MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015433	AT	3	6	695333	695338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_015433	GAT	2	6	695371	695376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_015433	GTCA	2	8	695399	695406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14004	NC_015433	TAA	2	6	695430	695435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_015433	TTATA	2	10	695476	695485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_015433	TGG	2	6	695496	695501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_015433	CAGGTG	2	12	695507	695518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14008	NC_015433	AAC	3	9	695520	695528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_015433	GAAGC	2	10	695539	695548	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14010	NC_015433	ATG	2	6	695579	695584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_015433	TCA	2	6	695620	695625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_015433	GTCA	2	8	695699	695706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14013	NC_015433	TAA	2	6	695730	695735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_015433	TAT	2	6	695779	695784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_015433	TGG	2	6	695796	695801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_015433	CAGGTG	2	12	695807	695818	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14017	NC_015433	AAC	3	9	695820	695828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_015433	GAAGC	2	10	695839	695848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14019	NC_015433	ATG	2	6	695879	695884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_015433	TCA	2	6	695920	695925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_015433	GTCA	2	8	695999	696006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14022	NC_015433	TAA	2	6	696030	696035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_015433	TTATA	2	10	696076	696085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_015433	TGG	2	6	696096	696101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_015433	CAGGTG	2	12	696106	696117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14026	NC_015433	AAC	3	9	696119	696127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_015433	CTT	2	6	696205	696210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_015433	A	7	7	696226	696232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_015433	TGA	2	6	696295	696300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_015433	ATG	2	6	696316	696321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_015433	AG	3	6	696335	696340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_015433	GCAA	2	8	696357	696364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14033	NC_015433	TTAT	2	8	696372	696379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_015433	TAA	2	6	696476	696481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_015433	ATA	2	6	696490	696495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_015433	CAA	2	6	696530	696535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_015433	TTAA	2	8	696549	696556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_015433	GTG	2	6	696577	696582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_015433	AAG	2	6	696584	696589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_015433	CAGGTA	2	12	696771	696782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14041	NC_015433	A	6	6	696810	696815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_015433	AAT	2	6	696944	696949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832511
14043	NC_015433	TGC	2	6	696970	696975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832511
14044	NC_015433	GAA	2	6	697027	697032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832511
14045	NC_015433	A	6	6	697123	697128	100 %	0 %	0 %	0 %	330832511
14046	NC_015433	AG	3	6	697142	697147	50 %	0 %	50 %	0 %	330832511
14047	NC_015433	CAA	2	6	697160	697165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832511
14048	NC_015433	T	6	6	697272	697277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_015433	TGAT	2	8	697281	697288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_015433	GTT	2	6	697353	697358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832512
14051	NC_015433	TTG	2	6	697429	697434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832512
14052	NC_015433	ATT	2	6	697438	697443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14053	NC_015433	TTG	2	6	697501	697506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832512
14054	NC_015433	TCGGAT	2	12	697532	697543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330832512
14055	NC_015433	TTG	2	6	697584	697589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832512
14056	NC_015433	ATT	2	6	697657	697662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14057	NC_015433	AAAG	2	8	697753	697760	75 %	0 %	25 %	0 %	330832512
14058	NC_015433	TTC	2	6	697870	697875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832512
14059	NC_015433	AAC	2	6	697909	697914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832512
14060	NC_015433	GCCA	2	8	697989	697996	25 %	0 %	25 %	50 %	330832512
14061	NC_015433	CGAT	2	8	697997	698004	25 %	25 %	25 %	25 %	330832512
14062	NC_015433	GTG	2	6	698010	698015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832512
