1361853	1361860	0 %	100 %	0 %	0 %	330833138
27542	NC_015433	TCGG	2	8	1362004	1362011	0 %	25 %	50 %	25 %	330833138
27543	NC_015433	GAG	2	6	1362102	1362107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833138
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27545	NC_015433	ATC	2	6	1362222	1362227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833138
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27548	NC_015433	TGA	2	6	1362368	1362373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833138
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27550	NC_015433	T	6	6	1362510	1362515	0 %	100 %	0 %	0 %	330833138
27551	NC_015433	AGCCT	2	10	1362529	1362538	20 %	20 %	20 %	40 %	330833138
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27553	NC_015433	CTG	2	6	1362615	1362620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833138
27554	NC_015433	CTA	2	6	1362626	1362631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833138
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27557	NC_015433	CGG	2	6	1362760	1362765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833138
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27562	NC_015433	ATTG	2	8	1363067	1363074	25 %	50 %	25 %	0 %	330833138
27563	NC_015433	CGC	2	6	1363092	1363097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833138
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27592	NC_015433	CAT	2	6	1364715	1364720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833140
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27609	NC_015433	TTCA	2	8	1365467	1365474	25 %	50 %	0 %	25 %	330833140
27610	NC_015433	TCTTCA	2	12	1365486	1365497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330833141
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27613	NC_015433	AGA	2	6	1365576	1365581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833141
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27615	NC_015433	CAAT	2	8	1365748	1365755	50 %	25 %	0 %	25 %	330833141
27616	NC_015433	AAGA	2	8	1365783	1365790	75 %	0 %	25 %	0 %	330833141
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