MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_015433	GCG	2	6	1234302	1234307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833012
25003	NC_015433	TGT	2	6	1234314	1234319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833012
25004	NC_015433	TGCTC	2	10	1234364	1234373	0 %	40 %	20 %	40 %	330833012
25005	NC_015433	AGA	2	6	1234398	1234403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833012
25006	NC_015433	GTT	2	6	1234494	1234499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833012
25007	NC_015433	AGGTC	2	10	1234661	1234670	20 %	20 %	40 %	20 %	330833012
25008	NC_015433	CAGG	2	8	1234679	1234686	25 %	0 %	50 %	25 %	330833012
25009	NC_015433	TTG	2	6	1234693	1234698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833012
25010	NC_015433	CCAG	2	8	1234799	1234806	25 %	0 %	25 %	50 %	330833012
25011	NC_015433	A	6	6	1234827	1234832	100 %	0 %	0 %	0 %	330833012
25012	NC_015433	CGAACA	2	12	1234975	1234986	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330833012
25013	NC_015433	CAT	2	6	1235015	1235020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833012
25014	NC_015433	TAGC	2	8	1235080	1235087	25 %	25 %	25 %	25 %	330833012
25015	NC_015433	TCA	2	6	1235113	1235118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833012
25016	NC_015433	TCTT	2	8	1235137	1235144	0 %	75 %	0 %	25 %	330833012
25017	NC_015433	TGA	2	6	1235219	1235224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833012
25018	NC_015433	CTA	2	6	1235237	1235242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833012
25019	NC_015433	TTC	2	6	1235245	1235250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833012
25020	NC_015433	TCT	2	6	1235251	1235256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833012
25021	NC_015433	GTG	2	6	1235299	1235304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833012
25022	NC_015433	GTT	2	6	1235389	1235394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833012
25023	NC_015433	ACTG	2	8	1235402	1235409	25 %	25 %	25 %	25 %	330833012
25024	NC_015433	TGC	2	6	1235527	1235532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833012
25025	NC_015433	A	6	6	1235547	1235552	100 %	0 %	0 %	0 %	330833012
25026	NC_015433	TTTCC	2	10	1235564	1235573	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25027	NC_015433	AAGA	2	8	1235643	1235650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25028	NC_015433	ACT	2	6	1235654	1235659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833013
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25030	NC_015433	CTGT	2	8	1235749	1235756	0 %	50 %	25 %	25 %	330833013
25031	NC_015433	TGA	2	6	1235762	1235767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833013
25032	NC_015433	AGA	2	6	1235786	1235791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833013
25033	NC_015433	CTC	2	6	1235850	1235855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833013
25034	NC_015433	TGT	2	6	1235866	1235871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833013
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25038	NC_015433	TAG	2	6	1235941	1235946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833013
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25040	NC_015433	TGT	2	6	1235953	1235958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833013
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25052	NC_015433	GCA	2	6	1236415	1236420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833014
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25055	NC_015433	GAA	2	6	1236569	1236574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833014
25056	NC_015433	TCT	2	6	1236607	1236612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833014
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25067	NC_015433	TTCT	2	8	1236934	1236941	0 %	75 %	0 %	25 %	330833015
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25102	NC_015433	CAAT	2	8	1238739	1238746	50 %	25 %	0 %	25 %	330833017
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25117	NC_015433	T	7	7	1239220	1239226	0 %	100 %	0 %	0 %	330833017
25118	NC_015433	TCAA	2	8	1239237	1239244	50 %	25 %	0 %	25 %	330833017
25119	NC_015433	TCA	2	6	1239296	1239301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833018
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25128	NC_015433	TTGTA	2	10	1239743	1239752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25129	NC_015433	A	6	6	1239786	1239791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25130	NC_015433	TTG	2	6	1239809	1239814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25131	NC_015433	A	6	6	1239826	1239831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25132	NC_015433	ACT	2	6	1239990	1239995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833019
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25198	NC_015433	TAC	2	6	1243431	1243436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25207	NC_015433	AT	3	6	1243659	1243664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25208	NC_015433	TA	3	6	1243679	1243684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25211	NC_015433	CGCGA	2	10	1243814	1243823	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25212	NC_015433	CT	3	6	1243830	1243835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25213	NC_015433	ATT	2	6	1243929	1243934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25232	NC_015433	CAG	2	6	1244793	1244798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833023
25233	NC_015433	GAGCT	2	10	1244845	1244854	20 %	20 %	40 %	20 %	330833023
25234	NC_015433	TCTT	2	8	1244858	1244865	0 %	75 %	0 %	25 %	330833023
25235	NC_015433	TCCT	2	8	1244887	1244894	0 %	50 %	0 %	50 %	330833023
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25237	NC_015433	ACG	2	6	1245019	1245024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833023
25238	NC_015433	CAT	2	6	1245097	1245102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833023
25239	NC_015433	ATA	2	6	1245106	1245111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833023
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25241	NC_015433	CTTT	2	8	1245125	1245132	0 %	75 %	0 %	25 %	330833023
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25243	NC_015433	ATC	2	6	1245298	1245303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833024
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25345	NC_015433	CT	4	8	1250492	1250499	0 %	50 %	0 %	50 %	330833034
25346	NC_015433	CTG	2	6	1250519	1250524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833034
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25350	NC_015433	CTC	2	6	1250687	1250692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25351	NC_015433	TAGAA	2	10	1250697	1250706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25352	NC_015433	ACC	2	6	1250810	1250815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833035
25353	NC_015433	GGCCAT	2	12	1250816	1250827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330833035
25354	NC_015433	ACC	3	9	1250837	1250845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833035
25355	NC_015433	TGA	2	6	1250875	1250880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833035
25356	NC_015433	CTTG	2	8	1250906	1250913	0 %	50 %	25 %	25 %	330833035
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25427	NC_015433	TA	4	8	1254257	1254264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25475	NC_015433	CTG	2	6	1255826	1255831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833038
25476	NC_015433	TTC	2	6	1255877	1255882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833038
25477	NC_015433	TCG	2	6	1255894	1255899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833038
25478	NC_015433	TGA	2	6	1256049	1256054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833038
25479	NC_015433	TTC	2	6	1256123	1256128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833038
25480	NC_015433	TTC	2	6	1256217	1256222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25481	NC_015433	AC	3	6	1256227	1256232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25482	NC_015433	AGGT	2	8	1256237	1256244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25483	NC_015433	TCA	2	6	1256396	1256401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833039
25484	NC_015433	CTG	2	6	1256500	1256505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833039
25485	NC_015433	A	6	6	1256515	1256520	100 %	0 %	0 %	0 %	330833039
25486	NC_015433	CA	3	6	1256557	1256562	50 %	0 %	0 %	50 %	330833039
25487	NC_015433	ATC	2	6	1256644	1256649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833039
25488	NC_015433	ACT	2	6	1256714	1256719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833039
25489	NC_015433	GTT	2	6	1256790	1256795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833039
25490	NC_015433	CT	3	6	1256815	1256820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25491	NC_015433	TTA	2	6	1256821	1256826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833040
25492	NC_015433	GAC	2	6	1256917	1256922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833040
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25495	NC_015433	TCT	2	6	1257017	1257022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833040
25496	NC_015433	AT	4	8	1257111	1257118	50 %	50 %	0 %	0 %	330833040
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25499	NC_015433	TTC	2	6	1257302	1257307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833041
25500	NC_015433	CGT	2	6	1257334	1257339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833041

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