MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015433	CTT	2	6	671134	671139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832489
13502	NC_015433	TCT	2	6	671145	671150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832489
13503	NC_015433	CTG	2	6	671188	671193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832489
13504	NC_015433	AGAA	2	8	671207	671214	75 %	0 %	25 %	0 %	330832489
13505	NC_015433	A	6	6	671292	671297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_015433	ATT	2	6	671410	671415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832490
13507	NC_015433	GCT	2	6	671485	671490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832490
13508	NC_015433	TCA	2	6	671496	671501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832490
13509	NC_015433	TTGA	2	8	671503	671510	25 %	50 %	25 %	0 %	330832490
13510	NC_015433	TAT	2	6	671604	671609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832490
13511	NC_015433	GTGG	2	8	671611	671618	0 %	25 %	75 %	0 %	330832490
13512	NC_015433	TACA	2	8	671629	671636	50 %	25 %	0 %	25 %	330832490
13513	NC_015433	GCAG	2	8	671748	671755	25 %	0 %	50 %	25 %	330832490
13514	NC_015433	A	6	6	671809	671814	100 %	0 %	0 %	0 %	330832490
13515	NC_015433	GACA	2	8	671878	671885	50 %	0 %	25 %	25 %	330832490
13516	NC_015433	ATCA	2	8	671902	671909	50 %	25 %	0 %	25 %	330832490
13517	NC_015433	GAT	2	6	671922	671927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832490
13518	NC_015433	GGC	2	6	671928	671933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832490
13519	NC_015433	AGC	2	6	671985	671990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832490
13520	NC_015433	GCC	2	6	672077	672082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832490
13521	NC_015433	CCG	2	6	672176	672181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832490
13522	NC_015433	GGA	2	6	672183	672188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832490
13523	NC_015433	AGAA	2	8	672210	672217	75 %	0 %	25 %	0 %	330832491
13524	NC_015433	CCT	2	6	672229	672234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832491
13525	NC_015433	CAG	2	6	672251	672256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832491
13526	NC_015433	GGA	2	6	672280	672285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832491
13527	NC_015433	CAA	2	6	672439	672444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832491
13528	NC_015433	GAA	2	6	672476	672481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832491
13529	NC_015433	ATCG	2	8	672500	672507	25 %	25 %	25 %	25 %	330832491
13530	NC_015433	TTGG	2	8	672605	672612	0 %	50 %	50 %	0 %	330832491
13531	NC_015433	CAT	2	6	672619	672624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832491
13532	NC_015433	CAGG	2	8	672635	672642	25 %	0 %	50 %	25 %	330832491
13533	NC_015433	CCG	2	6	672688	672693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832491
13534	NC_015433	GAA	2	6	672745	672750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832491
13535	NC_015433	TAT	2	6	672835	672840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832491
13536	NC_015433	TGA	2	6	672874	672879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832491
13537	NC_015433	GGTT	2	8	672955	672962	0 %	50 %	50 %	0 %	330832491
13538	NC_015433	GGA	2	6	673012	673017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832491
13539	NC_015433	ATC	2	6	673046	673051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832491
13540	NC_015433	GAGCAG	2	12	673076	673087	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330832491
13541	NC_015433	CT	3	6	673140	673145	0 %	50 %	0 %	50 %	330832491
13542	NC_015433	ACA	2	6	673146	673151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832491
13543	NC_015433	CAGT	2	8	673183	673190	25 %	25 %	25 %	25 %	330832491
13544	NC_015433	GAT	2	6	673243	673248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832491
13545	NC_015433	TAA	2	6	673405	673410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832491
13546	NC_015433	GAA	2	6	673421	673426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832491
13547	NC_015433	CAA	2	6	673524	673529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832492
13548	NC_015433	AGA	2	6	673604	673609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832492
13549	NC_015433	ACT	2	6	673618	673623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832492
13550	NC_015433	CAG	2	6	673638	673643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832492
13551	NC_015433	AAGC	2	8	673679	673686	50 %	0 %	25 %	25 %	330832492
13552	NC_015433	CGG	2	6	673738	673743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832492
13553	NC_015433	T	6	6	673759	673764	0 %	100 %	0 %	0 %	330832492
13554	NC_015433	GTC	2	6	673830	673835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832492
13555	NC_015433	GGA	2	6	673841	673846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832492
13556	NC_015433	CGA	2	6	673930	673935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832492
13557	NC_015433	GAA	2	6	673971	673976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832492
13558	NC_015433	GGTCG	2	10	674023	674032	0 %	20 %	60 %	20 %	330832492
13559	NC_015433	TA	4	8	674044	674051	50 %	50 %	0 %	0 %	330832492
13560	NC_015433	ATCA	2	8	674158	674165	50 %	25 %	0 %	25 %	330832493
13561	NC_015433	TCAC	2	8	674252	674259	25 %	25 %	0 %	50 %	330832493
13562	NC_015433	T	6	6	674292	674297	0 %	100 %	0 %	0 %	330832493
13563	NC_015433	GATATT	2	12	674335	674346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330832493
13564	NC_015433	CATT	2	8	674418	674425	25 %	50 %	0 %	25 %	330832493
13565	NC_015433	ACCAT	2	10	674501	674510	40 %	20 %	0 %	40 %	330832493