14063	NC_015433	CTA	2	6	698021	698026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832512
14064	NC_015433	A	6	6	698045	698050	100 %	0 %	0 %	0 %	330832512
14065	NC_015433	TTA	2	6	698057	698062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14066	NC_015433	ATT	2	6	698098	698103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14067	NC_015433	ATTTTT	2	12	698137	698148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330832512
14068	NC_015433	TG	3	6	698177	698182	0 %	50 %	50 %	0 %	330832512
14069	NC_015433	CTG	2	6	698188	698193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832512
14070	NC_015433	AGA	2	6	698209	698214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832512
14071	NC_015433	TAA	2	6	698215	698220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832512
14072	NC_015433	ACC	2	6	698266	698271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832512
14073	NC_015433	ATTC	2	8	698388	698395	25 %	50 %	0 %	25 %	330832512
14074	NC_015433	ATA	2	6	698405	698410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832512
14075	NC_015433	TTGT	2	8	698421	698428	0 %	75 %	25 %	0 %	330832512
14076	NC_015433	AGG	2	6	698440	698445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832512
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14079	NC_015433	GAC	2	6	698602	698607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832512
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14081	NC_015433	TTA	2	6	698634	698639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14082	NC_015433	TA	3	6	698644	698649	50 %	50 %	0 %	0 %	330832512
14083	NC_015433	CTG	2	6	698663	698668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832512
14084	NC_015433	AAAGAA	2	12	698749	698760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	330832512
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14089	NC_015433	TCAA	2	8	698894	698901	50 %	25 %	0 %	25 %	330832512
14090	NC_015433	AATA	2	8	698920	698927	75 %	25 %	0 %	0 %	330832512
14091	NC_015433	AAT	2	6	699067	699072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832512
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14093	NC_015433	AGA	2	6	699095	699100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832512
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14095	NC_015433	A	6	6	699175	699180	100 %	0 %	0 %	0 %	330832512
14096	NC_015433	GTT	2	6	699207	699212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832512
14097	NC_015433	TTA	2	6	699224	699229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832512
14098	NC_015433	AGT	2	6	699283	699288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832512
14099	NC_015433	AT	4	8	699291	699298	50 %	50 %	0 %	0 %	330832512
14100	NC_015433	TAA	2	6	699307	699312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832512
14101	NC_015433	TCT	2	6	699334	699339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832512
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14103	NC_015433	AGAGA	2	10	699626	699635	60 %	0 %	40 %	0 %	330832512
14104	NC_015433	CAT	2	6	699654	699659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832512
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14106	NC_015433	ATTT	2	8	699709	699716	25 %	75 %	0 %	0 %	330832512
14107	NC_015433	TTGGT	2	10	699733	699742	0 %	60 %	40 %	0 %	330832512
14108	NC_015433	CAT	2	6	699768	699773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832512
14109	NC_015433	A	6	6	699818	699823	100 %	0 %	0 %	0 %	330832512
14110	NC_015433	CAAT	2	8	699828	699835	50 %	25 %	0 %	25 %	330832512
14111	NC_015433	TTA	2	6	699882	699887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_015433	TTA	2	6	699946	699951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_015433	AGAAAA	2	12	699994	700005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_015433	A	8	8	700037	700044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_015433	A	6	6	700047	700052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_015433	TAT	2	6	700107	700112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832513
14117	NC_015433	CTGC	2	8	700126	700133	0 %	25 %	25 %	50 %	330832513
14118	NC_015433	TGG	2	6	700140	700145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832513
14119	NC_015433	CAA	2	6	700162	700167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832513
14120	NC_015433	GTCA	2	8	700171	700178	25 %	25 %	25 %	25 %	330832513
14121	NC_015433	TCA	2	6	700230	700235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832513
14122	NC_015433	ACCT	2	8	700246	700253	25 %	25 %	0 %	50 %	330832513
14123	NC_015433	CCA	2	6	700279	700284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832513
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14125	NC_015433	CAG	2	6	700357	700362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832513
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14493	NC_015433	TCA	2	6	715263	715268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832526
14494	NC_015433	GAT	2	6	715270	715275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832526
14495	NC_015433	ATTT	2	8	715276	715283	25 %	75 %	0 %	0 %	330832526
14496	NC_015433	A	6	6	715298	715303	100 %	0 %	0 %	0 %	330832526
14497	NC_015433	AAGG	2	8	715360	715367	50 %	0 %	50 %	0 %	330832526
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