MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_015433	CAAG	2	8	858468	858475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17503	NC_015433	CAG	2	6	858581	858586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17504	NC_015433	T	6	6	858587	858592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_015433	CAGAGC	2	12	858605	858616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17506	NC_015433	TAA	2	6	858625	858630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_015433	TGT	2	6	858631	858636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_015433	TTC	2	6	858743	858748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17509	NC_015433	TG	3	6	858761	858766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_015433	T	6	6	858774	858779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_015433	TGA	2	6	858805	858810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_015433	TGA	2	6	858846	858851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_015433	GCT	2	6	858882	858887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17514	NC_015433	TGAGC	2	10	858965	858974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17515	NC_015433	TA	3	6	859071	859076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_015433	TCC	2	6	859123	859128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17517	NC_015433	T	7	7	859182	859188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_015433	T	7	7	859211	859217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_015433	AAGAA	2	10	859219	859228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_015433	T	7	7	859272	859278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_015433	TTTC	2	8	859403	859410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17522	NC_015433	TTC	2	6	859447	859452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_015433	AATC	2	8	859679	859686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17524	NC_015433	ATG	2	6	859701	859706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_015433	A	7	7	859717	859723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_015433	TAT	2	6	859736	859741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_015433	TTA	2	6	859760	859765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_015433	TA	3	6	859841	859846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_015433	TGCT	2	8	859875	859882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17530	NC_015433	CT	3	6	859912	859917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17531	NC_015433	A	6	6	859922	859927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_015433	CTAA	2	8	859928	859935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17533	NC_015433	ATG	2	6	859964	859969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17534	NC_015433	A	6	6	860057	860062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_015433	TGGTA	2	10	860080	860089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_015433	A	6	6	860100	860105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_015433	CTG	2	6	860322	860327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832660
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17545	NC_015433	ATC	2	6	860606	860611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832660
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17548	NC_015433	CGTG	2	8	860827	860834	0 %	25 %	50 %	25 %	330832660
17549	NC_015433	AAACC	2	10	860882	860891	60 %	0 %	0 %	40 %	330832660
17550	NC_015433	ACA	2	6	860981	860986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832660
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17554	NC_015433	CTG	2	6	861162	861167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832660
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17562	NC_015433	CTGA	2	8	861536	861543	25 %	25 %	25 %	25 %	330832660
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17567	NC_015433	T	6	6	861832	861837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17582	NC_015433	A	6	6	862845	862850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17592	NC_015433	ATTGG	2	10	863362	863371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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17594	NC_015433	GAA	2	6	863485	863490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17598	NC_015433	GAC	2	6	863770	863775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17599	NC_015433	GACTGG	2	12	863799	863810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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17601	NC_015433	GAAG	2	8	863892	863899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_015433	AAT	2	6	863968	863973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_015433	CT	3	6	864035	864040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17604	NC_015433	TCAC	2	8	864128	864135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17608	NC_015433	CCGT	2	8	864275	864282	0 %	25 %	25 %	50 %	330832662
17609	NC_015433	T	6	6	864292	864297	0 %	100 %	0 %	0 %	330832662
17610	NC_015433	ATA	2	6	864344	864349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832662
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17612	NC_015433	CAA	2	6	864363	864368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832662
17613	NC_015433	TAACA	2	10	864390	864399	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17614	NC_015433	GCA	2	6	864479	864484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832663
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17616	NC_015433	T	6	6	864635	864640	0 %	100 %	0 %	0 %	330832663
17617	NC_015433	CCA	2	6	864695	864700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832663
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17626	NC_015433	TA	3	6	865078	865083	50 %	50 %	0 %	0 %	330832663
17627	NC_015433	AGAA	2	8	865136	865143	75 %	0 %	25 %	0 %	330832663
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