13566	NC_015433	GT	3	6	674514	674519	0 %	50 %	50 %	0 %	330832493
13567	NC_015433	GC	3	6	674574	674579	0 %	0 %	50 %	50 %	330832493
13568	NC_015433	AGA	2	6	674640	674645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832493
13569	NC_015433	TCC	2	6	674679	674684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832493
13570	NC_015433	AGC	2	6	674873	674878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832493
13571	NC_015433	TGG	2	6	675026	675031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832494
13572	NC_015433	GAT	2	6	675063	675068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832494
13573	NC_015433	T	6	6	675068	675073	0 %	100 %	0 %	0 %	330832494
13574	NC_015433	AGC	2	6	675106	675111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832494
13575	NC_015433	TCA	2	6	675119	675124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832494
13576	NC_015433	A	7	7	675127	675133	100 %	0 %	0 %	0 %	330832494
13577	NC_015433	T	6	6	675180	675185	0 %	100 %	0 %	0 %	330832494
13578	NC_015433	AAT	2	6	675228	675233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832494
13579	NC_015433	ATG	2	6	675250	675255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832494
13580	NC_015433	CCAG	2	8	675271	675278	25 %	0 %	25 %	50 %	330832494
13581	NC_015433	TGA	2	6	675316	675321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832494
13582	NC_015433	TAG	2	6	675334	675339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832494
13583	NC_015433	AG	3	6	675572	675577	50 %	0 %	50 %	0 %	330832494
13584	NC_015433	TGC	2	6	675592	675597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832494
13585	NC_015433	AAG	2	6	675615	675620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832494
13586	NC_015433	A	6	6	675642	675647	100 %	0 %	0 %	0 %	330832494
13587	NC_015433	AGC	2	6	675674	675679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832494
13588	NC_015433	CT	3	6	675697	675702	0 %	50 %	0 %	50 %	330832494
13589	NC_015433	ACT	2	6	675718	675723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832494
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13591	NC_015433	GCGATA	2	12	675845	675856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330832495
13592	NC_015433	GTTT	2	8	675859	675866	0 %	75 %	25 %	0 %	330832495
13593	NC_015433	T	6	6	675864	675869	0 %	100 %	0 %	0 %	330832495
13594	NC_015433	GTT	2	6	675885	675890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832495
13595	NC_015433	TGG	2	6	675906	675911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832495
13596	NC_015433	TAC	2	6	675916	675921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832495
13597	NC_015433	GTA	2	6	675923	675928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832495
13598	NC_015433	T	6	6	675929	675934	0 %	100 %	0 %	0 %	330832495
13599	NC_015433	T	6	6	675953	675958	0 %	100 %	0 %	0 %	330832495
13600	NC_015433	TCT	2	6	676001	676006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832495
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13602	NC_015433	TTGT	2	8	676073	676080	0 %	75 %	25 %	0 %	330832495
13603	NC_015433	CCA	2	6	676168	676173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832495
13604	NC_015433	ATA	2	6	676183	676188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832495
13605	NC_015433	ATC	2	6	676306	676311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832495
13606	NC_015433	AAT	2	6	676312	676317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832495
13607	NC_015433	CAC	2	6	676341	676346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832495
13608	NC_015433	TCC	2	6	676391	676396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832495
13609	NC_015433	ACC	2	6	676414	676419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832495
13610	NC_015433	GAT	2	6	676423	676428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832495
13611	NC_015433	GCA	2	6	676541	676546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832495
13612	NC_015433	CTT	2	6	676633	676638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832495
13613	NC_015433	AG	3	6	676641	676646	50 %	0 %	50 %	0 %	330832495
13614	NC_015433	GAC	2	6	676789	676794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832495
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13619	NC_015433	ACC	2	6	676928	676933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832495
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13987	NC_015433	GAG	2	6	694760	694765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13988	NC_015433	ACT	2	6	694778	694783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13989	NC_015433	CAG	2	6	694812	694817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13990	NC_015433	CAA	2	6	694821	694826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13991	NC_015433	GTA	2	6	694827	694832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13992	NC_015433	AAG	2	6	694849	694854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13994	NC_015433	GTCA	2	8	695099	695106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13995	NC_015433	TAA	2	6	695130	695135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13996	NC_015433	TTATA	2	10	695176	695185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13997	NC_015433	GTG	2	6	695195	695200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13998	NC_015433	CAGGTG	2	12	695207	695218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13999	NC_015433	AAC	3	9	695220	695228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14000	NC_015433	TCA	2	6	695320	695325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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